MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis I19 chromosome

Total Repeats: 1300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017303	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	384507789
2	NC_017303	CACGC	2	10	5735	5744	20 %	0 %	20 %	60 %	384507794
3	NC_017303	TTATC	2	10	14086	14095	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017303	ACGTA	2	10	14249	14258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017303	CAGTA	2	10	14632	14641	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017303	CAGTG	2	10	15503	15512	20 %	20 %	40 %	20 %	384507804
7	NC_017303	AAAAT	2	10	16763	16772	80 %	20 %	0 %	0 %	384507805
8	NC_017303	TAGCG	2	10	18331	18340	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017303	CTTTT	2	10	19238	19247	0 %	80 %	0 %	20 %	384507809
10	NC_017303	GCTCT	2	10	19275	19284	0 %	40 %	20 %	40 %	384507809
11	NC_017303	TGGAT	2	10	23217	23226	20 %	40 %	40 %	0 %	384507818
12	NC_017303	TGCGT	2	10	24500	24509	0 %	40 %	40 %	20 %	384507819
13	NC_017303	CTGAT	2	10	28531	28540	20 %	40 %	20 %	20 %	384507823
14	NC_017303	GGAGC	2	10	29484	29493	20 %	0 %	60 %	20 %	384507824
15	NC_017303	TTGCT	2	10	30573	30582	0 %	60 %	20 %	20 %	384507825
16	NC_017303	TGAGG	2	10	37406	37415	20 %	20 %	60 %	0 %	384507829
17	NC_017303	CACAT	2	10	39590	39599	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017303	TGCGG	2	10	40523	40532	0 %	20 %	60 %	20 %	384507833
19	NC_017303	GCCTC	2	10	47300	47309	0 %	20 %	20 %	60 %	384507839
20	NC_017303	GAAGG	2	10	47314	47323	40 %	0 %	60 %	0 %	384507839
21	NC_017303	CAGTG	2	10	49245	49254	20 %	20 %	40 %	20 %	384507841
22	NC_017303	TGAGA	2	10	49587	49596	40 %	20 %	40 %	0 %	384507841
23	NC_017303	AGTGA	2	10	49637	49646	40 %	20 %	40 %	0 %	384507841
24	NC_017303	GCGGT	2	10	51787	51796	0 %	20 %	60 %	20 %	384507844
25	NC_017303	TTGGA	2	10	52673	52682	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017303	TTGAT	2	10	52708	52717	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017303	TGCAC	2	10	52802	52811	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017303	CTGGC	2	10	53061	53070	0 %	20 %	40 %	40 %	384507846
29	NC_017303	GCAGC	2	10	53560	53569	20 %	0 %	40 %	40 %	384507846
30	NC_017303	GACTG	2	10	53576	53585	20 %	20 %	40 %	20 %	384507846
31	NC_017303	AAGGC	2	10	55817	55826	40 %	0 %	40 %	20 %	384507848
32	NC_017303	ATGGC	2	10	58677	58686	20 %	20 %	40 %	20 %	384507852
33	NC_017303	ATGTG	2	10	62847	62856	20 %	40 %	40 %	0 %	384507856
34	NC_017303	TCTGT	2	10	64664	64673	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017303	GCTGG	2	10	65005	65014	0 %	20 %	60 %	20 %	384507858
36	NC_017303	AGGGA	2	10	67613	67622	40 %	0 %	60 %	0 %	384507860
37	NC_017303	AAGAT	2	10	69420	69429	60 %	20 %	20 %	0 %	384507862
38	NC_017303	GGAGC	2	10	69527	69536	20 %	0 %	60 %	20 %	384507862
39	NC_017303	GGTCT	2	10	71241	71250	0 %	40 %	40 %	20 %	384507864
40	NC_017303	CATGT	2	10	71817	71826	20 %	40 %	20 %	20 %	384507865
41	NC_017303	CAGCG	2	10	72694	72703	20 %	0 %	40 %	40 %	384507866
42	NC_017303	CAGGC	2	10	73100	73109	20 %	0 %	40 %	40 %	384507866
43	NC_017303	ATGGC	2	10	73945	73954	20 %	20 %	40 %	20 %	384507867
44	NC_017303	AGGCA	2	10	75265	75274	40 %	0 %	40 %	20 %	384507868
45	NC_017303	TAATT	2	10	76511	76520	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017303	GCTTT	2	10	81106	81115	0 %	60 %	20 %	20 %	384507875
47	NC_017303	TGACC	2	10	81362	81371	20 %	20 %	20 %	40 %	384507875
48	NC_017303	CGTTA	2	10	82104	82113	20 %	40 %	20 %	20 %	384507876
49	NC_017303	TGCTG	2	10	82738	82747	0 %	40 %	40 %	20 %	384507876
50	NC_017303	TGGCC	2	10	84729	84738	0 %	20 %	40 %	40 %	384507877
51	NC_017303	GCGAC	2	10	85533	85542	20 %	0 %	40 %	40 %	384507877
52	NC_017303	TGGGA	2	10	88948	88957	20 %	20 %	60 %	0 %	384507883
53	NC_017303	GATCG	2	10	90048	90057	20 %	20 %	40 %	20 %	384507885
54	NC_017303	CAAAA	2	10	90780	90789	80 %	0 %	0 %	20 %	384507886
55	NC_017303	AACAA	2	10	93621	93630	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017303	TGCAA	2	10	96628	96637	40 %	20 %	20 %	20 %	384507891
57	NC_017303	TGCAG	2	10	96848	96857	20 %	20 %	40 %	20 %	384507891
58	NC_017303	AGGTC	2	10	99284	99293	20 %	20 %	40 %	20 %	384507894
59	NC_017303	ACCAA	2	10	101143	101152	60 %	0 %	0 %	40 %	384507894
60	NC_017303	TCATC	2	10	102406	102415	20 %	40 %	0 %	40 %	384507895
61	NC_017303	TGCAC	2	10	104221	104230	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017303	ACCTG	2	10	104436	104445	20 %	20 %	20 %	40 %	384507896
63	NC_017303	CGGTG	2	10	104645	104654	0 %	20 %	60 %	20 %	384507896
64	NC_017303	CGGCG	2	10	107264	107273	0 %	0 %	60 %	40 %	384507899
65	NC_017303	CGCGG	2	10	107324	107333	0 %	0 %	60 %	40 %	384507900
66	NC_017303	CAGCG	2	10	107860	107869	20 %	0 %	40 %	40 %	384507901
67	NC_017303	GGATC	2	10	118423	118432	20 %	20 %	40 %	20 %	384507911
68	NC_017303	TGTTT	2	10	120895	120904	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017303	CGGGA	2	10	125539	125548	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017303	GACTG	2	10	127800	127809	20 %	20 %	40 %	20 %	384507917
71	NC_017303	TTGGT	2	10	129109	129118	0 %	60 %	40 %	0 %	384507917
72	NC_017303	TTAAG	2	10	130892	130901	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017303	GTGCG	2	10	131432	131441	0 %	20 %	60 %	20 %	384507919
74	NC_017303	GTGGC	2	10	133170	133179	0 %	20 %	60 %	20 %	384507920
75	NC_017303	CGCGT	2	10	133487	133496	0 %	20 %	40 %	40 %	384507921
76	NC_017303	GGGGC	2	10	133615	133624	0 %	0 %	80 %	20 %	384507921
77	NC_017303	AGACG	2	10	135420	135429	40 %	0 %	40 %	20 %	384507923
78	NC_017303	GGGGC	2	10	135638	135647	0 %	0 %	80 %	20 %	384507924
79	NC_017303	ACGGT	2	10	136794	136803	20 %	20 %	40 %	20 %	384507925
80	NC_017303	CGATC	2	10	137067	137076	20 %	20 %	20 %	40 %	384507925
81	NC_017303	TGGCC	2	10	137274	137283	0 %	20 %	40 %	40 %	384507925
82	NC_017303	TGGTG	2	10	137652	137661	0 %	40 %	60 %	0 %	384507925
83	NC_017303	GGAGT	2	10	138124	138133	20 %	20 %	60 %	0 %	384507925
84	NC_017303	ATTGC	2	10	142058	142067	20 %	40 %	20 %	20 %	384507928
85	NC_017303	AAAAC	2	10	144884	144893	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017303	TCACT	2	10	145929	145938	20 %	40 %	0 %	40 %	384507933
87	NC_017303	ATTTC	2	10	146546	146555	20 %	60 %	0 %	20 %	384507933
88	NC_017303	AATGG	2	10	150246	150255	40 %	20 %	40 %	0 %	384507936
89	NC_017303	GTGAG	2	10	151229	151238	20 %	20 %	60 %	0 %	384507938
90	NC_017303	CTGAA	2	10	152027	152036	40 %	20 %	20 %	20 %	384507938
91	NC_017303	CCAGC	2	10	153319	153328	20 %	0 %	20 %	60 %	384507939
92	NC_017303	TTGCC	2	10	153829	153838	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017303	GTACC	2	10	155788	155797	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017303	TACGC	2	10	156345	156354	20 %	20 %	20 %	40 %	384507941
95	NC_017303	GCGAC	2	10	159839	159848	20 %	0 %	40 %	40 %	384507946
96	NC_017303	GGTTG	2	10	161115	161124	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017303	CCTTG	2	10	161491	161500	0 %	40 %	20 %	40 %	384507947
98	NC_017303	GCATA	2	10	163215	163224	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017303	TGTGC	2	10	164438	164447	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017303	CGGTG	2	10	165460	165469	0 %	20 %	60 %	20 %	384507950
101	NC_017303	CATGG	2	10	167593	167602	20 %	20 %	40 %	20 %	384507952
102	NC_017303	CAGAT	2	10	167949	167958	40 %	20 %	20 %	20 %	384507952
103	NC_017303	GGATG	2	10	168847	168856	20 %	20 %	60 %	0 %	384507952
104	NC_017303	GGGAC	2	10	171473	171482	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017303	CACTT	2	10	171653	171662	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017303	AAACT	2	10	172531	172540	60 %	20 %	0 %	20 %	384507954
107	NC_017303	ACCGG	2	10	172926	172935	20 %	0 %	40 %	40 %	384507954
108	NC_017303	ATTGA	2	10	178736	178745	40 %	40 %	20 %	0 %	384507958
109	NC_017303	GTGGA	2	10	181145	181154	20 %	20 %	60 %	0 %	384507959
110	NC_017303	TTAAG	2	10	184477	184486	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017303	TGACC	2	10	185395	185404	20 %	20 %	20 %	40 %	384507962
112	NC_017303	AGGTG	2	10	186348	186357	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017303	TTGCA	2	10	186681	186690	20 %	40 %	20 %	20 %	384507964
114	NC_017303	GTTTG	2	10	188621	188630	0 %	60 %	40 %	0 %	384507967
115	NC_017303	CGGAT	2	10	189561	189570	20 %	20 %	40 %	20 %	384507968
116	NC_017303	AGCGC	2	10	190719	190728	20 %	0 %	40 %	40 %	384507969
117	NC_017303	GCAGT	2	10	192206	192215	20 %	20 %	40 %	20 %	384507970
118	NC_017303	CAATG	2	10	192478	192487	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017303	TAACG	2	10	193447	193456	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017303	AAGCC	2	10	194774	194783	40 %	0 %	20 %	40 %	384507971
121	NC_017303	GGCCC	2	10	196847	196856	0 %	0 %	40 %	60 %	384507974
122	NC_017303	GAATT	2	10	200412	200421	40 %	40 %	20 %	0 %	384507979
123	NC_017303	CAAGG	2	10	201301	201310	40 %	0 %	40 %	20 %	384507979
124	NC_017303	GATGG	2	10	203750	203759	20 %	20 %	60 %	0 %	384507980
125	NC_017303	TGGCG	2	10	204484	204493	0 %	20 %	60 %	20 %	384507981
126	NC_017303	TGCCA	2	10	206507	206516	20 %	20 %	20 %	40 %	384507982
127	NC_017303	AAATA	2	10	206609	206618	80 %	20 %	0 %	0 %	384507982
128	NC_017303	ATTCT	2	10	207205	207214	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017303	CAGGC	2	10	212022	212031	20 %	0 %	40 %	40 %	384507985
130	NC_017303	TTGTA	2	10	212432	212441	20 %	60 %	20 %	0 %	384507986
131	NC_017303	GCGAC	2	10	216948	216957	20 %	0 %	40 %	40 %	384507991
132	NC_017303	AGATC	2	10	216973	216982	40 %	20 %	20 %	20 %	384507991
133	NC_017303	CAAGG	2	10	217887	217896	40 %	0 %	40 %	20 %	384507992
134	NC_017303	AGAAA	2	10	218616	218625	80 %	0 %	20 %	0 %	384507993
135	NC_017303	CGGGG	2	10	224650	224659	0 %	0 %	80 %	20 %	384508000
136	NC_017303	GAAAA	2	10	224789	224798	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017303	CGAGA	2	10	225430	225439	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017303	TGCGC	2	10	227088	227097	0 %	20 %	40 %	40 %	384508003
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140	NC_017303	CATTG	2	10	228937	228946	20 %	40 %	20 %	20 %	384508005
141	NC_017303	CAAAA	2	10	229052	229061	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017303	CGCAA	2	10	229751	229760	40 %	0 %	20 %	40 %	384508008
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151	NC_017303	GCCAT	2	10	244887	244896	20 %	20 %	20 %	40 %	384508018
152	NC_017303	CGCAG	2	10	247943	247952	20 %	0 %	40 %	40 %	384508021
153	NC_017303	CATGC	2	10	249714	249723	20 %	20 %	20 %	40 %	384508022
154	NC_017303	CCATG	2	10	249945	249954	20 %	20 %	20 %	40 %	384508022
155	NC_017303	AATTG	2	10	250118	250127	40 %	40 %	20 %	0 %	384508022
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157	NC_017303	GAAGT	2	10	255311	255320	40 %	20 %	40 %	0 %	384508027
158	NC_017303	CCGTG	2	10	255497	255506	0 %	20 %	40 %	40 %	384508027
159	NC_017303	TGGGG	2	10	256328	256337	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017303	TGCTC	2	10	260437	260446	0 %	40 %	20 %	40 %	384508031
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176	NC_017303	CGGGT	2	10	282787	282796	0 %	20 %	60 %	20 %	384508056
177	NC_017303	GGCCC	2	10	285248	285257	0 %	0 %	40 %	60 %	384508059
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185	NC_017303	GCTCT	2	10	306182	306191	0 %	40 %	20 %	40 %	384508077
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190	NC_017303	TGTTC	2	10	312316	312325	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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197	NC_017303	TGGGG	2	10	321212	321221	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
198	NC_017303	TTGTG	2	10	322025	322034	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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214	NC_017303	TGCGG	2	10	356070	356079	0 %	20 %	60 %	20 %	384508116
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235	NC_017303	GATGC	2	10	399990	399999	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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241	NC_017303	CAGCT	2	10	405389	405398	20 %	20 %	20 %	40 %	384508172
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243	NC_017303	GATGC	2	10	408618	408627	20 %	20 %	40 %	20 %	384508176
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253	NC_017303	GGGGA	2	10	426781	426790	20 %	0 %	80 %	0 %	384508193
254	NC_017303	TTTGG	2	10	428716	428725	0 %	60 %	40 %	0 %	384508195
255	NC_017303	GCTAC	2	10	428981	428990	20 %	20 %	20 %	40 %	384508195
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260	NC_017303	GGTGC	2	10	435353	435362	0 %	20 %	60 %	20 %	384508204
261	NC_017303	AGTTG	2	10	439540	439549	20 %	40 %	40 %	0 %	384508207
262	NC_017303	CTACG	2	10	440842	440851	20 %	20 %	20 %	40 %	384508208
263	NC_017303	AAGTG	2	10	443437	443446	40 %	20 %	40 %	0 %	384508210
264	NC_017303	GATGT	2	10	447523	447532	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017303	GTCGC	2	10	448157	448166	0 %	20 %	40 %	40 %	384508215
266	NC_017303	GGTGG	2	10	451409	451418	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
267	NC_017303	GCATC	2	10	452692	452701	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
268	NC_017303	CGCAA	2	10	452871	452880	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
269	NC_017303	GCTGT	2	10	453638	453647	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
270	NC_017303	CGATC	2	10	453766	453775	20 %	20 %	20 %	40 %	384508221
271	NC_017303	TGCGC	2	10	453909	453918	0 %	20 %	40 %	40 %	384508221
272	NC_017303	GACCT	2	10	455866	455875	20 %	20 %	20 %	40 %	384508223
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279	NC_017303	AGGTG	2	10	462188	462197	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017303	TTCTG	2	10	463176	463185	0 %	60 %	20 %	20 %	384508231
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282	NC_017303	ATCTG	2	10	464941	464950	20 %	40 %	20 %	20 %	384508232
283	NC_017303	CCATT	2	10	466032	466041	20 %	40 %	0 %	40 %	384508233
284	NC_017303	TTTCT	2	10	467148	467157	0 %	80 %	0 %	20 %	384508234
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286	NC_017303	CCGTG	2	10	467907	467916	0 %	20 %	40 %	40 %	384508235
287	NC_017303	TGCCT	2	10	468615	468624	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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290	NC_017303	GTCTT	2	10	476677	476686	0 %	60 %	20 %	20 %	384508241
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306	NC_017303	CTTCT	2	10	511905	511914	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
307	NC_017303	GCGTC	2	10	512148	512157	0 %	20 %	40 %	40 %	384508271
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317	NC_017303	CTGGG	2	10	534716	534725	0 %	20 %	60 %	20 %	384508297
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352	NC_017303	GACTG	2	10	584275	584284	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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379	NC_017303	TGACA	2	10	624127	624136	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
380	NC_017303	TGTGT	2	10	624142	624151	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
381	NC_017303	CAAAT	2	10	625602	625611	60 %	20 %	0 %	20 %	384508372
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386	NC_017303	GGTTG	2	10	635619	635628	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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