MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017305	TAAA	2	8	1829	1836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017305	TCGC	2	8	8248	8255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017305	GAAA	2	8	20225	20232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017305	TCAT	2	8	23817	23824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017305	TGAT	2	8	23835	23842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017305	GCTA	2	8	29129	29136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017305	TACT	2	8	39036	39043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017305	AAGA	2	8	39118	39125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017305	TGCG	2	8	39568	39575	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017305	GCTG	2	8	41456	41463	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017305	AATG	2	8	44451	44458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017305	AAAT	2	8	46095	46102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017305	TTGC	2	8	47824	47831	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017305	ATTA	2	8	47899	47906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017305	GTTT	2	8	50901	50908	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017305	TTGG	2	8	57810	57817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017305	GCAC	2	8	59682	59689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017305	CTTT	2	8	61444	61451	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017305	AGTG	2	8	69198	69205	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017305	GGTT	2	8	69716	69723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017305	GGAA	2	8	74758	74765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017305	TAAT	2	8	76506	76513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017305	TCCT	2	8	79233	79240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017305	TGGG	2	8	85954	85961	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017305	CTTT	2	8	86038	86045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017305	GAAG	2	8	88631	88638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017305	TCTT	2	8	90235	90242	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017305	TCTT	2	8	104986	104993	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017305	GCAG	2	8	112218	112225	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017305	GAGG	2	8	113661	113668	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017305	TACC	2	8	117300	117307	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017305	GAAT	2	8	117327	117334	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017305	GGCA	2	8	117337	117344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017305	CCAC	2	8	119590	119597	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_017305	TCCT	2	8	121287	121294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017305	TCTT	2	8	121491	121498	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017305	TTGG	2	8	124445	124452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017305	GCCG	2	8	124881	124888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017305	GGCA	2	8	124890	124897	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017305	ATTT	2	8	127477	127484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017305	TGTT	2	8	129824	129831	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017305	TGGA	2	8	132432	132439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017305	TGCG	2	8	140979	140986	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017305	CAAA	2	8	150001	150008	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017305	GCCC	2	8	153923	153930	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_017305	CTGC	2	8	154060	154067	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017305	TTCC	2	8	155681	155688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017305	ATGC	2	8	157175	157182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017305	ATCA	2	8	160663	160670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017305	ATAC	2	8	160736	160743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017305	CAGG	2	8	160756	160763	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017305	GTAG	2	8	160870	160877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017305	CGGC	2	8	163037	163044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017305	TTTG	2	8	164202	164209	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017305	ATGC	2	8	164228	164235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017305	GATG	2	8	169115	169122	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017305	TGTT	2	8	169189	169196	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017305	TCCC	2	8	169458	169465	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_017305	GAGG	2	8	171133	171140	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017305	TGCT	2	8	171147	171154	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017305	AAAT	2	8	171426	171433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017305	GGAC	2	8	171688	171695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017305	ATAG	2	8	175154	175161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017305	AAAT	2	8	178950	178957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017305	AGCC	2	8	184420	184427	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017305	ATCT	2	8	186295	186302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017305	CAGT	2	8	195076	195083	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017305	ATGG	2	8	196662	196669	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017305	TCAC	2	8	202699	202706	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017305	GAAT	2	8	207417	207424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017305	AAGC	2	8	207754	207761	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017305	AAGC	2	8	207851	207858	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017305	CTTT	2	8	207965	207972	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017305	TCAC	2	8	208143	208150	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017305	ATCT	2	8	208328	208335	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017305	ACGA	2	8	208435	208442	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017305	ATTG	2	8	209239	209246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017305	CAAA	2	8	210396	210403	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017305	CGAA	2	8	210491	210498	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017305	GTTC	2	8	214537	214544	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017305	TAGA	2	8	222968	222975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017305	GCCC	2	8	224798	224805	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_017305	GTCT	2	8	225156	225163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017305	TTCA	2	8	235938	235945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017305	TCCT	2	8	237944	237951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017305	GATA	2	8	238059	238066	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017305	GTAG	2	8	238073	238080	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017305	CCTA	2	8	238102	238109	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017305	AGCC	2	8	241020	241027	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017305	TTTA	2	8	243302	243309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017305	CGCC	2	8	251140	251147	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_017305	AGTT	2	8	252303	252310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017305	TAAA	2	8	252437	252444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017305	ACTC	2	8	260042	260049	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017305	ATGA	2	8	260514	260521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017305	ATTA	2	8	260577	260584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017305	GAAT	2	8	265192	265199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017305	TATT	2	8	267743	267750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017305	GTTC	2	8	280755	280762	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017305	GCGG	2	8	281215	281222	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017305	TCCC	2	8	287029	287036	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_017305	ATCA	2	8	293235	293242	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017305	CTCG	2	8	294372	294379	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017305	AAGG	2	8	294418	294425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017305	GCTG	2	8	310541	310548	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017305	AGGT	2	8	310589	310596	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017305	ATAA	2	8	310603	310610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017305	TGGA	2	8	310789	310796	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017305	ATCG	2	8	312149	312156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017305	TGCC	2	8	313374	313381	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017305	CCTT	2	8	319717	319724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017305	GCTT	2	8	321922	321929	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017305	GACC	2	8	325138	325145	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017305	TGCT	2	8	325724	325731	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017305	AGGA	2	8	329143	329150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017305	AGCG	2	8	333099	333106	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017305	GTAT	2	8	338930	338937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017305	AGTA	2	8	348954	348961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017305	ACTT	2	8	350002	350009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017305	GCTT	2	8	356265	356272	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017305	TGGT	2	8	356342	356349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017305	AGTG	2	8	357614	357621	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017305	TCCT	2	8	359845	359852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017305	GCCG	2	8	359926	359933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017305	ATTA	2	8	376742	376749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017305	GGGA	2	8	378775	378782	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017305	ATTA	2	8	379040	379047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017305	AAGA	2	8	382256	382263	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017305	TTAA	2	8	383440	383447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017305	CTTT	2	8	383872	383879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017305	AGCG	2	8	385231	385238	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017305	TCGC	2	8	397256	397263	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017305	ACTA	2	8	397266	397273	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017305	CTTG	2	8	397453	397460	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017305	TTTA	2	8	397761	397768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017305	TGAA	2	8	400124	400131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017305	ATTG	2	8	400192	400199	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017305	CATG	2	8	400452	400459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017305	GCTG	2	8	400759	400766	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017305	TCCG	2	8	404671	404678	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017305	AGTC	2	8	412055	412062	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017305	GGGA	2	8	418706	418713	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017305	AGGC	2	8	419392	419399	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017305	CTGG	2	8	419635	419642	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017305	AGAC	2	8	419650	419657	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017305	AAAC	2	8	422767	422774	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017305	GCAG	2	8	423280	423287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017305	TGAG	2	8	423333	423340	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017305	CGGA	2	8	423605	423612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017305	TTGA	2	8	426875	426882	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017305	TTCT	2	8	426908	426915	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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153	NC_017305	ATGC	2	8	436775	436782	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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172	NC_017305	GTCC	2	8	482884	482891	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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498	NC_017305	CTTT	2	8	1495473	1495480	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
499	NC_017305	GCCG	2	8	1500918	1500925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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