MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 4941

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017305	TTCC	2	8	710	717	0 %	50 %	0 %	50 %	384509885
2	NC_017305	AGCC	2	8	857	864	25 %	0 %	25 %	50 %	384509885
3	NC_017305	ATGC	2	8	922	929	25 %	25 %	25 %	25 %	384509885
4	NC_017305	CAGG	2	8	1029	1036	25 %	0 %	50 %	25 %	384509885
5	NC_017305	TACG	2	8	1223	1230	25 %	25 %	25 %	25 %	384509885
6	NC_017305	GATG	2	8	1560	1567	25 %	25 %	50 %	0 %	384509885
7	NC_017305	TAAA	2	8	1829	1836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017305	GAAG	2	8	2427	2434	50 %	0 %	50 %	0 %	384509887
9	NC_017305	CCCA	2	8	2482	2489	25 %	0 %	0 %	75 %	384509887
10	NC_017305	CTGC	2	8	2767	2774	0 %	25 %	25 %	50 %	384509887
11	NC_017305	GAAA	2	8	3253	3260	75 %	0 %	25 %	0 %	384509887
12	NC_017305	TTAC	2	8	3396	3403	25 %	50 %	0 %	25 %	384509887
13	NC_017305	TCGT	2	8	3681	3688	0 %	50 %	25 %	25 %	384509888
14	NC_017305	AAGG	2	8	4837	4844	50 %	0 %	50 %	0 %	384509888
15	NC_017305	ATAC	2	8	5412	5419	50 %	25 %	0 %	25 %	384509889
16	NC_017305	ATGC	2	8	5814	5821	25 %	25 %	25 %	25 %	384509890
17	NC_017305	TCGC	2	8	8248	8255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017305	GAAA	2	8	8468	8475	75 %	0 %	25 %	0 %	384509893
19	NC_017305	ACTC	2	8	9475	9482	25 %	25 %	0 %	50 %	384509895
20	NC_017305	CAAC	2	8	9633	9640	50 %	0 %	0 %	50 %	384509895
21	NC_017305	GCAT	2	8	9728	9735	25 %	25 %	25 %	25 %	384509895
22	NC_017305	CACG	2	8	10759	10766	25 %	0 %	25 %	50 %	384509895
23	NC_017305	TTAG	2	8	11985	11992	25 %	50 %	25 %	0 %	384509896
24	NC_017305	TCGC	2	8	12463	12470	0 %	25 %	25 %	50 %	384509897
25	NC_017305	GGAT	2	8	12473	12480	25 %	25 %	50 %	0 %	384509897
26	NC_017305	TTCC	2	8	12740	12747	0 %	50 %	0 %	50 %	384509897
27	NC_017305	GCTA	2	8	12808	12815	25 %	25 %	25 %	25 %	384509897
28	NC_017305	GCCT	2	8	12827	12834	0 %	25 %	25 %	50 %	384509897
29	NC_017305	TTGT	2	8	13534	13541	0 %	75 %	25 %	0 %	384509898
30	NC_017305	GCCC	2	8	13684	13691	0 %	0 %	25 %	75 %	384509898
31	NC_017305	AGTG	2	8	13933	13940	25 %	25 %	50 %	0 %	384509898
32	NC_017305	TGGG	2	8	14427	14434	0 %	25 %	75 %	0 %	384509899
33	NC_017305	AATC	2	8	14957	14964	50 %	25 %	0 %	25 %	384509900
34	NC_017305	AAAG	2	8	15049	15056	75 %	0 %	25 %	0 %	384509900
35	NC_017305	AGCT	2	8	15348	15355	25 %	25 %	25 %	25 %	384509900
36	NC_017305	AAGG	2	8	15668	15675	50 %	0 %	50 %	0 %	384509900
37	NC_017305	TTTA	2	8	16065	16072	25 %	75 %	0 %	0 %	384509901
38	NC_017305	GCCA	2	8	16974	16981	25 %	0 %	25 %	50 %	384509902
39	NC_017305	GCTT	2	8	17831	17838	0 %	50 %	25 %	25 %	384509903
40	NC_017305	ACCG	2	8	18833	18840	25 %	0 %	25 %	50 %	384509904
41	NC_017305	CAAT	2	8	19219	19226	50 %	25 %	0 %	25 %	384509905
42	NC_017305	GAAA	2	8	20225	20232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017305	CGTG	2	8	20896	20903	0 %	25 %	50 %	25 %	384509908
44	NC_017305	TCCC	2	8	21083	21090	0 %	25 %	0 %	75 %	384509909
45	NC_017305	TTCC	2	8	21948	21955	0 %	50 %	0 %	50 %	384509912
46	NC_017305	TACC	2	8	22256	22263	25 %	25 %	0 %	50 %	384509913
47	NC_017305	AGCG	2	8	23047	23054	25 %	0 %	50 %	25 %	384509914
48	NC_017305	TTGA	2	8	23236	23243	25 %	50 %	25 %	0 %	384509914
49	NC_017305	TCAT	2	8	23817	23824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017305	TGAT	2	8	23835	23842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017305	CCTG	2	8	24580	24587	0 %	25 %	25 %	50 %	384509915
52	NC_017305	GGTG	2	8	24974	24981	0 %	25 %	75 %	0 %	384509915
53	NC_017305	TGAG	2	8	25491	25498	25 %	25 %	50 %	0 %	384509916
54	NC_017305	GGTG	2	8	25684	25691	0 %	25 %	75 %	0 %	384509916
55	NC_017305	AATT	2	8	27656	27663	50 %	50 %	0 %	0 %	384509918
56	NC_017305	TGGA	2	8	27813	27820	25 %	25 %	50 %	0 %	384509918
57	NC_017305	GAAG	2	8	27968	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	384509918
58	NC_017305	GAAA	2	8	28629	28636	75 %	0 %	25 %	0 %	384509919
59	NC_017305	CTTC	2	8	28638	28645	0 %	50 %	0 %	50 %	384509919
60	NC_017305	AGAA	2	8	28670	28677	75 %	0 %	25 %	0 %	384509919
61	NC_017305	GCTA	2	8	29129	29136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017305	TGAG	2	8	29777	29784	25 %	25 %	50 %	0 %	384509921
63	NC_017305	GTAC	2	8	29978	29985	25 %	25 %	25 %	25 %	384509921
64	NC_017305	GATC	2	8	30587	30594	25 %	25 %	25 %	25 %	384509921
65	NC_017305	GGAA	2	8	31725	31732	50 %	0 %	50 %	0 %	384509922
66	NC_017305	TGGC	2	8	31987	31994	0 %	25 %	50 %	25 %	384509922
67	NC_017305	GGTT	2	8	32232	32239	0 %	50 %	50 %	0 %	384509922
68	NC_017305	CTGA	2	8	32264	32271	25 %	25 %	25 %	25 %	384509922
69	NC_017305	GGAC	2	8	33588	33595	25 %	0 %	50 %	25 %	384509923
70	NC_017305	GATA	2	8	34334	34341	50 %	25 %	25 %	0 %	384509923
71	NC_017305	TAAC	2	8	35723	35730	50 %	25 %	0 %	25 %	384509924
72	NC_017305	CAAG	2	8	35927	35934	50 %	0 %	25 %	25 %	384509924
73	NC_017305	CAGG	2	8	36342	36349	25 %	0 %	50 %	25 %	384509925
74	NC_017305	GCCC	2	8	36531	36538	0 %	0 %	25 %	75 %	384509925
75	NC_017305	TGGC	2	8	36651	36658	0 %	25 %	50 %	25 %	384509925
76	NC_017305	TGGT	2	8	37553	37560	0 %	50 %	50 %	0 %	384509926
77	NC_017305	GCTT	2	8	37801	37808	0 %	50 %	25 %	25 %	384509926
78	NC_017305	TACT	2	8	39036	39043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017305	AAGA	2	8	39118	39125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017305	TGCG	2	8	39568	39575	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017305	AAAG	2	8	39901	39908	75 %	0 %	25 %	0 %	384509928
82	NC_017305	TAGA	2	8	40147	40154	50 %	25 %	25 %	0 %	384509928
83	NC_017305	TAAG	2	8	40287	40294	50 %	25 %	25 %	0 %	384509928
84	NC_017305	CAAG	2	8	40508	40515	50 %	0 %	25 %	25 %	384509929
85	NC_017305	GCTG	2	8	41456	41463	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017305	GCTG	2	8	41555	41562	0 %	25 %	50 %	25 %	384509931
87	NC_017305	ATCA	2	8	41967	41974	50 %	25 %	0 %	25 %	384509931
88	NC_017305	ATGC	2	8	42351	42358	25 %	25 %	25 %	25 %	384509931
89	NC_017305	CCGG	2	8	43266	43273	0 %	0 %	50 %	50 %	384509932
90	NC_017305	CGCC	2	8	43864	43871	0 %	0 %	25 %	75 %	384509933
91	NC_017305	ATGC	2	8	43929	43936	25 %	25 %	25 %	25 %	384509933
92	NC_017305	AATG	2	8	44451	44458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017305	GGAA	3	12	44629	44640	50 %	0 %	50 %	0 %	384509934
94	NC_017305	AGCC	2	8	45558	45565	25 %	0 %	25 %	50 %	384509934
95	NC_017305	AAAT	2	8	46095	46102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017305	TTGC	2	8	47824	47831	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017305	ATTA	2	8	47899	47906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017305	ATAC	2	8	48802	48809	50 %	25 %	0 %	25 %	384509937
99	NC_017305	TGCG	2	8	48914	48921	0 %	25 %	50 %	25 %	384509937
100	NC_017305	GTTT	2	8	50901	50908	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017305	TCAT	2	8	51227	51234	25 %	50 %	0 %	25 %	384509939
102	NC_017305	ATCG	2	8	51463	51470	25 %	25 %	25 %	25 %	384509939
103	NC_017305	CGAT	2	8	51940	51947	25 %	25 %	25 %	25 %	384509940
104	NC_017305	ATGA	2	8	52074	52081	50 %	25 %	25 %	0 %	384509940
105	NC_017305	CTGG	2	8	52475	52482	0 %	25 %	50 %	25 %	384509941
106	NC_017305	ATGC	2	8	53796	53803	25 %	25 %	25 %	25 %	384509942
107	NC_017305	TGAT	2	8	54030	54037	25 %	50 %	25 %	0 %	384509942
108	NC_017305	CAAG	2	8	54115	54122	50 %	0 %	25 %	25 %	384509942
109	NC_017305	ACTT	2	8	54206	54213	25 %	50 %	0 %	25 %	384509942
110	NC_017305	CCGT	2	8	55310	55317	0 %	25 %	25 %	50 %	384509943
111	NC_017305	AGCA	2	8	55498	55505	50 %	0 %	25 %	25 %	384509944
112	NC_017305	GCGG	2	8	56577	56584	0 %	0 %	75 %	25 %	384509945
113	NC_017305	CGAC	2	8	56718	56725	25 %	0 %	25 %	50 %	384509946
114	NC_017305	CATC	2	8	57037	57044	25 %	25 %	0 %	50 %	384509946
115	NC_017305	GAGG	2	8	57250	57257	25 %	0 %	75 %	0 %	384509946
116	NC_017305	ATTG	2	8	57585	57592	25 %	50 %	25 %	0 %	384509946
117	NC_017305	TTGG	2	8	57810	57817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017305	AGGG	2	8	58574	58581	25 %	0 %	75 %	0 %	384509948
119	NC_017305	GCAC	2	8	59682	59689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017305	TGAC	2	8	59729	59736	25 %	25 %	25 %	25 %	384509949
121	NC_017305	CGTT	2	8	59976	59983	0 %	50 %	25 %	25 %	384509949
122	NC_017305	AAAC	2	8	60022	60029	75 %	0 %	0 %	25 %	384509949
123	NC_017305	TCAT	2	8	60270	60277	25 %	50 %	0 %	25 %	384509949
124	NC_017305	TGCT	2	8	60763	60770	0 %	50 %	25 %	25 %	384509950
125	NC_017305	GTGC	2	8	61174	61181	0 %	25 %	50 %	25 %	384509951
126	NC_017305	CGTA	2	8	61306	61313	25 %	25 %	25 %	25 %	384509951
127	NC_017305	CTTT	2	8	61444	61451	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017305	ACCT	2	8	61936	61943	25 %	25 %	0 %	50 %	384509952
129	NC_017305	ATAC	2	8	62095	62102	50 %	25 %	0 %	25 %	384509952
130	NC_017305	CATG	2	8	62119	62126	25 %	25 %	25 %	25 %	384509952
131	NC_017305	GCGG	2	8	63096	63103	0 %	0 %	75 %	25 %	384509953
132	NC_017305	AACA	2	8	63127	63134	75 %	0 %	0 %	25 %	384509953
133	NC_017305	GATT	2	8	65392	65399	25 %	50 %	25 %	0 %	384509954
134	NC_017305	CCAG	2	8	66225	66232	25 %	0 %	25 %	50 %	384509955
135	NC_017305	GGTG	2	8	66441	66448	0 %	25 %	75 %	0 %	384509955
136	NC_017305	ATCC	2	8	66732	66739	25 %	25 %	0 %	50 %	384509955
137	NC_017305	GGCT	2	8	67969	67976	0 %	25 %	50 %	25 %	384509956
138	NC_017305	GCTG	2	8	68511	68518	0 %	25 %	50 %	25 %	384509957
139	NC_017305	CTTG	2	8	68836	68843	0 %	50 %	25 %	25 %	384509957
140	NC_017305	TCCA	2	8	68979	68986	25 %	25 %	0 %	50 %	384509957
141	NC_017305	AGTG	2	8	69198	69205	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017305	GGTT	2	8	69716	69723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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