MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 42/02-A chromosome

Total Repeats: 1299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017306	ACCAC	2	10	1693	1702	40 %	0 %	0 %	60 %	387135562
2	NC_017306	CACGC	2	10	5733	5742	20 %	0 %	20 %	60 %	387135566
3	NC_017306	TTATC	2	10	14084	14093	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017306	ACGTA	2	10	14247	14256	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017306	CAGTA	2	10	14630	14639	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017306	CAGTG	2	10	15501	15510	20 %	20 %	40 %	20 %	387135576
7	NC_017306	AAAAT	2	10	16761	16770	80 %	20 %	0 %	0 %	387135577
8	NC_017306	TAGCG	2	10	18329	18338	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017306	CTTTT	2	10	19236	19245	0 %	80 %	0 %	20 %	387135581
10	NC_017306	GCTCT	2	10	19273	19282	0 %	40 %	20 %	40 %	387135581
11	NC_017306	TGGAT	2	10	23214	23223	20 %	40 %	40 %	0 %	387135586
12	NC_017306	TGCGT	2	10	24498	24507	0 %	40 %	40 %	20 %	387135587
13	NC_017306	CTGAT	2	10	28529	28538	20 %	40 %	20 %	20 %	387135591
14	NC_017306	GGAGC	2	10	29482	29491	20 %	0 %	60 %	20 %	387135592
15	NC_017306	TTGCT	2	10	30570	30579	0 %	60 %	20 %	20 %	387135593
16	NC_017306	TGAGG	2	10	37403	37412	20 %	20 %	60 %	0 %	387135597
17	NC_017306	CACAT	2	10	39587	39596	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017306	TGCGG	2	10	40520	40529	0 %	20 %	60 %	20 %	387135601
19	NC_017306	GCCTC	2	10	47298	47307	0 %	20 %	20 %	60 %	387135607
20	NC_017306	GAAGG	2	10	47312	47321	40 %	0 %	60 %	0 %	387135607
21	NC_017306	CAGTG	2	10	49243	49252	20 %	20 %	40 %	20 %	387135609
22	NC_017306	TGAGA	2	10	49585	49594	40 %	20 %	40 %	0 %	387135609
23	NC_017306	AGTGA	2	10	49635	49644	40 %	20 %	40 %	0 %	387135609
24	NC_017306	GCGGT	2	10	51785	51794	0 %	20 %	60 %	20 %	387135612
25	NC_017306	TTGGA	2	10	52671	52680	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017306	TTGAT	2	10	52706	52715	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017306	TGCAC	2	10	52800	52809	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017306	CTGGC	2	10	53059	53068	0 %	20 %	40 %	40 %	387135614
29	NC_017306	GCAGC	2	10	53558	53567	20 %	0 %	40 %	40 %	387135614
30	NC_017306	GACTG	2	10	53574	53583	20 %	20 %	40 %	20 %	387135614
31	NC_017306	AAGGC	2	10	55815	55824	40 %	0 %	40 %	20 %	387135616
32	NC_017306	ATGGC	2	10	58675	58684	20 %	20 %	40 %	20 %	387135620
33	NC_017306	ATGTG	2	10	62844	62853	20 %	40 %	40 %	0 %	387135624
34	NC_017306	TCTGT	2	10	64664	64673	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017306	GCTGG	2	10	65005	65014	0 %	20 %	60 %	20 %	387135626
36	NC_017306	AGGGA	2	10	67613	67622	40 %	0 %	60 %	0 %	387135628
37	NC_017306	AAGAT	2	10	69420	69429	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017306	GGAGC	2	10	69527	69536	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017306	GGTCT	2	10	71241	71250	0 %	40 %	40 %	20 %	387135631
40	NC_017306	CATGT	2	10	71817	71826	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017306	CAGCG	2	10	72697	72706	20 %	0 %	40 %	40 %	387135632
42	NC_017306	CAGGC	2	10	73103	73112	20 %	0 %	40 %	40 %	387135632
43	NC_017306	ATGGC	2	10	73948	73957	20 %	20 %	40 %	20 %	387135633
44	NC_017306	AGGCA	2	10	75268	75277	40 %	0 %	40 %	20 %	387135634
45	NC_017306	TAATT	2	10	76514	76523	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017306	GCTTT	2	10	81109	81118	0 %	60 %	20 %	20 %	387135641
47	NC_017306	TGACC	2	10	81365	81374	20 %	20 %	20 %	40 %	387135641
48	NC_017306	CGTTA	2	10	82107	82116	20 %	40 %	20 %	20 %	387135642
49	NC_017306	TGCTG	2	10	82741	82750	0 %	40 %	40 %	20 %	387135642
50	NC_017306	TGGCC	2	10	84732	84741	0 %	20 %	40 %	40 %	387135643
51	NC_017306	GCGAC	2	10	85536	85545	20 %	0 %	40 %	40 %	387135643
52	NC_017306	TGGGA	2	10	88951	88960	20 %	20 %	60 %	0 %	387135649
53	NC_017306	GATCG	2	10	90050	90059	20 %	20 %	40 %	20 %	387135651
54	NC_017306	CAAAA	2	10	90782	90791	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017306	AACAA	2	10	93623	93632	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017306	TGCAA	2	10	96630	96639	40 %	20 %	20 %	20 %	387135656
57	NC_017306	TGCAG	2	10	96850	96859	20 %	20 %	40 %	20 %	387135656
58	NC_017306	AGGTC	2	10	99286	99295	20 %	20 %	40 %	20 %	387135659
59	NC_017306	ACCAA	2	10	101145	101154	60 %	0 %	0 %	40 %	387135659
60	NC_017306	TCATC	2	10	102408	102417	20 %	40 %	0 %	40 %	387135660
61	NC_017306	TGCAC	2	10	104223	104232	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017306	ACCTG	2	10	104438	104447	20 %	20 %	20 %	40 %	387135661
63	NC_017306	CGGTG	2	10	104647	104656	0 %	20 %	60 %	20 %	387135661
64	NC_017306	CGGCG	2	10	107266	107275	0 %	0 %	60 %	40 %	387135664
65	NC_017306	CGCGG	2	10	107326	107335	0 %	0 %	60 %	40 %	387135665
66	NC_017306	CAGCG	2	10	107862	107871	20 %	0 %	40 %	40 %	387135666
67	NC_017306	GGATC	2	10	118428	118437	20 %	20 %	40 %	20 %	387135676
68	NC_017306	TGTTT	2	10	120901	120910	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017306	CGGGA	2	10	125545	125554	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017306	GACTG	2	10	127806	127815	20 %	20 %	40 %	20 %	387135682
71	NC_017306	TTGGT	2	10	129115	129124	0 %	60 %	40 %	0 %	387135682
72	NC_017306	TTAAG	2	10	130899	130908	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017306	GTGCG	2	10	131439	131448	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017306	GTGGC	2	10	133176	133185	0 %	20 %	60 %	20 %	387135684
75	NC_017306	CGCGT	2	10	133496	133505	0 %	20 %	40 %	40 %	387135685
76	NC_017306	GGGGC	2	10	133624	133633	0 %	0 %	80 %	20 %	387135685
77	NC_017306	AGACG	2	10	135429	135438	40 %	0 %	40 %	20 %	387135687
78	NC_017306	GGGGC	2	10	135647	135656	0 %	0 %	80 %	20 %	387135688
79	NC_017306	ACGGT	2	10	136802	136811	20 %	20 %	40 %	20 %	387135689
80	NC_017306	CGATC	2	10	137075	137084	20 %	20 %	20 %	40 %	387135689
81	NC_017306	TGGCC	2	10	137282	137291	0 %	20 %	40 %	40 %	387135689
82	NC_017306	TGGTG	2	10	137660	137669	0 %	40 %	60 %	0 %	387135689
83	NC_017306	GGAGT	2	10	138132	138141	20 %	20 %	60 %	0 %	387135689
84	NC_017306	ATTGC	2	10	142066	142075	20 %	40 %	20 %	20 %	387135692
85	NC_017306	AAAAC	2	10	144892	144901	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017306	TCACT	2	10	145937	145946	20 %	40 %	0 %	40 %	387135697
87	NC_017306	ATTTC	2	10	146554	146563	20 %	60 %	0 %	20 %	387135697
88	NC_017306	AATGG	2	10	150254	150263	40 %	20 %	40 %	0 %	387135700
89	NC_017306	GTGAG	2	10	151237	151246	20 %	20 %	60 %	0 %	387135702
90	NC_017306	CTGAA	2	10	152035	152044	40 %	20 %	20 %	20 %	387135702
91	NC_017306	CCAGC	2	10	153327	153336	20 %	0 %	20 %	60 %	387135703
92	NC_017306	TTGCC	2	10	153837	153846	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017306	GTACC	2	10	155796	155805	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017306	TACGC	2	10	156353	156362	20 %	20 %	20 %	40 %	387135705
95	NC_017306	GCGAC	2	10	159847	159856	20 %	0 %	40 %	40 %	387135710
96	NC_017306	GGTTG	2	10	161123	161132	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017306	CCTTG	2	10	161499	161508	0 %	40 %	20 %	40 %	387135711
98	NC_017306	GCATA	2	10	163223	163232	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017306	TGTGC	2	10	164446	164455	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017306	CGGTG	2	10	165471	165480	0 %	20 %	60 %	20 %	387135714
101	NC_017306	CATGG	2	10	167604	167613	20 %	20 %	40 %	20 %	387135716
102	NC_017306	CAGAT	2	10	167960	167969	40 %	20 %	20 %	20 %	387135716
103	NC_017306	GGATG	2	10	168858	168867	20 %	20 %	60 %	0 %	387135716
104	NC_017306	GGGAC	2	10	171484	171493	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017306	CACTT	2	10	171664	171673	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017306	AAACT	2	10	172542	172551	60 %	20 %	0 %	20 %	387135718
107	NC_017306	ACCGG	2	10	172937	172946	20 %	0 %	40 %	40 %	387135718
108	NC_017306	ATTGA	2	10	178747	178756	40 %	40 %	20 %	0 %	387135722
109	NC_017306	GTGGA	2	10	181156	181165	20 %	20 %	60 %	0 %	387135723
110	NC_017306	TTAAG	2	10	184488	184497	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017306	TGACC	2	10	185406	185415	20 %	20 %	20 %	40 %	387135726
112	NC_017306	AGGTG	2	10	186359	186368	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017306	TTGCA	2	10	186692	186701	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017306	GTTTG	2	10	188631	188640	0 %	60 %	40 %	0 %	387135731
115	NC_017306	CGGAT	2	10	189571	189580	20 %	20 %	40 %	20 %	387135732
116	NC_017306	AGCGC	2	10	190729	190738	20 %	0 %	40 %	40 %	387135733
117	NC_017306	GCAGT	2	10	192216	192225	20 %	20 %	40 %	20 %	387135734
118	NC_017306	CAATG	2	10	192487	192496	40 %	20 %	20 %	20 %	387135734
119	NC_017306	TAACG	2	10	193462	193471	40 %	20 %	20 %	20 %	387135735
120	NC_017306	AAGCC	2	10	194789	194798	40 %	0 %	20 %	40 %	387135736
121	NC_017306	GGCCC	2	10	196861	196870	0 %	0 %	40 %	60 %	387135739
122	NC_017306	GAATT	2	10	200426	200435	40 %	40 %	20 %	0 %	387135744
123	NC_017306	CAAGG	2	10	201315	201324	40 %	0 %	40 %	20 %	387135744
124	NC_017306	GATGG	2	10	203764	203773	20 %	20 %	60 %	0 %	387135745
125	NC_017306	TGGCG	2	10	204498	204507	0 %	20 %	60 %	20 %	387135746
126	NC_017306	TGCCA	2	10	206521	206530	20 %	20 %	20 %	40 %	387135747
127	NC_017306	AAATA	2	10	206623	206632	80 %	20 %	0 %	0 %	387135747
128	NC_017306	ATTCT	2	10	207219	207228	20 %	60 %	0 %	20 %	387135748
129	NC_017306	CAGGC	2	10	212036	212045	20 %	0 %	40 %	40 %	387135751
130	NC_017306	TTGTA	2	10	212446	212455	20 %	60 %	20 %	0 %	387135752
131	NC_017306	GCGAC	2	10	216962	216971	20 %	0 %	40 %	40 %	387135757
132	NC_017306	AGATC	2	10	216987	216996	40 %	20 %	20 %	20 %	387135757
133	NC_017306	CAAGG	2	10	217901	217910	40 %	0 %	40 %	20 %	387135758
134	NC_017306	AGAAA	2	10	218630	218639	80 %	0 %	20 %	0 %	387135759
135	NC_017306	CGGGG	2	10	224664	224673	0 %	0 %	80 %	20 %	387135766
136	NC_017306	GAAAA	2	10	224803	224812	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017306	CGAGA	2	10	225443	225452	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017306	TGCGC	2	10	227104	227113	0 %	20 %	40 %	40 %	387135769
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151	NC_017306	GCCAT	2	10	244903	244912	20 %	20 %	20 %	40 %	387135784
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158	NC_017306	CCGTG	2	10	255513	255522	0 %	20 %	40 %	40 %	387135792
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266	NC_017306	GGTGG	2	10	451435	451444	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
267	NC_017306	GCATC	2	10	452718	452727	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
268	NC_017306	CGCAA	2	10	452898	452907	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
269	NC_017306	GCTGT	2	10	453665	453674	0 %	40 %	40 %	20 %	387135983
270	NC_017306	CGATC	2	10	453793	453802	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
271	NC_017306	TGCGC	2	10	453936	453945	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
272	NC_017306	GACCT	2	10	455893	455902	20 %	20 %	20 %	40 %	387135985
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499	NC_017306	CCTTG	2	10	850668	850677	0 %	40 %	20 %	40 %	387136334
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