MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum H04402 065

Total Repeats: 2529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017299	TAGCAG	2	12	392	403	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387816238
2	NC_017299	AAAAAT	2	12	1331	1342	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387816238
3	NC_017299	TCTATT	2	12	1552	1563	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017299	GATAAT	2	12	2150	2161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387816239
5	NC_017299	AAGTTA	2	12	2832	2843	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387816240
6	NC_017299	CAAATA	2	12	3065	3076	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387816241
7	NC_017299	ATAAAG	2	12	3161	3172	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387816241
8	NC_017299	ATAAAA	2	12	3295	3306	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387816241
9	NC_017299	GAAGTA	2	12	4793	4804	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387816243
10	NC_017299	TTGATA	2	12	5844	5855	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387816243
11	NC_017299	GATTAG	2	12	6490	6501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387816244
12	NC_017299	TTTAAA	2	12	7355	7366	50 %	50 %	0 %	0 %	387816244
13	NC_017299	CAAGCT	2	12	7581	7592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387816244
14	NC_017299	ATAGAT	2	12	17707	17718	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387816248
15	NC_017299	ACAAAT	2	12	18616	18627	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387816248
16	NC_017299	AATAAA	2	12	19589	19600	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387816249
17	NC_017299	GCAAAA	2	12	23445	23456	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387816252
18	NC_017299	ATTTAG	2	12	25301	25312	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387816253
19	NC_017299	TTATTT	2	12	26385	26396	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387816254
20	NC_017299	ATATAG	2	12	26617	26628	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387816254
21	NC_017299	AGAAGC	2	12	27035	27046	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387816254
22	NC_017299	TAAAAG	2	12	27936	27947	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017299	AGATGA	2	12	34180	34191	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387816260
24	NC_017299	CTATAG	2	12	34364	34375	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387816261
25	NC_017299	AATATA	2	12	35378	35389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017299	AGAAAA	2	12	36187	36198	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387816264
27	NC_017299	ATGTTT	2	12	41241	41252	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387816270
28	NC_017299	AATATG	2	12	63086	63097	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387816276
29	NC_017299	TAAAAA	2	12	78377	78388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017299	AATATG	2	12	81936	81947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387816285
31	NC_017299	AATTAT	2	12	83958	83969	50 %	50 %	0 %	0 %	387816288
32	NC_017299	GAAAAA	2	12	84499	84510	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387816289
33	NC_017299	AGTTAA	2	12	84993	85004	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387816289
34	NC_017299	TGTAGA	2	12	85334	85345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017299	AAAATA	2	12	86951	86962	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387816292
36	NC_017299	GTTTTA	2	12	87184	87195	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387816292
37	NC_017299	AGAAAA	2	12	87219	87230	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387816292
38	NC_017299	GTAAGA	2	12	88620	88631	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387816293
39	NC_017299	AATAAA	2	12	89228	89239	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017299	TTTCAA	2	12	94331	94342	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017299	ATTTAA	2	12	98291	98302	50 %	50 %	0 %	0 %	387816306
42	NC_017299	ATAAAT	2	12	102240	102251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387816308
43	NC_017299	AGTTAA	2	12	104100	104111	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387816310
44	NC_017299	AGAACA	2	12	106972	106983	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387816313
45	NC_017299	AATATA	2	12	109370	109381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387816315
46	NC_017299	AGGACA	2	12	110118	110129	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387816316
47	NC_017299	GTAGAT	2	12	110386	110397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387816316
48	NC_017299	TACTGA	2	12	113043	113054	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387816319
49	NC_017299	TATTAA	2	12	114162	114173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017299	AATAAA	2	12	116223	116234	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387816323
51	NC_017299	GATATA	2	12	116311	116322	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387816323
52	NC_017299	TAAAGA	2	12	117559	117570	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387816324
53	NC_017299	TTAAAT	2	12	121328	121339	50 %	50 %	0 %	0 %	387816328
54	NC_017299	TCAAAA	2	12	123845	123856	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387816329
55	NC_017299	TTTGCT	2	12	124871	124882	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387816329
56	NC_017299	GAAAAA	2	12	127007	127018	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387816331
57	NC_017299	AGGAAA	2	12	127269	127280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387816331
58	NC_017299	AATGTA	2	12	128079	128090	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387816331
59	NC_017299	TGGATA	2	12	131130	131141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387816332
60	NC_017299	CATGAA	2	12	132303	132314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387816333
61	NC_017299	ATAAAT	2	12	132417	132428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387816333
62	NC_017299	ATAAGA	2	12	138015	138026	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387816337
63	NC_017299	ATATAA	2	12	140699	140710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387816341
64	NC_017299	ATTTTT	2	12	143619	143630	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387816343
65	NC_017299	GTAAGT	2	12	143853	143864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387816343
66	NC_017299	TTGAAA	2	12	144051	144062	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387816344
67	NC_017299	TGATTT	2	12	144517	144528	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387816344
68	NC_017299	AGCAAG	2	12	145236	145247	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387816345
69	NC_017299	AAAGAA	2	12	148594	148605	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387816349
70	NC_017299	AATATA	2	12	149673	149684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387816350
71	NC_017299	ATTAGT	2	12	152538	152549	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387816351
72	NC_017299	TTAAAG	2	12	157435	157446	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387816355
73	NC_017299	TACCTA	2	12	158522	158533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387816356
74	NC_017299	ACATTA	2	12	159243	159254	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017299	GTAGAA	2	12	161509	161520	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387816358
76	NC_017299	AAGGAA	2	12	162001	162012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017299	AAAAGA	2	12	162068	162079	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387816359
78	NC_017299	ATAAAT	2	12	162309	162320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387816359
79	NC_017299	ATAGAA	2	12	162728	162739	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387816360
80	NC_017299	AAACTT	2	12	163059	163070	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017299	AGATTT	2	12	163320	163331	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387816361
82	NC_017299	AAAGAA	2	12	163507	163518	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387816361
83	NC_017299	ATGAAT	2	12	165259	165270	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387816362
84	NC_017299	TTTATT	2	12	165531	165542	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017299	GTGGTA	2	12	169489	169500	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387816367
86	NC_017299	ATATAA	2	12	170695	170706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387816368
87	NC_017299	AGGTAT	2	12	174349	174360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387816373
88	NC_017299	AGTTAT	2	12	176585	176596	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387816376
89	NC_017299	TACAAC	2	12	177678	177689	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387816377
90	NC_017299	ATATTT	2	12	178689	178700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017299	AAAAAT	2	12	179220	179231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387816378
92	NC_017299	ATGGTA	2	12	183229	183240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387816384
93	NC_017299	AACATA	2	12	183297	183308	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387816384
94	NC_017299	AATTAA	2	12	185679	185690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387816386
95	NC_017299	TAATTT	2	12	186395	186406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387816387
96	NC_017299	AATAAA	2	12	187373	187384	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387816388
97	NC_017299	ATAAAA	2	12	187446	187457	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387816388
98	NC_017299	TTTAAT	2	12	189515	189526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017299	TAAAGT	2	12	190367	190378	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387816390
100	NC_017299	AATGGT	2	12	194293	194304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387816395
101	NC_017299	TTAAAA	2	12	195654	195665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387816396
102	NC_017299	TAAATA	2	12	196414	196425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387816396
103	NC_017299	AAAGAT	2	12	197031	197042	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387816396
104	NC_017299	TGTAAT	2	12	201791	201802	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387816400
105	NC_017299	AAAGAA	2	12	202722	202733	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387816400
106	NC_017299	GTAGAA	2	12	202959	202970	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387816400
107	NC_017299	GAAATA	2	12	204066	204077	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387816401
108	NC_017299	AATTAA	2	12	205088	205099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387816402
109	NC_017299	GAAAAA	2	12	206924	206935	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387816403
110	NC_017299	AATATT	2	12	208417	208428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017299	ATTAAT	2	12	209585	209596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017299	GGGTAA	2	12	211038	211049	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387816405
113	NC_017299	ATATAG	2	12	211528	211539	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387816406
114	NC_017299	TAAGAT	2	12	212060	212071	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387816407
115	NC_017299	CAGATA	2	12	213136	213147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387816409
116	NC_017299	TCTCAG	2	12	213813	213824	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387816409
117	NC_017299	GATAAA	2	12	214116	214127	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387816409
118	NC_017299	TAAAAG	2	12	214534	214545	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387816409
119	NC_017299	CTATAT	2	12	215687	215698	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387816410
120	NC_017299	ATTATA	2	12	216097	216108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017299	AATTAT	2	12	216119	216130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017299	TATAAA	2	12	216696	216707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387816411
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