MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis I19 chromosome

Total Repeats: 819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017303	TCGC	2	8	8250	8257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017303	GAAA	2	8	20227	20234	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017303	TCAT	2	8	23819	23826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017303	TGAT	2	8	23837	23844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017303	GCTA	2	8	29131	29138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017303	TACT	2	8	39039	39046	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017303	AAGA	2	8	39121	39128	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017303	TGCG	2	8	39571	39578	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017303	GCTG	2	8	41459	41466	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017303	AATG	2	8	44454	44461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017303	AAAT	2	8	46098	46105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017303	TTGC	2	8	47827	47834	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017303	ATTA	2	8	47902	47909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017303	GTTT	2	8	50904	50911	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017303	TTGG	2	8	57813	57820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017303	GCAC	2	8	59685	59692	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017303	CTTT	2	8	61447	61454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017303	AGTG	2	8	69223	69230	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017303	GGAA	2	8	74783	74790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017303	TAAT	2	8	76531	76538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017303	TCCT	2	8	79258	79265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017303	TCTT	2	8	90265	90272	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017303	TCTT	2	8	105016	105023	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017303	GAGG	2	8	113678	113685	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017303	TACC	2	8	117317	117324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017303	GAAT	2	8	117344	117351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017303	GGCA	2	8	117354	117361	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017303	CCAC	2	8	119607	119614	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_017303	TCCT	2	8	121304	121311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017303	TCTT	2	8	121508	121515	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017303	TTGG	2	8	124462	124469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017303	GCCG	2	8	124898	124905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017303	GGCA	2	8	124907	124914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017303	ATTT	2	8	127494	127501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017303	TGTT	2	8	129841	129848	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017303	TGCG	2	8	141057	141064	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017303	GCCC	2	8	154001	154008	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_017303	CTGC	2	8	154138	154145	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017303	TTCC	2	8	155759	155766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017303	ATGC	2	8	157253	157260	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017303	ATCA	2	8	160741	160748	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017303	ATAC	2	8	160814	160821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017303	CAGG	2	8	160834	160841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017303	GTAG	2	8	160948	160955	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017303	CGGC	2	8	163115	163122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017303	TTTG	2	8	164280	164287	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017303	ATGC	2	8	164306	164313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017303	GATG	2	8	169193	169200	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017303	TGTT	2	8	169267	169274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017303	TCCC	2	8	169536	169543	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_017303	GAGG	2	8	171211	171218	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017303	TGCT	2	8	171225	171232	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017303	AAAT	2	8	171504	171511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017303	GGAC	2	8	171766	171773	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017303	ATAG	2	8	175232	175239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017303	AAAT	2	8	179028	179035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017303	AGCC	2	8	184498	184505	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017303	ATCT	2	8	186373	186380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017303	TTGT	2	8	192739	192746	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017303	CGAT	2	8	193021	193028	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017303	CTGC	2	8	193087	193094	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017303	CTGC	2	8	193327	193334	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017303	TGGG	2	8	193434	193441	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017303	AGCA	2	8	193604	193611	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017303	CAGT	2	8	195172	195179	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017303	ATGG	2	8	196758	196765	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017303	TCAC	2	8	202795	202802	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017303	GAAT	2	8	207513	207520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017303	AAGC	2	8	207850	207857	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017303	AAGC	2	8	207947	207954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017303	CTTT	2	8	208061	208068	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017303	TCAC	2	8	208239	208246	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017303	ATCT	2	8	208424	208431	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017303	ACGA	2	8	208531	208538	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017303	ATTG	2	8	209335	209342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017303	CAAA	2	8	210492	210499	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017303	CGAA	2	8	210587	210594	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017303	GTTC	2	8	214633	214640	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017303	TAGA	2	8	223063	223070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017303	GCCC	2	8	224893	224900	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_017303	GTCT	2	8	225251	225258	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017303	TTCA	2	8	236033	236040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017303	TCCT	2	8	238039	238046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017303	GATA	2	8	238154	238161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017303	GTAG	2	8	238168	238175	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017303	CCTA	2	8	238197	238204	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017303	AGCC	2	8	241115	241122	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017303	TTTA	2	8	243397	243404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017303	CGCC	2	8	251235	251242	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_017303	AGTT	2	8	252398	252405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017303	TAAA	2	8	252532	252539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017303	ACTC	2	8	260137	260144	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017303	ATGA	2	8	260609	260616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017303	ATTA	2	8	260672	260679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017303	GAAT	2	8	265287	265294	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017303	TATT	2	8	267839	267846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017303	GTTC	2	8	280851	280858	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017303	GCGG	2	8	281311	281318	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017303	TCCC	2	8	287113	287120	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_017303	ATCA	2	8	293358	293365	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017303	CTCG	2	8	294495	294502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017303	AAGG	2	8	294541	294548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017303	GCTG	2	8	310664	310671	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017303	AGGT	2	8	310712	310719	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017303	ATAA	2	8	310726	310733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017303	TGGA	2	8	310912	310919	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017303	ATCG	2	8	312272	312279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017303	TGCC	2	8	313497	313504	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017303	CCTT	2	8	319840	319847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017303	GCTT	2	8	322043	322050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017303	GACC	2	8	325259	325266	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017303	TGCT	2	8	325845	325852	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017303	TTAT	2	8	327843	327850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017303	AGCG	2	8	333220	333227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017303	GTAT	2	8	339051	339058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017303	GGAT	2	8	347030	347037	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017303	AGTA	2	8	348984	348991	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017303	ACTT	2	8	350054	350061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017303	GCTT	2	8	356318	356325	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017303	TGGT	2	8	356395	356402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017303	AGTG	2	8	357667	357674	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017303	TCCT	2	8	359898	359905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017303	GCCG	2	8	359979	359986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017303	ATTA	2	8	376781	376788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017303	GGGA	2	8	378814	378821	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017303	ATTA	2	8	379079	379086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017303	AAGA	2	8	382295	382302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017303	TTAA	2	8	383479	383486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017303	AGCG	2	8	385269	385276	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017303	TCGC	2	8	397293	397300	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017303	ACTA	2	8	397303	397310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017303	CTTG	2	8	397490	397497	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017303	TTTA	2	8	397798	397805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017303	TGAA	2	8	400161	400168	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017303	ATTG	2	8	400229	400236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017303	CATG	2	8	400489	400496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017303	GCTG	2	8	400796	400803	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017303	CATC	2	8	401081	401088	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017303	TCCG	2	8	404741	404748	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017303	AGTC	2	8	412125	412132	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017303	GGGA	2	8	418776	418783	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017303	AGGC	2	8	419461	419468	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017303	CTGG	2	8	419704	419711	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017303	AGAC	2	8	419719	419726	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017303	TTGA	2	8	426921	426928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017303	TTCT	2	8	426954	426961	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017303	ACCC	2	8	429205	429212	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
148	NC_017303	ATGC	2	8	436821	436828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017303	AGGA	2	8	443342	443349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017303	CTTA	2	8	447590	447597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017303	ATTG	2	8	452596	452603	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_017303	ATCT	2	8	1587287	1587294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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