MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum F str. 230613 plasmid pCBF

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017298	TATTT	2	10	38	47	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017298	TATGA	2	10	1110	1119	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017298	TATAA	2	10	1675	1684	60 %	40 %	0 %	0 %	384463967
4	NC_017298	ATTAA	2	10	3129	3138	60 %	40 %	0 %	0 %	384463971
5	NC_017298	ATAAA	2	10	4071	4080	80 %	20 %	0 %	0 %	384463972
6	NC_017298	ATATA	2	10	5170	5179	60 %	40 %	0 %	0 %	384463973
7	NC_017298	ATAAA	2	10	5474	5483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017298	AATTA	2	10	5500	5509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017298	CTATA	2	10	5770	5779	40 %	40 %	0 %	20 %	384463974
10	NC_017298	ATTTC	2	10	5916	5925	20 %	60 %	0 %	20 %	384463974
11	NC_017298	TAATA	2	10	7103	7112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017298	CCTTT	2	10	7131	7140	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017298	ATAAA	2	10	7302	7311	80 %	20 %	0 %	0 %	384463976
14	NC_017298	AAAAC	2	10	7423	7432	80 %	0 %	0 %	20 %	384463976
15	NC_017298	GATAA	2	10	7685	7694	60 %	20 %	20 %	0 %	384463976
16	NC_017298	AAAAT	2	10	7862	7871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017298	TGAAT	2	10	8186	8195	40 %	40 %	20 %	0 %	384463977
18	NC_017298	TAAAT	2	10	8297	8306	60 %	40 %	0 %	0 %	384463977
19	NC_017298	ATTTA	2	10	10293	10302	40 %	60 %	0 %	0 %	384463982
20	NC_017298	TTTTA	2	10	10575	10584	20 %	80 %	0 %	0 %	384463982
21	NC_017298	ATTAC	2	10	10681	10690	40 %	40 %	0 %	20 %	384463982
22	NC_017298	TTTTA	2	10	11254	11263	20 %	80 %	0 %	0 %	384463984
23	NC_017298	TTATT	2	10	11334	11343	20 %	80 %	0 %	0 %	384463984
24	NC_017298	AATTT	2	10	12225	12234	40 %	60 %	0 %	0 %	384463984
25	NC_017298	ATTAA	2	10	12615	12624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017298	TTTTA	2	10	12677	12686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017298	TTTTC	2	10	12968	12977	0 %	80 %	0 %	20 %	384463985
28	NC_017298	ATATT	2	10	13448	13457	40 %	60 %	0 %	0 %	384463985
29	NC_017298	CATAC	2	10	13791	13800	40 %	20 %	0 %	40 %	384463986
30	NC_017298	TAAGG	2	10	13956	13965	40 %	20 %	40 %	0 %	384463986
31	NC_017298	TTTTA	2	10	14324	14333	20 %	80 %	0 %	0 %	384463986
32	NC_017298	TTTCA	2	10	15113	15122	20 %	60 %	0 %	20 %	384463986
33	NC_017298	TATAT	2	10	15724	15733	40 %	60 %	0 %	0 %	384463987
34	NC_017298	TAAAA	2	10	16803	16812	80 %	20 %	0 %	0 %	384463987

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.