MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum H04402 065

Total Repeats: 540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017299	TCTATT	2	12	1552	1563	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017299	TAAAAG	2	12	27936	27947	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017299	AATATA	2	12	35378	35389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017299	TAAAAA	2	12	78377	78388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017299	TGTAGA	2	12	85334	85345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017299	AATAAA	2	12	89228	89239	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017299	TTTCAA	2	12	94331	94342	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017299	TATTAA	2	12	114162	114173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017299	ACATTA	2	12	159243	159254	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017299	AAGGAA	2	12	162001	162012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017299	AAACTT	2	12	163059	163070	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017299	TTTATT	2	12	165531	165542	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017299	ATATTT	2	12	178689	178700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017299	TTTAAT	2	12	189515	189526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017299	AATATT	2	12	208417	208428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017299	ATTAAT	2	12	209585	209596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017299	ATTATA	2	12	216097	216108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017299	AATTAT	2	12	216119	216130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017299	ATTAAA	2	12	217267	217278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017299	TATTTT	2	12	217281	217292	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017299	ATTTTA	2	12	231516	231527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017299	TTTAAT	2	12	236382	236393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017299	TTTAAT	2	12	249313	249324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017299	ATTTAA	2	12	259726	259737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017299	ATTAAA	2	12	272108	272119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017299	GAAATA	2	12	280332	280343	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017299	TAAATA	2	12	296216	296227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017299	TAATTT	2	12	325425	325436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017299	TAAAAG	2	12	328273	328284	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017299	AAAATA	2	12	338302	338313	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017299	TAAATA	2	12	338332	338343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017299	AGGATA	2	12	373800	373811	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017299	TATAAT	2	12	388956	388967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017299	AGCTTT	2	12	390387	390398	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017299	AAAATG	2	12	391662	391673	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017299	TTTAAT	2	12	400001	400012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017299	ATTAAA	2	12	408441	408452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017299	TAAATT	2	12	411386	411397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017299	TAATAT	2	12	411541	411552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017299	GAGATC	2	12	413601	413612	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017299	TGTGAG	2	12	420418	420429	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017299	ATTTTA	2	12	430072	430083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017299	TTAAAA	2	12	450295	450306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017299	AGAATA	2	12	473633	473644	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017299	TTTATT	2	12	480263	480274	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017299	TATAGA	2	12	482266	482277	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017299	AATAGC	2	12	483695	483706	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017299	ATATAA	2	12	491348	491359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017299	TTAATA	2	12	491963	491974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017299	TTTATA	2	12	493308	493319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017299	TAGGTA	2	12	505797	505808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017299	ATTAAT	2	12	513344	513355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017299	ATTAAA	2	12	514695	514706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017299	ATTTTT	2	12	522470	522481	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017299	TTCAAT	2	12	522596	522607	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017299	AAAGCA	2	12	525032	525043	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017299	ATATTA	2	12	535880	535891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017299	GTATTA	2	12	536077	536088	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017299	TTTAAT	2	12	540784	540795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017299	TTTTTA	2	12	544267	544278	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017299	TAAAAT	2	12	553428	553439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017299	GTTAAT	2	12	565418	565429	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017299	ATTAAA	2	12	567152	567163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017299	TTTATT	2	12	586374	586385	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017299	AAAATA	2	12	592409	592420	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017299	TTATAT	2	12	596707	596718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017299	TATAAA	2	12	600377	600388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017299	ATAAGG	2	12	600489	600500	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017299	TTTATT	2	12	601565	601576	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017299	TTTATT	2	12	605586	605597	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017299	ATAGAA	2	12	608798	608809	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017299	TATAAA	2	12	609731	609742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017299	TAGATT	2	12	612891	612902	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017299	AAAGTA	2	12	623578	623589	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017299	GTAGTC	2	12	641385	641396	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017299	TAAAAA	2	12	641423	641434	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017299	TTTAAT	2	12	641439	641450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017299	TTAAAA	2	12	641559	641570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017299	TAAAAT	2	12	645874	645885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017299	TTTTAA	2	12	648145	648156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017299	TTTAAA	2	12	650997	651008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017299	TTTAAG	2	12	654179	654190	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017299	TAAAAA	2	12	666769	666780	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017299	TACATA	2	12	675740	675751	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017299	TTTTAC	2	12	677106	677117	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017299	TTTAAT	2	12	678160	678171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017299	TTAAAT	2	12	678231	678242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017299	ATTTAG	2	12	681969	681980	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017299	ATTTTT	2	12	682583	682594	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017299	AAAATA	2	12	684800	684811	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017299	TTTAAT	2	12	684814	684825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017299	AATTAA	2	12	685046	685057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017299	AAAATC	2	12	698752	698763	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017299	TCAAAT	2	12	698909	698920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017299	TTTTTC	2	12	699209	699220	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017299	TTAAAA	2	12	703119	703130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017299	TTCAAT	2	12	706004	706015	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017299	AAATGA	2	12	714643	714654	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017299	TGAAAT	2	12	721172	721183	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017299	ATTTTT	2	12	732275	732286	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017299	ATTTTA	2	12	734344	734355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017299	ATTTTT	2	12	734517	734528	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017299	AAATTA	2	12	735915	735926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017299	TATTGT	2	12	739474	739485	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017299	ATGGAA	2	12	768207	768218	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017299	TTATAA	2	12	779153	779164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017299	TTTAAT	2	12	781443	781454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017299	TTTTTG	2	12	783170	783181	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017299	ATTTAA	2	12	789180	789191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017299	TAAAAA	2	12	789225	789236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017299	TAAAGT	2	12	795125	795136	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017299	TTATTT	2	12	795822	795833	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017299	TAAATA	2	12	799811	799822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017299	AATATA	2	12	813520	813531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017299	AAATAA	2	12	835247	835258	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017299	TTAAAT	2	12	841862	841873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017299	TTTGTT	2	12	854731	854742	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017299	GAATAT	2	12	858703	858714	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017299	ATTAGA	2	12	868043	868054	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017299	AATTAT	2	12	893482	893493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017299	CCTCTA	2	12	897594	897605	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017299	TTATAA	2	12	902312	902323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017299	ATTATC	2	12	905240	905251	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017299	AAAACA	2	12	906405	906416	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017299	GGGGAG	2	12	930449	930460	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017299	ATTAAT	2	12	931733	931744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017299	GAAAAA	2	12	932059	932070	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017299	CTTTTG	2	12	947081	947092	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017299	TTTCAA	2	12	949484	949495	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017299	AATAAA	2	12	967154	967165	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017299	CAAGCA	2	12	967310	967321	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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133	NC_017299	AAAATA	2	12	971459	971470	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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