MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017308	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	387139675
2	NC_017308	CACGC	2	10	5735	5744	20 %	0 %	20 %	60 %	387139679
3	NC_017308	GTGGA	2	10	5772	5781	20 %	20 %	60 %	0 %	387139679
4	NC_017308	AATCT	2	10	6609	6618	40 %	40 %	0 %	20 %	387139679
5	NC_017308	AAAAT	2	10	16739	16748	80 %	20 %	0 %	0 %	387139688
6	NC_017308	CTTTT	2	10	19214	19223	0 %	80 %	0 %	20 %	387139692
7	NC_017308	GCTCT	2	10	19251	19260	0 %	40 %	20 %	40 %	387139692
8	NC_017308	TGCGT	2	10	24130	24139	0 %	40 %	40 %	20 %	387139697
9	NC_017308	CTGAT	2	10	28154	28163	20 %	40 %	20 %	20 %	387139701
10	NC_017308	GGAGC	2	10	29086	29095	20 %	0 %	60 %	20 %	387139702
11	NC_017308	TTGCT	2	10	30174	30183	0 %	60 %	20 %	20 %	387139703
12	NC_017308	TGCGG	2	10	40092	40101	0 %	20 %	60 %	20 %	387139710
13	NC_017308	GCCTC	2	10	45286	45295	0 %	20 %	20 %	60 %	387139715
14	NC_017308	GAAGG	2	10	45300	45309	40 %	0 %	60 %	0 %	387139715
15	NC_017308	CAGTG	2	10	47231	47240	20 %	20 %	40 %	20 %	387139717
16	NC_017308	TGAGA	2	10	47573	47582	40 %	20 %	40 %	0 %	387139717
17	NC_017308	AGTGA	2	10	47623	47632	40 %	20 %	40 %	0 %	387139717
18	NC_017308	CTGGC	2	10	51030	51039	0 %	20 %	40 %	40 %	387139724
19	NC_017308	GCAGC	2	10	51529	51538	20 %	0 %	40 %	40 %	387139724
20	NC_017308	GACTG	2	10	51545	51554	20 %	20 %	40 %	20 %	387139724
21	NC_017308	AAGGC	2	10	53786	53795	40 %	0 %	40 %	20 %	387139726
22	NC_017308	ATGGC	2	10	56610	56619	20 %	20 %	40 %	20 %	387139730
23	NC_017308	ATGTG	2	10	60779	60788	20 %	40 %	40 %	0 %	387139735
24	NC_017308	GCTGG	2	10	62936	62945	0 %	20 %	60 %	20 %	387139736
25	NC_017308	AAGAT	2	10	67330	67339	60 %	20 %	20 %	0 %	387139739
26	NC_017308	GGAGC	2	10	67437	67446	20 %	0 %	60 %	20 %	387139739
27	NC_017308	GGTCT	2	10	69151	69160	0 %	40 %	40 %	20 %	387139741
28	NC_017308	CATGT	2	10	69728	69737	20 %	40 %	20 %	20 %	387139742
29	NC_017308	CAGCG	2	10	70605	70614	20 %	0 %	40 %	40 %	387139743
30	NC_017308	ACTGA	2	10	70782	70791	40 %	20 %	20 %	20 %	387139743
31	NC_017308	CAGGC	2	10	71011	71020	20 %	0 %	40 %	40 %	387139743
32	NC_017308	ATGGC	2	10	71856	71865	20 %	20 %	40 %	20 %	387139744
33	NC_017308	GCTTT	2	10	79013	79022	0 %	60 %	20 %	20 %	387139751
34	NC_017308	TGACC	2	10	79269	79278	20 %	20 %	20 %	40 %	387139751
35	NC_017308	CGTTA	2	10	80011	80020	20 %	40 %	20 %	20 %	387139752
36	NC_017308	TGCTG	2	10	80645	80654	0 %	40 %	40 %	20 %	387139752
37	NC_017308	TGGCC	2	10	82636	82645	0 %	20 %	40 %	40 %	387139753
38	NC_017308	GCGAC	2	10	83440	83449	20 %	0 %	40 %	40 %	387139753
39	NC_017308	TGGGA	2	10	86855	86864	20 %	20 %	60 %	0 %	387139759
40	NC_017308	GATCG	2	10	87954	87963	20 %	20 %	40 %	20 %	387139761
41	NC_017308	CAAAA	2	10	88686	88695	80 %	0 %	0 %	20 %	387139762
42	NC_017308	AACAA	2	10	91527	91536	80 %	0 %	0 %	20 %	387139764
43	NC_017308	TGCAA	2	10	94534	94543	40 %	20 %	20 %	20 %	387139767
44	NC_017308	TGCAG	2	10	94754	94763	20 %	20 %	40 %	20 %	387139767
45	NC_017308	AGGTC	2	10	97190	97199	20 %	20 %	40 %	20 %	387139770
46	NC_017308	ACCAA	2	10	99049	99058	60 %	0 %	0 %	40 %	387139770
47	NC_017308	TCATC	2	10	100312	100321	20 %	40 %	0 %	40 %	387139771
48	NC_017308	CCTGG	2	10	102343	102352	0 %	20 %	40 %	40 %	387139772
49	NC_017308	CGGTG	2	10	102551	102560	0 %	20 %	60 %	20 %	387139772
50	NC_017308	CGGCG	2	10	105170	105179	0 %	0 %	60 %	40 %	387139775
51	NC_017308	CGCGG	2	10	105230	105239	0 %	0 %	60 %	40 %	387139776
52	NC_017308	CAGCG	2	10	105766	105775	20 %	0 %	40 %	40 %	387139777
53	NC_017308	GGATC	2	10	116296	116305	20 %	20 %	40 %	20 %	387139786
54	NC_017308	GGGGC	2	10	131246	131255	0 %	0 %	80 %	20 %	387139792
55	NC_017308	AGACG	2	10	133051	133060	40 %	0 %	40 %	20 %	387139794
56	NC_017308	ACGGT	2	10	134382	134391	20 %	20 %	40 %	20 %	387139796
57	NC_017308	CGATC	2	10	134655	134664	20 %	20 %	20 %	40 %	387139796
58	NC_017308	TGGCC	2	10	134862	134871	0 %	20 %	40 %	40 %	387139796
59	NC_017308	TGGTG	2	10	135240	135249	0 %	40 %	60 %	0 %	387139796
60	NC_017308	GGAGT	2	10	135712	135721	20 %	20 %	60 %	0 %	387139796
61	NC_017308	ATTGC	2	10	139646	139655	20 %	40 %	20 %	20 %	387139799
62	NC_017308	TCACT	2	10	143470	143479	20 %	40 %	0 %	40 %	387139804
63	NC_017308	ATTTC	2	10	144087	144096	20 %	60 %	0 %	20 %	387139804
64	NC_017308	AATGG	2	10	147771	147780	40 %	20 %	40 %	0 %	387139806
65	NC_017308	GTGAG	2	10	148754	148763	20 %	20 %	60 %	0 %	387139808
66	NC_017308	CTGAA	2	10	149552	149561	40 %	20 %	20 %	20 %	387139808
67	NC_017308	CCAGC	2	10	150844	150853	20 %	0 %	20 %	60 %	387139809
68	NC_017308	TACGC	2	10	153870	153879	20 %	20 %	20 %	40 %	387139811
69	NC_017308	CCTTG	2	10	159002	159011	0 %	40 %	20 %	40 %	387139816
70	NC_017308	CGGTG	2	10	162972	162981	0 %	20 %	60 %	20 %	387139819
71	NC_017308	CATGG	2	10	165105	165114	20 %	20 %	40 %	20 %	387139821
72	NC_017308	CAGAT	2	10	165461	165470	40 %	20 %	20 %	20 %	387139821
73	NC_017308	GGATG	2	10	166359	166368	20 %	20 %	60 %	0 %	387139821
74	NC_017308	AAACT	2	10	170007	170016	60 %	20 %	0 %	20 %	387139822
75	NC_017308	ACCGG	2	10	170402	170411	20 %	0 %	40 %	40 %	387139822
76	NC_017308	TGACC	2	10	180260	180269	20 %	20 %	20 %	40 %	387139829
77	NC_017308	TTGCA	2	10	181528	181537	20 %	40 %	20 %	20 %	387139830
78	NC_017308	GTTTG	2	10	182614	182623	0 %	60 %	40 %	0 %	387139831
79	NC_017308	CGGAT	2	10	183554	183563	20 %	20 %	40 %	20 %	387139832
80	NC_017308	AGCGC	2	10	184712	184721	20 %	0 %	40 %	40 %	387139833
81	NC_017308	GCAGT	2	10	186199	186208	20 %	20 %	40 %	20 %	387139834
82	NC_017308	CAATG	2	10	186470	186479	40 %	20 %	20 %	20 %	387139834
83	NC_017308	TAACG	2	10	187442	187451	40 %	20 %	20 %	20 %	387139835
84	NC_017308	AAGCC	2	10	188769	188778	40 %	0 %	20 %	40 %	387139836
85	NC_017308	GGCCC	2	10	190837	190846	0 %	0 %	40 %	60 %	387139839
86	NC_017308	TGGCG	2	10	198437	198446	0 %	20 %	60 %	20 %	387139844
87	NC_017308	CAGGC	2	10	201486	201495	20 %	0 %	40 %	40 %	387139846
88	NC_017308	TTGTA	2	10	201896	201905	20 %	60 %	20 %	0 %	387139847
89	NC_017308	GCGAC	2	10	206412	206421	20 %	0 %	40 %	40 %	387139852
90	NC_017308	AGATC	2	10	206437	206446	40 %	20 %	20 %	20 %	387139852
91	NC_017308	CAAGG	2	10	207351	207360	40 %	0 %	40 %	20 %	387139853
92	NC_017308	AGAAA	2	10	208080	208089	80 %	0 %	20 %	0 %	387139854
93	NC_017308	AGTGC	2	10	213112	213121	20 %	20 %	40 %	20 %	387139860
94	NC_017308	CGGGG	2	10	214114	214123	0 %	0 %	80 %	20 %	387139861
95	NC_017308	TGCGC	2	10	216548	216557	0 %	20 %	40 %	40 %	387139864
96	NC_017308	CATTG	2	10	218397	218406	20 %	40 %	20 %	20 %	387139866
97	NC_017308	CGCAA	2	10	219211	219220	40 %	0 %	20 %	40 %	387139869
98	NC_017308	CTGTG	2	10	222951	222960	0 %	40 %	40 %	20 %	387139871
99	NC_017308	GCCGT	2	10	224352	224361	0 %	20 %	40 %	40 %	387139871
100	NC_017308	AGAAA	2	10	225259	225268	80 %	0 %	20 %	0 %	387139871
101	NC_017308	AGAGT	2	10	228686	228695	40 %	20 %	40 %	0 %	387139873
102	NC_017308	AGTGG	2	10	230971	230980	20 %	20 %	60 %	0 %	387139875
103	NC_017308	TTTTG	2	10	230985	230994	0 %	80 %	20 %	0 %	387139875
104	NC_017308	GCCAT	2	10	234342	234351	20 %	20 %	20 %	40 %	387139878
105	NC_017308	CGTAG	2	10	234568	234577	20 %	20 %	40 %	20 %	387139878
106	NC_017308	CGCAG	2	10	237398	237407	20 %	0 %	40 %	40 %	387139881
107	NC_017308	CATGC	2	10	239169	239178	20 %	20 %	20 %	40 %	387139882
108	NC_017308	CCATG	2	10	239400	239409	20 %	20 %	20 %	40 %	387139882
109	NC_017308	CCCCG	2	10	244225	244234	0 %	0 %	20 %	80 %	387139887
110	NC_017308	GAAGT	2	10	244766	244775	40 %	20 %	40 %	0 %	387139887
111	NC_017308	CCGTG	2	10	244952	244961	0 %	20 %	40 %	40 %	387139887
112	NC_017308	GCGCA	2	10	249328	249337	20 %	0 %	40 %	40 %	387139889
113	NC_017308	TGCTC	2	10	249888	249897	0 %	40 %	20 %	40 %	387139890
114	NC_017308	GGCTC	2	10	252128	252137	0 %	20 %	40 %	40 %	387139893
115	NC_017308	GGAAG	2	10	253540	253549	40 %	0 %	60 %	0 %	387139894
116	NC_017308	CCATG	2	10	254927	254936	20 %	20 %	20 %	40 %	387139896
117	NC_017308	TTGCC	2	10	255014	255023	0 %	40 %	20 %	40 %	387139896
118	NC_017308	GAATG	2	10	258336	258345	40 %	20 %	40 %	0 %	387139898
119	NC_017308	GGTGT	2	10	259091	259100	0 %	40 %	60 %	0 %	387139899
120	NC_017308	CGGGG	2	10	259332	259341	0 %	0 %	80 %	20 %	387139899
121	NC_017308	TCGTC	2	10	260486	260495	0 %	40 %	20 %	40 %	387139900
122	NC_017308	GCATC	2	10	261230	261239	20 %	20 %	20 %	40 %	387139900
123	NC_017308	GGTGG	2	10	262376	262385	0 %	20 %	80 %	0 %	387139901
124	NC_017308	ACGCA	2	10	262647	262656	40 %	0 %	20 %	40 %	387139901
125	NC_017308	CTTCT	2	10	263587	263596	0 %	60 %	0 %	40 %	387139902
126	NC_017308	AATGC	2	10	265040	265049	40 %	20 %	20 %	20 %	387139903
127	NC_017308	CAGAG	2	10	265136	265145	40 %	0 %	40 %	20 %	387139903
128	NC_017308	TGCGT	2	10	268726	268735	0 %	40 %	40 %	20 %	387139907
129	NC_017308	CGGGT	2	10	271881	271890	0 %	20 %	60 %	20 %	387139914
130	NC_017308	TAGGC	2	10	274551	274560	20 %	20 %	40 %	20 %	387139917
131	NC_017308	GCAGG	2	10	280298	280307	20 %	0 %	60 %	20 %	387139922
132	NC_017308	AGGCC	2	10	285266	285275	20 %	0 %	40 %	40 %	387139925
133	NC_017308	TGCTT	2	10	285777	285786	0 %	60 %	20 %	20 %	387139925
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