MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 42/02-A chromosome

Total Repeats: 888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017306	TAAA	2	8	1828	1835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017306	TCGC	2	8	8248	8255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017306	GAAA	2	8	20225	20232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017306	TCCC	2	8	21083	21090	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_017306	TCAT	2	8	23816	23823	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017306	TGAT	2	8	23834	23841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017306	GCTA	2	8	29129	29136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017306	TACT	2	8	39036	39043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017306	AAGA	2	8	39118	39125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017306	TGCG	2	8	39568	39575	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017306	GCTG	2	8	41456	41463	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017306	AATG	2	8	44452	44459	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017306	AAAT	2	8	46096	46103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017306	TTGC	2	8	47825	47832	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017306	ATTA	2	8	47900	47907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017306	GTTT	2	8	50902	50909	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017306	TTGG	2	8	57811	57818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017306	GCAC	2	8	59683	59690	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017306	CTTT	2	8	61445	61452	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017306	AGTG	2	8	69223	69230	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017306	GGTT	2	8	69741	69748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017306	ATGA	2	8	71839	71846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017306	GGAA	2	8	74786	74793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017306	TAAT	2	8	76534	76541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017306	TCCT	2	8	79261	79268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017306	TCTT	2	8	90267	90274	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017306	TTGC	2	8	90932	90939	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017306	TCTT	2	8	105018	105025	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017306	GAGG	2	8	113683	113690	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017306	TACC	2	8	117322	117329	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017306	GAAT	2	8	117349	117356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017306	GGCA	2	8	117359	117366	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017306	CCAC	2	8	119612	119619	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_017306	TCCT	2	8	121310	121317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017306	TCTT	2	8	121514	121521	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017306	TTGG	2	8	124468	124475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017306	GCCG	2	8	124904	124911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017306	GGCA	2	8	124913	124920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017306	ATTT	2	8	127500	127507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017306	TGTT	2	8	129847	129854	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017306	GAGC	2	8	131683	131690	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017306	CTTG	2	8	131766	131773	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017306	ACGC	2	8	132048	132055	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017306	TAAG	2	8	132105	132112	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017306	GGTG	2	8	132413	132420	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017306	TGGA	2	8	132515	132522	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017306	TGCG	2	8	141065	141072	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017306	CAAA	2	8	150087	150094	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017306	GCCC	2	8	154009	154016	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_017306	CTGC	2	8	154146	154153	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017306	TTCC	2	8	155767	155774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017306	ATGC	2	8	157261	157268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017306	ATCA	2	8	160749	160756	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017306	ATAC	2	8	160822	160829	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017306	CAGG	2	8	160842	160849	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017306	GTAG	2	8	160956	160963	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017306	CGGC	2	8	163123	163130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017306	TTTG	2	8	164288	164295	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017306	ATGC	2	8	164314	164321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017306	GATG	2	8	169204	169211	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017306	TGTT	2	8	169278	169285	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017306	TCCC	2	8	169547	169554	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_017306	GAGG	2	8	171222	171229	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017306	TGCT	2	8	171236	171243	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017306	AAAT	2	8	171515	171522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017306	GGAC	2	8	171777	171784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017306	ATAG	2	8	175243	175250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017306	AAAT	2	8	179039	179046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017306	AGCC	2	8	184509	184516	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017306	ATCT	2	8	186384	186391	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017306	CTTT	2	8	187867	187874	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017306	CGGA	2	8	188069	188076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017306	ATGG	2	8	188107	188114	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017306	GGCA	2	8	188242	188249	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017306	CAGT	2	8	195186	195193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017306	ATGG	2	8	196772	196779	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017306	TCAC	2	8	202809	202816	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017306	AAGC	2	8	207864	207871	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017306	AAGC	2	8	207961	207968	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017306	CTTT	2	8	208075	208082	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017306	TCAC	2	8	208253	208260	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017306	ATCT	2	8	208438	208445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017306	ACGA	2	8	208545	208552	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017306	ATTG	2	8	209349	209356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017306	CAAA	2	8	210506	210513	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017306	CGAA	2	8	210601	210608	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017306	GTTC	2	8	214647	214654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017306	TAGA	2	8	223077	223084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017306	GCCC	2	8	224907	224914	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_017306	GTCT	2	8	225264	225271	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017306	TTCA	2	8	236049	236056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017306	TCCT	2	8	238055	238062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017306	GATA	2	8	238170	238177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017306	GTAG	2	8	238184	238191	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017306	CCTA	2	8	238213	238220	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017306	AGCC	2	8	241131	241138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017306	TTTA	2	8	243413	243420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017306	CGCC	2	8	251251	251258	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_017306	AGTT	2	8	252414	252421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017306	TAAA	2	8	252548	252555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017306	ACTC	2	8	260153	260160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017306	ATGA	2	8	260625	260632	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017306	ATTA	2	8	260688	260695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017306	GAAT	2	8	265303	265310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017306	TATT	2	8	267855	267862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017306	GTTC	2	8	280867	280874	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017306	GCGG	2	8	281327	281334	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017306	GTAC	2	8	281393	281400	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017306	TCCC	2	8	287129	287136	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_017306	ATCA	2	8	293376	293383	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017306	GCTT	2	8	293419	293426	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017306	CTCG	2	8	294513	294520	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017306	AAGG	2	8	294559	294566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017306	GCTG	2	8	310682	310689	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017306	ATCG	2	8	312289	312296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017306	TGCC	2	8	313514	313521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017306	GCTT	2	8	315414	315421	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017306	CCTT	2	8	319851	319858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017306	GCTT	2	8	322056	322063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017306	GACC	2	8	325272	325279	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017306	TGCT	2	8	325858	325865	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017306	TTAT	2	8	327856	327863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017306	AGGA	2	8	329277	329284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017306	AGCG	2	8	333233	333240	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017306	GTAT	2	8	339064	339071	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017306	GGAT	2	8	347041	347048	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017306	AGTA	2	8	348996	349003	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017306	GAAT	2	8	355795	355802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017306	GCTT	2	8	356329	356336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017306	TGGT	2	8	356406	356413	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017306	AGTG	2	8	357678	357685	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017306	TCCT	2	8	359909	359916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017306	GCCG	2	8	359990	359997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017306	ATTA	2	8	376792	376799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017306	GGGA	2	8	378825	378832	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017306	ATTA	2	8	379090	379097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017306	AAGA	2	8	382307	382314	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017306	TTAA	2	8	383491	383498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017306	AGCG	2	8	385281	385288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017306	TCGC	2	8	397306	397313	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017306	ACTA	2	8	397316	397323	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017306	CTTG	2	8	397503	397510	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017306	TTTA	2	8	397810	397817	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017306	TGAA	2	8	400173	400180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017306	ATTG	2	8	400241	400248	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017306	CATG	2	8	400501	400508	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017306	GCTG	2	8	400808	400815	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017306	CATC	2	8	401093	401100	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017306	TCCG	2	8	404753	404760	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017306	AGTC	2	8	412137	412144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017306	GCCA	2	8	412353	412360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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162	NC_017306	TGAG	2	8	423393	423400	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_017306	TGTC	2	8	1442988	1442995	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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