MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Edwardsiella tarda FL6-60 chromosome

Total Repeats: 559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017309	CTGCT	2	10	12349	12358	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017309	GCGCA	2	10	18575	18584	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017309	TGATT	2	10	40408	40417	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017309	GCGGG	2	10	47799	47808	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017309	TCCGG	2	10	62605	62614	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017309	GCAAT	2	10	116571	116580	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017309	ATTGC	2	10	153002	153011	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017309	TGGAT	2	10	158357	158366	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017309	GGTTT	2	10	160540	160549	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017309	AGTGA	2	10	163095	163104	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017309	ATTGC	2	10	188388	188397	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017309	AGCGC	2	10	191778	191787	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017309	TGCAC	2	10	191841	191850	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017309	CTGTT	2	10	199725	199734	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017309	CCGCC	2	10	208449	208458	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
16	NC_017309	CCCCG	2	10	238990	238999	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
17	NC_017309	GTTGC	2	10	251548	251557	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017309	AAGCA	2	10	261116	261125	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017309	AAATC	2	10	264646	264655	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017309	AGGTA	2	10	265071	265080	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017309	GCCGT	2	10	267281	267290	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017309	AGAAT	2	10	267404	267413	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017309	TCATG	2	10	267859	267868	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017309	TGGCA	2	10	268006	268015	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017309	GCCGC	2	10	282516	282525	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_017309	CGCGG	2	10	298332	298341	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017309	CGACG	2	10	299993	300002	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017309	AATCA	2	10	300276	300285	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017309	ATTTA	2	10	300362	300371	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017309	ATTTT	2	10	321588	321597	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017309	GATGA	2	10	324534	324543	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017309	TTTTA	2	10	332905	332914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017309	TTGTA	2	10	337199	337208	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017309	TTGTG	2	10	337342	337351	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017309	TGCTC	2	10	339807	339816	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017309	ATAGG	2	10	340100	340109	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017309	CTGCG	2	10	347370	347379	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017309	GATTG	2	10	347751	347760	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017309	AATGG	2	10	349126	349135	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017309	AAAAT	2	10	352991	353000	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017309	GCGCC	2	10	365208	365217	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_017309	CGGGC	2	10	366231	366240	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_017309	TGAAA	2	10	368672	368681	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017309	CACAA	2	10	371437	371446	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017309	GCGCC	2	10	390366	390375	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46	NC_017309	CGGCG	2	10	390379	390388	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017309	TGTTA	2	10	408880	408889	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017309	AAATG	2	10	409770	409779	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017309	GCCGG	2	10	419041	419050	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017309	CCGTG	2	10	419062	419071	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017309	TCTTT	2	10	419711	419720	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017309	ATCAC	2	10	438460	438469	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_017309	GCGTG	2	10	443312	443321	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017309	CGGCG	2	10	446776	446785	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017309	GGGAT	2	10	448542	448551	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017309	AAAAG	2	10	469668	469677	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017309	TTGAT	2	10	476958	476967	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017309	AGAAA	2	10	487684	487693	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017309	GTAAC	2	10	502448	502457	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017309	GGGCA	2	10	504818	504827	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017309	GTTTT	3	15	539529	539543	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017309	CACCT	2	10	541712	541721	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_017309	CGGGG	2	10	556845	556854	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017309	TTGCG	2	10	558317	558326	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017309	GATAG	2	10	564089	564098	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017309	ATTGC	2	10	585379	585388	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017309	CGGAG	2	10	587650	587659	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017309	GCTTT	2	10	596831	596840	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017309	GGCAG	2	10	604240	604249	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017309	AAGAT	2	10	608510	608519	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017309	CAACA	2	10	608567	608576	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_017309	CGGCG	2	10	633703	633712	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017309	CTGCG	2	10	633848	633857	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_017309	GACAG	2	10	635272	635281	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017309	GCGCC	2	10	635774	635783	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_017309	CGCGG	2	10	662895	662904	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017309	CGTTC	2	10	669902	669911	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017309	TGCGC	2	10	669934	669943	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017309	CATTG	2	10	677394	677403	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017309	ATTTT	2	10	709834	709843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017309	GCACG	2	10	718083	718092	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017309	GTGGA	2	10	723678	723687	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017309	TTGCG	2	10	728465	728474	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017309	CTTTC	2	10	728555	728564	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017309	GTAAT	2	10	751784	751793	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017309	CGCGG	2	10	765746	765755	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017309	CGGTG	2	10	789087	789096	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017309	TTGTA	2	10	816253	816262	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017309	CGGCG	2	10	821736	821745	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_017309	GGCGC	2	10	836242	836251	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017309	TGGCA	2	10	850911	850920	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017309	TCGGC	2	10	858495	858504	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017309	AAAAT	2	10	869592	869601	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017309	AAAAG	2	10	875780	875789	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017309	GGCAT	2	10	882946	882955	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017309	AAGAA	2	10	883166	883175	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017309	CCCGG	2	10	894058	894067	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_017309	TGGGG	2	10	894463	894472	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017309	ATAAG	2	10	895220	895229	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017309	CCAGT	2	10	896098	896107	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017309	CATTG	2	10	904297	904306	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017309	GGGGA	2	10	920311	920320	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017309	GACGT	2	10	920577	920586	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017309	AAGAA	2	10	923622	923631	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017309	TCTCG	2	10	928470	928479	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017309	ATAAG	2	10	930119	930128	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017309	ATGAT	2	10	941453	941462	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017309	GCCGC	2	10	945676	945685	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
109	NC_017309	CAGGT	2	10	951321	951330	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017309	CATAA	2	10	965894	965903	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017309	ATGAG	2	10	967041	967050	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017309	CGGGG	2	10	973996	974005	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017309	GACGC	2	10	976756	976765	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017309	CGGCG	2	10	995946	995955	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017309	GTAAG	2	10	1009955	1009964	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017309	GGGAT	2	10	1020284	1020293	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017309	ATTTA	2	10	1020661	1020670	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017309	TATTT	2	10	1029682	1029691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017309	CGCGC	2	10	1033194	1033203	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
120	NC_017309	AGGGA	2	10	1035228	1035237	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017309	GCGCC	2	10	1038580	1038589	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
122	NC_017309	AAACC	2	10	1038766	1038775	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017309	AATAT	2	10	1046040	1046049	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017309	AACGC	2	10	1050443	1050452	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017309	TGGCG	2	10	1050524	1050533	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017309	TCATA	2	10	1072802	1072811	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017309	CGCGG	3	15	1072855	1072869	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_017309	CGGCG	2	10	1073743	1073752	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017309	TTTAT	2	10	1075318	1075327	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017309	GGAGC	2	10	1102449	1102458	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017309	CTTTT	2	10	1110847	1110856	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017309	TTTTC	2	10	1112237	1112246	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017309	GTCAC	2	10	1117951	1117960	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_017309	GGCGC	2	10	1128628	1128637	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_017309	TATAT	2	10	1134386	1134395	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017309	CGGAG	2	10	1147900	1147909	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017309	GGATG	2	10	1148151	1148160	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017309	CGCTG	2	10	1148473	1148482	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_017309	TGTTC	2	10	1189676	1189685	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017309	CGGGG	2	10	1203074	1203083	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017309	TTTTC	2	10	1213029	1213038	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017309	GCGCG	2	10	1221321	1221330	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
143	NC_017309	GCCGC	2	10	1226308	1226317	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_017309	GGTGG	2	10	1230500	1230509	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017309	GGAAA	3	15	1230525	1230539	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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390	NC_017309	GCCAT	2	10	2551833	2551842	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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423	NC_017309	CGGCG	2	10	2764694	2764703	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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442	NC_017309	GGGCG	2	10	2891449	2891458	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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465	NC_017309	TGCAT	2	10	3065311	3065320	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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