MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis I19 chromosome

Total Repeats: 1056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017303	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	384507789
2	NC_017303	CACGC	2	10	5735	5744	20 %	0 %	20 %	60 %	384507794
3	NC_017303	CAGTG	2	10	15503	15512	20 %	20 %	40 %	20 %	384507804
4	NC_017303	AAAAT	2	10	16763	16772	80 %	20 %	0 %	0 %	384507805
5	NC_017303	CTTTT	2	10	19238	19247	0 %	80 %	0 %	20 %	384507809
6	NC_017303	GCTCT	2	10	19275	19284	0 %	40 %	20 %	40 %	384507809
7	NC_017303	TGGAT	2	10	23217	23226	20 %	40 %	40 %	0 %	384507818
8	NC_017303	TGCGT	2	10	24500	24509	0 %	40 %	40 %	20 %	384507819
9	NC_017303	CTGAT	2	10	28531	28540	20 %	40 %	20 %	20 %	384507823
10	NC_017303	GGAGC	2	10	29484	29493	20 %	0 %	60 %	20 %	384507824
11	NC_017303	TTGCT	2	10	30573	30582	0 %	60 %	20 %	20 %	384507825
12	NC_017303	TGAGG	2	10	37406	37415	20 %	20 %	60 %	0 %	384507829
13	NC_017303	TGCGG	2	10	40523	40532	0 %	20 %	60 %	20 %	384507833
14	NC_017303	GCCTC	2	10	47300	47309	0 %	20 %	20 %	60 %	384507839
15	NC_017303	GAAGG	2	10	47314	47323	40 %	0 %	60 %	0 %	384507839
16	NC_017303	CAGTG	2	10	49245	49254	20 %	20 %	40 %	20 %	384507841
17	NC_017303	TGAGA	2	10	49587	49596	40 %	20 %	40 %	0 %	384507841
18	NC_017303	AGTGA	2	10	49637	49646	40 %	20 %	40 %	0 %	384507841
19	NC_017303	GCGGT	2	10	51787	51796	0 %	20 %	60 %	20 %	384507844
20	NC_017303	CTGGC	2	10	53061	53070	0 %	20 %	40 %	40 %	384507846
21	NC_017303	GCAGC	2	10	53560	53569	20 %	0 %	40 %	40 %	384507846
22	NC_017303	GACTG	2	10	53576	53585	20 %	20 %	40 %	20 %	384507846
23	NC_017303	AAGGC	2	10	55817	55826	40 %	0 %	40 %	20 %	384507848
24	NC_017303	ATGGC	2	10	58677	58686	20 %	20 %	40 %	20 %	384507852
25	NC_017303	ATGTG	2	10	62847	62856	20 %	40 %	40 %	0 %	384507856
26	NC_017303	GCTGG	2	10	65005	65014	0 %	20 %	60 %	20 %	384507858
27	NC_017303	AGGGA	2	10	67613	67622	40 %	0 %	60 %	0 %	384507860
28	NC_017303	AAGAT	2	10	69420	69429	60 %	20 %	20 %	0 %	384507862
29	NC_017303	GGAGC	2	10	69527	69536	20 %	0 %	60 %	20 %	384507862
30	NC_017303	GGTCT	2	10	71241	71250	0 %	40 %	40 %	20 %	384507864
31	NC_017303	CATGT	2	10	71817	71826	20 %	40 %	20 %	20 %	384507865
32	NC_017303	CAGCG	2	10	72694	72703	20 %	0 %	40 %	40 %	384507866
33	NC_017303	CAGGC	2	10	73100	73109	20 %	0 %	40 %	40 %	384507866
34	NC_017303	ATGGC	2	10	73945	73954	20 %	20 %	40 %	20 %	384507867
35	NC_017303	AGGCA	2	10	75265	75274	40 %	0 %	40 %	20 %	384507868
36	NC_017303	GCTTT	2	10	81106	81115	0 %	60 %	20 %	20 %	384507875
37	NC_017303	TGACC	2	10	81362	81371	20 %	20 %	20 %	40 %	384507875
38	NC_017303	CGTTA	2	10	82104	82113	20 %	40 %	20 %	20 %	384507876
39	NC_017303	TGCTG	2	10	82738	82747	0 %	40 %	40 %	20 %	384507876
40	NC_017303	TGGCC	2	10	84729	84738	0 %	20 %	40 %	40 %	384507877
41	NC_017303	GCGAC	2	10	85533	85542	20 %	0 %	40 %	40 %	384507877
42	NC_017303	TGGGA	2	10	88948	88957	20 %	20 %	60 %	0 %	384507883
43	NC_017303	GATCG	2	10	90048	90057	20 %	20 %	40 %	20 %	384507885
44	NC_017303	CAAAA	2	10	90780	90789	80 %	0 %	0 %	20 %	384507886
45	NC_017303	TGCAA	2	10	96628	96637	40 %	20 %	20 %	20 %	384507891
46	NC_017303	TGCAG	2	10	96848	96857	20 %	20 %	40 %	20 %	384507891
47	NC_017303	AGGTC	2	10	99284	99293	20 %	20 %	40 %	20 %	384507894
48	NC_017303	ACCAA	2	10	101143	101152	60 %	0 %	0 %	40 %	384507894
49	NC_017303	TCATC	2	10	102406	102415	20 %	40 %	0 %	40 %	384507895
50	NC_017303	ACCTG	2	10	104436	104445	20 %	20 %	20 %	40 %	384507896
51	NC_017303	CGGTG	2	10	104645	104654	0 %	20 %	60 %	20 %	384507896
52	NC_017303	CGGCG	2	10	107264	107273	0 %	0 %	60 %	40 %	384507899
53	NC_017303	CGCGG	2	10	107324	107333	0 %	0 %	60 %	40 %	384507900
54	NC_017303	CAGCG	2	10	107860	107869	20 %	0 %	40 %	40 %	384507901
55	NC_017303	GGATC	2	10	118423	118432	20 %	20 %	40 %	20 %	384507911
56	NC_017303	GACTG	2	10	127800	127809	20 %	20 %	40 %	20 %	384507917
57	NC_017303	TTGGT	2	10	129109	129118	0 %	60 %	40 %	0 %	384507917
58	NC_017303	GTGCG	2	10	131432	131441	0 %	20 %	60 %	20 %	384507919
59	NC_017303	GTGGC	2	10	133170	133179	0 %	20 %	60 %	20 %	384507920
60	NC_017303	CGCGT	2	10	133487	133496	0 %	20 %	40 %	40 %	384507921
61	NC_017303	GGGGC	2	10	133615	133624	0 %	0 %	80 %	20 %	384507921
62	NC_017303	AGACG	2	10	135420	135429	40 %	0 %	40 %	20 %	384507923
63	NC_017303	GGGGC	2	10	135638	135647	0 %	0 %	80 %	20 %	384507924
64	NC_017303	ACGGT	2	10	136794	136803	20 %	20 %	40 %	20 %	384507925
65	NC_017303	CGATC	2	10	137067	137076	20 %	20 %	20 %	40 %	384507925
66	NC_017303	TGGCC	2	10	137274	137283	0 %	20 %	40 %	40 %	384507925
67	NC_017303	TGGTG	2	10	137652	137661	0 %	40 %	60 %	0 %	384507925
68	NC_017303	GGAGT	2	10	138124	138133	20 %	20 %	60 %	0 %	384507925
69	NC_017303	ATTGC	2	10	142058	142067	20 %	40 %	20 %	20 %	384507928
70	NC_017303	TCACT	2	10	145929	145938	20 %	40 %	0 %	40 %	384507933
71	NC_017303	ATTTC	2	10	146546	146555	20 %	60 %	0 %	20 %	384507933
72	NC_017303	AATGG	2	10	150246	150255	40 %	20 %	40 %	0 %	384507936
73	NC_017303	GTGAG	2	10	151229	151238	20 %	20 %	60 %	0 %	384507938
74	NC_017303	CTGAA	2	10	152027	152036	40 %	20 %	20 %	20 %	384507938
75	NC_017303	CCAGC	2	10	153319	153328	20 %	0 %	20 %	60 %	384507939
76	NC_017303	TACGC	2	10	156345	156354	20 %	20 %	20 %	40 %	384507941
77	NC_017303	GCGAC	2	10	159839	159848	20 %	0 %	40 %	40 %	384507946
78	NC_017303	CCTTG	2	10	161491	161500	0 %	40 %	20 %	40 %	384507947
79	NC_017303	CGGTG	2	10	165460	165469	0 %	20 %	60 %	20 %	384507950
80	NC_017303	CATGG	2	10	167593	167602	20 %	20 %	40 %	20 %	384507952
81	NC_017303	CAGAT	2	10	167949	167958	40 %	20 %	20 %	20 %	384507952
82	NC_017303	GGATG	2	10	168847	168856	20 %	20 %	60 %	0 %	384507952
83	NC_017303	AAACT	2	10	172531	172540	60 %	20 %	0 %	20 %	384507954
84	NC_017303	ACCGG	2	10	172926	172935	20 %	0 %	40 %	40 %	384507954
85	NC_017303	ATTGA	2	10	178736	178745	40 %	40 %	20 %	0 %	384507958
86	NC_017303	GTGGA	2	10	181145	181154	20 %	20 %	60 %	0 %	384507959
87	NC_017303	TGACC	2	10	185395	185404	20 %	20 %	20 %	40 %	384507962
88	NC_017303	TTGCA	2	10	186681	186690	20 %	40 %	20 %	20 %	384507964
89	NC_017303	GTTTG	2	10	188621	188630	0 %	60 %	40 %	0 %	384507967
90	NC_017303	CGGAT	2	10	189561	189570	20 %	20 %	40 %	20 %	384507968
91	NC_017303	AGCGC	2	10	190719	190728	20 %	0 %	40 %	40 %	384507969
92	NC_017303	GCAGT	2	10	192206	192215	20 %	20 %	40 %	20 %	384507970
93	NC_017303	AAGCC	2	10	194774	194783	40 %	0 %	20 %	40 %	384507971
94	NC_017303	GGCCC	2	10	196847	196856	0 %	0 %	40 %	60 %	384507974
95	NC_017303	GAATT	2	10	200412	200421	40 %	40 %	20 %	0 %	384507979
96	NC_017303	CAAGG	2	10	201301	201310	40 %	0 %	40 %	20 %	384507979
97	NC_017303	GATGG	2	10	203750	203759	20 %	20 %	60 %	0 %	384507980
98	NC_017303	TGGCG	2	10	204484	204493	0 %	20 %	60 %	20 %	384507981
99	NC_017303	TGCCA	2	10	206507	206516	20 %	20 %	20 %	40 %	384507982
100	NC_017303	AAATA	2	10	206609	206618	80 %	20 %	0 %	0 %	384507982
101	NC_017303	CAGGC	2	10	212022	212031	20 %	0 %	40 %	40 %	384507985
102	NC_017303	TTGTA	2	10	212432	212441	20 %	60 %	20 %	0 %	384507986
103	NC_017303	GCGAC	2	10	216948	216957	20 %	0 %	40 %	40 %	384507991
104	NC_017303	AGATC	2	10	216973	216982	40 %	20 %	20 %	20 %	384507991
105	NC_017303	CAAGG	2	10	217887	217896	40 %	0 %	40 %	20 %	384507992
106	NC_017303	AGAAA	2	10	218616	218625	80 %	0 %	20 %	0 %	384507993
107	NC_017303	CGGGG	2	10	224650	224659	0 %	0 %	80 %	20 %	384508000
108	NC_017303	TGCGC	2	10	227088	227097	0 %	20 %	40 %	40 %	384508003
109	NC_017303	CACTG	2	10	228248	228257	20 %	20 %	20 %	40 %	384508004
110	NC_017303	CATTG	2	10	228937	228946	20 %	40 %	20 %	20 %	384508005
111	NC_017303	CGCAA	2	10	229751	229760	40 %	0 %	20 %	40 %	384508008
112	NC_017303	GATCG	2	10	230069	230078	20 %	20 %	40 %	20 %	384508009
113	NC_017303	CAAGA	2	10	231981	231990	60 %	0 %	20 %	20 %	384508009
114	NC_017303	TGGCT	2	10	232177	232186	0 %	40 %	40 %	20 %	384508009
115	NC_017303	CTGTG	2	10	233496	233505	0 %	40 %	40 %	20 %	384508011
116	NC_017303	GCCGT	2	10	234897	234906	0 %	20 %	40 %	40 %	384508011
117	NC_017303	AGAAA	2	10	235804	235813	80 %	0 %	20 %	0 %	384508011
118	NC_017303	AGAGT	2	10	239231	239240	40 %	20 %	40 %	0 %	384508013
119	NC_017303	TTTTG	2	10	241530	241539	0 %	80 %	20 %	0 %	384508015
120	NC_017303	GCCAT	2	10	244887	244896	20 %	20 %	20 %	40 %	384508018
121	NC_017303	CGCAG	2	10	247943	247952	20 %	0 %	40 %	40 %	384508021
122	NC_017303	CATGC	2	10	249714	249723	20 %	20 %	20 %	40 %	384508022
123	NC_017303	CCATG	2	10	249945	249954	20 %	20 %	20 %	40 %	384508022
124	NC_017303	AATTG	2	10	250118	250127	40 %	40 %	20 %	0 %	384508022
125	NC_017303	CCCCG	2	10	254770	254779	0 %	0 %	20 %	80 %	384508027
126	NC_017303	GAAGT	2	10	255311	255320	40 %	20 %	40 %	0 %	384508027
127	NC_017303	CCGTG	2	10	255497	255506	0 %	20 %	40 %	40 %	384508027
128	NC_017303	TGCTC	2	10	260437	260446	0 %	40 %	20 %	40 %	384508031
129	NC_017303	TTGGA	2	10	262355	262364	20 %	40 %	40 %	0 %	384508033
130	NC_017303	GGCTC	2	10	262677	262686	0 %	20 %	40 %	40 %	384508034
131	NC_017303	TCCTT	2	10	263407	263416	0 %	60 %	0 %	40 %	384508035
132	NC_017303	GGAAG	2	10	264093	264102	40 %	0 %	60 %	0 %	384508036
133	NC_017303	CCATG	2	10	265480	265489	20 %	20 %	20 %	40 %	384508038
134	NC_017303	TTGCC	2	10	265567	265576	0 %	40 %	20 %	40 %	384508038
135	NC_017303	GAATG	2	10	268909	268918	40 %	20 %	40 %	0 %	384508040
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152	NC_017303	GCTCT	2	10	306182	306191	0 %	40 %	20 %	40 %	384508077
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249	NC_017303	GCGTC	2	10	512148	512157	0 %	20 %	40 %	40 %	384508271
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252	NC_017303	CGAGC	2	10	518570	518579	20 %	0 %	40 %	40 %	384508279
253	NC_017303	ATCAA	2	10	522101	522110	60 %	20 %	0 %	20 %	384508283
254	NC_017303	TGTGT	2	10	522917	522926	0 %	60 %	40 %	0 %	384508284
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258	NC_017303	CTGGG	2	10	534716	534725	0 %	20 %	60 %	20 %	384508297
259	NC_017303	TCCGG	2	10	538994	539003	0 %	20 %	40 %	40 %	384508301
260	NC_017303	GGCGT	2	10	539117	539126	0 %	20 %	60 %	20 %	384508301
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262	NC_017303	CCGTA	2	10	542092	542101	20 %	20 %	20 %	40 %	384508304
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387	NC_017303	CGATC	2	10	792434	792443	20 %	20 %	20 %	40 %	384508528
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389	NC_017303	GCGAT	2	10	795348	795357	20 %	20 %	40 %	20 %	384508530
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