MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum F str. 230613 chromosome

Total Repeats: 741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017297	TCTATT	2	12	1552	1563	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017297	TAAAAG	2	12	29172	29183	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017297	TTTTAT	2	12	33443	33454	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017297	AATATA	2	12	36611	36622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017297	TAAAAA	2	12	79646	79657	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017297	AAAATA	2	12	88217	88228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017297	GTTTTA	2	12	88450	88461	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017297	AGAAAA	2	12	88485	88496	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017297	ATCACA	2	12	89429	89440	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017297	GTAAGA	2	12	89890	89901	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017297	AATAAA	2	12	90498	90509	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017297	TTTCAA	2	12	95600	95611	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017297	TACTGA	2	12	114438	114449	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017297	TATTAA	2	12	115554	115565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017297	GAAAAA	2	12	128396	128407	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017297	AATGTA	2	12	129468	129479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017297	CATGAA	2	12	133692	133703	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017297	GAACAC	2	12	133731	133742	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017297	CATGAG	2	12	133746	133757	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017297	ATAAAT	2	12	133812	133823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017297	ACATTA	2	12	160819	160830	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017297	AAGGAA	2	12	163577	163588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017297	AAACTT	2	12	164635	164646	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017297	TTTATT	2	12	167156	167167	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017297	ATATTT	2	12	180323	180334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017297	TTTAAT	2	12	191153	191164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017297	TTAAAA	2	12	197592	197603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017297	TAAATA	2	12	198351	198362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017297	AAAGAT	2	12	198968	198979	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017297	AATATT	2	12	210306	210317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017297	ATTAAT	2	12	210358	210369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017297	ATTAAT	2	12	211475	211486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017297	CAGATA	2	12	215027	215038	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017297	GATAAA	2	12	216007	216018	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017297	TAAAAG	2	12	216425	216436	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017297	ATTATA	2	12	217988	217999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017297	AATTAT	2	12	218010	218021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017297	ATTTTA	2	12	233412	233423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017297	AGATAA	2	12	249194	249205	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017297	AATAAA	2	12	259111	259122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017297	ATTAAA	2	12	274294	274305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017297	GAAATA	2	12	282456	282467	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017297	ACTTCA	2	12	283770	283781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017297	ATTTGA	2	12	285653	285664	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017297	AGGAAC	2	12	297766	297777	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017297	TTGTAA	2	12	300515	300526	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017297	TTTATA	2	12	302958	302969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017297	AAAAGA	2	12	303405	303416	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017297	GTGAAA	2	12	304078	304089	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017297	GCATTA	2	12	304410	304421	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017297	TTTTAA	2	12	308147	308158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017297	AGATGA	2	12	308847	308858	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017297	AATAAA	2	12	322605	322616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017297	TAATTT	2	12	331874	331885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017297	TTTTTA	2	12	331987	331998	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017297	TAATTT	2	12	342880	342891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017297	TAAAAG	2	12	345805	345816	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017297	AAAATA	2	12	355815	355826	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017297	AAAATG	2	12	367254	367265	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017297	TTTAAT	2	12	376610	376621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017297	TTAAAA	2	12	384457	384468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017297	ATTAAA	2	12	385644	385655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017297	GAGATC	2	12	390805	390816	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017297	TTATTT	2	12	391211	391222	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017297	TATAAA	2	12	397355	397366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017297	TGTGAG	2	12	397587	397598	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017297	TAATAT	2	12	404640	404651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017297	ATTTTA	2	12	407367	407378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017297	TATTTT	2	12	411395	411406	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017297	TAAATA	2	12	417677	417688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017297	TATTTT	2	12	417908	417919	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017297	TATTTA	2	12	419960	419971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017297	TTTTCA	2	12	420338	420349	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017297	TTAAAA	2	12	427902	427913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017297	AGAATA	2	12	451689	451700	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017297	AAATTA	2	12	458220	458231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017297	TTTATT	2	12	462862	462873	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017297	TATAGA	2	12	464987	464998	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017297	AATAGC	2	12	466416	466427	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017297	ATTAAA	2	12	469642	469653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017297	ATATAA	2	12	474053	474064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017297	AATATT	2	12	481379	481390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017297	TACAAG	2	12	490543	490554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017297	ATTAAT	2	12	496401	496412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017297	ATTAAA	2	12	497751	497762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017297	ATTTTT	2	12	505581	505592	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017297	TTCAAT	2	12	505695	505706	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017297	AAAGCA	2	12	508117	508128	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017297	CCTATG	2	12	518336	518347	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017297	GATGGA	2	12	518353	518364	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017297	ATATTA	2	12	518962	518973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017297	GTATTA	2	12	519159	519170	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017297	TTTAAT	2	12	523865	523876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017297	TTTTTA	2	12	527349	527360	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017297	TTAAAA	2	12	532209	532220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017297	TAAAAT	2	12	537505	537516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017297	AAAACA	2	12	542315	542326	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017297	TGTAAA	2	12	542477	542488	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017297	GTTAAT	2	12	548645	548656	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017297	ATTAAA	2	12	550378	550389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017297	TTAATT	2	12	562345	562356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017297	ATTAAA	2	12	562577	562588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017297	TTTATT	2	12	569865	569876	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017297	GAGGAA	2	12	571543	571554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017297	ATTTAA	2	12	572159	572170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017297	AAGGAA	2	12	572326	572337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017297	GAAAAA	2	12	573246	573257	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017297	GAAAAA	2	12	573408	573419	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017297	ATTTAA	2	12	573424	573435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017297	AGTTGG	2	12	573769	573780	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017297	TAAATA	2	12	574003	574014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017297	AAAATA	2	12	575901	575912	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017297	TTCATG	2	12	577136	577147	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017297	TTATAT	2	12	580196	580207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017297	ATTTAA	2	12	580668	580679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017297	TATAAA	2	12	585306	585317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017297	AATTTT	2	12	594901	594912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017297	ATTAAA	2	12	594946	594957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017297	ATATTT	2	12	595006	595017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017297	TTATTT	2	12	595025	595036	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017297	TCAGCT	2	12	603491	603502	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017297	TAAAAA	2	12	618168	618179	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017297	TTTAAT	2	12	618184	618195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017297	TTAAAA	2	12	618304	618315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017297	TTTTAA	2	12	624914	624925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017297	TTTAAA	2	12	627765	627776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017297	TTTAAG	2	12	630958	630969	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017297	ATTAAA	2	12	634865	634876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017297	TAAAAA	2	12	643544	643555	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017297	GTATTA	2	12	649137	649148	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017297	TTTTAC	2	12	654355	654366	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017297	TTTAAT	2	12	655409	655420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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