MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum F str. 230613 plasmid pCBF

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017298	TGG	3	9	138	146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463963
2	NC_017298	GCT	2	6	181	186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384463963
3	NC_017298	GGT	2	6	187	192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463963
4	NC_017298	TGG	2	6	201	206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463963
5	NC_017298	ATG	2	6	215	220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463963
6	NC_017298	TGG	2	6	309	314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463964
7	NC_017298	GGT	2	6	319	324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463964
8	NC_017298	GCT	2	6	349	354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384463964
9	NC_017298	TGG	2	6	366	371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463964
10	NC_017298	TGT	2	6	372	377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384463964
11	NC_017298	AGC	2	6	391	396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384463964
12	NC_017298	TGG	2	6	408	413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463964
13	NC_017298	TGG	2	6	420	425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463964
14	NC_017298	ATG	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463964
15	NC_017298	TCT	2	6	590	595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463965
16	NC_017298	CTA	2	6	619	624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384463965
17	NC_017298	ATT	2	6	668	673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463965
18	NC_017298	TTA	2	6	784	789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463965
19	NC_017298	CAA	2	6	1210	1215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384463966
20	NC_017298	CAC	2	6	1312	1317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384463966
21	NC_017298	AGA	2	6	1572	1577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384463967
22	NC_017298	TGG	2	6	1584	1589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463967
23	NC_017298	TTA	2	6	1736	1741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463968
24	NC_017298	TGA	2	6	1747	1752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463968
25	NC_017298	TTA	2	6	1760	1765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463968
26	NC_017298	GTG	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463968
27	NC_017298	TGC	2	6	1819	1824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384463968
28	NC_017298	GTT	3	9	1841	1849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384463968
29	NC_017298	ACA	2	6	1856	1861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384463968
30	NC_017298	ATA	2	6	1894	1899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463968
31	NC_017298	TAT	2	6	1979	1984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463969
32	NC_017298	AAT	2	6	2031	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463969
33	NC_017298	TAA	3	9	2088	2096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463969
34	NC_017298	CAC	2	6	2105	2110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384463969
35	NC_017298	ATA	2	6	2191	2196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463969
36	NC_017298	TAT	2	6	2300	2305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463969
37	NC_017298	TCA	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384463969
38	NC_017298	TTC	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463969
39	NC_017298	TAT	2	6	2369	2374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463969
40	NC_017298	TTA	2	6	2415	2420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463970
41	NC_017298	ACA	2	6	3248	3253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384463971
42	NC_017298	GCT	2	6	3276	3281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384463971
43	NC_017298	GAT	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463971
44	NC_017298	TAG	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463972
45	NC_017298	TTG	2	6	4597	4602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384463973
46	NC_017298	CAA	2	6	4662	4667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384463973
47	NC_017298	ATG	2	6	4671	4676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463973
48	NC_017298	TAT	2	6	4721	4726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463973
49	NC_017298	TGT	2	6	4939	4944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384463973
50	NC_017298	GAA	2	6	4971	4976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384463973
51	NC_017298	ATA	2	6	5025	5030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463973
52	NC_017298	TTC	2	6	5080	5085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463973
53	NC_017298	AAT	2	6	5111	5116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463973
54	NC_017298	TTA	2	6	5196	5201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463973
55	NC_017298	TAA	2	6	5621	5626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463974
56	NC_017298	ATT	2	6	5669	5674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463974
57	NC_017298	CAA	2	6	5737	5742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384463974
58	NC_017298	ATT	2	6	5753	5758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463974
59	NC_017298	TTA	2	6	5788	5793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463974
60	NC_017298	TTC	2	6	5849	5854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463974
61	NC_017298	CTT	2	6	5992	5997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463974
62	NC_017298	TAA	2	6	6049	6054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463974
63	NC_017298	CTT	2	6	6111	6116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463974
64	NC_017298	TTA	2	6	6130	6135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463974
65	NC_017298	CTA	2	6	6417	6422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384463974
66	NC_017298	TTA	2	6	6442	6447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463974
67	NC_017298	ATC	2	6	6485	6490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384463974
68	NC_017298	AGG	2	6	6550	6555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384463974
69	NC_017298	ATT	2	6	6587	6592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463974
70	NC_017298	TTC	2	6	6612	6617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463974
71	NC_017298	GAA	2	6	7235	7240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384463976
72	NC_017298	ATA	2	6	7256	7261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463976
73	NC_017298	TAT	2	6	7276	7281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463976
74	NC_017298	GCA	2	6	7292	7297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384463976
75	NC_017298	ATT	2	6	7404	7409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463976
76	NC_017298	AGA	2	6	7516	7521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384463976
77	NC_017298	ATA	2	6	7595	7600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463976
78	NC_017298	TAA	2	6	7716	7721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463976
79	NC_017298	TTA	2	6	8221	8226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463977
80	NC_017298	CTT	2	6	8242	8247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463977
81	NC_017298	TAA	2	6	8276	8281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463977
82	NC_017298	TAT	2	6	8383	8388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463977
83	NC_017298	TTA	2	6	8401	8406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463977
84	NC_017298	TCA	2	6	8462	8467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384463978
85	NC_017298	AGC	2	6	8485	8490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384463978
86	NC_017298	ATT	2	6	8496	8501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463978
87	NC_017298	TTC	2	6	8630	8635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463978
88	NC_017298	TTC	2	6	8648	8653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463978
89	NC_017298	TTC	2	6	8780	8785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463978
90	NC_017298	TAT	2	6	8792	8797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463978
91	NC_017298	TTC	2	6	8798	8803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463978
92	NC_017298	AGT	2	6	8809	8814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463978
93	NC_017298	ATC	2	6	8834	8839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384463978
94	NC_017298	TAT	2	6	8866	8871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463978
95	NC_017298	TTC	2	6	8873	8878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463978
96	NC_017298	CTA	2	6	8890	8895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384463978
97	NC_017298	GAA	3	9	8955	8963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384463978
98	NC_017298	AAT	2	6	8966	8971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463978
99	NC_017298	TAT	2	6	9532	9537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463979
100	NC_017298	ATG	2	6	9590	9595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463979
101	NC_017298	GTA	2	6	9596	9601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463979
102	NC_017298	AGT	2	6	9646	9651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463979
103	NC_017298	TAT	2	6	9663	9668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463979
104	NC_017298	ATA	2	6	9673	9678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463979
105	NC_017298	AGA	2	6	9737	9742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384463980
106	NC_017298	AGA	2	6	9776	9781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384463980
107	NC_017298	AGA	2	6	9788	9793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384463980
108	NC_017298	TAG	2	6	9820	9825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463980
109	NC_017298	AAC	2	6	9887	9892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384463980
110	NC_017298	AGA	2	6	9899	9904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384463980
111	NC_017298	TCA	2	6	10020	10025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384463981
112	NC_017298	TCT	4	12	10062	10073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463981
113	NC_017298	TAA	2	6	10106	10111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463981
114	NC_017298	CCT	2	6	10229	10234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384463982
115	NC_017298	ATC	2	6	10380	10385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384463982
116	NC_017298	TAT	2	6	10439	10444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463982
117	NC_017298	TCT	2	6	10566	10571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463982
118	NC_017298	GTA	3	9	10612	10620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463982
119	NC_017298	TAG	2	6	10649	10654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463982
120	NC_017298	TCT	2	6	10672	10677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463982
121	NC_017298	TCA	2	6	10927	10932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384463983
122	NC_017298	TTA	2	6	11165	11170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463984
123	NC_017298	TAA	2	6	11245	11250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463984
124	NC_017298	TTG	2	6	11284	11289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384463984
125	NC_017298	TCT	2	6	11314	11319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463984
126	NC_017298	TCT	2	6	11356	11361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463984
127	NC_017298	CTT	2	6	11367	11372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463984
128	NC_017298	TAT	2	6	11380	11385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463984
129	NC_017298	TTC	2	6	11404	11409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463984
130	NC_017298	ACC	2	6	11458	11463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384463984
131	NC_017298	CTT	2	6	11541	11546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463984
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.