MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 31666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017305	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509885
2	NC_017305	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509885
3	NC_017305	TTA	2	6	330	335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384509885
4	NC_017305	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509885
5	NC_017305	CTT	2	6	458	463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509885
6	NC_017305	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509885
7	NC_017305	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509885
8	NC_017305	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509885
9	NC_017305	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509885
10	NC_017305	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509885
11	NC_017305	GAT	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509885
12	NC_017305	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384509885
13	NC_017305	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509885
14	NC_017305	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509885
15	NC_017305	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509885
16	NC_017305	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509885
17	NC_017305	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509885
18	NC_017305	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509885
19	NC_017305	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509885
20	NC_017305	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509885
21	NC_017305	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509885
22	NC_017305	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509885
23	NC_017305	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509885
24	NC_017305	AGT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017305	TTA	2	6	2194	2199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384509886
26	NC_017305	AAC	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017305	TGC	2	6	2308	2313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017305	GAG	2	6	2378	2383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017305	TAC	2	6	2495	2500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509887
30	NC_017305	TCA	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509887
31	NC_017305	GAT	2	6	2521	2526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509887
32	NC_017305	GCT	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509887
33	NC_017305	CAT	2	6	2637	2642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509887
34	NC_017305	GCA	3	9	2827	2835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509887
35	NC_017305	GCT	2	6	3168	3173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509887
36	NC_017305	CGG	2	6	3305	3310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509887
37	NC_017305	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509887
38	NC_017305	GAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509887
39	NC_017305	CTG	2	6	3592	3597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017305	TTG	2	6	3764	3769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509888
41	NC_017305	CTG	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509888
42	NC_017305	GTG	2	6	4025	4030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509888
43	NC_017305	TTG	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509888
44	NC_017305	GAT	2	6	4183	4188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509888
45	NC_017305	GAG	2	6	4387	4392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509888
46	NC_017305	CGT	2	6	4394	4399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509888
47	NC_017305	GAC	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509888
48	NC_017305	CGA	2	6	4647	4652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509888
49	NC_017305	CTG	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509889
50	NC_017305	AGA	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509889
51	NC_017305	TGC	2	6	4906	4911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509889
52	NC_017305	GCG	2	6	4930	4935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509889
53	NC_017305	ACG	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509889
54	NC_017305	CGG	2	6	5143	5148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509889
55	NC_017305	TGG	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509889
56	NC_017305	AGC	2	6	5191	5196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509889
57	NC_017305	ATG	2	6	5276	5281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509889
58	NC_017305	TAA	2	6	5542	5547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017305	CGG	2	6	5768	5773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509890
60	NC_017305	TGG	2	6	5867	5872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509890
61	NC_017305	GGT	2	6	5904	5909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509890
62	NC_017305	ACC	2	6	6057	6062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509890
63	NC_017305	ACC	3	9	6096	6104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509890
64	NC_017305	CAT	2	6	6116	6121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509890
65	NC_017305	TCG	2	6	6125	6130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509890
66	NC_017305	GAA	2	6	6198	6203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509890
67	NC_017305	TGA	2	6	6224	6229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509890
68	NC_017305	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509890
69	NC_017305	GAA	2	6	6308	6313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509890
70	NC_017305	GAA	2	6	6320	6325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509890
71	NC_017305	TTA	2	6	6335	6340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384509890
72	NC_017305	TGA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509890
73	NC_017305	GAA	2	6	6531	6536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509890
74	NC_017305	TGA	2	6	6562	6567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509890
75	NC_017305	TCT	2	6	6816	6821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509890
76	NC_017305	GGC	2	6	6836	6841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509890
77	NC_017305	TGG	2	6	6887	6892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509890
78	NC_017305	GGT	2	6	6972	6977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509890
79	NC_017305	ATT	2	6	7095	7100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384509890
80	NC_017305	ATG	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509890
81	NC_017305	CAA	2	6	7139	7144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509890
82	NC_017305	GCT	3	9	7208	7216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509890
83	NC_017305	TTG	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509890
84	NC_017305	CCG	2	6	7278	7283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509890
85	NC_017305	GAA	2	6	7356	7361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509890
86	NC_017305	CAA	2	6	7385	7390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509890
87	NC_017305	GAT	2	6	7392	7397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509890
88	NC_017305	ATG	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509890
89	NC_017305	TGA	2	6	7514	7519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509890
90	NC_017305	TCG	2	6	7556	7561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509890
91	NC_017305	TAG	3	9	7671	7679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017305	TTC	2	6	7896	7901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509891
93	NC_017305	GAG	2	6	7944	7949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509891
94	NC_017305	AGC	2	6	7956	7961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509891
95	NC_017305	TGC	2	6	7992	7997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509891
96	NC_017305	GAG	2	6	8103	8108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509891
97	NC_017305	ATG	2	6	8148	8153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017305	GTT	2	6	8206	8211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017305	CAA	2	6	8236	8241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017305	TTC	2	6	8263	8268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017305	ATT	2	6	8301	8306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384509892
102	NC_017305	TTA	2	6	8408	8413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017305	CTG	2	6	8545	8550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509893
104	NC_017305	GGA	2	6	8569	8574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509893
105	NC_017305	TGT	2	6	8590	8595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509893
106	NC_017305	CTG	2	6	8598	8603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509893
107	NC_017305	TGC	2	6	8649	8654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509893
108	NC_017305	GTC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509893
109	NC_017305	GCG	2	6	8721	8726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509894
110	NC_017305	TGA	2	6	8807	8812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509894
111	NC_017305	GCT	2	6	8824	8829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509894
112	NC_017305	CGA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509895
113	NC_017305	GCG	2	6	9099	9104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509895
114	NC_017305	GAG	2	6	9140	9145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509895
115	NC_017305	CCG	2	6	9232	9237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509895
116	NC_017305	ACG	2	6	9438	9443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509895
117	NC_017305	CGC	2	6	9448	9453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509895
118	NC_017305	TTC	2	6	9570	9575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509895
119	NC_017305	TGA	2	6	9597	9602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509895
120	NC_017305	TCT	2	6	9678	9683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509895
121	NC_017305	GAA	2	6	9857	9862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509895
122	NC_017305	TGC	2	6	10155	10160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509895
123	NC_017305	TTA	2	6	10162	10167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384509895
124	NC_017305	TCG	2	6	10195	10200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509895
125	NC_017305	GAA	2	6	10217	10222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509895
126	NC_017305	CGA	2	6	10276	10281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509895
127	NC_017305	AGA	2	6	10419	10424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509895
128	NC_017305	CGT	2	6	10553	10558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509895
129	NC_017305	ATT	2	6	10565	10570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384509895
130	NC_017305	GAA	2	6	10592	10597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509895
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255	NC_017305	TGT	2	6	18017	18022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509903
256	NC_017305	CAG	2	6	18164	18169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509903
257	NC_017305	CGC	2	6	18257	18262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509903
258	NC_017305	TGC	2	6	18269	18274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509903
259	NC_017305	ATG	2	6	18359	18364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509904
260	NC_017305	ACT	2	6	18521	18526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509904
261	NC_017305	CAT	2	6	18562	18567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509904
262	NC_017305	GGT	2	6	18587	18592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509904
263	NC_017305	GGC	2	6	18614	18619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509904
264	NC_017305	TCC	2	6	18675	18680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384509904
265	NC_017305	GTG	2	6	18734	18739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509904
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270	NC_017305	TCC	2	6	18994	18999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384509905
271	NC_017305	TCA	2	6	19051	19056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509905
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273	NC_017305	TTA	2	6	19300	19305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384509905
274	NC_017305	CTG	2	6	19357	19362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509905
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277	NC_017305	ATC	2	6	19621	19626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509905
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280	NC_017305	GTT	2	6	19718	19723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509905
281	NC_017305	GCA	2	6	19773	19778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509906
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284	NC_017305	GAA	2	6	20100	20105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_017305	TGG	2	6	20281	20286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
286	NC_017305	GCT	2	6	20367	20372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_017305	CGA	2	6	20406	20411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_017305	CAG	2	6	20559	20564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_017305	GAA	2	6	20828	20833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509908
290	NC_017305	CAT	2	6	20865	20870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509908
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293	NC_017305	AGT	2	6	21033	21038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_017305	CCT	2	6	21094	21099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384509909
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298	NC_017305	GAT	2	6	21319	21324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
299	NC_017305	GCA	2	6	21365	21370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
300	NC_017305	CGA	2	6	21591	21596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509910
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323	NC_017305	AAT	2	6	23703	23708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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325	NC_017305	TTG	2	6	24077	24082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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375	NC_017305	ACC	2	6	27547	27552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509918
376	NC_017305	GCT	2	6	27553	27558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509918
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496	NC_017305	AAG	2	6	35556	35561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509924
497	NC_017305	TAC	2	6	35631	35636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509924
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499	NC_017305	CGT	2	6	35947	35952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509924
500	NC_017305	AGC	2	6	36069	36074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509925

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