MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum F str. 230613 chromosome

Total Repeats: 2598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017297	TAGCAG	2	12	392	403	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384460460
2	NC_017297	AAAAAT	2	12	1331	1342	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384460460
3	NC_017297	TCTATT	2	12	1552	1563	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017297	GATAAT	2	12	2150	2161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460461
5	NC_017297	AAGTTA	2	12	2832	2843	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460462
6	NC_017297	CAAATA	2	12	3075	3086	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384460463
7	NC_017297	ATAAAG	2	12	3171	3182	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384460463
8	NC_017297	ATAAAA	2	12	3305	3316	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384460463
9	NC_017297	GAAGTA	2	12	4803	4814	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384460465
10	NC_017297	GATTAG	2	12	6500	6511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460466
11	NC_017297	TTTAAA	2	12	7365	7376	50 %	50 %	0 %	0 %	384460466
12	NC_017297	GATATA	2	12	7810	7821	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460466
13	NC_017297	ATAGAT	2	12	17714	17725	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460471
14	NC_017297	ACAAAT	2	12	18623	18634	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384460471
15	NC_017297	AATAAA	2	12	19596	19607	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384460472
16	NC_017297	GCAAAA	2	12	23452	23463	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384460475
17	NC_017297	AATTGT	2	12	25282	25293	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384460477
18	NC_017297	AGCTAC	2	12	27695	27706	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384460479
19	NC_017297	TAAAAG	2	12	29172	29183	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017297	TTTTAT	2	12	33443	33454	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017297	AGATGA	2	12	35416	35427	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384460485
22	NC_017297	CTATAG	2	12	35597	35608	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384460486
23	NC_017297	AATATA	2	12	36611	36622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017297	AGAAAA	2	12	37420	37431	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384460489
25	NC_017297	ATGTTT	2	12	42474	42485	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384460495
26	NC_017297	AATATG	2	12	64304	64315	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460502
27	NC_017297	TAAAAA	2	12	79646	79657	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017297	ATTATA	2	12	83183	83194	50 %	50 %	0 %	0 %	384460511
29	NC_017297	AATATG	2	12	83203	83214	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460511
30	NC_017297	AATTAT	2	12	85225	85236	50 %	50 %	0 %	0 %	384460514
31	NC_017297	GAAAAA	2	12	85766	85777	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384460515
32	NC_017297	TGTAGA	2	12	86601	86612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460516
33	NC_017297	AAAATA	2	12	88217	88228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017297	GTTTTA	2	12	88450	88461	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017297	AGAAAA	2	12	88485	88496	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017297	ATCACA	2	12	89429	89440	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017297	GTAAGA	2	12	89890	89901	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017297	AATAAA	2	12	90498	90509	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017297	TTTCAA	2	12	95600	95611	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017297	ATTTAA	2	12	99591	99602	50 %	50 %	0 %	0 %	384460528
41	NC_017297	ATAAAT	2	12	103670	103681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460530
42	NC_017297	AGTTAA	2	12	105534	105545	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460532
43	NC_017297	AGAACA	2	12	108406	108417	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384460534
44	NC_017297	AATATA	2	12	110764	110775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460536
45	NC_017297	AGGACA	2	12	111512	111523	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384460537
46	NC_017297	GTAGAT	2	12	111780	111791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460537
47	NC_017297	TACTGA	2	12	114438	114449	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017297	TATTAA	2	12	115554	115565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017297	AATAAA	2	12	117615	117626	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384460543
50	NC_017297	GATATA	2	12	117703	117714	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460543
51	NC_017297	TAAAGA	2	12	118951	118962	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384460544
52	NC_017297	TTAAAT	2	12	122720	122731	50 %	50 %	0 %	0 %	384460548
53	NC_017297	TCAAAA	2	12	125235	125246	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384460549
54	NC_017297	TTTGCT	2	12	126261	126272	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384460549
55	NC_017297	GAAAAA	2	12	128396	128407	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017297	AATGTA	2	12	129468	129479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017297	TGGATA	2	12	132518	132529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460551
58	NC_017297	CATGAA	2	12	133692	133703	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017297	GAACAC	2	12	133731	133742	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017297	CATGAG	2	12	133746	133757	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017297	ATAAAT	2	12	133812	133823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017297	ATAAGA	2	12	139410	139421	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384460555
63	NC_017297	ATATAA	2	12	142093	142104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460558
64	NC_017297	ATTTTT	2	12	145012	145023	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384460560
65	NC_017297	GTAAGT	2	12	145246	145257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460560
66	NC_017297	TTGAAA	2	12	145444	145455	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460561
67	NC_017297	AGCAAG	2	12	146629	146640	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384460562
68	NC_017297	AAAGAA	2	12	150037	150048	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384460566
69	NC_017297	AATATA	2	12	151116	151127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460567
70	NC_017297	ATTAGT	2	12	153981	153992	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384460568
71	NC_017297	AAATTT	2	12	157920	157931	50 %	50 %	0 %	0 %	384460572
72	NC_017297	TTAAAG	2	12	159011	159022	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460573
73	NC_017297	TACCTA	2	12	160098	160109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384460574
74	NC_017297	ACATTA	2	12	160819	160830	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017297	GTAGAA	2	12	163085	163096	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384460576
76	NC_017297	AAGGAA	2	12	163577	163588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017297	AAAAGA	2	12	163644	163655	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384460577
78	NC_017297	ATAAAT	2	12	163885	163896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460577
79	NC_017297	ATAGAA	2	12	164304	164315	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384460578
80	NC_017297	AAACTT	2	12	164635	164646	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017297	AGATTT	2	12	164896	164907	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384460579
82	NC_017297	AAAGAA	2	12	165083	165094	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384460579
83	NC_017297	ATGAAT	2	12	166884	166895	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460580
84	NC_017297	TTTATT	2	12	167156	167167	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017297	GTGGTA	2	12	171114	171125	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384460585
86	NC_017297	ATATAA	2	12	172320	172331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460586
87	NC_017297	AGGTAT	2	12	175973	175984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460591
88	NC_017297	TTGAAA	2	12	176397	176408	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460592
89	NC_017297	AGTTAT	2	12	178219	178230	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384460594
90	NC_017297	TACAAC	2	12	179312	179323	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384460595
91	NC_017297	ATATTT	2	12	180323	180334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017297	ATGGTA	2	12	184861	184872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460601
93	NC_017297	AACATA	2	12	184929	184940	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384460601
94	NC_017297	AATTAA	2	12	187311	187322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460603
95	NC_017297	TAATTT	2	12	188028	188039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460604
96	NC_017297	AATAAA	2	12	189006	189017	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384460605
97	NC_017297	ATAAAA	2	12	189079	189090	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384460605
98	NC_017297	ATTAAT	2	12	190857	190868	50 %	50 %	0 %	0 %	384460606
99	NC_017297	TTTAAT	2	12	191153	191164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017297	TAAAGT	2	12	192029	192040	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460607
101	NC_017297	AATGGT	2	12	196231	196242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460613
102	NC_017297	TTAAAA	2	12	197592	197603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017297	TAAATA	2	12	198351	198362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017297	AAAGAT	2	12	198968	198979	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017297	TGTAAT	2	12	203728	203739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384460617
106	NC_017297	AAAGAA	2	12	204659	204670	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384460617
107	NC_017297	GTAGAA	2	12	204896	204907	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384460617
108	NC_017297	GAAATA	2	12	206003	206014	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384460618
109	NC_017297	AATTAA	2	12	206977	206988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460619
110	NC_017297	GAAAAA	2	12	208813	208824	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384460620
111	NC_017297	AATATT	2	12	210306	210317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017297	ATTAAT	2	12	210358	210369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017297	ATTAAT	2	12	211475	211486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017297	GGGTAA	2	12	212928	212939	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384460622
115	NC_017297	ATATAG	2	12	213418	213429	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460623
116	NC_017297	TAAGAT	2	12	213950	213961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460624
117	NC_017297	CAGATA	2	12	215027	215038	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017297	GATAAA	2	12	216007	216018	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017297	TAAAAG	2	12	216425	216436	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017297	CTATAT	2	12	217578	217589	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384460626
121	NC_017297	ATTATA	2	12	217988	217999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017297	AATTAT	2	12	218010	218021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017297	TATAAA	2	12	218587	218598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460627
124	NC_017297	TTTATA	2	12	224928	224939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460634
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