MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium thermocellum DSM 1313 chromosome

Total Repeats: 7252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017304	TGAA	2	8	225	232	50 %	25 %	25 %	0 %	385777387
2	NC_017304	ATGC	2	8	680	687	25 %	25 %	25 %	25 %	385777387
3	NC_017304	CAAA	2	8	915	922	75 %	0 %	0 %	25 %	385777387
4	NC_017304	GAAA	2	8	952	959	75 %	0 %	25 %	0 %	385777387
5	NC_017304	TCCC	2	8	1397	1404	0 %	25 %	0 %	75 %	385777387
6	NC_017304	CATG	2	8	1451	1458	25 %	25 %	25 %	25 %	385777387
7	NC_017304	GGAA	2	8	1825	1832	50 %	0 %	50 %	0 %	385777388
8	NC_017304	GGAA	2	8	1882	1889	50 %	0 %	50 %	0 %	385777388
9	NC_017304	GGAA	2	8	2230	2237	50 %	0 %	50 %	0 %	385777388
10	NC_017304	AATA	3	12	2881	2892	75 %	25 %	0 %	0 %	385777388
11	NC_017304	AAAT	2	8	3419	3426	75 %	25 %	0 %	0 %	385777390
12	NC_017304	GACG	2	8	3774	3781	25 %	0 %	50 %	25 %	385777390
13	NC_017304	TTAT	3	12	4603	4614	25 %	75 %	0 %	0 %	385777391
14	NC_017304	GCAA	2	8	4775	4782	50 %	0 %	25 %	25 %	385777392
15	NC_017304	GCGG	2	8	5085	5092	0 %	0 %	75 %	25 %	385777392
16	NC_017304	ATTT	2	8	5508	5515	25 %	75 %	0 %	0 %	385777392
17	NC_017304	GAGG	2	8	5619	5626	25 %	0 %	75 %	0 %	385777392
18	NC_017304	AATC	2	8	7857	7864	50 %	25 %	0 %	25 %	385777393
19	NC_017304	ATTG	2	8	8054	8061	25 %	50 %	25 %	0 %	385777393
20	NC_017304	AAAT	2	8	8546	8553	75 %	25 %	0 %	0 %	385777394
21	NC_017304	TGAA	2	8	8858	8865	50 %	25 %	25 %	0 %	385777394
22	NC_017304	GCTG	2	8	9111	9118	0 %	25 %	50 %	25 %	385777394
23	NC_017304	TAAA	2	8	9161	9168	75 %	25 %	0 %	0 %	385777394
24	NC_017304	GATT	2	8	9290	9297	25 %	50 %	25 %	0 %	385777394
25	NC_017304	ATTG	2	8	9939	9946	25 %	50 %	25 %	0 %	385777395
26	NC_017304	TAAT	2	8	11086	11093	50 %	50 %	0 %	0 %	385777396
27	NC_017304	ATAA	2	8	11152	11159	75 %	25 %	0 %	0 %	385777396
28	NC_017304	AAAC	2	8	11466	11473	75 %	0 %	0 %	25 %	385777397
29	NC_017304	AAGT	2	8	11978	11985	50 %	25 %	25 %	0 %	385777397
30	NC_017304	AAAG	2	8	13498	13505	75 %	0 %	25 %	0 %	385777398
31	NC_017304	AAGT	2	8	13666	13673	50 %	25 %	25 %	0 %	385777398
32	NC_017304	TGAT	2	8	14051	14058	25 %	50 %	25 %	0 %	385777398
33	NC_017304	ATTT	2	8	14848	14855	25 %	75 %	0 %	0 %	385777399
34	NC_017304	AAAT	2	8	15478	15485	75 %	25 %	0 %	0 %	385777399
35	NC_017304	CCGT	2	8	15592	15599	0 %	25 %	25 %	50 %	385777399
36	NC_017304	TCTT	2	8	15665	15672	0 %	75 %	0 %	25 %	385777399
37	NC_017304	TTTA	2	8	16153	16160	25 %	75 %	0 %	0 %	385777400
38	NC_017304	TTAC	2	8	17647	17654	25 %	50 %	0 %	25 %	385777402
39	NC_017304	ACCT	2	8	17784	17791	25 %	25 %	0 %	50 %	385777402
40	NC_017304	TCCG	2	8	20090	20097	0 %	25 %	25 %	50 %	385777403
41	NC_017304	TGTT	2	8	21458	21465	0 %	75 %	25 %	0 %	385777405
42	NC_017304	AAAT	2	8	22982	22989	75 %	25 %	0 %	0 %	385777408
43	NC_017304	GGAT	2	8	23317	23324	25 %	25 %	50 %	0 %	385777408
44	NC_017304	TTCA	2	8	24328	24335	25 %	50 %	0 %	25 %	385777409
45	NC_017304	AGAA	2	8	25004	25011	75 %	0 %	25 %	0 %	385777409
46	NC_017304	AATT	2	8	25773	25780	50 %	50 %	0 %	0 %	385777411
47	NC_017304	TATC	2	8	26416	26423	25 %	50 %	0 %	25 %	385777412
48	NC_017304	TATG	2	8	26480	26487	25 %	50 %	25 %	0 %	385777412
49	NC_017304	AATG	2	8	27798	27805	50 %	25 %	25 %	0 %	385777413
50	NC_017304	CGTT	2	8	27806	27813	0 %	50 %	25 %	25 %	385777413
51	NC_017304	ATTT	2	8	27933	27940	25 %	75 %	0 %	0 %	385777413
52	NC_017304	AAAT	2	8	27979	27986	75 %	25 %	0 %	0 %	385777413
53	NC_017304	ATTA	2	8	28245	28252	50 %	50 %	0 %	0 %	385777414
54	NC_017304	TTTA	2	8	28529	28536	25 %	75 %	0 %	0 %	385777414
55	NC_017304	TGCT	2	8	28571	28578	0 %	50 %	25 %	25 %	385777414
56	NC_017304	ACCA	2	8	28758	28765	50 %	0 %	0 %	50 %	385777414
57	NC_017304	GCCT	2	8	29273	29280	0 %	25 %	25 %	50 %	385777414
58	NC_017304	GGAA	2	8	29664	29671	50 %	0 %	50 %	0 %	385777415
59	NC_017304	GAAA	2	8	30040	30047	75 %	0 %	25 %	0 %	385777415
60	NC_017304	CCGG	2	8	32141	32148	0 %	0 %	50 %	50 %	385777416
61	NC_017304	GAAG	2	8	32598	32605	50 %	0 %	50 %	0 %	385777417
62	NC_017304	GATG	2	8	32899	32906	25 %	25 %	50 %	0 %	385777417
63	NC_017304	GAAA	2	8	32923	32930	75 %	0 %	25 %	0 %	385777417
64	NC_017304	GTCA	2	8	33138	33145	25 %	25 %	25 %	25 %	385777417
65	NC_017304	TATT	2	8	34357	34364	25 %	75 %	0 %	0 %	385777419
66	NC_017304	AGGC	2	8	35105	35112	25 %	0 %	50 %	25 %	385777419
67	NC_017304	GGAT	2	8	35254	35261	25 %	25 %	50 %	0 %	385777419
68	NC_017304	AATT	2	8	36006	36013	50 %	50 %	0 %	0 %	385777420
69	NC_017304	GAAG	2	8	36157	36164	50 %	0 %	50 %	0 %	385777420
70	NC_017304	ATGA	2	8	36310	36317	50 %	25 %	25 %	0 %	385777420
71	NC_017304	TGAA	2	8	36530	36537	50 %	25 %	25 %	0 %	385777420
72	NC_017304	AGTG	2	8	36790	36797	25 %	25 %	50 %	0 %	385777420
73	NC_017304	ACAA	2	8	36813	36820	75 %	0 %	0 %	25 %	385777420
74	NC_017304	TTGA	2	8	38221	38228	25 %	50 %	25 %	0 %	385777423
75	NC_017304	TGTT	2	8	38456	38463	0 %	75 %	25 %	0 %	385777423
76	NC_017304	AAAT	2	8	39231	39238	75 %	25 %	0 %	0 %	385777424
77	NC_017304	AAAG	2	8	39487	39494	75 %	0 %	25 %	0 %	385777424
78	NC_017304	TTGA	2	8	40623	40630	25 %	50 %	25 %	0 %	385777425
79	NC_017304	GGAC	2	8	42522	42529	25 %	0 %	50 %	25 %	385777427
80	NC_017304	TCAG	2	8	42808	42815	25 %	25 %	25 %	25 %	385777427
81	NC_017304	CGGA	2	8	42986	42993	25 %	0 %	50 %	25 %	385777427
82	NC_017304	TTGC	2	8	43172	43179	0 %	50 %	25 %	25 %	385777427
83	NC_017304	GAAA	2	8	43374	43381	75 %	0 %	25 %	0 %	385777427
84	NC_017304	CAGA	2	8	43509	43516	50 %	0 %	25 %	25 %	385777427
85	NC_017304	ATAA	2	8	44043	44050	75 %	25 %	0 %	0 %	385777428
86	NC_017304	GAAC	2	8	44825	44832	50 %	0 %	25 %	25 %	385777428
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88	NC_017304	GCTT	2	8	45433	45440	0 %	50 %	25 %	25 %	385777429
89	NC_017304	GAAA	2	8	45665	45672	75 %	0 %	25 %	0 %	385777429
90	NC_017304	GGAT	2	8	46892	46899	25 %	25 %	50 %	0 %	385777429
91	NC_017304	AAAT	2	8	46904	46911	75 %	25 %	0 %	0 %	385777429
92	NC_017304	GGAT	2	8	48325	48332	25 %	25 %	50 %	0 %	385777430
93	NC_017304	AGTG	2	8	51612	51619	25 %	25 %	50 %	0 %	385777432
94	NC_017304	ACAA	2	8	51905	51912	75 %	0 %	0 %	25 %	385777432
95	NC_017304	GAAA	2	8	52015	52022	75 %	0 %	25 %	0 %	385777432
96	NC_017304	ACTT	2	8	52038	52045	25 %	50 %	0 %	25 %	385777432
97	NC_017304	AATA	2	8	52684	52691	75 %	25 %	0 %	0 %	385777433
98	NC_017304	TTTC	2	8	52708	52715	0 %	75 %	0 %	25 %	385777433
99	NC_017304	TTTG	2	8	52792	52799	0 %	75 %	25 %	0 %	385777433
100	NC_017304	TGTT	2	8	53274	53281	0 %	75 %	25 %	0 %	385777433
101	NC_017304	AAAT	2	8	53349	53356	75 %	25 %	0 %	0 %	385777433
102	NC_017304	GATT	2	8	53692	53699	25 %	50 %	25 %	0 %	385777434
103	NC_017304	TTTC	2	8	53742	53749	0 %	75 %	0 %	25 %	385777434
104	NC_017304	TTGC	2	8	54299	54306	0 %	50 %	25 %	25 %	385777434
105	NC_017304	CTGC	2	8	54550	54557	0 %	25 %	25 %	50 %	385777434
106	NC_017304	GGTT	2	8	54853	54860	0 %	50 %	50 %	0 %	385777435
107	NC_017304	TGGA	2	8	55020	55027	25 %	25 %	50 %	0 %	385777435
108	NC_017304	TTTC	2	8	55342	55349	0 %	75 %	0 %	25 %	385777435
109	NC_017304	CTTC	2	8	55372	55379	0 %	50 %	0 %	50 %	385777435
110	NC_017304	ATGG	2	8	56181	56188	25 %	25 %	50 %	0 %	385777436
111	NC_017304	CAAA	2	8	56327	56334	75 %	0 %	0 %	25 %	385777436
112	NC_017304	ATGA	2	8	56521	56528	50 %	25 %	25 %	0 %	385777436
113	NC_017304	TCAG	2	8	57262	57269	25 %	25 %	25 %	25 %	385777436
114	NC_017304	TTGA	2	8	57433	57440	25 %	50 %	25 %	0 %	385777436
115	NC_017304	TTTG	2	8	57659	57666	0 %	75 %	25 %	0 %	385777436
116	NC_017304	ATTG	2	8	58077	58084	25 %	50 %	25 %	0 %	385777437
117	NC_017304	ATAA	2	8	59121	59128	75 %	25 %	0 %	0 %	385777438
118	NC_017304	GTTT	2	8	59175	59182	0 %	75 %	25 %	0 %	385777438
119	NC_017304	AATT	2	8	60388	60395	50 %	50 %	0 %	0 %	385777439
120	NC_017304	TTCC	2	8	60420	60427	0 %	50 %	0 %	50 %	385777439
121	NC_017304	TATT	2	8	60578	60585	25 %	75 %	0 %	0 %	385777439
122	NC_017304	TTGC	2	8	60923	60930	0 %	50 %	25 %	25 %	385777439
123	NC_017304	AATT	2	8	61138	61145	50 %	50 %	0 %	0 %	385777439
124	NC_017304	CATT	2	8	61644	61651	25 %	50 %	0 %	25 %	385777439
125	NC_017304	TTTA	2	8	62431	62438	25 %	75 %	0 %	0 %	385777439
126	NC_017304	CTTT	2	8	62653	62660	0 %	75 %	0 %	25 %	385777439
127	NC_017304	TATG	2	8	62827	62834	25 %	50 %	25 %	0 %	385777440
128	NC_017304	TTTC	2	8	63110	63117	0 %	75 %	0 %	25 %	385777440
129	NC_017304	TCCT	3	12	63435	63446	0 %	50 %	0 %	50 %	385777440
130	NC_017304	CCTT	2	8	64801	64808	0 %	50 %	0 %	50 %	385777441
131	NC_017304	GAAT	2	8	65384	65391	50 %	25 %	25 %	0 %	385777442
132	NC_017304	CAAC	2	8	65573	65580	50 %	0 %	0 %	50 %	385777442
133	NC_017304	AACT	2	8	65624	65631	50 %	25 %	0 %	25 %	385777442
134	NC_017304	ACAA	2	8	65720	65727	75 %	0 %	0 %	25 %	385777442
135	NC_017304	AAAC	2	8	67428	67435	75 %	0 %	0 %	25 %	385777444
136	NC_017304	GAAA	2	8	67783	67790	75 %	0 %	25 %	0 %	385777444
137	NC_017304	TAAA	2	8	68363	68370	75 %	25 %	0 %	0 %	385777445
138	NC_017304	AAAG	2	8	69693	69700	75 %	0 %	25 %	0 %	385777446
139	NC_017304	GAAG	2	8	70280	70287	50 %	0 %	50 %	0 %	385777446
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