MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium thermocellum DSM 1313 chromosome

Total Repeats: 9283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017304	CATT	2	8	39	46	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017304	TGAA	2	8	225	232	50 %	25 %	25 %	0 %	385777387
3	NC_017304	ATGC	2	8	680	687	25 %	25 %	25 %	25 %	385777387
4	NC_017304	CAAA	2	8	915	922	75 %	0 %	0 %	25 %	385777387
5	NC_017304	GAAA	2	8	952	959	75 %	0 %	25 %	0 %	385777387
6	NC_017304	TCCC	2	8	1397	1404	0 %	25 %	0 %	75 %	385777387
7	NC_017304	CATG	2	8	1451	1458	25 %	25 %	25 %	25 %	385777387
8	NC_017304	GGAA	2	8	1825	1832	50 %	0 %	50 %	0 %	385777388
9	NC_017304	GGAA	2	8	1882	1889	50 %	0 %	50 %	0 %	385777388
10	NC_017304	GGAA	2	8	2230	2237	50 %	0 %	50 %	0 %	385777388
11	NC_017304	AATA	3	12	2881	2892	75 %	25 %	0 %	0 %	385777388
12	NC_017304	AAAT	2	8	3419	3426	75 %	25 %	0 %	0 %	385777390
13	NC_017304	GACG	2	8	3774	3781	25 %	0 %	50 %	25 %	385777390
14	NC_017304	ATGT	2	8	4265	4272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017304	TTAT	3	12	4603	4614	25 %	75 %	0 %	0 %	385777391
16	NC_017304	GCAA	2	8	4775	4782	50 %	0 %	25 %	25 %	385777392
17	NC_017304	GCGG	2	8	5085	5092	0 %	0 %	75 %	25 %	385777392
18	NC_017304	ATTT	2	8	5508	5515	25 %	75 %	0 %	0 %	385777392
19	NC_017304	GAGG	2	8	5619	5626	25 %	0 %	75 %	0 %	385777392
20	NC_017304	ATTA	2	8	6932	6939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017304	CAAG	2	8	6972	6979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017304	TGAA	2	8	7158	7165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017304	TAAT	2	8	7285	7292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017304	AATC	2	8	7857	7864	50 %	25 %	0 %	25 %	385777393
25	NC_017304	ATTG	2	8	8054	8061	25 %	50 %	25 %	0 %	385777393
26	NC_017304	AAAT	2	8	8546	8553	75 %	25 %	0 %	0 %	385777394
27	NC_017304	TGAA	2	8	8858	8865	50 %	25 %	25 %	0 %	385777394
28	NC_017304	GCTG	2	8	9111	9118	0 %	25 %	50 %	25 %	385777394
29	NC_017304	TAAA	2	8	9161	9168	75 %	25 %	0 %	0 %	385777394
30	NC_017304	GATT	2	8	9290	9297	25 %	50 %	25 %	0 %	385777394
31	NC_017304	AAAC	2	8	9841	9848	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017304	ATTG	2	8	9939	9946	25 %	50 %	25 %	0 %	385777395
33	NC_017304	TAAT	2	8	11086	11093	50 %	50 %	0 %	0 %	385777396
34	NC_017304	ATAA	2	8	11152	11159	75 %	25 %	0 %	0 %	385777396
35	NC_017304	GTAT	2	8	11237	11244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017304	TTAA	2	8	11284	11291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017304	AAAC	2	8	11466	11473	75 %	0 %	0 %	25 %	385777397
38	NC_017304	AAGT	2	8	11978	11985	50 %	25 %	25 %	0 %	385777397
39	NC_017304	TAAG	2	8	12652	12659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017304	AAAG	2	8	13498	13505	75 %	0 %	25 %	0 %	385777398
41	NC_017304	AAGT	2	8	13666	13673	50 %	25 %	25 %	0 %	385777398
42	NC_017304	TGAT	2	8	14051	14058	25 %	50 %	25 %	0 %	385777398
43	NC_017304	TTAT	2	8	14595	14602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017304	ATAA	2	8	14674	14681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017304	ATAA	2	8	14791	14798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017304	GTAA	2	8	14839	14846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017304	ATTT	2	8	14848	14855	25 %	75 %	0 %	0 %	385777399
48	NC_017304	AAAT	2	8	15478	15485	75 %	25 %	0 %	0 %	385777399
49	NC_017304	CCGT	2	8	15592	15599	0 %	25 %	25 %	50 %	385777399
50	NC_017304	TCTT	2	8	15665	15672	0 %	75 %	0 %	25 %	385777399
51	NC_017304	TTTA	2	8	16153	16160	25 %	75 %	0 %	0 %	385777400
52	NC_017304	TAAA	2	8	17395	17402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017304	TTAC	2	8	17647	17654	25 %	50 %	0 %	25 %	385777402
54	NC_017304	ACCT	2	8	17784	17791	25 %	25 %	0 %	50 %	385777402
55	NC_017304	TTGC	2	8	19273	19280	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017304	TCCG	2	8	20090	20097	0 %	25 %	25 %	50 %	385777403
57	NC_017304	ATTT	2	8	21379	21386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017304	TGTT	2	8	21458	21465	0 %	75 %	25 %	0 %	385777405
59	NC_017304	ACAA	2	8	21924	21931	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017304	ATAA	2	8	22004	22011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017304	AAAT	2	8	22982	22989	75 %	25 %	0 %	0 %	385777408
62	NC_017304	GGAT	2	8	23317	23324	25 %	25 %	50 %	0 %	385777408
63	NC_017304	TTCA	2	8	24328	24335	25 %	50 %	0 %	25 %	385777409
64	NC_017304	AGAA	2	8	25004	25011	75 %	0 %	25 %	0 %	385777409
65	NC_017304	AATT	2	8	25773	25780	50 %	50 %	0 %	0 %	385777411
66	NC_017304	TATC	2	8	26416	26423	25 %	50 %	0 %	25 %	385777412
67	NC_017304	TATG	2	8	26480	26487	25 %	50 %	25 %	0 %	385777412
68	NC_017304	AATT	2	8	27144	27151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017304	TAAA	2	8	27167	27174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017304	ACAA	2	8	27247	27254	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017304	AATG	2	8	27798	27805	50 %	25 %	25 %	0 %	385777413
72	NC_017304	CGTT	2	8	27806	27813	0 %	50 %	25 %	25 %	385777413
73	NC_017304	ATTT	2	8	27933	27940	25 %	75 %	0 %	0 %	385777413
74	NC_017304	AAAT	2	8	27979	27986	75 %	25 %	0 %	0 %	385777413
75	NC_017304	TAAA	3	12	28093	28104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017304	ATTA	2	8	28245	28252	50 %	50 %	0 %	0 %	385777414
77	NC_017304	TTTA	2	8	28529	28536	25 %	75 %	0 %	0 %	385777414
78	NC_017304	TGCT	2	8	28571	28578	0 %	50 %	25 %	25 %	385777414
79	NC_017304	ACCA	2	8	28758	28765	50 %	0 %	0 %	50 %	385777414
80	NC_017304	GCCT	2	8	29273	29280	0 %	25 %	25 %	50 %	385777414
81	NC_017304	GGAA	2	8	29664	29671	50 %	0 %	50 %	0 %	385777415
82	NC_017304	GAAA	2	8	30040	30047	75 %	0 %	25 %	0 %	385777415
83	NC_017304	CCGG	2	8	32141	32148	0 %	0 %	50 %	50 %	385777416
84	NC_017304	GAAG	2	8	32598	32605	50 %	0 %	50 %	0 %	385777417
85	NC_017304	GATG	2	8	32899	32906	25 %	25 %	50 %	0 %	385777417
86	NC_017304	GAAA	2	8	32923	32930	75 %	0 %	25 %	0 %	385777417
87	NC_017304	GTCA	2	8	33138	33145	25 %	25 %	25 %	25 %	385777417
88	NC_017304	CTTA	2	8	33937	33944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017304	ATTT	2	8	34080	34087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017304	TATT	2	8	34357	34364	25 %	75 %	0 %	0 %	385777419
91	NC_017304	AGGC	2	8	35105	35112	25 %	0 %	50 %	25 %	385777419
92	NC_017304	GGAT	2	8	35254	35261	25 %	25 %	50 %	0 %	385777419
93	NC_017304	AATT	2	8	36006	36013	50 %	50 %	0 %	0 %	385777420
94	NC_017304	GAAG	2	8	36157	36164	50 %	0 %	50 %	0 %	385777420
95	NC_017304	ATGA	2	8	36310	36317	50 %	25 %	25 %	0 %	385777420
96	NC_017304	TGAA	2	8	36530	36537	50 %	25 %	25 %	0 %	385777420
97	NC_017304	AGTG	2	8	36790	36797	25 %	25 %	50 %	0 %	385777420
98	NC_017304	ACAA	2	8	36813	36820	75 %	0 %	0 %	25 %	385777420
99	NC_017304	TTGA	2	8	38221	38228	25 %	50 %	25 %	0 %	385777423
100	NC_017304	TGTT	2	8	38456	38463	0 %	75 %	25 %	0 %	385777423
101	NC_017304	AAAT	2	8	39231	39238	75 %	25 %	0 %	0 %	385777424
102	NC_017304	AAAG	2	8	39487	39494	75 %	0 %	25 %	0 %	385777424
103	NC_017304	TTGA	2	8	40623	40630	25 %	50 %	25 %	0 %	385777425
104	NC_017304	GTTT	2	8	41987	41994	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017304	GGAC	2	8	42522	42529	25 %	0 %	50 %	25 %	385777427
106	NC_017304	TCAG	2	8	42808	42815	25 %	25 %	25 %	25 %	385777427
107	NC_017304	CGGA	2	8	42986	42993	25 %	0 %	50 %	25 %	385777427
108	NC_017304	TTGC	2	8	43172	43179	0 %	50 %	25 %	25 %	385777427
109	NC_017304	GAAA	2	8	43374	43381	75 %	0 %	25 %	0 %	385777427
110	NC_017304	CAGA	2	8	43509	43516	50 %	0 %	25 %	25 %	385777427
111	NC_017304	ATAA	2	8	44043	44050	75 %	25 %	0 %	0 %	385777428
112	NC_017304	GAAC	2	8	44825	44832	50 %	0 %	25 %	25 %	385777428
113	NC_017304	TTTG	2	8	45399	45406	0 %	75 %	25 %	0 %	385777429
114	NC_017304	GCTT	2	8	45433	45440	0 %	50 %	25 %	25 %	385777429
115	NC_017304	GAAA	2	8	45665	45672	75 %	0 %	25 %	0 %	385777429
116	NC_017304	GGAT	2	8	46892	46899	25 %	25 %	50 %	0 %	385777429
117	NC_017304	AAAT	2	8	46904	46911	75 %	25 %	0 %	0 %	385777429
118	NC_017304	GGAT	2	8	48325	48332	25 %	25 %	50 %	0 %	385777430
119	NC_017304	TTTC	2	8	48852	48859	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017304	TTTG	2	8	48861	48868	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017304	TTTC	2	8	48968	48975	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017304	CTGT	2	8	49097	49104	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017304	CATT	2	8	49884	49891	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017304	AGTG	2	8	51612	51619	25 %	25 %	50 %	0 %	385777432
125	NC_017304	ACAA	2	8	51905	51912	75 %	0 %	0 %	25 %	385777432
126	NC_017304	GAAA	2	8	52015	52022	75 %	0 %	25 %	0 %	385777432
127	NC_017304	ACTT	2	8	52038	52045	25 %	50 %	0 %	25 %	385777432
128	NC_017304	GCAA	2	8	52266	52273	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017304	AAAG	2	8	52310	52317	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017304	AATA	2	8	52684	52691	75 %	25 %	0 %	0 %	385777433
131	NC_017304	TTTC	2	8	52708	52715	0 %	75 %	0 %	25 %	385777433
132	NC_017304	TTTG	2	8	52792	52799	0 %	75 %	25 %	0 %	385777433
133	NC_017304	TGTT	2	8	53274	53281	0 %	75 %	25 %	0 %	385777433
134	NC_017304	AAAT	2	8	53349	53356	75 %	25 %	0 %	0 %	385777433
135	NC_017304	GATT	2	8	53692	53699	25 %	50 %	25 %	0 %	385777434
136	NC_017304	TTTC	2	8	53742	53749	0 %	75 %	0 %	25 %	385777434
137	NC_017304	TTGC	2	8	54299	54306	0 %	50 %	25 %	25 %	385777434
138	NC_017304	CTGC	2	8	54550	54557	0 %	25 %	25 %	50 %	385777434
139	NC_017304	GGTT	2	8	54853	54860	0 %	50 %	50 %	0 %	385777435
140	NC_017304	TGGA	2	8	55020	55027	25 %	25 %	50 %	0 %	385777435
141	NC_017304	TTTC	2	8	55342	55349	0 %	75 %	0 %	25 %	385777435
142	NC_017304	CTTC	2	8	55372	55379	0 %	50 %	0 %	50 %	385777435
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144	NC_017304	AGAA	2	8	56125	56132	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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