MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 30905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017308	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139675
2	NC_017308	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
3	NC_017308	ACT	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139675
4	NC_017308	TGC	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
5	NC_017308	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139675
6	NC_017308	TTC	3	9	456	464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139675
7	NC_017308	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139675
8	NC_017308	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
9	NC_017308	CTG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
10	NC_017308	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139675
11	NC_017308	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139675
12	NC_017308	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139675
13	NC_017308	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387139675
14	NC_017308	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139675
15	NC_017308	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139675
16	NC_017308	ACT	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139675
17	NC_017308	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139675
18	NC_017308	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139675
19	NC_017308	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139675
20	NC_017308	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139675
21	NC_017308	CGA	2	6	1523	1528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139675
22	NC_017308	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
23	NC_017308	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139675
24	NC_017308	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139675
25	NC_017308	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
26	NC_017308	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139675
27	NC_017308	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139675
28	NC_017308	AGT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017308	TTA	2	6	2196	2201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017308	AAC	2	6	2251	2256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017308	TGC	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017308	GAG	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017308	TAC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139676
34	NC_017308	TCA	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139676
35	NC_017308	GAT	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139676
36	NC_017308	GCT	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139676
37	NC_017308	CAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139676
38	NC_017308	GCA	3	9	2829	2837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139676
39	NC_017308	GCT	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139676
40	NC_017308	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139676
41	NC_017308	AGA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139676
42	NC_017308	GAG	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139676
43	NC_017308	CTG	2	6	3594	3599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017308	TTG	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139677
45	NC_017308	CTG	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139677
46	NC_017308	TTG	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139677
47	NC_017308	GAT	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139677
48	NC_017308	GAG	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139677
49	NC_017308	TCA	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139677
50	NC_017308	GAC	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139677
51	NC_017308	CGA	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139677
52	NC_017308	GCC	2	6	4734	4739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139677
53	NC_017308	CTG	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139678
54	NC_017308	AGA	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139678
55	NC_017308	GCG	2	6	4932	4937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139678
56	NC_017308	CGG	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139678
57	NC_017308	TGG	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139678
58	NC_017308	AGC	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139678
59	NC_017308	ATG	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139678
60	NC_017308	TAA	2	6	5544	5549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017308	TGG	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139679
62	NC_017308	GGT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139679
63	NC_017308	ACC	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139679
64	NC_017308	ACC	3	9	6098	6106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139679
65	NC_017308	CAT	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139679
66	NC_017308	CGT	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139679
67	NC_017308	TGA	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
68	NC_017308	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139679
69	NC_017308	GAA	2	6	6310	6315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139679
70	NC_017308	GAA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139679
71	NC_017308	TTA	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139679
72	NC_017308	TGA	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
73	NC_017308	GAA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139679
74	NC_017308	TGA	2	6	6564	6569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
75	NC_017308	TCT	2	6	6818	6823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139679
76	NC_017308	GGC	2	6	6838	6843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139679
77	NC_017308	TGG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139679
78	NC_017308	ATT	2	6	7097	7102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139679
79	NC_017308	ATG	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
80	NC_017308	CAA	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139679
81	NC_017308	GCT	3	9	7210	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139679
82	NC_017308	TTG	2	6	7223	7228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139679
83	NC_017308	CCG	2	6	7280	7285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139679
84	NC_017308	GAA	2	6	7358	7363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139679
85	NC_017308	CAA	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139679
86	NC_017308	GAT	2	6	7394	7399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
87	NC_017308	ATG	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
88	NC_017308	TGA	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
89	NC_017308	TCG	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139679
90	NC_017308	TAG	3	9	7673	7681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017308	CAG	2	6	7750	7755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139680
92	NC_017308	TTC	2	6	7898	7903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139680
93	NC_017308	GAG	2	6	7946	7951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139680
94	NC_017308	AGC	2	6	7958	7963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139680
95	NC_017308	TGC	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139680
96	NC_017308	GAG	2	6	8105	8110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139680
97	NC_017308	ATG	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017308	GTT	2	6	8208	8213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017308	ACG	2	6	8237	8242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017308	TTC	2	6	8262	8267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017308	ATT	2	6	8300	8305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139681
102	NC_017308	TTA	2	6	8407	8412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017308	CTG	2	6	8544	8549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017308	TGT	2	6	8589	8594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017308	CTG	2	6	8597	8602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017308	TGC	2	6	8648	8653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017308	GTC	2	6	8658	8663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017308	GCG	2	6	8720	8725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139682
109	NC_017308	TGA	2	6	8806	8811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139682
110	NC_017308	GCT	2	6	8823	8828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139682
111	NC_017308	CGA	2	6	9084	9089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139683
112	NC_017308	GCG	2	6	9098	9103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139683
113	NC_017308	GAG	2	6	9139	9144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139683
114	NC_017308	CCG	2	6	9231	9236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139683
115	NC_017308	ACG	2	6	9437	9442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139683
116	NC_017308	CGC	2	6	9447	9452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139683
117	NC_017308	TTC	2	6	9569	9574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139683
118	NC_017308	TGA	2	6	9596	9601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139683
119	NC_017308	TCT	2	6	9677	9682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139683
120	NC_017308	GAA	3	9	9853	9861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139683
121	NC_017308	ACA	2	6	9914	9919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139683
122	NC_017308	TGC	2	6	10154	10159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139683
123	NC_017308	TTA	2	6	10161	10166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139683
124	NC_017308	TCG	2	6	10194	10199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139683
125	NC_017308	GAA	2	6	10216	10221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139683
126	NC_017308	CGA	2	6	10275	10280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139683
127	NC_017308	AGA	2	6	10418	10423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139683
128	NC_017308	CGT	2	6	10552	10557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139683
129	NC_017308	ATT	2	6	10564	10569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139683
130	NC_017308	GAA	2	6	10591	10596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139683
131	NC_017308	GTG	2	6	10618	10623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139683
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257	NC_017308	ACT	2	6	18499	18504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139691
258	NC_017308	CAT	2	6	18540	18545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139691
259	NC_017308	GGT	2	6	18565	18570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139691
260	NC_017308	GGC	2	6	18592	18597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139691
261	NC_017308	TCC	2	6	18653	18658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387139691
262	NC_017308	GTG	2	6	18712	18717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139691
263	NC_017308	CAA	2	6	18732	18737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139691
264	NC_017308	CCA	2	6	18738	18743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139691
265	NC_017308	GTT	2	6	18784	18789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139691
266	NC_017308	GGA	2	6	18950	18955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139692
267	NC_017308	TCC	2	6	18972	18977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387139692
268	NC_017308	TCA	2	6	19029	19034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139692
269	NC_017308	TTA	2	6	19041	19046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139692
270	NC_017308	TTA	2	6	19278	19283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139692
271	NC_017308	CTG	2	6	19335	19340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139692
272	NC_017308	TTG	2	6	19497	19502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139692
273	NC_017308	TGG	2	6	19567	19572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139692
274	NC_017308	ATC	2	6	19599	19604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139692
275	NC_017308	GTA	2	6	19640	19645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139692
276	NC_017308	TTG	2	6	19653	19658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139692
277	NC_017308	GTT	2	6	19696	19701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139692
278	NC_017308	GCA	2	6	19751	19756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_017308	AAT	2	6	19916	19921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387139693
280	NC_017308	GTT	2	6	19988	19993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139693
281	NC_017308	GAA	2	6	20078	20083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017308	TGG	2	6	20259	20264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017308	GCT	2	6	20345	20350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_017308	CGA	2	6	20384	20389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_017308	CAT	2	6	20718	20723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139694
286	NC_017308	GAA	2	6	20869	20874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139694
287	NC_017308	AGT	2	6	20886	20891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_017308	GAA	2	6	20914	20919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017308	CCT	2	6	20947	20952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
290	NC_017308	GCC	2	6	20973	20978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
291	NC_017308	GTC	2	6	20979	20984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_017308	GAG	2	6	21056	21061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
293	NC_017308	GAT	2	6	21172	21177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_017308	CGG	2	6	21213	21218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_017308	CGA	2	6	21444	21449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_017308	ACA	2	6	21506	21511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_017308	ATC	2	6	21728	21733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_017308	GAT	2	6	21748	21753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
299	NC_017308	TCG	2	6	21914	21919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139695
300	NC_017308	CAT	2	6	22117	22122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139695
301	NC_017308	TAT	2	6	22264	22269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_017308	GAT	2	6	22291	22296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139696
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309	NC_017308	AAG	2	6	23015	23020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139696
310	NC_017308	ACG	2	6	23103	23108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139696
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315	NC_017308	TTG	2	6	23709	23714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
316	NC_017308	TAT	3	9	23763	23771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139697
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322	NC_017308	ACT	2	6	24093	24098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139697
323	NC_017308	CAG	2	6	24165	24170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139697
324	NC_017308	TAC	2	6	24350	24355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139697
325	NC_017308	GTG	2	6	24661	24666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139697
326	NC_017308	CAT	2	6	24722	24727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139698
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361	NC_017308	TGA	2	6	26726	26731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139700
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379	NC_017308	CTT	2	6	28381	28386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139701
380	NC_017308	CAA	2	6	28419	28424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139701
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