MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 1298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017305	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	384509885
2	NC_017305	CACGC	2	10	5733	5742	20 %	0 %	20 %	60 %	384509890
3	NC_017305	TTATC	2	10	14084	14093	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017305	ACGTA	2	10	14247	14256	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017305	CAGTA	2	10	14630	14639	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017305	CAGTG	2	10	15501	15510	20 %	20 %	40 %	20 %	384509900
7	NC_017305	AAAAT	2	10	16761	16770	80 %	20 %	0 %	0 %	384509901
8	NC_017305	TAGCG	2	10	18329	18338	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017305	CTTTT	2	10	19236	19245	0 %	80 %	0 %	20 %	384509905
10	NC_017305	GCTCT	2	10	19273	19282	0 %	40 %	20 %	40 %	384509905
11	NC_017305	TGGAT	2	10	23215	23224	20 %	40 %	40 %	0 %	384509914
12	NC_017305	TGCGT	2	10	24498	24507	0 %	40 %	40 %	20 %	384509915
13	NC_017305	CTGAT	2	10	28529	28538	20 %	40 %	20 %	20 %	384509919
14	NC_017305	GGAGC	2	10	29482	29491	20 %	0 %	60 %	20 %	384509920
15	NC_017305	TTGCT	2	10	30570	30579	0 %	60 %	20 %	20 %	384509921
16	NC_017305	TGAGG	2	10	37403	37412	20 %	20 %	60 %	0 %	384509925
17	NC_017305	CACAT	2	10	39587	39596	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017305	TGCGG	2	10	40520	40529	0 %	20 %	60 %	20 %	384509929
19	NC_017305	GCCTC	2	10	47297	47306	0 %	20 %	20 %	60 %	384509935
20	NC_017305	GAAGG	2	10	47311	47320	40 %	0 %	60 %	0 %	384509935
21	NC_017305	CAGTG	2	10	49242	49251	20 %	20 %	40 %	20 %	384509937
22	NC_017305	TGAGA	2	10	49584	49593	40 %	20 %	40 %	0 %	384509937
23	NC_017305	AGTGA	2	10	49634	49643	40 %	20 %	40 %	0 %	384509937
24	NC_017305	GCGGT	2	10	51784	51793	0 %	20 %	60 %	20 %	384509940
25	NC_017305	TTGGA	2	10	52670	52679	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017305	TTGAT	2	10	52705	52714	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017305	TGCAC	2	10	52799	52808	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017305	CTGGC	2	10	53058	53067	0 %	20 %	40 %	40 %	384509942
29	NC_017305	GCAGC	2	10	53557	53566	20 %	0 %	40 %	40 %	384509942
30	NC_017305	GACTG	2	10	53573	53582	20 %	20 %	40 %	20 %	384509942
31	NC_017305	AAGGC	2	10	55814	55823	40 %	0 %	40 %	20 %	384509944
32	NC_017305	ATGGC	2	10	58674	58683	20 %	20 %	40 %	20 %	384509948
33	NC_017305	ATGTG	2	10	62844	62853	20 %	40 %	40 %	0 %	384509952
34	NC_017305	TCTGT	2	10	64658	64667	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017305	GCTGG	2	10	64999	65008	0 %	20 %	60 %	20 %	384509954
36	NC_017305	AGGGA	2	10	67588	67597	40 %	0 %	60 %	0 %	384509956
37	NC_017305	AAGAT	2	10	69395	69404	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017305	GGAGC	2	10	69502	69511	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017305	GGTCT	2	10	71216	71225	0 %	40 %	40 %	20 %	384509959
40	NC_017305	CATGT	2	10	71792	71801	20 %	40 %	20 %	20 %	384509960
41	NC_017305	CAGCG	2	10	72669	72678	20 %	0 %	40 %	40 %	384509961
42	NC_017305	CAGGC	2	10	73075	73084	20 %	0 %	40 %	40 %	384509961
43	NC_017305	ATGGC	2	10	73920	73929	20 %	20 %	40 %	20 %	384509962
44	NC_017305	AGGCA	2	10	75240	75249	40 %	0 %	40 %	20 %	384509963
45	NC_017305	TAATT	2	10	76486	76495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017305	GCTTT	2	10	81081	81090	0 %	60 %	20 %	20 %	384509970
47	NC_017305	TGACC	2	10	81337	81346	20 %	20 %	20 %	40 %	384509970
48	NC_017305	CGTTA	2	10	82079	82088	20 %	40 %	20 %	20 %	384509971
49	NC_017305	TGCTG	2	10	82713	82722	0 %	40 %	40 %	20 %	384509971
50	NC_017305	TGGCC	2	10	84704	84713	0 %	20 %	40 %	40 %	384509972
51	NC_017305	GCGAC	2	10	85508	85517	20 %	0 %	40 %	40 %	384509972
52	NC_017305	TGGGA	2	10	88918	88927	20 %	20 %	60 %	0 %	384509977
53	NC_017305	GATCG	2	10	90018	90027	20 %	20 %	40 %	20 %	384509979
54	NC_017305	CAAAA	2	10	90750	90759	80 %	0 %	0 %	20 %	384509980
55	NC_017305	AACAA	2	10	93591	93600	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017305	TGCAA	2	10	96598	96607	40 %	20 %	20 %	20 %	384509985
57	NC_017305	TGCAG	2	10	96818	96827	20 %	20 %	40 %	20 %	384509985
58	NC_017305	AGGTC	2	10	99254	99263	20 %	20 %	40 %	20 %	384509988
59	NC_017305	ACCAA	2	10	101113	101122	60 %	0 %	0 %	40 %	384509988
60	NC_017305	TCATC	2	10	102376	102385	20 %	40 %	0 %	40 %	384509989
61	NC_017305	TGCAC	2	10	104191	104200	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017305	ACCTG	2	10	104406	104415	20 %	20 %	20 %	40 %	384509990
63	NC_017305	CGGTG	2	10	104615	104624	0 %	20 %	60 %	20 %	384509990
64	NC_017305	CGGCG	2	10	107234	107243	0 %	0 %	60 %	40 %	384509993
65	NC_017305	CGCGG	2	10	107294	107303	0 %	0 %	60 %	40 %	384509994
66	NC_017305	CAGCG	2	10	107830	107839	20 %	0 %	40 %	40 %	384509995
67	NC_017305	GGATC	2	10	118406	118415	20 %	20 %	40 %	20 %	384510005
68	NC_017305	TGTTT	2	10	120878	120887	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017305	CGGGA	2	10	125522	125531	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017305	GACTG	2	10	127783	127792	20 %	20 %	40 %	20 %	384510011
71	NC_017305	TTGGT	2	10	129092	129101	0 %	60 %	40 %	0 %	384510011
72	NC_017305	GTGCG	2	10	131355	131364	0 %	20 %	60 %	20 %	384510013
73	NC_017305	GTGGC	2	10	133093	133102	0 %	20 %	60 %	20 %	384510014
74	NC_017305	CGCGT	2	10	133410	133419	0 %	20 %	40 %	40 %	384510015
75	NC_017305	GGGGC	2	10	133538	133547	0 %	0 %	80 %	20 %	384510015
76	NC_017305	AGACG	2	10	135343	135352	40 %	0 %	40 %	20 %	384510017
77	NC_017305	GGGGC	2	10	135561	135570	0 %	0 %	80 %	20 %	384510018
78	NC_017305	ACGGT	2	10	136716	136725	20 %	20 %	40 %	20 %	384510019
79	NC_017305	CGATC	2	10	136989	136998	20 %	20 %	20 %	40 %	384510019
80	NC_017305	TGGCC	2	10	137196	137205	0 %	20 %	40 %	40 %	384510019
81	NC_017305	TGGTG	2	10	137574	137583	0 %	40 %	60 %	0 %	384510019
82	NC_017305	GGAGT	2	10	138046	138055	20 %	20 %	60 %	0 %	384510019
83	NC_017305	ATTGC	2	10	141980	141989	20 %	40 %	20 %	20 %	384510022
84	NC_017305	AAAAC	2	10	144806	144815	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017305	TCACT	2	10	145851	145860	20 %	40 %	0 %	40 %	384510027
86	NC_017305	ATTTC	2	10	146468	146477	20 %	60 %	0 %	20 %	384510027
87	NC_017305	AATGG	2	10	150168	150177	40 %	20 %	40 %	0 %	384510030
88	NC_017305	GTGAG	2	10	151151	151160	20 %	20 %	60 %	0 %	384510032
89	NC_017305	CTGAA	2	10	151949	151958	40 %	20 %	20 %	20 %	384510032
90	NC_017305	CCAGC	2	10	153241	153250	20 %	0 %	20 %	60 %	384510033
91	NC_017305	TTGCC	2	10	153751	153760	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017305	GTACC	2	10	155710	155719	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017305	TACGC	2	10	156267	156276	20 %	20 %	20 %	40 %	384510035
94	NC_017305	GCGAC	2	10	159761	159770	20 %	0 %	40 %	40 %	384510040
95	NC_017305	GGTTG	2	10	161037	161046	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017305	CCTTG	2	10	161413	161422	0 %	40 %	20 %	40 %	384510041
97	NC_017305	GCATA	2	10	163137	163146	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017305	TGTGC	2	10	164360	164369	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017305	CGGTG	2	10	165382	165391	0 %	20 %	60 %	20 %	384510044
100	NC_017305	CATGG	2	10	167515	167524	20 %	20 %	40 %	20 %	384510046
101	NC_017305	CAGAT	2	10	167871	167880	40 %	20 %	20 %	20 %	384510046
102	NC_017305	GGATG	2	10	168769	168778	20 %	20 %	60 %	0 %	384510046
103	NC_017305	GGGAC	2	10	171395	171404	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017305	CACTT	2	10	171575	171584	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017305	AAACT	2	10	172453	172462	60 %	20 %	0 %	20 %	384510048
106	NC_017305	ACCGG	2	10	172848	172857	20 %	0 %	40 %	40 %	384510048
107	NC_017305	ATTGA	2	10	178658	178667	40 %	40 %	20 %	0 %	384510052
108	NC_017305	GTGGA	2	10	181067	181076	20 %	20 %	60 %	0 %	384510053
109	NC_017305	TTAAG	2	10	184399	184408	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017305	TGACC	2	10	185317	185326	20 %	20 %	20 %	40 %	384510056
111	NC_017305	AGGTG	2	10	186270	186279	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017305	TTGCA	2	10	186603	186612	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017305	GTTTG	2	10	188543	188552	0 %	60 %	40 %	0 %	384510061
114	NC_017305	CGGAT	2	10	189483	189492	20 %	20 %	40 %	20 %	384510062
115	NC_017305	AGCGC	2	10	190641	190650	20 %	0 %	40 %	40 %	384510063
116	NC_017305	GCAGT	2	10	192128	192137	20 %	20 %	40 %	20 %	384510064
117	NC_017305	CAATG	2	10	192400	192409	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017305	TAACG	2	10	193352	193361	40 %	20 %	20 %	20 %	384510065
119	NC_017305	AAGCC	2	10	194679	194688	40 %	0 %	20 %	40 %	384510066
120	NC_017305	GGCCC	2	10	196751	196760	0 %	0 %	40 %	60 %	384510069
121	NC_017305	GAATT	2	10	200316	200325	40 %	40 %	20 %	0 %	384510074
122	NC_017305	CAAGG	2	10	201205	201214	40 %	0 %	40 %	20 %	384510074
123	NC_017305	GATGG	2	10	203654	203663	20 %	20 %	60 %	0 %	384510075
124	NC_017305	TGGCG	2	10	204388	204397	0 %	20 %	60 %	20 %	384510076
125	NC_017305	TGCCA	2	10	206411	206420	20 %	20 %	20 %	40 %	384510077
126	NC_017305	AAATA	2	10	206513	206522	80 %	20 %	0 %	0 %	384510077
127	NC_017305	ATTCT	2	10	207109	207118	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017305	CAGGC	2	10	211926	211935	20 %	0 %	40 %	40 %	384510080
129	NC_017305	TTGTA	2	10	212336	212345	20 %	60 %	20 %	0 %	384510081
130	NC_017305	GCGAC	2	10	216853	216862	20 %	0 %	40 %	40 %	384510086
131	NC_017305	AGATC	2	10	216878	216887	40 %	20 %	20 %	20 %	384510086
132	NC_017305	CAAGG	2	10	217792	217801	40 %	0 %	40 %	20 %	384510087
133	NC_017305	AGAAA	2	10	218521	218530	80 %	0 %	20 %	0 %	384510088
134	NC_017305	CGGGG	2	10	224555	224564	0 %	0 %	80 %	20 %	384510095
135	NC_017305	GAAAA	2	10	224694	224703	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017305	CGAGA	2	10	225335	225344	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017305	TGCGC	2	10	226993	227002	0 %	20 %	40 %	40 %	384510098
138	NC_017305	CACTG	2	10	228153	228162	20 %	20 %	20 %	40 %	384510099
139	NC_017305	CATTG	2	10	228842	228851	20 %	40 %	20 %	20 %	384510100
140	NC_017305	CAAAA	2	10	228957	228966	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017305	CGCAA	2	10	229656	229665	40 %	0 %	20 %	40 %	384510103
142	NC_017305	GATCG	2	10	229974	229983	20 %	20 %	40 %	20 %	384510104
143	NC_017305	CAAGA	2	10	231886	231895	60 %	0 %	20 %	20 %	384510104
144	NC_017305	TGGCT	2	10	232082	232091	0 %	40 %	40 %	20 %	384510104
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146	NC_017305	GCCGT	2	10	234802	234811	0 %	20 %	40 %	40 %	384510106
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150	NC_017305	GCCAT	2	10	244792	244801	20 %	20 %	20 %	40 %	384510113
151	NC_017305	CGCAG	2	10	247848	247857	20 %	0 %	40 %	40 %	384510116
152	NC_017305	CATGC	2	10	249619	249628	20 %	20 %	20 %	40 %	384510117
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154	NC_017305	AATTG	2	10	250023	250032	40 %	40 %	20 %	0 %	384510117
155	NC_017305	CCCCG	2	10	254675	254684	0 %	0 %	20 %	80 %	384510121
156	NC_017305	GAAGT	2	10	255216	255225	40 %	20 %	40 %	0 %	384510121
157	NC_017305	CCGTG	2	10	255402	255411	0 %	20 %	40 %	40 %	384510121
158	NC_017305	TGGGG	2	10	256233	256242	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017305	TGCTC	2	10	260342	260351	0 %	40 %	20 %	40 %	384510125
160	NC_017305	TTGGA	2	10	262260	262269	20 %	40 %	40 %	0 %	384510127
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177	NC_017305	GCAGG	2	10	291079	291088	20 %	0 %	60 %	20 %	384510158
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183	NC_017305	ATTAG	2	10	305371	305380	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017305	GCTCT	2	10	306059	306068	0 %	40 %	20 %	40 %	384510171
185	NC_017305	GCAAG	2	10	306229	306238	40 %	0 %	40 %	20 %	384510171
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188	NC_017305	TGCGA	2	10	310560	310569	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
189	NC_017305	TGTTC	2	10	312193	312202	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
190	NC_017305	GCAGA	2	10	312926	312935	40 %	0 %	40 %	20 %	384510176
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192	NC_017305	GCGCA	2	10	313575	313584	20 %	0 %	40 %	40 %	384510177
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197	NC_017305	TTGTG	2	10	321904	321913	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
198	NC_017305	GCAAC	2	10	322999	323008	40 %	0 %	20 %	40 %	384510185
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200	NC_017305	ATGCC	2	10	325427	325436	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
201	NC_017305	TGGCG	2	10	325968	325977	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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209	NC_017305	AGCTG	2	10	347569	347578	20 %	20 %	40 %	20 %	384510201
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211	NC_017305	CAGCT	2	10	350269	350278	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
212	NC_017305	CTTGC	2	10	355549	355558	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
213	NC_017305	TGCGG	2	10	356018	356027	0 %	20 %	60 %	20 %	384510209
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218	NC_017305	GAACA	2	10	367235	367244	60 %	0 %	20 %	20 %	384510225
219	NC_017305	GACGG	2	10	371665	371674	20 %	0 %	60 %	20 %	384510233
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234	NC_017305	GATGC	2	10	399953	399962	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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240	NC_017305	CAGCT	2	10	405319	405328	20 %	20 %	20 %	40 %	384510267
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242	NC_017305	GATGC	2	10	408548	408557	20 %	20 %	40 %	20 %	384510271
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248	NC_017305	AAGAC	2	10	423220	423229	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
249	NC_017305	CCTGT	2	10	424297	424306	0 %	40 %	20 %	40 %	384510285
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254	NC_017305	GCTAC	2	10	428935	428944	20 %	20 %	20 %	40 %	384510289
255	NC_017305	GAGCA	2	10	429432	429441	40 %	0 %	40 %	20 %	384510290
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257	NC_017305	CGAGC	2	10	433112	433121	20 %	0 %	40 %	40 %	384510295
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261	NC_017305	CTACG	2	10	440796	440805	20 %	20 %	20 %	40 %	384510302
262	NC_017305	AAGTG	2	10	443391	443400	40 %	20 %	40 %	0 %	384510304
263	NC_017305	GATGT	2	10	447477	447486	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017305	GTCGC	2	10	448111	448120	0 %	20 %	40 %	40 %	384510309
265	NC_017305	GGTGG	2	10	451363	451372	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
266	NC_017305	GCATC	2	10	452646	452655	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
267	NC_017305	CGCAA	2	10	452827	452836	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
268	NC_017305	GCTGT	2	10	453594	453603	0 %	40 %	40 %	20 %	384510314
269	NC_017305	CGATC	2	10	453722	453731	20 %	20 %	20 %	40 %	384510315
270	NC_017305	TGCGC	2	10	453865	453874	0 %	20 %	40 %	40 %	384510315
271	NC_017305	GACCT	2	10	455833	455842	20 %	20 %	20 %	40 %	384510317
272	NC_017305	GGGTT	2	10	455960	455969	0 %	40 %	60 %	0 %	384510317
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277	NC_017305	TGATG	2	10	460232	460241	20 %	40 %	40 %	0 %	384510323
278	NC_017305	AGGTG	2	10	462155	462164	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
279	NC_017305	TTCTG	2	10	463143	463152	0 %	60 %	20 %	20 %	384510325
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281	NC_017305	ATCTG	2	10	464908	464917	20 %	40 %	20 %	20 %	384510326
282	NC_017305	CCATT	2	10	465999	466008	20 %	40 %	0 %	40 %	384510327
283	NC_017305	TTTCT	2	10	467115	467124	0 %	80 %	0 %	20 %	384510328
284	NC_017305	GGTTC	2	10	467621	467630	0 %	40 %	40 %	20 %	384510328
285	NC_017305	CCGTG	2	10	467874	467883	0 %	20 %	40 %	40 %	384510329
286	NC_017305	TGCCT	2	10	468582	468591	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
287	NC_017305	CTTTG	2	10	475099	475108	0 %	60 %	20 %	20 %	384510333
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289	NC_017305	GTCTT	2	10	476642	476651	0 %	60 %	20 %	20 %	384510335
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297	NC_017305	CGGTA	2	10	487829	487838	20 %	20 %	40 %	20 %	384510345
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302	NC_017305	CCCGT	2	10	500434	500443	0 %	20 %	20 %	60 %	384510353
303	NC_017305	AGGGG	2	10	500780	500789	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
304	NC_017305	TCCCA	2	10	510382	510391	20 %	20 %	0 %	60 %	384510362
305	NC_017305	CTTCT	2	10	511842	511851	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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316	NC_017305	CTGGG	2	10	534646	534655	0 %	20 %	60 %	20 %	384510391
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382	NC_017305	GGGGC	2	10	628340	628349	0 %	0 %	80 %	20 %	384510466
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497	NC_017305	TAATG	2	10	847697	847706	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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