MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis CIP 52.97 chromosome

Total Repeats: 918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017307	GAAA	2	8	20229	20236	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017307	TCAT	2	8	23686	23693	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017307	TGAT	2	8	23704	23711	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017307	GCTA	2	8	28998	29005	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017307	TACT	2	8	38905	38912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017307	AAGA	2	8	38987	38994	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017307	TGCG	2	8	39437	39444	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017307	GCTG	2	8	41325	41332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017307	TCGG	2	8	42277	42284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017307	AATG	2	8	43520	43527	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017307	AAAT	2	8	45170	45177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017307	TTGC	2	8	46899	46906	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017307	ATAC	2	8	47876	47883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017307	GCAT	2	8	48248	48255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017307	GTTT	2	8	49958	49965	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017307	TTGG	2	8	56869	56876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017307	GCAC	2	8	59406	59413	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017307	CTTT	2	8	61168	61175	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017307	AGTG	2	8	68950	68957	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017307	TGCC	2	8	74482	74489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017307	GGAA	2	8	74515	74522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017307	TAAT	2	8	76263	76270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017307	GAAA	2	8	77164	77171	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017307	CTTC	2	8	77658	77665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017307	TCCT	2	8	78991	78998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017307	TCTT	2	8	104754	104761	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017307	GCAG	2	8	111988	111995	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017307	GAGG	2	8	113676	113683	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017307	TACC	2	8	117344	117351	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017307	GAAT	2	8	117371	117378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017307	GGCA	2	8	117381	117388	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017307	CCAC	2	8	119634	119641	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_017307	TCCT	2	8	121332	121339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017307	TCTT	2	8	121536	121543	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017307	TTGG	2	8	124490	124497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017307	GCCG	2	8	124926	124933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017307	GGCA	2	8	124935	124942	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017307	ATTT	2	8	127502	127509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017307	TGGA	2	8	132474	132481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017307	CGCC	2	8	138910	138917	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_017307	TTCG	2	8	138970	138977	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017307	CCTA	2	8	139086	139093	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017307	TGCG	2	8	140981	140988	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017307	CAAA	2	8	150002	150009	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017307	TTCC	2	8	155682	155689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017307	ATGC	2	8	157176	157183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017307	ATAC	2	8	160736	160743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017307	CAGG	2	8	160756	160763	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017307	GTAG	2	8	160870	160877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017307	CTAC	2	8	160887	160894	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017307	CGGC	2	8	163037	163044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017307	TTTG	2	8	164202	164209	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017307	CGCT	2	8	165404	165411	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017307	GGCT	2	8	165462	165469	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017307	TTAT	2	8	165992	165999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017307	TGTT	2	8	169192	169199	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017307	TCCC	2	8	169462	169469	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_017307	TGCT	2	8	171154	171161	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017307	AAAT	2	8	171433	171440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017307	GGAC	2	8	171695	171702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017307	TGAA	2	8	171710	171717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017307	GCAT	2	8	172223	172230	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017307	AGTC	2	8	172525	172532	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017307	ACTT	2	8	172589	172596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017307	GTTT	2	8	172958	172965	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017307	CTGG	2	8	173991	173998	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017307	CCAA	2	8	174174	174181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017307	TCTG	2	8	174242	174249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017307	GGAC	2	8	174518	174525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017307	ATAG	2	8	175159	175166	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017307	ATTA	2	8	178907	178914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017307	AGCC	2	8	182050	182057	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017307	ATCT	2	8	183926	183933	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017307	ATCT	2	8	184991	184998	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017307	AGCA	2	8	191582	191589	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017307	CAGT	2	8	193150	193157	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017307	TTAA	2	8	194513	194520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017307	ACGC	2	8	194627	194634	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017307	ATGG	2	8	194736	194743	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017307	TCAC	2	8	200773	200780	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017307	GTTC	2	8	208418	208425	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017307	TAGA	2	8	216850	216857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017307	GCCC	2	8	218680	218687	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_017307	GTCT	2	8	219036	219043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017307	AACT	2	8	229812	229819	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017307	TTCA	2	8	229823	229830	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017307	TCCT	2	8	231829	231836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017307	GATA	2	8	231944	231951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017307	GTAG	2	8	231958	231965	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017307	CCTA	2	8	231987	231994	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017307	AGCC	2	8	234905	234912	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017307	TTTA	2	8	237187	237194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017307	AGTT	2	8	246188	246195	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017307	ACTC	2	8	253927	253934	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017307	ATGA	2	8	254399	254406	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017307	ATTA	2	8	254462	254469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017307	GAAT	2	8	259077	259084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017307	TATT	2	8	261630	261637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017307	AGTC	2	8	261639	261646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017307	AACT	2	8	271702	271709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017307	CCTT	2	8	271791	271798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017307	CGTG	2	8	274292	274299	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017307	GCGG	2	8	274759	274766	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017307	GTAC	2	8	274825	274832	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017307	TCCC	2	8	280561	280568	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_017307	GCTT	2	8	286848	286855	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017307	CTCG	2	8	287942	287949	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017307	AAGG	2	8	287988	287995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017307	GCTG	2	8	304111	304118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017307	ATCG	2	8	305718	305725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017307	TGCC	2	8	306943	306950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017307	TAAC	2	8	309084	309091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017307	CCTT	2	8	313280	313287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017307	GCTT	2	8	315485	315492	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017307	TTAT	2	8	321286	321293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017307	AGGA	2	8	322706	322713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017307	GCTG	2	8	322896	322903	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017307	TTTA	2	8	322963	322970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017307	ATGG	2	8	323051	323058	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017307	AGCG	2	8	326662	326669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017307	GTAT	2	8	332493	332500	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017307	GGAT	2	8	340471	340478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017307	CAAC	2	8	341802	341809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017307	AGTA	2	8	342426	342433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017307	TTTC	2	8	342654	342661	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017307	GTCA	2	8	344471	344478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017307	TGGG	2	8	344521	344528	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017307	GAAT	2	8	349125	349132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017307	GCTT	2	8	349662	349669	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017307	TGGT	2	8	349739	349746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017307	AGTG	2	8	351011	351018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017307	TCCT	2	8	353241	353248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017307	GCCG	2	8	353322	353329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017307	ATTA	2	8	370126	370133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017307	AGAA	2	8	372290	372297	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017307	ATTA	2	8	372426	372433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017307	AAGA	2	8	375643	375650	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017307	ATCT	2	8	377087	377094	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017307	CATC	2	8	377333	377340	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017307	ATTT	3	12	377394	377405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017307	CATC	2	8	379359	379366	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017307	AAAC	2	8	379389	379396	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017307	AGAA	2	8	379486	379493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017307	ACCA	2	8	379591	379598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017307	CTTC	2	8	381131	381138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017307	ATAC	2	8	381139	381146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017307	AGCG	2	8	384197	384204	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017307	TCGC	2	8	396221	396228	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017307	ACTA	2	8	396231	396238	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017307	CTTG	2	8	396418	396425	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017307	TTTA	2	8	396725	396732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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