MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017301	TCGC	2	8	8249	8256	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017301	GAAA	2	8	20226	20233	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017301	TCAT	2	8	23817	23824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017301	TGAT	2	8	23835	23842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017301	GCTA	2	8	29129	29136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017301	TACT	2	8	39036	39043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017301	AAGA	2	8	39118	39125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017301	TGCG	2	8	39568	39575	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017301	GCTG	2	8	41456	41463	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017301	AATG	2	8	44451	44458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017301	AAAT	2	8	46095	46102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017301	TTGC	2	8	47824	47831	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017301	ATTA	2	8	47899	47906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017301	GTTT	2	8	50901	50908	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017301	TTGG	2	8	57810	57817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017301	GCAC	2	8	59682	59689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017301	CTTT	2	8	61444	61451	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017301	AGTG	2	8	69223	69230	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017301	GGTT	2	8	69741	69748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017301	GGAA	2	8	74783	74790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017301	TAAT	2	8	76531	76538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017301	TCCT	2	8	79258	79265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017301	TCTT	2	8	90265	90272	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017301	TCTT	2	8	105016	105023	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017301	GCAG	2	8	112248	112255	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017301	GAGG	2	8	113678	113685	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017301	TACC	2	8	117317	117324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017301	GAAT	2	8	117344	117351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017301	GGCA	2	8	117354	117361	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017301	CCAC	2	8	119607	119614	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_017301	TCCT	2	8	121304	121311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017301	TCTT	2	8	121508	121515	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017301	TTGG	2	8	124462	124469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017301	GCCG	2	8	124898	124905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017301	GGCA	2	8	124907	124914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017301	ATTT	2	8	127494	127501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017301	TGTT	2	8	129841	129848	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017301	TGCG	2	8	141056	141063	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017301	CAAA	2	8	150078	150085	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017301	GCCC	2	8	154000	154007	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_017301	CTGC	2	8	154137	154144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017301	TTCC	2	8	155758	155765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017301	ATGC	2	8	157252	157259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017301	ATCA	2	8	160740	160747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017301	ATAC	2	8	160813	160820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017301	CAGG	2	8	160833	160840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017301	GTAG	2	8	160947	160954	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017301	CGGC	2	8	163114	163121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017301	TTTG	2	8	164279	164286	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017301	ATGC	2	8	164305	164312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017301	GATG	2	8	169195	169202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017301	TGTT	2	8	169269	169276	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017301	TCCC	2	8	169538	169545	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_017301	GAGG	2	8	171213	171220	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017301	TGCT	2	8	171227	171234	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017301	AAAT	2	8	171506	171513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017301	GGAC	2	8	171768	171775	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017301	ATAG	2	8	175234	175241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017301	AAAT	2	8	179030	179037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017301	AGCC	2	8	184500	184507	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017301	ATCT	2	8	186375	186382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017301	CAGT	2	8	195156	195163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017301	ATGG	2	8	196742	196749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017301	TCAC	2	8	202779	202786	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017301	GAAT	2	8	207497	207504	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017301	AAGC	2	8	207834	207841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017301	AAGC	2	8	207931	207938	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017301	CTTT	2	8	208045	208052	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017301	TCAC	2	8	208223	208230	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017301	ATCT	2	8	208408	208415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017301	ACGA	2	8	208515	208522	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017301	ATTG	2	8	209319	209326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017301	CAAA	2	8	210476	210483	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017301	CGAA	2	8	210571	210578	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017301	GTTC	2	8	214617	214624	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017301	TAGA	2	8	223047	223054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017301	GCCC	2	8	224877	224884	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_017301	GTCT	2	8	225235	225242	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017301	TTCA	2	8	236017	236024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017301	TCCT	2	8	238023	238030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017301	GATA	2	8	238138	238145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017301	GTAG	2	8	238152	238159	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017301	CCTA	2	8	238181	238188	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017301	AGCC	2	8	241099	241106	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017301	TTTA	2	8	243381	243388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017301	CGCC	2	8	251219	251226	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_017301	AGTT	2	8	252382	252389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017301	TAAA	2	8	252516	252523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017301	ACTC	2	8	260121	260128	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017301	ATGA	2	8	260593	260600	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017301	ATTA	2	8	260656	260663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017301	GAAT	2	8	265273	265280	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017301	TATT	2	8	267825	267832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017301	GTTC	2	8	280674	280681	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017301	GCGG	2	8	281134	281141	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017301	GTAC	2	8	281200	281207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017301	TCCC	2	8	286936	286943	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_017301	ATCA	2	8	293183	293190	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017301	CTCG	2	8	294320	294327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017301	AAGG	2	8	294366	294373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017301	GCTG	2	8	310489	310496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017301	AGGT	2	8	310537	310544	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017301	ATAA	2	8	310551	310558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017301	TGGA	2	8	310737	310744	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017301	ATCG	2	8	312097	312104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017301	TGCC	2	8	313322	313329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017301	CCTT	2	8	319665	319672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017301	GCTT	2	8	321868	321875	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017301	GACC	2	8	325084	325091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017301	TGCT	2	8	325670	325677	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017301	TTAT	2	8	327668	327675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017301	AGGA	2	8	329089	329096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017301	AGCG	2	8	333045	333052	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017301	GTAT	2	8	338876	338883	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017301	GGAT	2	8	346855	346862	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017301	AGTA	2	8	348809	348816	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017301	ACTT	2	8	349858	349865	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017301	CAGT	2	8	353471	353478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017301	GCTT	2	8	356122	356129	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017301	TGGT	2	8	356199	356206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017301	AGTG	2	8	357471	357478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017301	TCCT	2	8	359702	359709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017301	GCCG	2	8	359783	359790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017301	ATTA	2	8	376585	376592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017301	GGGA	2	8	378618	378625	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017301	ATTA	2	8	378883	378890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017301	AAGA	2	8	382099	382106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017301	TTAA	2	8	383283	383290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017301	AGCG	2	8	385073	385080	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017301	TCGC	2	8	397097	397104	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017301	ACTA	2	8	397107	397114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017301	CTTG	2	8	397294	397301	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017301	TTTA	2	8	397602	397609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017301	TGAA	2	8	399965	399972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017301	ATTG	2	8	400033	400040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017301	CATG	2	8	400293	400300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017301	GCTG	2	8	400600	400607	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017301	CATC	2	8	400885	400892	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017301	TCCG	2	8	404545	404552	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017301	GGGA	2	8	418580	418587	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017301	AGGC	2	8	419265	419272	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017301	CTGG	2	8	419508	419515	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017301	AGAC	2	8	419523	419530	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017301	TTGA	2	8	426725	426732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017301	TTCT	2	8	426758	426765	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017301	ACCC	2	8	429009	429016	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
147	NC_017301	ATGC	2	8	436625	436632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017301	AGGA	2	8	443146	443153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017301	CTTA	2	8	447406	447413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017301	ATTG	2	8	452412	452419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017301	AGCC	2	8	461310	461317	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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442	NC_017301	CCTA	2	8	1398369	1398376	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
443	NC_017301	ATCT	2	8	1400645	1400652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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461	NC_017301	TACG	2	8	1470061	1470068	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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465	NC_017301	CGCC	2	8	1473284	1473291	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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470	NC_017301	TGAG	2	8	1480816	1480823	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
471	NC_017301	GATT	2	8	1481097	1481104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
472	NC_017301	GTAG	2	8	1494864	1494871	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
473	NC_017301	CTGC	2	8	1497643	1497650	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
474	NC_017301	TAAG	2	8	1497710	1497717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
475	NC_017301	CTTT	2	8	1497846	1497853	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
476	NC_017301	GCCG	2	8	1503291	1503298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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479	NC_017301	CAGT	2	8	1511037	1511044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_017301	ACTT	2	8	1523753	1523760	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
482	NC_017301	TTTA	2	8	1524308	1524315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_017301	TATT	2	8	1524335	1524342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_017301	TTCA	3	12	1527151	1527162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
486	NC_017301	TTAA	2	8	1542067	1542074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_017301	CATC	2	8	1545921	1545928	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
488	NC_017301	AGGC	2	8	1549136	1549143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
489	NC_017301	TGTC	2	8	1553614	1553621	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
490	NC_017301	AACC	2	8	1555099	1555106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
491	NC_017301	CTAG	2	8	1559267	1559274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
492	NC_017301	GAAA	2	8	1560033	1560040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
493	NC_017301	GAAG	2	8	1560089	1560096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
494	NC_017301	TTTC	2	8	1565475	1565482	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
495	NC_017301	ATTT	2	8	1565736	1565743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_017301	CTTA	2	8	1570479	1570486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
497	NC_017301	TGAG	2	8	1570691	1570698	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
498	NC_017301	CCTC	2	8	1573275	1573282	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
499	NC_017301	ATAA	2	8	1575389	1575396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_017301	TTCC	2	8	1577743	1577750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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