MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum F str. 230613 plasmid pCBF

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017298	GA	3	6	120	125	50 %	0 %	50 %	0 %	384463963
2	NC_017298	TA	3	6	545	550	50 %	50 %	0 %	0 %	384463965
3	NC_017298	CT	3	6	1224	1229	0 %	50 %	0 %	50 %	384463966
4	NC_017298	CT	3	6	1247	1252	0 %	50 %	0 %	50 %	384463966
5	NC_017298	AT	3	6	1291	1296	50 %	50 %	0 %	0 %	384463966
6	NC_017298	AC	3	6	1343	1348	50 %	0 %	0 %	50 %	384463966
7	NC_017298	TA	4	8	1986	1993	50 %	50 %	0 %	0 %	384463969
8	NC_017298	TA	4	8	2004	2011	50 %	50 %	0 %	0 %	384463969
9	NC_017298	TA	3	6	2139	2144	50 %	50 %	0 %	0 %	384463969
10	NC_017298	TA	3	6	2291	2296	50 %	50 %	0 %	0 %	384463969
11	NC_017298	AT	3	6	2304	2309	50 %	50 %	0 %	0 %	384463969
12	NC_017298	AT	3	6	3096	3101	50 %	50 %	0 %	0 %	384463971
13	NC_017298	AT	3	6	3185	3190	50 %	50 %	0 %	0 %	384463971
14	NC_017298	AT	3	6	3262	3267	50 %	50 %	0 %	0 %	384463971
15	NC_017298	TA	4	8	4607	4614	50 %	50 %	0 %	0 %	384463973
16	NC_017298	AT	3	6	4632	4637	50 %	50 %	0 %	0 %	384463973
17	NC_017298	TA	3	6	4686	4691	50 %	50 %	0 %	0 %	384463973
18	NC_017298	CT	4	8	4699	4706	0 %	50 %	0 %	50 %	384463973
19	NC_017298	CA	3	6	4798	4803	50 %	0 %	0 %	50 %	384463973
20	NC_017298	AT	3	6	5158	5163	50 %	50 %	0 %	0 %	384463973
21	NC_017298	TA	4	8	5242	5249	50 %	50 %	0 %	0 %	384463973
22	NC_017298	TA	3	6	5951	5956	50 %	50 %	0 %	0 %	384463974
23	NC_017298	AT	3	6	6578	6583	50 %	50 %	0 %	0 %	384463974
24	NC_017298	AG	3	6	7469	7474	50 %	0 %	50 %	0 %	384463976
25	NC_017298	AT	3	6	7491	7496	50 %	50 %	0 %	0 %	384463976
26	NC_017298	TA	3	6	7554	7559	50 %	50 %	0 %	0 %	384463976
27	NC_017298	AT	3	6	7725	7730	50 %	50 %	0 %	0 %	384463976
28	NC_017298	TC	3	6	8063	8068	0 %	50 %	0 %	50 %	384463977
29	NC_017298	AT	4	8	8082	8089	50 %	50 %	0 %	0 %	384463977
30	NC_017298	AT	3	6	8172	8177	50 %	50 %	0 %	0 %	384463977
31	NC_017298	CT	3	6	8703	8708	0 %	50 %	0 %	50 %	384463978
32	NC_017298	CT	3	6	8977	8982	0 %	50 %	0 %	50 %	384463978
33	NC_017298	CT	3	6	10011	10016	0 %	50 %	0 %	50 %	384463981
34	NC_017298	AT	3	6	10533	10538	50 %	50 %	0 %	0 %	384463982
35	NC_017298	TA	3	6	11640	11645	50 %	50 %	0 %	0 %	384463984
36	NC_017298	TC	3	6	11660	11665	0 %	50 %	0 %	50 %	384463984
37	NC_017298	TA	3	6	11763	11768	50 %	50 %	0 %	0 %	384463984
38	NC_017298	TA	3	6	11875	11880	50 %	50 %	0 %	0 %	384463984
39	NC_017298	TA	3	6	12074	12079	50 %	50 %	0 %	0 %	384463984
40	NC_017298	TA	4	8	12214	12221	50 %	50 %	0 %	0 %	384463984
41	NC_017298	TC	3	6	13475	13480	0 %	50 %	0 %	50 %	384463985
42	NC_017298	TA	3	6	13519	13524	50 %	50 %	0 %	0 %	384463985
43	NC_017298	TA	3	6	13834	13839	50 %	50 %	0 %	0 %	384463986
44	NC_017298	AT	3	6	14062	14067	50 %	50 %	0 %	0 %	384463986
45	NC_017298	TA	3	6	14866	14871	50 %	50 %	0 %	0 %	384463986
46	NC_017298	AT	3	6	15052	15057	50 %	50 %	0 %	0 %	384463986
47	NC_017298	TC	3	6	15100	15105	0 %	50 %	0 %	50 %	384463986
48	NC_017298	AT	3	6	15301	15306	50 %	50 %	0 %	0 %	384463987
49	NC_017298	AT	3	6	15678	15683	50 %	50 %	0 %	0 %	384463987
50	NC_017298	AC	3	6	16227	16232	50 %	0 %	0 %	50 %	384463987
51	NC_017298	TA	3	6	16467	16472	50 %	50 %	0 %	0 %	384463987
52	NC_017298	TC	3	6	16578	16583	0 %	50 %	0 %	50 %	384463987
53	NC_017298	AT	3	6	16857	16862	50 %	50 %	0 %	0 %	384463987
54	NC_017298	CT	3	6	17245	17250	0 %	50 %	0 %	50 %	384463987

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.