MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 27604

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017301	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505697
2	NC_017301	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505697
3	NC_017301	TTA	2	6	330	335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505697
4	NC_017301	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505697
5	NC_017301	CTT	2	6	458	463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505697
6	NC_017301	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505697
7	NC_017301	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505697
8	NC_017301	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505697
9	NC_017301	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505697
10	NC_017301	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505697
11	NC_017301	GAT	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505697
12	NC_017301	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505697
13	NC_017301	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505697
14	NC_017301	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505697
15	NC_017301	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505697
16	NC_017301	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505697
17	NC_017301	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505697
18	NC_017301	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505697
19	NC_017301	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505697
20	NC_017301	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505697
21	NC_017301	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505697
22	NC_017301	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505697
23	NC_017301	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505697
24	NC_017301	AGT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505698
25	NC_017301	TAC	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505699
26	NC_017301	TCA	2	6	2511	2516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505699
27	NC_017301	GAT	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505699
28	NC_017301	GCT	2	6	2626	2631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505699
29	NC_017301	CAT	2	6	2638	2643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505699
30	NC_017301	GCA	3	9	2828	2836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505699
31	NC_017301	GCT	2	6	3169	3174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505699
32	NC_017301	CGG	2	6	3306	3311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505699
33	NC_017301	AGA	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505699
34	NC_017301	GAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505699
35	NC_017301	TTG	2	6	3765	3770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505700
36	NC_017301	CTG	2	6	3867	3872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505700
37	NC_017301	GTG	2	6	4026	4031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505700
38	NC_017301	TTG	2	6	4065	4070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505700
39	NC_017301	GAT	2	6	4184	4189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505700
40	NC_017301	GAG	2	6	4388	4393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505700
41	NC_017301	CGT	2	6	4395	4400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505700
42	NC_017301	GAC	2	6	4508	4513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505700
43	NC_017301	CGA	2	6	4648	4653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505700
44	NC_017301	CTG	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505701
45	NC_017301	AGA	2	6	4883	4888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505701
46	NC_017301	TGC	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505701
47	NC_017301	GCG	2	6	4931	4936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505701
48	NC_017301	ACG	2	6	5074	5079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505701
49	NC_017301	CGG	2	6	5144	5149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505701
50	NC_017301	TGG	2	6	5176	5181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505701
51	NC_017301	AGC	2	6	5192	5197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505701
52	NC_017301	ATG	2	6	5277	5282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505701
53	NC_017301	CGG	2	6	5769	5774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505702
54	NC_017301	TGG	2	6	5868	5873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505702
55	NC_017301	GGT	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505702
56	NC_017301	ACC	2	6	6058	6063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505702
57	NC_017301	ACC	3	9	6097	6105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505702
58	NC_017301	CAT	2	6	6117	6122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505702
59	NC_017301	TCG	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505702
60	NC_017301	GAA	2	6	6199	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505702
61	NC_017301	TGA	2	6	6225	6230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505702
62	NC_017301	CTG	2	6	6299	6304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505702
63	NC_017301	GAA	2	6	6309	6314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505702
64	NC_017301	GAA	2	6	6321	6326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505702
65	NC_017301	TTA	2	6	6336	6341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505702
66	NC_017301	TGA	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505702
67	NC_017301	GAA	2	6	6532	6537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505702
68	NC_017301	TGA	2	6	6563	6568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505702
69	NC_017301	TCT	2	6	6817	6822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505702
70	NC_017301	GGC	2	6	6837	6842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505702
71	NC_017301	TGG	2	6	6888	6893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505702
72	NC_017301	GGT	2	6	6973	6978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505702
73	NC_017301	ATT	2	6	7096	7101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505702
74	NC_017301	ATG	2	6	7124	7129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505702
75	NC_017301	CAA	2	6	7140	7145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505702
76	NC_017301	GCT	3	9	7209	7217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505702
77	NC_017301	TTG	2	6	7222	7227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505702
78	NC_017301	CCG	2	6	7279	7284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505702
79	NC_017301	GAA	2	6	7357	7362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505702
80	NC_017301	CAA	2	6	7386	7391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505702
81	NC_017301	GAT	2	6	7393	7398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505702
82	NC_017301	ATG	2	6	7499	7504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505702
83	NC_017301	TGA	2	6	7515	7520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505702
84	NC_017301	TCG	2	6	7557	7562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505702
85	NC_017301	TTC	2	6	7897	7902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505703
86	NC_017301	GAG	2	6	7945	7950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505703
87	NC_017301	AGC	2	6	7957	7962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505703
88	NC_017301	TGC	2	6	7993	7998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505703
89	NC_017301	GAG	2	6	8104	8109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505703
90	NC_017301	ATT	2	6	8302	8307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505704
91	NC_017301	CTG	2	6	8546	8551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505705
92	NC_017301	GGA	2	6	8570	8575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505705
93	NC_017301	TGT	2	6	8591	8596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505705
94	NC_017301	CTG	2	6	8599	8604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505705
95	NC_017301	TGC	2	6	8650	8655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505705
96	NC_017301	GTC	2	6	8660	8665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505705
97	NC_017301	GCG	2	6	8722	8727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505706
98	NC_017301	TGA	2	6	8808	8813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505706
99	NC_017301	GCT	2	6	8825	8830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505706
100	NC_017301	CGA	2	6	9086	9091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505707
101	NC_017301	GCG	2	6	9100	9105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505707
102	NC_017301	GAG	2	6	9141	9146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505707
103	NC_017301	CCG	2	6	9233	9238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505707
104	NC_017301	ACG	2	6	9439	9444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505707
105	NC_017301	CGC	2	6	9449	9454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505707
106	NC_017301	TTC	2	6	9571	9576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505707
107	NC_017301	TGA	2	6	9598	9603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505707
108	NC_017301	TCT	2	6	9679	9684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505707
109	NC_017301	GAA	2	6	9858	9863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505707
110	NC_017301	TGC	2	6	10156	10161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505707
111	NC_017301	TTA	2	6	10163	10168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505707
112	NC_017301	TCG	2	6	10196	10201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505707
113	NC_017301	GAA	2	6	10218	10223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505707
114	NC_017301	CGA	2	6	10277	10282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505707
115	NC_017301	AGA	2	6	10420	10425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505707
116	NC_017301	CGT	2	6	10554	10559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505707
117	NC_017301	ATT	2	6	10566	10571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505707
118	NC_017301	GAA	2	6	10593	10598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505707
119	NC_017301	GTG	3	9	10620	10628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505707
120	NC_017301	CGT	2	6	10686	10691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505707
121	NC_017301	CTT	2	6	10745	10750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505707
122	NC_017301	AAG	2	6	10971	10976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505707
123	NC_017301	GGT	2	6	11010	11015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505707
124	NC_017301	GAA	2	6	11037	11042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505707
125	NC_017301	ATG	2	6	11074	11079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505707
126	NC_017301	GCT	2	6	11084	11089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505707
127	NC_017301	GAA	2	6	11100	11105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505707
128	NC_017301	TGA	3	9	11129	11137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505707
129	NC_017301	CGA	2	6	11195	11200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505707
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252	NC_017301	TTG	2	6	19676	19681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505717
253	NC_017301	GTT	2	6	19719	19724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505717
254	NC_017301	GCA	2	6	19774	19779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505718
255	NC_017301	AAT	2	6	19939	19944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505719
256	NC_017301	GTT	2	6	20011	20016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505719
257	NC_017301	GAA	2	6	20829	20834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505720
258	NC_017301	CAT	2	6	20866	20871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505720
259	NC_017301	GAA	2	6	20937	20942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505720
260	NC_017301	GAA	2	6	21017	21022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505720
261	NC_017301	CCT	2	6	21095	21100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505721
262	NC_017301	GCC	2	6	21121	21126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505721
263	NC_017301	GTC	2	6	21127	21132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505721
264	NC_017301	CGA	2	6	21592	21597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505722
265	NC_017301	ACA	2	6	21654	21659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505722
266	NC_017301	GCT	2	6	21860	21865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505723
267	NC_017301	ATG	2	6	21892	21897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505723
268	NC_017301	AGT	2	6	21962	21967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505724
269	NC_017301	AGT	2	6	21971	21976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505724
270	NC_017301	AGC	3	9	21989	21997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505724
271	NC_017301	GTT	2	6	22055	22060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505724
272	NC_017301	TCG	2	6	22282	22287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505725
273	NC_017301	CAT	2	6	22485	22490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505725
274	NC_017301	GAT	2	6	22659	22664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505726
275	NC_017301	CCA	2	6	22738	22743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505726
276	NC_017301	CGA	2	6	22833	22838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505726
277	NC_017301	CAA	2	6	22858	22863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505726
278	NC_017301	AGA	2	6	22885	22890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505726
279	NC_017301	TTC	2	6	22892	22897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505726
280	NC_017301	TGC	2	6	22975	22980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505726
281	NC_017301	TCC	2	6	23031	23036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505726
282	NC_017301	AAG	2	6	23383	23388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505726
283	NC_017301	ACG	2	6	23471	23476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505726
284	NC_017301	GTT	2	6	23495	23500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505726
285	NC_017301	CGA	2	6	23582	23587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505726
286	NC_017301	AAT	2	6	23703	23708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505726
287	NC_017301	GTT	2	6	24124	24129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505727
288	NC_017301	AAT	2	6	24141	24146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505727
289	NC_017301	TGT	2	6	24189	24194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505727
290	NC_017301	TGG	2	6	24331	24336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505727
291	NC_017301	ATG	2	6	24344	24349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505727
292	NC_017301	CTA	2	6	24356	24361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505727
293	NC_017301	ACT	2	6	24461	24466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505727
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302	NC_017301	AAG	2	6	25355	25360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505728
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373	NC_017301	AGA	2	6	30283	30288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505733
374	NC_017301	GTG	2	6	30305	30310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505733
375	NC_017301	TGA	2	6	30348	30353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505733
376	NC_017301	GCT	2	6	30411	30416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505733
377	NC_017301	TGC	2	6	30486	30491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505733
378	NC_017301	GCC	2	6	30520	30525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505733
379	NC_017301	TTC	2	6	30595	30600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505733
380	NC_017301	GTG	2	6	30710	30715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505733
381	NC_017301	AGC	2	6	30763	30768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505733
382	NC_017301	GCA	2	6	30887	30892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505733
383	NC_017301	GGA	2	6	30986	30991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505733
384	NC_017301	TGG	2	6	31128	31133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505733
385	NC_017301	CGT	2	6	31134	31139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505733
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388	NC_017301	TCT	2	6	31310	31315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505733
389	NC_017301	CAA	2	6	31413	31418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505733
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392	NC_017301	TGA	2	6	31717	31722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505734
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396	NC_017301	ACT	2	6	31941	31946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505734
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400	NC_017301	GAG	2	6	32025	32030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505734
401	NC_017301	TCC	2	6	32080	32085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505734
402	NC_017301	TTG	2	6	32093	32098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505734
403	NC_017301	GTG	2	6	32185	32190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505734
404	NC_017301	CTG	2	6	32250	32255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505734
405	NC_017301	GTA	2	6	32299	32304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505734
406	NC_017301	GTG	2	6	32417	32422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505734
407	NC_017301	GCC	3	9	32620	32628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505734
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415	NC_017301	GTC	2	6	33084	33089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505734
416	NC_017301	GCT	2	6	33167	33172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505735
417	NC_017301	GCT	2	6	33176	33181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505735
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500	NC_017301	CAA	2	6	38325	38330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505739

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