MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1002 chromosome

Total Repeats: 1057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017300	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	384503606
2	NC_017300	CACGC	2	10	5735	5744	20 %	0 %	20 %	60 %	384503611
3	NC_017300	CAGTG	2	10	15503	15512	20 %	20 %	40 %	20 %	384503621
4	NC_017300	AAAAT	2	10	16763	16772	80 %	20 %	0 %	0 %	384503622
5	NC_017300	CTTTT	2	10	19238	19247	0 %	80 %	0 %	20 %	384503626
6	NC_017300	GCTCT	2	10	19275	19284	0 %	40 %	20 %	40 %	384503626
7	NC_017300	TGGAT	2	10	23216	23225	20 %	40 %	40 %	0 %	384503635
8	NC_017300	TGCGT	2	10	24500	24509	0 %	40 %	40 %	20 %	384503636
9	NC_017300	CTGAT	2	10	28531	28540	20 %	40 %	20 %	20 %	384503640
10	NC_017300	GGAGC	2	10	29484	29493	20 %	0 %	60 %	20 %	384503641
11	NC_017300	TTGCT	2	10	30572	30581	0 %	60 %	20 %	20 %	384503642
12	NC_017300	TGAGG	2	10	37405	37414	20 %	20 %	60 %	0 %	384503646
13	NC_017300	TGCGG	2	10	40522	40531	0 %	20 %	60 %	20 %	384503650
14	NC_017300	GCCTC	2	10	47299	47308	0 %	20 %	20 %	60 %	384503656
15	NC_017300	GAAGG	2	10	47313	47322	40 %	0 %	60 %	0 %	384503656
16	NC_017300	CAGTG	2	10	49244	49253	20 %	20 %	40 %	20 %	384503658
17	NC_017300	TGAGA	2	10	49586	49595	40 %	20 %	40 %	0 %	384503658
18	NC_017300	AGTGA	2	10	49636	49645	40 %	20 %	40 %	0 %	384503658
19	NC_017300	CTGGC	2	10	53062	53071	0 %	20 %	40 %	40 %	384503663
20	NC_017300	GCAGC	2	10	53561	53570	20 %	0 %	40 %	40 %	384503663
21	NC_017300	GACTG	2	10	53577	53586	20 %	20 %	40 %	20 %	384503663
22	NC_017300	AAGGC	2	10	55818	55827	40 %	0 %	40 %	20 %	384503665
23	NC_017300	ATGGC	2	10	58678	58687	20 %	20 %	40 %	20 %	384503669
24	NC_017300	ATGTG	2	10	62847	62856	20 %	40 %	40 %	0 %	384503673
25	NC_017300	GCTGG	2	10	65008	65017	0 %	20 %	60 %	20 %	384503675
26	NC_017300	AGGGA	2	10	67616	67625	40 %	0 %	60 %	0 %	384503677
27	NC_017300	AAGAT	2	10	69423	69432	60 %	20 %	20 %	0 %	384503679
28	NC_017300	GGAGC	2	10	69530	69539	20 %	0 %	60 %	20 %	384503679
29	NC_017300	GGTCT	2	10	71244	71253	0 %	40 %	40 %	20 %	384503681
30	NC_017300	CAGCG	2	10	72700	72709	20 %	0 %	40 %	40 %	384503682
31	NC_017300	CAGGC	2	10	73106	73115	20 %	0 %	40 %	40 %	384503682
32	NC_017300	ATGGC	2	10	73951	73960	20 %	20 %	40 %	20 %	384503683
33	NC_017300	AGGCA	2	10	75271	75280	40 %	0 %	40 %	20 %	384503684
34	NC_017300	GCTTT	2	10	81112	81121	0 %	60 %	20 %	20 %	384503691
35	NC_017300	TGACC	2	10	81368	81377	20 %	20 %	20 %	40 %	384503691
36	NC_017300	CGTTA	2	10	82110	82119	20 %	40 %	20 %	20 %	384503692
37	NC_017300	TGCTG	2	10	82744	82753	0 %	40 %	40 %	20 %	384503692
38	NC_017300	TGGCC	2	10	84735	84744	0 %	20 %	40 %	40 %	384503693
39	NC_017300	GCGAC	2	10	85539	85548	20 %	0 %	40 %	40 %	384503693
40	NC_017300	TGGGA	2	10	88954	88963	20 %	20 %	60 %	0 %	384503699
41	NC_017300	GATCG	2	10	90054	90063	20 %	20 %	40 %	20 %	384503701
42	NC_017300	CAAAA	2	10	90786	90795	80 %	0 %	0 %	20 %	384503702
43	NC_017300	AACAA	2	10	93627	93636	80 %	0 %	0 %	20 %	384503704
44	NC_017300	TGCAA	2	10	96634	96643	40 %	20 %	20 %	20 %	384503707
45	NC_017300	TGCAG	2	10	96854	96863	20 %	20 %	40 %	20 %	384503707
46	NC_017300	AGGTC	2	10	99290	99299	20 %	20 %	40 %	20 %	384503710
47	NC_017300	ACCAA	2	10	101149	101158	60 %	0 %	0 %	40 %	384503710
48	NC_017300	TCATC	2	10	102412	102421	20 %	40 %	0 %	40 %	384503711
49	NC_017300	ACCTG	2	10	104442	104451	20 %	20 %	20 %	40 %	384503712
50	NC_017300	CGGTG	2	10	104651	104660	0 %	20 %	60 %	20 %	384503712
51	NC_017300	CGGCG	2	10	107270	107279	0 %	0 %	60 %	40 %	384503715
52	NC_017300	CGCGG	2	10	107330	107339	0 %	0 %	60 %	40 %	384503716
53	NC_017300	CAGCG	2	10	107866	107875	20 %	0 %	40 %	40 %	384503717
54	NC_017300	GGATC	2	10	118432	118441	20 %	20 %	40 %	20 %	384503727
55	NC_017300	GACTG	2	10	127812	127821	20 %	20 %	40 %	20 %	384503733
56	NC_017300	TTGGT	2	10	129121	129130	0 %	60 %	40 %	0 %	384503733
57	NC_017300	GTGCG	2	10	131444	131453	0 %	20 %	60 %	20 %	384503735
58	NC_017300	GTGGC	2	10	133182	133191	0 %	20 %	60 %	20 %	384503736
59	NC_017300	CGCGT	2	10	133502	133511	0 %	20 %	40 %	40 %	384503737
60	NC_017300	GGGGC	2	10	133630	133639	0 %	0 %	80 %	20 %	384503737
61	NC_017300	AGACG	2	10	135435	135444	40 %	0 %	40 %	20 %	384503739
62	NC_017300	GGGGC	2	10	135653	135662	0 %	0 %	80 %	20 %	384503740
63	NC_017300	ACGGT	2	10	136808	136817	20 %	20 %	40 %	20 %	384503741
64	NC_017300	CGATC	2	10	137081	137090	20 %	20 %	20 %	40 %	384503741
65	NC_017300	TGGCC	2	10	137288	137297	0 %	20 %	40 %	40 %	384503741
66	NC_017300	TGGTG	2	10	137666	137675	0 %	40 %	60 %	0 %	384503741
67	NC_017300	GGAGT	2	10	138138	138147	20 %	20 %	60 %	0 %	384503741
68	NC_017300	ATTGC	2	10	142072	142081	20 %	40 %	20 %	20 %	384503744
69	NC_017300	TCACT	2	10	145943	145952	20 %	40 %	0 %	40 %	384503749
70	NC_017300	ATTTC	2	10	146560	146569	20 %	60 %	0 %	20 %	384503749
71	NC_017300	AATGG	2	10	150259	150268	40 %	20 %	40 %	0 %	384503752
72	NC_017300	GTGAG	2	10	151242	151251	20 %	20 %	60 %	0 %	384503754
73	NC_017300	CTGAA	2	10	152040	152049	40 %	20 %	20 %	20 %	384503754
74	NC_017300	CCAGC	2	10	153332	153341	20 %	0 %	20 %	60 %	384503755
75	NC_017300	TACGC	2	10	156358	156367	20 %	20 %	20 %	40 %	384503757
76	NC_017300	GCGAC	2	10	159852	159861	20 %	0 %	40 %	40 %	384503762
77	NC_017300	CCTTG	2	10	161504	161513	0 %	40 %	20 %	40 %	384503763
78	NC_017300	CGGTG	2	10	165474	165483	0 %	20 %	60 %	20 %	384503766
79	NC_017300	CATGG	2	10	167607	167616	20 %	20 %	40 %	20 %	384503768
80	NC_017300	CAGAT	2	10	167963	167972	40 %	20 %	20 %	20 %	384503768
81	NC_017300	GGATG	2	10	168861	168870	20 %	20 %	60 %	0 %	384503768
82	NC_017300	AAACT	2	10	172545	172554	60 %	20 %	0 %	20 %	384503770
83	NC_017300	ACCGG	2	10	172940	172949	20 %	0 %	40 %	40 %	384503770
84	NC_017300	ATTGA	2	10	178750	178759	40 %	40 %	20 %	0 %	384503774
85	NC_017300	GTGGA	2	10	181181	181190	20 %	20 %	60 %	0 %	384503775
86	NC_017300	TGACC	2	10	185431	185440	20 %	20 %	20 %	40 %	384503778
87	NC_017300	TTGCA	2	10	186717	186726	20 %	40 %	20 %	20 %	384503780
88	NC_017300	GTTTG	2	10	188656	188665	0 %	60 %	40 %	0 %	384503783
89	NC_017300	CGGAT	2	10	189596	189605	20 %	20 %	40 %	20 %	384503784
90	NC_017300	AGCGC	2	10	190754	190763	20 %	0 %	40 %	40 %	384503785
91	NC_017300	GCAGT	2	10	192241	192250	20 %	20 %	40 %	20 %	384503786
92	NC_017300	CAATG	2	10	192512	192521	40 %	20 %	20 %	20 %	384503786
93	NC_017300	TAACG	2	10	193487	193496	40 %	20 %	20 %	20 %	384503787
94	NC_017300	AAGCC	2	10	194814	194823	40 %	0 %	20 %	40 %	384503788
95	NC_017300	GGCCC	2	10	196886	196895	0 %	0 %	40 %	60 %	384503791
96	NC_017300	GAATT	2	10	200451	200460	40 %	40 %	20 %	0 %	384503796
97	NC_017300	CAAGG	2	10	201340	201349	40 %	0 %	40 %	20 %	384503796
98	NC_017300	GATGG	2	10	203789	203798	20 %	20 %	60 %	0 %	384503797
99	NC_017300	TGGCG	2	10	204523	204532	0 %	20 %	60 %	20 %	384503798
100	NC_017300	TGCCA	2	10	206546	206555	20 %	20 %	20 %	40 %	384503799
101	NC_017300	AAATA	2	10	206648	206657	80 %	20 %	0 %	0 %	384503799
102	NC_017300	ATTCT	2	10	207244	207253	20 %	60 %	0 %	20 %	384503800
103	NC_017300	CAGGC	2	10	212047	212056	20 %	0 %	40 %	40 %	384503803
104	NC_017300	TTGTA	2	10	212457	212466	20 %	60 %	20 %	0 %	384503804
105	NC_017300	GCGAC	2	10	216973	216982	20 %	0 %	40 %	40 %	384503809
106	NC_017300	AGATC	2	10	216998	217007	40 %	20 %	20 %	20 %	384503809
107	NC_017300	CAAGG	2	10	217912	217921	40 %	0 %	40 %	20 %	384503810
108	NC_017300	AGAAA	2	10	218641	218650	80 %	0 %	20 %	0 %	384503811
109	NC_017300	CGGGG	2	10	224672	224681	0 %	0 %	80 %	20 %	384503818
110	NC_017300	TGCGC	2	10	227114	227123	0 %	20 %	40 %	40 %	384503821
111	NC_017300	CACTG	2	10	228274	228283	20 %	20 %	20 %	40 %	384503822
112	NC_017300	CATTG	2	10	228963	228972	20 %	40 %	20 %	20 %	384503823
113	NC_017300	CGCAA	2	10	229777	229786	40 %	0 %	20 %	40 %	384503826
114	NC_017300	GATCG	2	10	230095	230104	20 %	20 %	40 %	20 %	384503827
115	NC_017300	CAAGA	2	10	232007	232016	60 %	0 %	20 %	20 %	384503827
116	NC_017300	TGGCT	2	10	232203	232212	0 %	40 %	40 %	20 %	384503827
117	NC_017300	CTGTG	2	10	233522	233531	0 %	40 %	40 %	20 %	384503829
118	NC_017300	GCCGT	2	10	234923	234932	0 %	20 %	40 %	40 %	384503829
119	NC_017300	AGAAA	2	10	235830	235839	80 %	0 %	20 %	0 %	384503829
120	NC_017300	AGAGT	2	10	239257	239266	40 %	20 %	40 %	0 %	384503831
121	NC_017300	TTTTG	2	10	241556	241565	0 %	80 %	20 %	0 %	384503833
122	NC_017300	GCCAT	2	10	244913	244922	20 %	20 %	20 %	40 %	384503836
123	NC_017300	CGCAG	2	10	247969	247978	20 %	0 %	40 %	40 %	384503839
124	NC_017300	CATGC	2	10	249740	249749	20 %	20 %	20 %	40 %	384503840
125	NC_017300	CCATG	2	10	249971	249980	20 %	20 %	20 %	40 %	384503840
126	NC_017300	AATTG	2	10	250144	250153	40 %	40 %	20 %	0 %	384503840
127	NC_017300	CCCCG	2	10	254796	254805	0 %	0 %	20 %	80 %	384503845
128	NC_017300	GAAGT	2	10	255337	255346	40 %	20 %	40 %	0 %	384503845
129	NC_017300	CCGTG	2	10	255523	255532	0 %	20 %	40 %	40 %	384503845
130	NC_017300	TGCTC	2	10	260463	260472	0 %	40 %	20 %	40 %	384503849
131	NC_017300	TTGGA	2	10	262381	262390	20 %	40 %	40 %	0 %	384503851
132	NC_017300	GGCTC	2	10	262703	262712	0 %	20 %	40 %	40 %	384503852
133	NC_017300	TCCTT	2	10	263433	263442	0 %	60 %	0 %	40 %	384503853
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254	NC_017300	ATCAA	2	10	522126	522135	60 %	20 %	0 %	20 %	384504102
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260	NC_017300	TCCGG	2	10	539007	539016	0 %	20 %	40 %	40 %	384504120
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262	NC_017300	CGGAG	2	10	541688	541697	20 %	0 %	60 %	20 %	384504122
263	NC_017300	CCGTA	2	10	542105	542114	20 %	20 %	20 %	40 %	384504123
264	NC_017300	GAACT	2	10	545425	545434	40 %	20 %	20 %	20 %	384504126
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292	NC_017300	TTAGG	2	10	588617	588626	20 %	40 %	40 %	0 %	384504162
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297	NC_017300	GCCAG	2	10	595281	595290	20 %	0 %	40 %	40 %	384504166
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386	NC_017300	AGGGG	2	10	800314	800323	20 %	0 %	80 %	0 %	384504355
387	NC_017300	GGGAT	2	10	800920	800929	20 %	20 %	60 %	0 %	384504355
388	NC_017300	TCTTT	2	10	801781	801790	0 %	80 %	0 %	20 %	384504356
389	NC_017300	GGGGT	2	10	802533	802542	0 %	20 %	80 %	0 %	384504357
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