MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 42/02-A chromosome

Total Repeats: 4946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017306	TTCC	2	8	709	716	0 %	50 %	0 %	50 %	387135562
2	NC_017306	AGCC	2	8	856	863	25 %	0 %	25 %	50 %	387135562
3	NC_017306	ATGC	2	8	921	928	25 %	25 %	25 %	25 %	387135562
4	NC_017306	CAGG	2	8	1028	1035	25 %	0 %	50 %	25 %	387135562
5	NC_017306	TACG	2	8	1222	1229	25 %	25 %	25 %	25 %	387135562
6	NC_017306	GATG	2	8	1559	1566	25 %	25 %	50 %	0 %	387135562
7	NC_017306	TAAA	2	8	1828	1835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017306	GAAG	2	8	2427	2434	50 %	0 %	50 %	0 %	387135563
9	NC_017306	CCCA	2	8	2482	2489	25 %	0 %	0 %	75 %	387135563
10	NC_017306	CTGC	2	8	2767	2774	0 %	25 %	25 %	50 %	387135563
11	NC_017306	GAAA	2	8	3253	3260	75 %	0 %	25 %	0 %	387135563
12	NC_017306	TTAC	2	8	3396	3403	25 %	50 %	0 %	25 %	387135563
13	NC_017306	TCGT	2	8	3681	3688	0 %	50 %	25 %	25 %	387135564
14	NC_017306	AAGG	2	8	4837	4844	50 %	0 %	50 %	0 %	387135564
15	NC_017306	ATAC	2	8	5412	5419	50 %	25 %	0 %	25 %	387135565
16	NC_017306	ATGC	2	8	5814	5821	25 %	25 %	25 %	25 %	387135566
17	NC_017306	TCGC	2	8	8248	8255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017306	GAAA	2	8	8468	8475	75 %	0 %	25 %	0 %	387135569
19	NC_017306	ACTC	2	8	9475	9482	25 %	25 %	0 %	50 %	387135571
20	NC_017306	CAAC	2	8	9633	9640	50 %	0 %	0 %	50 %	387135571
21	NC_017306	GCAT	2	8	9728	9735	25 %	25 %	25 %	25 %	387135571
22	NC_017306	CACG	2	8	10759	10766	25 %	0 %	25 %	50 %	387135571
23	NC_017306	TTAG	2	8	11985	11992	25 %	50 %	25 %	0 %	387135572
24	NC_017306	TCGC	2	8	12463	12470	0 %	25 %	25 %	50 %	387135573
25	NC_017306	GGAT	2	8	12473	12480	25 %	25 %	50 %	0 %	387135573
26	NC_017306	TTCC	2	8	12740	12747	0 %	50 %	0 %	50 %	387135573
27	NC_017306	GCTA	2	8	12808	12815	25 %	25 %	25 %	25 %	387135573
28	NC_017306	GCCT	2	8	12827	12834	0 %	25 %	25 %	50 %	387135573
29	NC_017306	TTGT	2	8	13534	13541	0 %	75 %	25 %	0 %	387135574
30	NC_017306	GCCC	2	8	13684	13691	0 %	0 %	25 %	75 %	387135574
31	NC_017306	AGTG	2	8	13933	13940	25 %	25 %	50 %	0 %	387135574
32	NC_017306	TGGG	2	8	14427	14434	0 %	25 %	75 %	0 %	387135575
33	NC_017306	AATC	2	8	14957	14964	50 %	25 %	0 %	25 %	387135576
34	NC_017306	AAAG	2	8	15049	15056	75 %	0 %	25 %	0 %	387135576
35	NC_017306	AGCT	2	8	15348	15355	25 %	25 %	25 %	25 %	387135576
36	NC_017306	AAGG	2	8	15668	15675	50 %	0 %	50 %	0 %	387135576
37	NC_017306	TTTA	2	8	16065	16072	25 %	75 %	0 %	0 %	387135577
38	NC_017306	GCCA	2	8	16974	16981	25 %	0 %	25 %	50 %	387135578
39	NC_017306	GCTT	2	8	17831	17838	0 %	50 %	25 %	25 %	387135579
40	NC_017306	ACCG	2	8	18833	18840	25 %	0 %	25 %	50 %	387135580
41	NC_017306	CAAT	2	8	19219	19226	50 %	25 %	0 %	25 %	387135581
42	NC_017306	GAAA	2	8	20225	20232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017306	CGTG	2	8	20896	20903	0 %	25 %	50 %	25 %	387135583
44	NC_017306	TCCC	2	8	21083	21090	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_017306	TTCC	2	8	21948	21955	0 %	50 %	0 %	50 %	387135584
46	NC_017306	TACC	2	8	22255	22262	25 %	25 %	0 %	50 %	387135585
47	NC_017306	AGCG	2	8	23046	23053	25 %	0 %	50 %	25 %	387135586
48	NC_017306	TTGA	2	8	23235	23242	25 %	50 %	25 %	0 %	387135586
49	NC_017306	TCAT	2	8	23816	23823	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017306	TGAT	2	8	23834	23841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017306	CCTG	2	8	24580	24587	0 %	25 %	25 %	50 %	387135587
52	NC_017306	GGTG	2	8	24974	24981	0 %	25 %	75 %	0 %	387135587
53	NC_017306	TGAG	2	8	25491	25498	25 %	25 %	50 %	0 %	387135588
54	NC_017306	GGTG	2	8	25684	25691	0 %	25 %	75 %	0 %	387135588
55	NC_017306	AATT	2	8	27656	27663	50 %	50 %	0 %	0 %	387135590
56	NC_017306	TGGA	2	8	27813	27820	25 %	25 %	50 %	0 %	387135590
57	NC_017306	GAAG	2	8	27968	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	387135590
58	NC_017306	GAAA	2	8	28629	28636	75 %	0 %	25 %	0 %	387135591
59	NC_017306	CTTC	2	8	28638	28645	0 %	50 %	0 %	50 %	387135591
60	NC_017306	AGAA	2	8	28670	28677	75 %	0 %	25 %	0 %	387135591
61	NC_017306	GCTA	2	8	29129	29136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017306	TGAG	2	8	29777	29784	25 %	25 %	50 %	0 %	387135593
63	NC_017306	GTAC	2	8	29978	29985	25 %	25 %	25 %	25 %	387135593
64	NC_017306	GATC	2	8	30587	30594	25 %	25 %	25 %	25 %	387135593
65	NC_017306	GGAA	2	8	31725	31732	50 %	0 %	50 %	0 %	387135594
66	NC_017306	TGGC	2	8	31987	31994	0 %	25 %	50 %	25 %	387135594
67	NC_017306	GGTT	2	8	32232	32239	0 %	50 %	50 %	0 %	387135594
68	NC_017306	CTGA	2	8	32264	32271	25 %	25 %	25 %	25 %	387135594
69	NC_017306	GGAC	2	8	33588	33595	25 %	0 %	50 %	25 %	387135595
70	NC_017306	GATA	2	8	34334	34341	50 %	25 %	25 %	0 %	387135595
71	NC_017306	TAAC	2	8	35723	35730	50 %	25 %	0 %	25 %	387135596
72	NC_017306	CAAG	2	8	35927	35934	50 %	0 %	25 %	25 %	387135596
73	NC_017306	CAGG	2	8	36342	36349	25 %	0 %	50 %	25 %	387135597
74	NC_017306	GCCC	2	8	36531	36538	0 %	0 %	25 %	75 %	387135597
75	NC_017306	TGGC	2	8	36651	36658	0 %	25 %	50 %	25 %	387135597
76	NC_017306	TGGT	2	8	37553	37560	0 %	50 %	50 %	0 %	387135598
77	NC_017306	GCTT	2	8	37801	37808	0 %	50 %	25 %	25 %	387135598
78	NC_017306	TACT	2	8	39036	39043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017306	AAGA	2	8	39118	39125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017306	TGCG	2	8	39568	39575	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017306	AAAG	2	8	39901	39908	75 %	0 %	25 %	0 %	387135600
82	NC_017306	TAGA	2	8	40147	40154	50 %	25 %	25 %	0 %	387135600
83	NC_017306	TAAG	2	8	40287	40294	50 %	25 %	25 %	0 %	387135600
84	NC_017306	CAAG	2	8	40508	40515	50 %	0 %	25 %	25 %	387135601
85	NC_017306	GCTG	2	8	41456	41463	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017306	GCTG	2	8	41556	41563	0 %	25 %	50 %	25 %	387135603
87	NC_017306	ATCA	2	8	41968	41975	50 %	25 %	0 %	25 %	387135603
88	NC_017306	ATGC	2	8	42352	42359	25 %	25 %	25 %	25 %	387135603
89	NC_017306	CCGG	2	8	43267	43274	0 %	0 %	50 %	50 %	387135604
90	NC_017306	CGCC	2	8	43865	43872	0 %	0 %	25 %	75 %	387135605
91	NC_017306	ATGC	2	8	43930	43937	25 %	25 %	25 %	25 %	387135605
92	NC_017306	AATG	2	8	44452	44459	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017306	GGAA	3	12	44630	44641	50 %	0 %	50 %	0 %	387135606
94	NC_017306	AGCC	2	8	45559	45566	25 %	0 %	25 %	50 %	387135606
95	NC_017306	AAAT	2	8	46096	46103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017306	TTGC	2	8	47825	47832	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017306	ATTA	2	8	47900	47907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017306	ATAC	2	8	48803	48810	50 %	25 %	0 %	25 %	387135609
99	NC_017306	TGCG	2	8	48915	48922	0 %	25 %	50 %	25 %	387135609
100	NC_017306	GTTT	2	8	50902	50909	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017306	TCAT	2	8	51228	51235	25 %	50 %	0 %	25 %	387135611
102	NC_017306	ATCG	2	8	51464	51471	25 %	25 %	25 %	25 %	387135611
103	NC_017306	CGAT	2	8	51941	51948	25 %	25 %	25 %	25 %	387135612
104	NC_017306	ATGA	2	8	52075	52082	50 %	25 %	25 %	0 %	387135612
105	NC_017306	CTGG	2	8	52476	52483	0 %	25 %	50 %	25 %	387135613
106	NC_017306	ATGC	2	8	53797	53804	25 %	25 %	25 %	25 %	387135614
107	NC_017306	TGAT	2	8	54031	54038	25 %	50 %	25 %	0 %	387135614
108	NC_017306	CAAG	2	8	54116	54123	50 %	0 %	25 %	25 %	387135614
109	NC_017306	ACTT	2	8	54207	54214	25 %	50 %	0 %	25 %	387135614
110	NC_017306	CCGT	2	8	55311	55318	0 %	25 %	25 %	50 %	387135615
111	NC_017306	AGCA	2	8	55499	55506	50 %	0 %	25 %	25 %	387135616
112	NC_017306	GCGG	2	8	56578	56585	0 %	0 %	75 %	25 %	387135617
113	NC_017306	CGAC	2	8	56719	56726	25 %	0 %	25 %	50 %	387135618
114	NC_017306	CATC	2	8	57038	57045	25 %	25 %	0 %	50 %	387135618
115	NC_017306	GAGG	2	8	57251	57258	25 %	0 %	75 %	0 %	387135618
116	NC_017306	ATTG	2	8	57586	57593	25 %	50 %	25 %	0 %	387135618
117	NC_017306	TTGG	2	8	57811	57818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017306	AGGG	2	8	58575	58582	25 %	0 %	75 %	0 %	387135620
119	NC_017306	GCAC	2	8	59683	59690	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017306	TGAC	2	8	59730	59737	25 %	25 %	25 %	25 %	387135621
121	NC_017306	CGTT	2	8	59977	59984	0 %	50 %	25 %	25 %	387135621
122	NC_017306	AAAC	2	8	60023	60030	75 %	0 %	0 %	25 %	387135621
123	NC_017306	TCAT	2	8	60271	60278	25 %	50 %	0 %	25 %	387135621
124	NC_017306	TGCT	2	8	60764	60771	0 %	50 %	25 %	25 %	387135622
125	NC_017306	GTGC	2	8	61175	61182	0 %	25 %	50 %	25 %	387135623
126	NC_017306	CGTA	2	8	61307	61314	25 %	25 %	25 %	25 %	387135623
127	NC_017306	CTTT	2	8	61445	61452	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017306	ACCT	2	8	61936	61943	25 %	25 %	0 %	50 %	387135624
129	NC_017306	ATAC	2	8	62095	62102	50 %	25 %	0 %	25 %	387135624
130	NC_017306	CATG	2	8	62119	62126	25 %	25 %	25 %	25 %	387135624
131	NC_017306	GCGG	2	8	63096	63103	0 %	0 %	75 %	25 %	387135625
132	NC_017306	AACA	2	8	63127	63134	75 %	0 %	0 %	25 %	387135625
133	NC_017306	GATT	2	8	65398	65405	25 %	50 %	25 %	0 %	387135626
134	NC_017306	CCAG	2	8	66250	66257	25 %	0 %	25 %	50 %	387135627
135	NC_017306	GGTG	2	8	66466	66473	0 %	25 %	75 %	0 %	387135627
136	NC_017306	ATCC	2	8	66757	66764	25 %	25 %	0 %	50 %	387135627
137	NC_017306	GGCT	2	8	67994	68001	0 %	25 %	50 %	25 %	387135628
138	NC_017306	GCTG	2	8	68536	68543	0 %	25 %	50 %	25 %	387135629
139	NC_017306	CTTG	2	8	68861	68868	0 %	50 %	25 %	25 %	387135629
140	NC_017306	TCCA	2	8	69004	69011	25 %	25 %	0 %	50 %	387135629
141	NC_017306	AGTG	2	8	69223	69230	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017306	GGTT	2	8	69741	69748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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