MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017301	AGCTTC	2	12	21471	21482	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017301	TTTTCT	2	12	22073	22084	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017301	GATGCC	2	12	69566	69577	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017301	CAGAAG	2	12	74757	74768	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017301	CTCACT	2	12	121045	121056	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017301	TGGGGC	2	12	182617	182628	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017301	TTTGCC	2	12	320841	320852	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017301	ACGGTA	2	12	321911	321922	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017301	AATTTT	2	12	325172	325183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017301	TTCCTC	2	12	346915	346926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017301	GCTATA	2	12	378464	378475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017301	ACGTTG	2	12	378992	379003	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017301	TGAGTA	2	12	390258	390269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017301	CTAAAA	2	12	397345	397356	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017301	AAAAGC	2	12	407909	407920	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017301	AGGGCT	2	12	429557	429568	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017301	AGCTTT	2	12	469721	469732	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017301	GTGCCT	2	12	480380	480391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017301	TGGTTC	2	12	483769	483780	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017301	GCGCAA	2	12	524414	524425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017301	TGCTCG	2	12	584411	584422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017301	AAGAAC	2	12	607925	607936	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017301	ATGGAG	2	12	607949	607960	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017301	AAAAAG	2	12	613689	613700	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017301	GGGTGT	2	12	618327	618338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017301	GTTTTT	2	12	620364	620375	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017301	AGCGAA	2	12	621441	621452	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017301	CTGAGC	2	12	650649	650660	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017301	GGCTGC	2	12	769985	769996	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017301	AATTTA	2	12	790575	790586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017301	AGGGGT	2	12	874063	874074	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017301	CCGTGC	2	12	939010	939021	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017301	GACGGT	2	12	948031	948042	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017301	GTGGTT	2	12	965950	965961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017301	GGGTGT	2	12	1029256	1029267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017301	GTTTTT	2	12	1031293	1031304	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017301	AGCGAA	2	12	1032370	1032381	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017301	TCAACT	2	12	1084994	1085005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017301	GGTTTG	2	12	1100899	1100910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017301	TTTTAT	2	12	1136881	1136892	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017301	AGAAAA	2	12	1150741	1150752	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017301	TCTTTT	2	12	1150762	1150773	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017301	AAGCTC	2	12	1207458	1207469	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017301	CAAGAA	2	12	1289416	1289427	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017301	AATCTA	2	12	1416935	1416946	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017301	TATTTC	2	12	1431070	1431081	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017301	GACGGT	2	12	1449953	1449964	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017301	GTCTGT	2	12	1477686	1477697	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017301	AATTTC	2	12	1511118	1511129	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017301	CTGTGC	2	12	1551502	1551513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017301	GCTCTT	2	12	1554892	1554903	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017301	CGTCGA	2	12	1577687	1577698	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017301	CGTCGA	2	12	1578001	1578012	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017301	CGTCGA	2	12	1578315	1578326	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017301	AGCTGG	2	12	1600305	1600316	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017301	TTGTGT	2	12	1640161	1640172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017301	ACTGCA	2	12	1709650	1709661	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017301	TCGCGT	2	12	1710860	1710871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017301	TTCATT	2	12	1712517	1712528	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017301	TTAGCG	2	12	1745774	1745785	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017301	ATTTTT	2	12	1753940	1753951	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017301	ACCCCT	2	12	1768975	1768986	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017301	AAAAGA	2	12	1814885	1814896	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017301	AGCTTT	2	12	1816084	1816095	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017301	ACCTTT	2	12	1835483	1835494	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017301	AGTGGT	2	12	1840328	1840339	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017301	TTCGCT	2	12	1848230	1848241	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017301	AAAAAC	2	12	1849307	1849318	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017301	CACCCA	2	12	1851345	1851356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017301	CAACGC	2	12	1903222	1903233	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017301	CCAAGC	2	12	1914359	1914370	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017301	TAATTT	2	12	1926384	1926395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017301	CGCATA	2	12	1935359	1935370	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017301	AAACAA	2	12	1942751	1942762	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017301	CATTAT	2	12	1969103	1969114	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017301	ACAGCC	2	12	1972577	1972588	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017301	ATACTC	2	12	2031511	2031522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017301	TACCCC	2	12	2034359	2034370	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017301	CATATA	2	12	2049000	2049011	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017301	ATGTTG	2	12	2056374	2056385	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017301	GATGAG	2	12	2056838	2056849	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017301	CAAGGA	2	12	2056927	2056938	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017301	TTCAAT	2	12	2061699	2061710	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017301	GCACGC	2	12	2062917	2062928	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017301	TCCTTA	2	12	2078243	2078254	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017301	AGGTCA	2	12	2079414	2079425	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017301	GCTTGG	2	12	2079902	2079913	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017301	TTTAGT	2	12	2088048	2088059	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017301	GCAACC	2	12	2113408	2113419	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017301	CGTCCG	2	12	2113697	2113708	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017301	CCCCCG	2	12	2114934	2114945	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
92	NC_017301	CATAGA	2	12	2179792	2179803	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017301	AGAAAA	2	12	2188133	2188144	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017301	CGATGC	2	12	2203132	2203143	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017301	TTCGCT	2	12	2221353	2221364	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017301	AAAAAC	2	12	2222430	2222441	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017301	CACCCA	2	12	2224468	2224479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017301	TTTTCT	2	12	2317949	2317960	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.