MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis I19 chromosome

Total Repeats: 27739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017303	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507789
2	NC_017303	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507789
3	NC_017303	TTA	2	6	330	335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384507789
4	NC_017303	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507789
5	NC_017303	CTT	2	6	458	463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507789
6	NC_017303	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507789
7	NC_017303	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507789
8	NC_017303	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507789
9	NC_017303	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507789
10	NC_017303	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507789
11	NC_017303	GAT	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507789
12	NC_017303	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384507789
13	NC_017303	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507789
14	NC_017303	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507789
15	NC_017303	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507789
16	NC_017303	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507789
17	NC_017303	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507789
18	NC_017303	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507789
19	NC_017303	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507789
20	NC_017303	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507789
21	NC_017303	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507789
22	NC_017303	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507789
23	NC_017303	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507789
24	NC_017303	AGT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507790
25	NC_017303	TAC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507791
26	NC_017303	TCA	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507791
27	NC_017303	GAT	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507791
28	NC_017303	GCT	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507791
29	NC_017303	CAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507791
30	NC_017303	GCA	3	9	2829	2837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507791
31	NC_017303	GCT	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507791
32	NC_017303	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507791
33	NC_017303	AGA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507791
34	NC_017303	GAG	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384507791
35	NC_017303	TTG	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507792
36	NC_017303	CTG	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507792
37	NC_017303	GTG	2	6	4027	4032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507792
38	NC_017303	TTG	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507792
39	NC_017303	GAT	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507792
40	NC_017303	GAG	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384507792
41	NC_017303	CGT	2	6	4396	4401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507792
42	NC_017303	GAC	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507792
43	NC_017303	CGA	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507792
44	NC_017303	CTG	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507793
45	NC_017303	AGA	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507793
46	NC_017303	TGC	2	6	4908	4913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507793
47	NC_017303	GCG	2	6	4932	4937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507793
48	NC_017303	ACG	2	6	5075	5080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507793
49	NC_017303	CGG	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507793
50	NC_017303	TGG	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507793
51	NC_017303	AGC	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507793
52	NC_017303	ATG	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507793
53	NC_017303	CGG	2	6	5770	5775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507794
54	NC_017303	TGG	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507794
55	NC_017303	GGT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507794
56	NC_017303	ACC	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507794
57	NC_017303	ACC	3	9	6098	6106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507794
58	NC_017303	CAT	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507794
59	NC_017303	TCG	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507794
60	NC_017303	GAA	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507794
61	NC_017303	TGA	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507794
62	NC_017303	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507794
63	NC_017303	GAA	2	6	6310	6315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507794
64	NC_017303	GAA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507794
65	NC_017303	TTA	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384507794
66	NC_017303	TGA	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507794
67	NC_017303	GAA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507794
68	NC_017303	TGA	2	6	6564	6569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507794
69	NC_017303	TCT	2	6	6818	6823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507794
70	NC_017303	GGC	2	6	6838	6843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507794
71	NC_017303	TGG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507794
72	NC_017303	GGT	2	6	6974	6979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507794
73	NC_017303	ATT	2	6	7097	7102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384507794
74	NC_017303	ATG	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507794
75	NC_017303	CAA	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507794
76	NC_017303	GCT	3	9	7210	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507794
77	NC_017303	TTG	2	6	7223	7228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507794
78	NC_017303	CCG	2	6	7280	7285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507794
79	NC_017303	GAA	2	6	7358	7363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507794
80	NC_017303	CAA	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507794
81	NC_017303	GAT	2	6	7394	7399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507794
82	NC_017303	ATG	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507794
83	NC_017303	TGA	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507794
84	NC_017303	TCG	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507794
85	NC_017303	TTC	2	6	7898	7903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507795
86	NC_017303	GAG	2	6	7946	7951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384507795
87	NC_017303	AGC	2	6	7958	7963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507795
88	NC_017303	TGC	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507795
89	NC_017303	GAG	2	6	8105	8110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384507795
90	NC_017303	ATT	2	6	8303	8308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384507796
91	NC_017303	CTG	2	6	8547	8552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507797
92	NC_017303	GGA	2	6	8571	8576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384507797
93	NC_017303	TGT	2	6	8592	8597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507797
94	NC_017303	CTG	2	6	8600	8605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507797
95	NC_017303	TGC	2	6	8651	8656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507797
96	NC_017303	GTC	2	6	8661	8666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507797
97	NC_017303	GCG	2	6	8723	8728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507798
98	NC_017303	TGA	2	6	8809	8814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507798
99	NC_017303	GCT	2	6	8826	8831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507798
100	NC_017303	CGA	2	6	9087	9092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507799
101	NC_017303	GCG	2	6	9101	9106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507799
102	NC_017303	GAG	2	6	9142	9147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384507799
103	NC_017303	CCG	2	6	9234	9239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507799
104	NC_017303	ACG	2	6	9440	9445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507799
105	NC_017303	CGC	2	6	9450	9455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507799
106	NC_017303	TTC	2	6	9572	9577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507799
107	NC_017303	TGA	2	6	9599	9604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507799
108	NC_017303	TCT	2	6	9680	9685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507799
109	NC_017303	GAA	2	6	9859	9864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507799
110	NC_017303	TGC	2	6	10157	10162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507799
111	NC_017303	TTA	2	6	10164	10169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384507799
112	NC_017303	TCG	2	6	10197	10202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507799
113	NC_017303	GAA	2	6	10219	10224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507799
114	NC_017303	CGA	2	6	10278	10283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507799
115	NC_017303	AGA	2	6	10421	10426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507799
116	NC_017303	CGT	2	6	10555	10560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507799
117	NC_017303	ATT	2	6	10567	10572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384507799
118	NC_017303	GAA	2	6	10594	10599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507799
119	NC_017303	GTG	3	9	10621	10629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507799
120	NC_017303	CGT	2	6	10687	10692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507799
121	NC_017303	CTT	2	6	10746	10751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507799
122	NC_017303	AAG	2	6	10972	10977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507799
123	NC_017303	GGT	2	6	11011	11016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507799
124	NC_017303	GAA	2	6	11038	11043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507799
125	NC_017303	ATG	2	6	11075	11080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507799
126	NC_017303	GCT	2	6	11085	11090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507799
127	NC_017303	GAA	2	6	11101	11106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507799
128	NC_017303	TGA	3	9	11130	11138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507799
129	NC_017303	CGA	2	6	11196	11201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507799
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252	NC_017303	GTA	2	6	19664	19669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507809
253	NC_017303	TTG	2	6	19677	19682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507809
254	NC_017303	GTT	2	6	19720	19725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507809
255	NC_017303	GCA	2	6	19775	19780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507810
256	NC_017303	AAT	2	6	19940	19945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384507811
257	NC_017303	GTT	2	6	20012	20017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507811
258	NC_017303	GAA	2	6	20830	20835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507812
259	NC_017303	CAT	2	6	20867	20872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507812
260	NC_017303	GAA	2	6	20938	20943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507812
261	NC_017303	GAA	2	6	21018	21023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507812
262	NC_017303	CCT	2	6	21096	21101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384507813
263	NC_017303	GCC	2	6	21122	21127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507813
264	NC_017303	GTC	2	6	21128	21133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507813
265	NC_017303	CGA	2	6	21593	21598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507814
266	NC_017303	ACA	2	6	21655	21660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507814
267	NC_017303	GCT	2	6	21861	21866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507816
268	NC_017303	ATG	2	6	21893	21898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507816
269	NC_017303	AGT	2	6	21963	21968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507816
270	NC_017303	AGT	2	6	21972	21977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507816
271	NC_017303	AGC	3	9	21990	21998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507816
272	NC_017303	GTT	2	6	22057	22062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507816
273	NC_017303	TCG	2	6	22284	22289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507817
274	NC_017303	CAT	2	6	22487	22492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507817
275	NC_017303	GAT	2	6	22661	22666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507818
276	NC_017303	CCA	2	6	22740	22745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507818
277	NC_017303	CGA	2	6	22835	22840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507818
278	NC_017303	CAA	2	6	22860	22865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507818
279	NC_017303	AGA	2	6	22887	22892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507818
280	NC_017303	TTC	2	6	22894	22899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507818
281	NC_017303	TGC	2	6	22977	22982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507818
282	NC_017303	TCC	2	6	23033	23038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384507818
283	NC_017303	AAG	2	6	23385	23390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507818
284	NC_017303	ACG	2	6	23473	23478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507818
285	NC_017303	GTT	2	6	23497	23502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507818
286	NC_017303	GTT	2	6	24126	24131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507819
287	NC_017303	AAT	2	6	24143	24148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384507819
288	NC_017303	TGT	2	6	24191	24196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507819
289	NC_017303	TGG	2	6	24333	24338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507819
290	NC_017303	ATG	2	6	24346	24351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507819
291	NC_017303	CTA	2	6	24358	24363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507819
292	NC_017303	ACT	2	6	24463	24468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507819
293	NC_017303	CGG	2	6	24575	24580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507819
294	NC_017303	TAC	2	6	24720	24725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507819
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302	NC_017303	TGG	2	6	25370	25375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507820
303	NC_017303	GGT	2	6	25390	25395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507820
304	NC_017303	GGC	2	6	25513	25518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507820
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309	NC_017303	AGC	2	6	25757	25762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507820
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323	NC_017303	CAT	2	6	26631	26636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507821
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325	NC_017303	ATC	2	6	26817	26822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507821
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332	NC_017303	TGA	2	6	27103	27108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507822
333	NC_017303	TAC	2	6	27215	27220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507822
334	NC_017303	CTG	2	6	27514	27519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507822
335	NC_017303	ACC	2	6	27549	27554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507822
336	NC_017303	GCT	2	6	27555	27560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507822
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342	NC_017303	CAG	2	6	27911	27916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507822
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353	NC_017303	CAA	2	6	28796	28801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507823
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363	NC_017303	ATG	2	6	29403	29408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507824
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365	NC_017303	GCA	2	6	29813	29818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507825
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368	NC_017303	CAC	2	6	30049	30054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507825
369	NC_017303	TGA	2	6	30090	30095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507825
370	NC_017303	TTC	2	6	30178	30183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507825
371	NC_017303	CTT	2	6	30213	30218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507825
372	NC_017303	AGA	2	6	30286	30291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507825
373	NC_017303	GTG	2	6	30308	30313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507825
374	NC_017303	TGA	2	6	30351	30356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507825
375	NC_017303	GCT	2	6	30414	30419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507825
376	NC_017303	TGC	2	6	30489	30494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507825
377	NC_017303	GCC	2	6	30523	30528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507825
378	NC_017303	TTC	2	6	30598	30603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507825
379	NC_017303	GTG	2	6	30713	30718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507825
380	NC_017303	AGC	2	6	30766	30771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507825
381	NC_017303	GCA	2	6	30890	30895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507825
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383	NC_017303	TGG	2	6	31131	31136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507825
384	NC_017303	CGT	2	6	31137	31142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507825
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400	NC_017303	TCC	2	6	32083	32088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384507826
401	NC_017303	TTG	2	6	32096	32101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507826
402	NC_017303	GTG	2	6	32188	32193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507826
403	NC_017303	CTG	2	6	32253	32258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507826
404	NC_017303	GTA	2	6	32302	32307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507826
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413	NC_017303	GCC	2	6	33054	33059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507826
414	NC_017303	GTC	2	6	33087	33092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507826
415	NC_017303	GCT	2	6	33170	33175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507827
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500	NC_017303	TGC	2	6	38358	38363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507831

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