MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 42/02-A chromosome

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017306	AGCTTC	2	12	21470	21481	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017306	TTTTCT	2	12	22072	22083	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017306	GATGCC	2	12	69566	69577	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017306	CAGAAG	2	12	74760	74771	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017306	CTCACT	2	12	121051	121062	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017306	AGCCGA	2	12	131103	131114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017306	TGGGGC	2	12	182626	182637	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017306	GAAAAA	2	12	188052	188063	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017306	TTTGCC	2	12	321027	321038	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017306	ACGGTA	2	12	322099	322110	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017306	AATTTT	2	12	325360	325371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017306	TTCCTC	2	12	347101	347112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017306	GCTATA	2	12	378671	378682	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017306	ACGTTG	2	12	379200	379211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017306	TGAGTA	2	12	390466	390477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017306	CTAAAA	2	12	397554	397565	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017306	AAAAGC	2	12	408117	408128	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017306	CCGAGA	2	12	423210	423221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017306	AGGGCT	2	12	429767	429778	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017306	AGCTTT	2	12	469930	469941	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017306	GTGCCT	2	12	480589	480600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017306	TGGTTC	2	12	484001	484012	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017306	GCGCAA	2	12	524655	524666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017306	TGCTCG	2	12	584652	584663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017306	AAAAAG	2	12	613931	613942	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017306	GGGTGT	2	12	618583	618594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017306	GTTTTT	2	12	620619	620630	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017306	AGCGAA	2	12	621696	621707	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017306	CTGAGC	2	12	650965	650976	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017306	GGCTGC	2	12	770332	770343	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017306	GTTTTT	2	12	796407	796418	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017306	AGGGGT	2	12	874436	874447	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017306	CCGTGC	2	12	939386	939397	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017306	GACGGT	2	12	948397	948408	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017306	GTGGTT	2	12	966316	966327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017306	TTCTAC	2	12	1020331	1020342	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017306	GGCAGA	2	12	1020624	1020635	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017306	ATCGAT	2	12	1020733	1020744	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017306	GTCGAA	2	12	1022273	1022284	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017306	GGGTGT	2	12	1029609	1029620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017306	GTTTTT	2	12	1031645	1031656	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017306	AGCGAA	2	12	1032722	1032733	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017306	TCAACT	2	12	1085348	1085359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017306	TTTTAT	2	12	1137010	1137021	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017306	GATCGC	2	12	1138512	1138523	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017306	AGAAAA	2	12	1150871	1150882	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017306	TCTTTT	2	12	1150892	1150903	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017306	AAGCTC	2	12	1207591	1207602	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017306	CAAGAA	2	12	1289548	1289559	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017306	AATCTA	2	12	1416998	1417009	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017306	TATTTC	2	12	1431145	1431156	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017306	TACGCT	2	12	1442697	1442708	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017306	GACGGT	2	12	1450026	1450037	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017306	GTCTGT	2	12	1477757	1477768	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017306	AATTTC	2	12	1511189	1511200	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017306	TCCATT	2	12	1544357	1544368	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017306	CTGTGC	2	12	1551574	1551585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017306	GTCGTA	2	12	1592099	1592110	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017306	AGCTGG	2	12	1600424	1600435	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017306	TTAGCG	2	12	1745880	1745891	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017306	ATTTTT	2	12	1754035	1754046	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017306	ATTGAC	2	12	1761803	1761814	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017306	ACCCCT	2	12	1769070	1769081	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017306	AAAAGA	2	12	1814982	1814993	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017306	AGCTTT	2	12	1816181	1816192	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017306	ACCTTT	2	12	1835580	1835591	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017306	AGTGGT	2	12	1840424	1840435	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017306	CAAAGG	2	12	1846293	1846304	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017306	TTCGCT	2	12	1857687	1857698	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017306	AAAAAC	2	12	1858764	1858775	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017306	CACCCA	2	12	1860801	1860812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017306	AGAACG	2	12	1905743	1905754	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017306	CAACGC	2	12	1912677	1912688	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017306	TAATTT	2	12	1935809	1935820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017306	CGCATA	2	12	1944784	1944795	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017306	AAACAA	2	12	1952176	1952187	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017306	CATTAT	2	12	1978551	1978562	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017306	ACAGCC	2	12	1982025	1982036	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017306	TTTTCA	2	12	1986393	1986404	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017306	TCCTTG	2	12	2032849	2032860	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017306	TAGGTG	2	12	2034961	2034972	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017306	ATACTC	2	12	2040960	2040971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017306	TACCCC	2	12	2043807	2043818	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017306	CATATA	2	12	2058449	2058460	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017306	ATGTTG	2	12	2065714	2065725	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017306	GATGAG	2	12	2066178	2066189	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017306	CAAGGA	2	12	2066267	2066278	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017306	TTCAAT	2	12	2071039	2071050	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017306	GCACGC	2	12	2072261	2072272	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017306	TCCTTA	2	12	2087587	2087598	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017306	AGGTCA	2	12	2088758	2088769	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017306	TTTAGT	2	12	2097393	2097404	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017306	CCCCCG	2	12	2124277	2124288	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
94	NC_017306	CATAGA	2	12	2189139	2189150	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017306	AGAAAA	2	12	2197480	2197491	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017306	CGATGC	2	12	2212476	2212487	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017306	TTCGCT	2	12	2230767	2230778	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017306	AAAAAC	2	12	2231844	2231855	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017306	CACCCA	2	12	2233881	2233892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017306	GAATAG	2	12	2240451	2240462	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017306	TGCCCA	2	12	2309870	2309881	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017306	TTTTCT	2	12	2327260	2327271	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.