MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 1015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017308	TAAA	2	8	1829	1836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017308	GAAA	2	8	8467	8474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017308	AATC	2	8	14942	14949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017308	AAAG	2	8	15034	15041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017308	AGCT	2	8	15333	15340	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017308	AAGG	2	8	15646	15653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017308	GAAA	2	8	20203	20210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017308	TCCC	2	8	20936	20943	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_017308	TCAT	2	8	23449	23456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017308	TGAT	2	8	23467	23474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017308	GCTA	2	8	28754	28761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017308	CAGG	2	8	35946	35953	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017308	GCCC	2	8	36135	36142	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_017308	TGGC	2	8	36255	36262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017308	TACT	2	8	38635	38642	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017308	AAGA	2	8	38717	38724	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017308	TGCG	2	8	39167	39174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017308	GCTG	2	8	41028	41035	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017308	TCGG	2	8	41981	41988	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017308	AATG	2	8	42453	42460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017308	GGAA	3	12	42622	42633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017308	AGCC	2	8	43547	43554	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017308	AAAT	2	8	44084	44091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017308	TTGC	2	8	45813	45820	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017308	GTTT	2	8	48885	48892	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017308	TTGG	2	8	55782	55789	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017308	GCAC	2	8	57618	57625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017308	GCGG	2	8	61031	61038	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017308	AACA	2	8	61062	61069	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017308	TGGG	2	8	62512	62519	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017308	GGCT	2	8	65904	65911	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017308	AGTG	2	8	67133	67140	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017308	TGCC	2	8	72661	72668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017308	GGAA	2	8	72694	72701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017308	GGAA	2	8	74123	74130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017308	TAAT	2	8	74438	74445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017308	TCCT	2	8	77165	77172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017308	TCTT	2	8	88171	88178	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017308	TCTT	2	8	102922	102929	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017308	GAGG	2	8	111584	111591	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017308	TGAT	2	8	111988	111995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017308	CTGC	2	8	113579	113586	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017308	TTGC	2	8	113882	113889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017308	TACC	2	8	115190	115197	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017308	GAAT	2	8	115217	115224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017308	GGCA	2	8	115227	115234	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017308	CCAC	2	8	117437	117444	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_017308	GCCA	2	8	117953	117960	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017308	TCCT	2	8	119053	119060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017308	TCTT	2	8	119257	119264	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017308	TGCG	2	8	119947	119954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017308	CCCA	2	8	120776	120783	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_017308	TTGG	2	8	122207	122214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017308	GCCG	2	8	122643	122650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017308	GGCA	2	8	122652	122659	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017308	GCGG	2	8	124581	124588	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017308	TGGG	2	8	124920	124927	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017308	ATTT	2	8	125232	125239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017308	ATGG	2	8	125363	125370	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017308	AGAA	2	8	125596	125603	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017308	GACG	2	8	125694	125701	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017308	GATA	2	8	125930	125937	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017308	GGCG	2	8	126413	126420	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017308	CTGG	2	8	126470	126477	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017308	TTCC	2	8	127435	127442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017308	TGGA	2	8	130137	130144	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017308	CCTA	2	8	137915	137922	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017308	TGCG	2	8	138645	138652	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017308	GCTT	2	8	145516	145523	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017308	CTTG	2	8	145828	145835	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017308	GATG	2	8	146981	146988	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017308	CAAA	2	8	147604	147611	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017308	GCCC	2	8	151526	151533	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_017308	CTGC	2	8	151663	151670	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017308	TTCC	2	8	153284	153291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017308	ATGC	2	8	154764	154771	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017308	ATAC	2	8	158325	158332	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017308	CAGG	2	8	158345	158352	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017308	GTAG	2	8	158459	158466	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017308	CTAC	2	8	158476	158483	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017308	CGGC	2	8	160626	160633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017308	TTTG	2	8	161791	161798	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017308	TGTT	2	8	166752	166759	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017308	TCCC	2	8	167020	167027	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_017308	CGGT	2	8	167250	167257	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017308	GAAT	2	8	167562	167569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017308	GCTA	2	8	167782	167789	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017308	AAGG	2	8	168040	168047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017308	GTTG	2	8	168601	168608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017308	TGCT	2	8	168701	168708	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017308	AAAT	2	8	168980	168987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017308	GGAC	2	8	169242	169249	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017308	CTGG	2	8	171532	171539	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017308	ATAG	2	8	172700	172707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017308	TGGC	2	8	174086	174093	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017308	ATTA	2	8	176422	176429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017308	AGCC	2	8	179363	179370	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017308	ATCT	2	8	181231	181238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017308	CAGT	2	8	189166	189173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017308	ATGG	2	8	190748	190755	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017308	TGCT	2	8	193872	193879	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017308	GTAG	2	8	194021	194028	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017308	AGGA	2	8	194142	194149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017308	GCGT	2	8	194218	194225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017308	GACA	2	8	194345	194352	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017308	AGCT	2	8	194615	194622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017308	TTTG	2	8	195205	195212	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017308	GAAG	2	8	196331	196338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017308	AGCT	2	8	196550	196557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017308	CAGC	2	8	196678	196685	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017308	CAGC	2	8	196747	196754	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017308	TCAC	2	8	196781	196788	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017308	CGCC	2	8	197132	197139	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_017308	CCGC	2	8	197257	197264	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_017308	ACCA	2	8	197726	197733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017308	CGAA	2	8	200051	200058	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017308	GTTC	2	8	204097	204104	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017308	TAGA	2	8	212527	212534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017308	GCCC	2	8	214357	214364	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_017308	GTCT	2	8	214714	214721	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017308	TGCT	2	8	220528	220535	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017308	GTGC	2	8	220937	220944	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017308	TTCA	2	8	225488	225495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017308	TCCT	2	8	227494	227501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017308	GATA	2	8	227609	227616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017308	GTAG	2	8	227623	227630	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017308	CCTA	2	8	227652	227659	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017308	AGCC	2	8	230570	230577	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017308	TTTA	2	8	232852	232859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017308	CGCC	2	8	240690	240697	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_017308	AGTT	2	8	241853	241860	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017308	TTGC	2	8	246457	246464	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017308	ACTC	2	8	249588	249595	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017308	ATGA	2	8	250060	250067	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017308	ATTA	2	8	250123	250130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017308	GAAT	2	8	254734	254741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017308	TATT	2	8	257286	257293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017308	CGTG	2	8	269938	269945	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017308	GCGG	2	8	270405	270412	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017308	TCCC	2	8	276207	276214	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
141	NC_017308	CTCG	2	8	283591	283598	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017308	AAGG	2	8	283637	283644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017308	TGTT	2	8	288740	288747	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017308	GTGG	2	8	289183	289190	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017308	TTTA	2	8	289288	289295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017308	GCAC	2	8	295665	295672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017308	GCTG	2	8	299752	299759	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017308	ATCG	2	8	301359	301366	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017308	TGCC	2	8	302543	302550	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017308	TAAC	2	8	304684	304691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017308	CCTT	2	8	308880	308887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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