MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 42/02-A chromosome

Total Repeats: 1036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017306	ACCAC	2	10	1693	1702	40 %	0 %	0 %	60 %	387135562
2	NC_017306	CACGC	2	10	5733	5742	20 %	0 %	20 %	60 %	387135566
3	NC_017306	CAGTG	2	10	15501	15510	20 %	20 %	40 %	20 %	387135576
4	NC_017306	AAAAT	2	10	16761	16770	80 %	20 %	0 %	0 %	387135577
5	NC_017306	CTTTT	2	10	19236	19245	0 %	80 %	0 %	20 %	387135581
6	NC_017306	GCTCT	2	10	19273	19282	0 %	40 %	20 %	40 %	387135581
7	NC_017306	TGGAT	2	10	23214	23223	20 %	40 %	40 %	0 %	387135586
8	NC_017306	TGCGT	2	10	24498	24507	0 %	40 %	40 %	20 %	387135587
9	NC_017306	CTGAT	2	10	28529	28538	20 %	40 %	20 %	20 %	387135591
10	NC_017306	GGAGC	2	10	29482	29491	20 %	0 %	60 %	20 %	387135592
11	NC_017306	TTGCT	2	10	30570	30579	0 %	60 %	20 %	20 %	387135593
12	NC_017306	TGAGG	2	10	37403	37412	20 %	20 %	60 %	0 %	387135597
13	NC_017306	TGCGG	2	10	40520	40529	0 %	20 %	60 %	20 %	387135601
14	NC_017306	GCCTC	2	10	47298	47307	0 %	20 %	20 %	60 %	387135607
15	NC_017306	GAAGG	2	10	47312	47321	40 %	0 %	60 %	0 %	387135607
16	NC_017306	CAGTG	2	10	49243	49252	20 %	20 %	40 %	20 %	387135609
17	NC_017306	TGAGA	2	10	49585	49594	40 %	20 %	40 %	0 %	387135609
18	NC_017306	AGTGA	2	10	49635	49644	40 %	20 %	40 %	0 %	387135609
19	NC_017306	GCGGT	2	10	51785	51794	0 %	20 %	60 %	20 %	387135612
20	NC_017306	CTGGC	2	10	53059	53068	0 %	20 %	40 %	40 %	387135614
21	NC_017306	GCAGC	2	10	53558	53567	20 %	0 %	40 %	40 %	387135614
22	NC_017306	GACTG	2	10	53574	53583	20 %	20 %	40 %	20 %	387135614
23	NC_017306	AAGGC	2	10	55815	55824	40 %	0 %	40 %	20 %	387135616
24	NC_017306	ATGGC	2	10	58675	58684	20 %	20 %	40 %	20 %	387135620
25	NC_017306	ATGTG	2	10	62844	62853	20 %	40 %	40 %	0 %	387135624
26	NC_017306	GCTGG	2	10	65005	65014	0 %	20 %	60 %	20 %	387135626
27	NC_017306	AGGGA	2	10	67613	67622	40 %	0 %	60 %	0 %	387135628
28	NC_017306	GGTCT	2	10	71241	71250	0 %	40 %	40 %	20 %	387135631
29	NC_017306	CAGCG	2	10	72697	72706	20 %	0 %	40 %	40 %	387135632
30	NC_017306	CAGGC	2	10	73103	73112	20 %	0 %	40 %	40 %	387135632
31	NC_017306	ATGGC	2	10	73948	73957	20 %	20 %	40 %	20 %	387135633
32	NC_017306	AGGCA	2	10	75268	75277	40 %	0 %	40 %	20 %	387135634
33	NC_017306	GCTTT	2	10	81109	81118	0 %	60 %	20 %	20 %	387135641
34	NC_017306	TGACC	2	10	81365	81374	20 %	20 %	20 %	40 %	387135641
35	NC_017306	CGTTA	2	10	82107	82116	20 %	40 %	20 %	20 %	387135642
36	NC_017306	TGCTG	2	10	82741	82750	0 %	40 %	40 %	20 %	387135642
37	NC_017306	TGGCC	2	10	84732	84741	0 %	20 %	40 %	40 %	387135643
38	NC_017306	GCGAC	2	10	85536	85545	20 %	0 %	40 %	40 %	387135643
39	NC_017306	TGGGA	2	10	88951	88960	20 %	20 %	60 %	0 %	387135649
40	NC_017306	GATCG	2	10	90050	90059	20 %	20 %	40 %	20 %	387135651
41	NC_017306	TGCAA	2	10	96630	96639	40 %	20 %	20 %	20 %	387135656
42	NC_017306	TGCAG	2	10	96850	96859	20 %	20 %	40 %	20 %	387135656
43	NC_017306	AGGTC	2	10	99286	99295	20 %	20 %	40 %	20 %	387135659
44	NC_017306	ACCAA	2	10	101145	101154	60 %	0 %	0 %	40 %	387135659
45	NC_017306	TCATC	2	10	102408	102417	20 %	40 %	0 %	40 %	387135660
46	NC_017306	ACCTG	2	10	104438	104447	20 %	20 %	20 %	40 %	387135661
47	NC_017306	CGGTG	2	10	104647	104656	0 %	20 %	60 %	20 %	387135661
48	NC_017306	CGGCG	2	10	107266	107275	0 %	0 %	60 %	40 %	387135664
49	NC_017306	CGCGG	2	10	107326	107335	0 %	0 %	60 %	40 %	387135665
50	NC_017306	CAGCG	2	10	107862	107871	20 %	0 %	40 %	40 %	387135666
51	NC_017306	GGATC	2	10	118428	118437	20 %	20 %	40 %	20 %	387135676
52	NC_017306	GACTG	2	10	127806	127815	20 %	20 %	40 %	20 %	387135682
53	NC_017306	TTGGT	2	10	129115	129124	0 %	60 %	40 %	0 %	387135682
54	NC_017306	GTGGC	2	10	133176	133185	0 %	20 %	60 %	20 %	387135684
55	NC_017306	CGCGT	2	10	133496	133505	0 %	20 %	40 %	40 %	387135685
56	NC_017306	GGGGC	2	10	133624	133633	0 %	0 %	80 %	20 %	387135685
57	NC_017306	AGACG	2	10	135429	135438	40 %	0 %	40 %	20 %	387135687
58	NC_017306	GGGGC	2	10	135647	135656	0 %	0 %	80 %	20 %	387135688
59	NC_017306	ACGGT	2	10	136802	136811	20 %	20 %	40 %	20 %	387135689
60	NC_017306	CGATC	2	10	137075	137084	20 %	20 %	20 %	40 %	387135689
61	NC_017306	TGGCC	2	10	137282	137291	0 %	20 %	40 %	40 %	387135689
62	NC_017306	TGGTG	2	10	137660	137669	0 %	40 %	60 %	0 %	387135689
63	NC_017306	GGAGT	2	10	138132	138141	20 %	20 %	60 %	0 %	387135689
64	NC_017306	ATTGC	2	10	142066	142075	20 %	40 %	20 %	20 %	387135692
65	NC_017306	TCACT	2	10	145937	145946	20 %	40 %	0 %	40 %	387135697
66	NC_017306	ATTTC	2	10	146554	146563	20 %	60 %	0 %	20 %	387135697
67	NC_017306	AATGG	2	10	150254	150263	40 %	20 %	40 %	0 %	387135700
68	NC_017306	GTGAG	2	10	151237	151246	20 %	20 %	60 %	0 %	387135702
69	NC_017306	CTGAA	2	10	152035	152044	40 %	20 %	20 %	20 %	387135702
70	NC_017306	CCAGC	2	10	153327	153336	20 %	0 %	20 %	60 %	387135703
71	NC_017306	TACGC	2	10	156353	156362	20 %	20 %	20 %	40 %	387135705
72	NC_017306	GCGAC	2	10	159847	159856	20 %	0 %	40 %	40 %	387135710
73	NC_017306	CCTTG	2	10	161499	161508	0 %	40 %	20 %	40 %	387135711
74	NC_017306	CGGTG	2	10	165471	165480	0 %	20 %	60 %	20 %	387135714
75	NC_017306	CATGG	2	10	167604	167613	20 %	20 %	40 %	20 %	387135716
76	NC_017306	CAGAT	2	10	167960	167969	40 %	20 %	20 %	20 %	387135716
77	NC_017306	GGATG	2	10	168858	168867	20 %	20 %	60 %	0 %	387135716
78	NC_017306	AAACT	2	10	172542	172551	60 %	20 %	0 %	20 %	387135718
79	NC_017306	ACCGG	2	10	172937	172946	20 %	0 %	40 %	40 %	387135718
80	NC_017306	ATTGA	2	10	178747	178756	40 %	40 %	20 %	0 %	387135722
81	NC_017306	GTGGA	2	10	181156	181165	20 %	20 %	60 %	0 %	387135723
82	NC_017306	TGACC	2	10	185406	185415	20 %	20 %	20 %	40 %	387135726
83	NC_017306	GTTTG	2	10	188631	188640	0 %	60 %	40 %	0 %	387135731
84	NC_017306	CGGAT	2	10	189571	189580	20 %	20 %	40 %	20 %	387135732
85	NC_017306	AGCGC	2	10	190729	190738	20 %	0 %	40 %	40 %	387135733
86	NC_017306	GCAGT	2	10	192216	192225	20 %	20 %	40 %	20 %	387135734
87	NC_017306	CAATG	2	10	192487	192496	40 %	20 %	20 %	20 %	387135734
88	NC_017306	TAACG	2	10	193462	193471	40 %	20 %	20 %	20 %	387135735
89	NC_017306	AAGCC	2	10	194789	194798	40 %	0 %	20 %	40 %	387135736
90	NC_017306	GGCCC	2	10	196861	196870	0 %	0 %	40 %	60 %	387135739
91	NC_017306	GAATT	2	10	200426	200435	40 %	40 %	20 %	0 %	387135744
92	NC_017306	CAAGG	2	10	201315	201324	40 %	0 %	40 %	20 %	387135744
93	NC_017306	GATGG	2	10	203764	203773	20 %	20 %	60 %	0 %	387135745
94	NC_017306	TGGCG	2	10	204498	204507	0 %	20 %	60 %	20 %	387135746
95	NC_017306	TGCCA	2	10	206521	206530	20 %	20 %	20 %	40 %	387135747
96	NC_017306	AAATA	2	10	206623	206632	80 %	20 %	0 %	0 %	387135747
97	NC_017306	ATTCT	2	10	207219	207228	20 %	60 %	0 %	20 %	387135748
98	NC_017306	CAGGC	2	10	212036	212045	20 %	0 %	40 %	40 %	387135751
99	NC_017306	TTGTA	2	10	212446	212455	20 %	60 %	20 %	0 %	387135752
100	NC_017306	GCGAC	2	10	216962	216971	20 %	0 %	40 %	40 %	387135757
101	NC_017306	AGATC	2	10	216987	216996	40 %	20 %	20 %	20 %	387135757
102	NC_017306	CAAGG	2	10	217901	217910	40 %	0 %	40 %	20 %	387135758
103	NC_017306	AGAAA	2	10	218630	218639	80 %	0 %	20 %	0 %	387135759
104	NC_017306	CGGGG	2	10	224664	224673	0 %	0 %	80 %	20 %	387135766
105	NC_017306	TGCGC	2	10	227104	227113	0 %	20 %	40 %	40 %	387135769
106	NC_017306	CACTG	2	10	228264	228273	20 %	20 %	20 %	40 %	387135770
107	NC_017306	CATTG	2	10	228953	228962	20 %	40 %	20 %	20 %	387135771
108	NC_017306	CGCAA	2	10	229767	229776	40 %	0 %	20 %	40 %	387135774
109	NC_017306	GATCG	2	10	230085	230094	20 %	20 %	40 %	20 %	387135775
110	NC_017306	CAAGA	2	10	231997	232006	60 %	0 %	20 %	20 %	387135775
111	NC_017306	TGGCT	2	10	232193	232202	0 %	40 %	40 %	20 %	387135775
112	NC_017306	CTGTG	2	10	233512	233521	0 %	40 %	40 %	20 %	387135777
113	NC_017306	GCCGT	2	10	234913	234922	0 %	20 %	40 %	40 %	387135777
114	NC_017306	AGAAA	2	10	235820	235829	80 %	0 %	20 %	0 %	387135777
115	NC_017306	AGAGT	2	10	239247	239256	40 %	20 %	40 %	0 %	387135779
116	NC_017306	TTTTG	2	10	241546	241555	0 %	80 %	20 %	0 %	387135781
117	NC_017306	GCCAT	2	10	244903	244912	20 %	20 %	20 %	40 %	387135784
118	NC_017306	CGCAG	2	10	247959	247968	20 %	0 %	40 %	40 %	387135787
119	NC_017306	CATGC	2	10	249730	249739	20 %	20 %	20 %	40 %	387135788
120	NC_017306	CCATG	2	10	249961	249970	20 %	20 %	20 %	40 %	387135788
121	NC_017306	AATTG	2	10	250134	250143	40 %	40 %	20 %	0 %	387135788
122	NC_017306	CCCCG	2	10	254786	254795	0 %	0 %	20 %	80 %	387135792
123	NC_017306	GAAGT	2	10	255327	255336	40 %	20 %	40 %	0 %	387135792
124	NC_017306	CCGTG	2	10	255513	255522	0 %	20 %	40 %	40 %	387135792
125	NC_017306	TGCTC	2	10	260453	260462	0 %	40 %	20 %	40 %	387135796
126	NC_017306	TTGGA	2	10	262371	262380	20 %	40 %	40 %	0 %	387135798
127	NC_017306	GGCTC	2	10	262693	262702	0 %	20 %	40 %	40 %	387135799
128	NC_017306	TCCTT	2	10	263423	263432	0 %	60 %	0 %	40 %	387135800
129	NC_017306	GGAAG	2	10	264109	264118	40 %	0 %	60 %	0 %	387135801
130	NC_017306	CCATG	2	10	265496	265505	20 %	20 %	20 %	40 %	387135803
131	NC_017306	TTGCC	2	10	265583	265592	0 %	40 %	20 %	40 %	387135803
132	NC_017306	GAATG	2	10	268925	268934	40 %	20 %	40 %	0 %	387135805
133	NC_017306	GGTGT	2	10	269680	269689	0 %	40 %	60 %	0 %	387135806
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