MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 42/02-A chromosome

Total Repeats: 27362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017306	TTA	2	6	329	334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135562
2	NC_017306	CAA	2	6	399	404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135562
3	NC_017306	CTT	2	6	457	462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135562
4	NC_017306	TCA	2	6	512	517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135562
5	NC_017306	TGC	2	6	626	631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135562
6	NC_017306	CGC	2	6	721	726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135562
7	NC_017306	AGC	2	6	736	741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135562
8	NC_017306	CAG	2	6	832	837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135562
9	NC_017306	GAT	2	6	1080	1085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135562
10	NC_017306	TCC	2	6	1093	1098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387135562
11	NC_017306	AAG	2	6	1105	1110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135562
12	NC_017306	GAA	2	6	1119	1124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135562
13	NC_017306	TGA	2	6	1294	1299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135562
14	NC_017306	GGC	2	6	1304	1309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135562
15	NC_017306	TTG	2	6	1321	1326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135562
16	NC_017306	ATG	2	6	1488	1493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135562
17	NC_017306	GAA	2	6	1745	1750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135562
18	NC_017306	ATG	2	6	1759	1764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135562
19	NC_017306	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135562
20	NC_017306	GCA	2	6	1781	1786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135562
21	NC_017306	TTC	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135562
22	NC_017306	TAC	2	6	2495	2500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135563
23	NC_017306	TCA	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135563
24	NC_017306	GAT	2	6	2521	2526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135563
25	NC_017306	GCT	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135563
26	NC_017306	CAT	2	6	2637	2642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135563
27	NC_017306	GCA	3	9	2827	2835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135563
28	NC_017306	GCT	2	6	3168	3173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135563
29	NC_017306	CGG	2	6	3305	3310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135563
30	NC_017306	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135563
31	NC_017306	GAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135563
32	NC_017306	TTG	2	6	3764	3769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135564
33	NC_017306	CTG	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135564
34	NC_017306	GTG	2	6	4025	4030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135564
35	NC_017306	TTG	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135564
36	NC_017306	GAT	2	6	4183	4188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135564
37	NC_017306	GAG	2	6	4387	4392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135564
38	NC_017306	CGT	2	6	4394	4399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135564
39	NC_017306	GAC	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135564
40	NC_017306	CGA	2	6	4647	4652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135564
41	NC_017306	CTG	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135565
42	NC_017306	AGA	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135565
43	NC_017306	TGC	2	6	4906	4911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135565
44	NC_017306	GCG	2	6	4930	4935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135565
45	NC_017306	ACG	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135565
46	NC_017306	CGG	2	6	5143	5148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135565
47	NC_017306	TGG	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135565
48	NC_017306	AGC	2	6	5191	5196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135565
49	NC_017306	ATG	2	6	5276	5281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135565
50	NC_017306	CGG	2	6	5768	5773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135566
51	NC_017306	TGG	2	6	5867	5872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135566
52	NC_017306	GGT	2	6	5904	5909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135566
53	NC_017306	ACC	2	6	6057	6062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135566
54	NC_017306	ACC	3	9	6096	6104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135566
55	NC_017306	CAT	2	6	6116	6121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135566
56	NC_017306	TCG	2	6	6125	6130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135566
57	NC_017306	GAA	2	6	6198	6203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135566
58	NC_017306	TGA	2	6	6224	6229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135566
59	NC_017306	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135566
60	NC_017306	GAA	2	6	6308	6313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135566
61	NC_017306	GAA	2	6	6320	6325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135566
62	NC_017306	TTA	2	6	6335	6340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135566
63	NC_017306	TGA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135566
64	NC_017306	GAA	2	6	6531	6536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135566
65	NC_017306	TGA	2	6	6562	6567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135566
66	NC_017306	TCT	2	6	6816	6821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135566
67	NC_017306	GGC	2	6	6836	6841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135566
68	NC_017306	TGG	2	6	6887	6892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135566
69	NC_017306	GGT	2	6	6972	6977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135566
70	NC_017306	ATT	2	6	7095	7100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135566
71	NC_017306	ATG	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135566
72	NC_017306	CAA	2	6	7139	7144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135566
73	NC_017306	GCT	3	9	7208	7216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135566
74	NC_017306	TTG	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135566
75	NC_017306	CCG	2	6	7278	7283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135566
76	NC_017306	GAA	2	6	7356	7361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135566
77	NC_017306	CAA	2	6	7385	7390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135566
78	NC_017306	GAT	2	6	7392	7397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135566
79	NC_017306	ATG	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135566
80	NC_017306	TGA	2	6	7514	7519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135566
81	NC_017306	TCG	2	6	7556	7561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135566
82	NC_017306	TTC	2	6	7896	7901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135567
83	NC_017306	GAG	2	6	7944	7949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135567
84	NC_017306	AGC	2	6	7956	7961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135567
85	NC_017306	TGC	2	6	7992	7997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135567
86	NC_017306	GAG	2	6	8103	8108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135567
87	NC_017306	ATT	2	6	8301	8306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135568
88	NC_017306	CTG	2	6	8545	8550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135569
89	NC_017306	GGA	2	6	8569	8574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135569
90	NC_017306	TGT	2	6	8590	8595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135569
91	NC_017306	CTG	2	6	8598	8603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135569
92	NC_017306	TGC	2	6	8649	8654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135569
93	NC_017306	GTC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135569
94	NC_017306	GCG	2	6	8721	8726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135570
95	NC_017306	TGA	2	6	8807	8812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135570
96	NC_017306	GCT	2	6	8824	8829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135570
97	NC_017306	CGA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135571
98	NC_017306	GCG	2	6	9099	9104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135571
99	NC_017306	GAG	2	6	9140	9145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135571
100	NC_017306	CCG	2	6	9232	9237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135571
101	NC_017306	ACG	2	6	9438	9443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135571
102	NC_017306	CGC	2	6	9448	9453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135571
103	NC_017306	TTC	2	6	9570	9575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135571
104	NC_017306	TGA	2	6	9597	9602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135571
105	NC_017306	TCT	2	6	9678	9683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135571
106	NC_017306	GAA	2	6	9857	9862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135571
107	NC_017306	TGC	2	6	10155	10160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135571
108	NC_017306	TTA	2	6	10162	10167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135571
109	NC_017306	TCG	2	6	10195	10200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135571
110	NC_017306	GAA	2	6	10217	10222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135571
111	NC_017306	CGA	2	6	10276	10281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135571
112	NC_017306	AGA	2	6	10419	10424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135571
113	NC_017306	CGT	2	6	10553	10558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135571
114	NC_017306	ATT	2	6	10565	10570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135571
115	NC_017306	GAA	2	6	10592	10597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135571
116	NC_017306	GTG	3	9	10619	10627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135571
117	NC_017306	CGT	2	6	10685	10690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135571
118	NC_017306	CTT	2	6	10744	10749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135571
119	NC_017306	AAG	2	6	10970	10975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135571
120	NC_017306	GGT	2	6	11009	11014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135571
121	NC_017306	GAA	2	6	11036	11041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135571
122	NC_017306	ATG	2	6	11073	11078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135571
123	NC_017306	GCT	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135571
124	NC_017306	GAA	2	6	11099	11104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135571
125	NC_017306	TGA	3	9	11128	11136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135571
126	NC_017306	CGA	2	6	11194	11199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135571
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128	NC_017306	TCT	2	6	11239	11244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135571
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252	NC_017306	GTT	2	6	20010	20015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135582
253	NC_017306	GAA	2	6	20828	20833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135583
254	NC_017306	CAT	2	6	20865	20870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135583
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257	NC_017306	AGT	2	6	21961	21966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135584
258	NC_017306	AGT	2	6	21970	21975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135584
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268	NC_017306	TTC	2	6	22891	22896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135586
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376	NC_017306	CAA	2	6	31413	31418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135593
377	NC_017306	GCA	2	6	31503	31508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135593
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379	NC_017306	TGA	2	6	31717	31722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135594
380	NC_017306	GGC	2	6	31786	31791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135594
381	NC_017306	AAC	2	6	31797	31802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135594
382	NC_017306	TTC	2	6	31881	31886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135594
383	NC_017306	ACT	2	6	31941	31946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135594
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385	NC_017306	CAA	2	6	31965	31970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135594
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388	NC_017306	TCC	2	6	32080	32085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387135594
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392	NC_017306	GTA	2	6	32299	32304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135594
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401	NC_017306	GCC	2	6	33051	33056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135594
402	NC_017306	GTC	2	6	33084	33089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135594
403	NC_017306	GCT	2	6	33167	33172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135595
404	NC_017306	GCT	2	6	33176	33181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135595
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499	NC_017306	GCC	2	6	38916	38921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135599
500	NC_017306	GTT	2	6	39688	39693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135600

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