MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 1296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017301	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	384505697
2	NC_017301	CACGC	2	10	5734	5743	20 %	0 %	20 %	60 %	384505702
3	NC_017301	TTATC	2	10	14085	14094	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017301	ACGTA	2	10	14248	14257	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017301	CAGTA	2	10	14631	14640	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017301	CAGTG	2	10	15502	15511	20 %	20 %	40 %	20 %	384505712
7	NC_017301	AAAAT	2	10	16762	16771	80 %	20 %	0 %	0 %	384505713
8	NC_017301	TAGCG	2	10	18330	18339	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017301	CTTTT	2	10	19237	19246	0 %	80 %	0 %	20 %	384505717
10	NC_017301	GCTCT	2	10	19274	19283	0 %	40 %	20 %	40 %	384505717
11	NC_017301	TGGAT	2	10	23215	23224	20 %	40 %	40 %	0 %	384505726
12	NC_017301	TGCGT	2	10	24498	24507	0 %	40 %	40 %	20 %	384505727
13	NC_017301	CTGAT	2	10	28529	28538	20 %	40 %	20 %	20 %	384505731
14	NC_017301	GGAGC	2	10	29482	29491	20 %	0 %	60 %	20 %	384505732
15	NC_017301	TTGCT	2	10	30570	30579	0 %	60 %	20 %	20 %	384505733
16	NC_017301	TGAGG	2	10	37403	37412	20 %	20 %	60 %	0 %	384505737
17	NC_017301	CACAT	2	10	39587	39596	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017301	TGCGG	2	10	40520	40529	0 %	20 %	60 %	20 %	384505741
19	NC_017301	GCCTC	2	10	47297	47306	0 %	20 %	20 %	60 %	384505747
20	NC_017301	GAAGG	2	10	47311	47320	40 %	0 %	60 %	0 %	384505747
21	NC_017301	CAGTG	2	10	49242	49251	20 %	20 %	40 %	20 %	384505749
22	NC_017301	TGAGA	2	10	49584	49593	40 %	20 %	40 %	0 %	384505749
23	NC_017301	AGTGA	2	10	49634	49643	40 %	20 %	40 %	0 %	384505749
24	NC_017301	GCGGT	2	10	51784	51793	0 %	20 %	60 %	20 %	384505752
25	NC_017301	TTGGA	2	10	52670	52679	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017301	TTGAT	2	10	52705	52714	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017301	TGCAC	2	10	52799	52808	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017301	CTGGC	2	10	53058	53067	0 %	20 %	40 %	40 %	384505754
29	NC_017301	GCAGC	2	10	53557	53566	20 %	0 %	40 %	40 %	384505754
30	NC_017301	GACTG	2	10	53573	53582	20 %	20 %	40 %	20 %	384505754
31	NC_017301	AAGGC	2	10	55814	55823	40 %	0 %	40 %	20 %	384505756
32	NC_017301	ATGGC	2	10	58674	58683	20 %	20 %	40 %	20 %	384505760
33	NC_017301	ATGTG	2	10	62844	62853	20 %	40 %	40 %	0 %	384505764
34	NC_017301	TCTGT	2	10	64664	64673	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017301	GCTGG	2	10	65005	65014	0 %	20 %	60 %	20 %	384505766
36	NC_017301	AGGGA	2	10	67613	67622	40 %	0 %	60 %	0 %	384505768
37	NC_017301	AAGAT	2	10	69420	69429	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017301	GGAGC	2	10	69527	69536	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017301	GGTCT	2	10	71241	71250	0 %	40 %	40 %	20 %	384505771
40	NC_017301	CATGT	2	10	71817	71826	20 %	40 %	20 %	20 %	384505772
41	NC_017301	CAGCG	2	10	72694	72703	20 %	0 %	40 %	40 %	384505773
42	NC_017301	CAGGC	2	10	73100	73109	20 %	0 %	40 %	40 %	384505773
43	NC_017301	ATGGC	2	10	73945	73954	20 %	20 %	40 %	20 %	384505774
44	NC_017301	AGGCA	2	10	75265	75274	40 %	0 %	40 %	20 %	384505775
45	NC_017301	TAATT	2	10	76511	76520	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017301	GCTTT	2	10	81106	81115	0 %	60 %	20 %	20 %	384505782
47	NC_017301	TGACC	2	10	81362	81371	20 %	20 %	20 %	40 %	384505782
48	NC_017301	CGTTA	2	10	82104	82113	20 %	40 %	20 %	20 %	384505783
49	NC_017301	TGCTG	2	10	82738	82747	0 %	40 %	40 %	20 %	384505783
50	NC_017301	TGGCC	2	10	84729	84738	0 %	20 %	40 %	40 %	384505784
51	NC_017301	GCGAC	2	10	85533	85542	20 %	0 %	40 %	40 %	384505784
52	NC_017301	TGGGA	2	10	88948	88957	20 %	20 %	60 %	0 %	384505790
53	NC_017301	GATCG	2	10	90048	90057	20 %	20 %	40 %	20 %	384505792
54	NC_017301	CAAAA	2	10	90780	90789	80 %	0 %	0 %	20 %	384505793
55	NC_017301	AACAA	2	10	93621	93630	80 %	0 %	0 %	20 %	384505795
56	NC_017301	TGCAA	2	10	96628	96637	40 %	20 %	20 %	20 %	384505798
57	NC_017301	TGCAG	2	10	96848	96857	20 %	20 %	40 %	20 %	384505798
58	NC_017301	AGGTC	2	10	99284	99293	20 %	20 %	40 %	20 %	384505801
59	NC_017301	ACCAA	2	10	101143	101152	60 %	0 %	0 %	40 %	384505801
60	NC_017301	TCATC	2	10	102406	102415	20 %	40 %	0 %	40 %	384505802
61	NC_017301	TGCAC	2	10	104221	104230	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017301	ACCTG	2	10	104436	104445	20 %	20 %	20 %	40 %	384505803
63	NC_017301	CGGTG	2	10	104645	104654	0 %	20 %	60 %	20 %	384505803
64	NC_017301	CGGCG	2	10	107264	107273	0 %	0 %	60 %	40 %	384505806
65	NC_017301	CGCGG	2	10	107324	107333	0 %	0 %	60 %	40 %	384505807
66	NC_017301	CAGCG	2	10	107860	107869	20 %	0 %	40 %	40 %	384505808
67	NC_017301	GGATC	2	10	118423	118432	20 %	20 %	40 %	20 %	384505818
68	NC_017301	TGTTT	2	10	120895	120904	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017301	CGGGA	2	10	125539	125548	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017301	GACTG	2	10	127800	127809	20 %	20 %	40 %	20 %	384505824
71	NC_017301	TTGGT	2	10	129109	129118	0 %	60 %	40 %	0 %	384505824
72	NC_017301	TTAAG	2	10	130892	130901	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017301	GTGCG	2	10	131432	131441	0 %	20 %	60 %	20 %	384505826
74	NC_017301	GTGGC	2	10	133170	133179	0 %	20 %	60 %	20 %	384505827
75	NC_017301	CGCGT	2	10	133487	133496	0 %	20 %	40 %	40 %	384505828
76	NC_017301	GGGGC	2	10	133615	133624	0 %	0 %	80 %	20 %	384505828
77	NC_017301	AGACG	2	10	135420	135429	40 %	0 %	40 %	20 %	384505830
78	NC_017301	GGGGC	2	10	135638	135647	0 %	0 %	80 %	20 %	384505831
79	NC_017301	ACGGT	2	10	136793	136802	20 %	20 %	40 %	20 %	384505833
80	NC_017301	CGATC	2	10	137066	137075	20 %	20 %	20 %	40 %	384505833
81	NC_017301	TGGCC	2	10	137273	137282	0 %	20 %	40 %	40 %	384505833
82	NC_017301	TGGTG	2	10	137651	137660	0 %	40 %	60 %	0 %	384505833
83	NC_017301	GGAGT	2	10	138123	138132	20 %	20 %	60 %	0 %	384505833
84	NC_017301	ATTGC	2	10	142057	142066	20 %	40 %	20 %	20 %	384505836
85	NC_017301	AAAAC	2	10	144883	144892	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017301	TCACT	2	10	145928	145937	20 %	40 %	0 %	40 %	384505841
87	NC_017301	ATTTC	2	10	146545	146554	20 %	60 %	0 %	20 %	384505841
88	NC_017301	AATGG	2	10	150245	150254	40 %	20 %	40 %	0 %	384505844
89	NC_017301	GTGAG	2	10	151228	151237	20 %	20 %	60 %	0 %	384505846
90	NC_017301	CTGAA	2	10	152026	152035	40 %	20 %	20 %	20 %	384505846
91	NC_017301	CCAGC	2	10	153318	153327	20 %	0 %	20 %	60 %	384505847
92	NC_017301	TTGCC	2	10	153828	153837	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017301	GTACC	2	10	155787	155796	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017301	TACGC	2	10	156344	156353	20 %	20 %	20 %	40 %	384505849
95	NC_017301	GCGAC	2	10	159838	159847	20 %	0 %	40 %	40 %	384505854
96	NC_017301	GGTTG	2	10	161114	161123	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017301	CCTTG	2	10	161490	161499	0 %	40 %	20 %	40 %	384505855
98	NC_017301	GCATA	2	10	163214	163223	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017301	TGTGC	2	10	164437	164446	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017301	CGGTG	2	10	165462	165471	0 %	20 %	60 %	20 %	384505858
101	NC_017301	CATGG	2	10	167595	167604	20 %	20 %	40 %	20 %	384505860
102	NC_017301	CAGAT	2	10	167951	167960	40 %	20 %	20 %	20 %	384505860
103	NC_017301	GGATG	2	10	168849	168858	20 %	20 %	60 %	0 %	384505860
104	NC_017301	GGGAC	2	10	171475	171484	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017301	CACTT	2	10	171655	171664	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017301	AAACT	2	10	172533	172542	60 %	20 %	0 %	20 %	384505862
107	NC_017301	ACCGG	2	10	172928	172937	20 %	0 %	40 %	40 %	384505862
108	NC_017301	ATTGA	2	10	178738	178747	40 %	40 %	20 %	0 %	384505866
109	NC_017301	GTGGA	2	10	181147	181156	20 %	20 %	60 %	0 %	384505867
110	NC_017301	TTAAG	2	10	184479	184488	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017301	TGACC	2	10	185397	185406	20 %	20 %	20 %	40 %	384505870
112	NC_017301	AGGTG	2	10	186350	186359	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017301	TTGCA	2	10	186683	186692	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017301	GTTTG	2	10	188623	188632	0 %	60 %	40 %	0 %	384505875
115	NC_017301	CGGAT	2	10	189563	189572	20 %	20 %	40 %	20 %	384505876
116	NC_017301	AGCGC	2	10	190721	190730	20 %	0 %	40 %	40 %	384505877
117	NC_017301	GCAGT	2	10	192208	192217	20 %	20 %	40 %	20 %	384505878
118	NC_017301	CAATG	2	10	192480	192489	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017301	TAACG	2	10	193432	193441	40 %	20 %	20 %	20 %	384505879
120	NC_017301	AAGCC	2	10	194759	194768	40 %	0 %	20 %	40 %	384505880
121	NC_017301	GGCCC	2	10	196831	196840	0 %	0 %	40 %	60 %	384505883
122	NC_017301	GAATT	2	10	200396	200405	40 %	40 %	20 %	0 %	384505888
123	NC_017301	CAAGG	2	10	201285	201294	40 %	0 %	40 %	20 %	384505888
124	NC_017301	GATGG	2	10	203734	203743	20 %	20 %	60 %	0 %	384505889
125	NC_017301	TGGCG	2	10	204468	204477	0 %	20 %	60 %	20 %	384505890
126	NC_017301	TGCCA	2	10	206491	206500	20 %	20 %	20 %	40 %	384505891
127	NC_017301	AAATA	2	10	206593	206602	80 %	20 %	0 %	0 %	384505891
128	NC_017301	ATTCT	2	10	207189	207198	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017301	CAGGC	2	10	212006	212015	20 %	0 %	40 %	40 %	384505894
130	NC_017301	TTGTA	2	10	212416	212425	20 %	60 %	20 %	0 %	384505895
131	NC_017301	GCGAC	2	10	216932	216941	20 %	0 %	40 %	40 %	384505900
132	NC_017301	AGATC	2	10	216957	216966	40 %	20 %	20 %	20 %	384505900
133	NC_017301	CAAGG	2	10	217871	217880	40 %	0 %	40 %	20 %	384505901
134	NC_017301	AGAAA	2	10	218600	218609	80 %	0 %	20 %	0 %	384505902
135	NC_017301	CGGGG	2	10	224634	224643	0 %	0 %	80 %	20 %	384505909
136	NC_017301	GAAAA	2	10	224773	224782	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017301	CGAGA	2	10	225414	225423	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017301	TGCGC	2	10	227072	227081	0 %	20 %	40 %	40 %	384505912
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214	NC_017301	TGCGG	2	10	355874	355883	0 %	20 %	60 %	20 %	384506025
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263	NC_017301	AAGTG	2	10	443241	443250	40 %	20 %	40 %	0 %	384506120
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265	NC_017301	GTCGC	2	10	447973	447982	0 %	20 %	40 %	40 %	384506125
266	NC_017301	GGTGG	2	10	451225	451234	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
267	NC_017301	GCATC	2	10	452508	452517	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
268	NC_017301	CGCAA	2	10	452688	452697	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
269	NC_017301	GCTGT	2	10	453455	453464	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
270	NC_017301	CGATC	2	10	453583	453592	20 %	20 %	20 %	40 %	384506131
271	NC_017301	TGCGC	2	10	453726	453735	0 %	20 %	40 %	40 %	384506131
272	NC_017301	GACCT	2	10	455684	455693	20 %	20 %	20 %	40 %	384506134
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274	NC_017301	TCGCG	2	10	456403	456412	0 %	20 %	40 %	40 %	384506135
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279	NC_017301	AGGTG	2	10	462006	462015	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017301	TTCTG	2	10	462994	463003	0 %	60 %	20 %	20 %	384506142
281	NC_017301	AAATT	2	10	464638	464647	60 %	40 %	0 %	0 %	384506143
282	NC_017301	ATCTG	2	10	464759	464768	20 %	40 %	20 %	20 %	384506143
283	NC_017301	CCATT	2	10	465850	465859	20 %	40 %	0 %	40 %	384506144
284	NC_017301	TTTCT	2	10	466966	466975	0 %	80 %	0 %	20 %	384506145
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286	NC_017301	CCGTG	2	10	467725	467734	0 %	20 %	40 %	40 %	384506146
287	NC_017301	TGCCT	2	10	468433	468442	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
288	NC_017301	CTTTG	2	10	474950	474959	0 %	60 %	20 %	20 %	384506150
289	NC_017301	CGGTG	2	10	476099	476108	0 %	20 %	60 %	20 %	384506151
290	NC_017301	GTCTT	2	10	476493	476502	0 %	60 %	20 %	20 %	384506152
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300	NC_017301	TCCAA	2	10	491597	491606	40 %	20 %	0 %	40 %	384506165
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304	NC_017301	AGGGG	2	10	500629	500638	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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306	NC_017301	CTTCT	2	10	511690	511699	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
307	NC_017301	GCGTC	2	10	511933	511942	0 %	20 %	40 %	40 %	384506183
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317	NC_017301	CTGGG	2	10	534501	534510	0 %	20 %	60 %	20 %	384506209
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498	NC_017301	TAATG	2	10	847522	847531	40 %	40 %	20 %	0 %	384506490
499	NC_017301	CCTTG	2	10	850323	850332	0 %	40 %	20 %	40 %	384506493
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