MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum F str. 230613 chromosome

Total Repeats: 1857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017297	TAGCAG	2	12	392	403	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384460460
2	NC_017297	AAAAAT	2	12	1331	1342	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384460460
3	NC_017297	GATAAT	2	12	2150	2161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460461
4	NC_017297	AAGTTA	2	12	2832	2843	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460462
5	NC_017297	CAAATA	2	12	3075	3086	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384460463
6	NC_017297	ATAAAG	2	12	3171	3182	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384460463
7	NC_017297	ATAAAA	2	12	3305	3316	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384460463
8	NC_017297	GAAGTA	2	12	4803	4814	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384460465
9	NC_017297	GATTAG	2	12	6500	6511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460466
10	NC_017297	TTTAAA	2	12	7365	7376	50 %	50 %	0 %	0 %	384460466
11	NC_017297	GATATA	2	12	7810	7821	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460466
12	NC_017297	ATAGAT	2	12	17714	17725	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460471
13	NC_017297	ACAAAT	2	12	18623	18634	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384460471
14	NC_017297	AATAAA	2	12	19596	19607	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384460472
15	NC_017297	GCAAAA	2	12	23452	23463	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384460475
16	NC_017297	AATTGT	2	12	25282	25293	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384460477
17	NC_017297	AGCTAC	2	12	27695	27706	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384460479
18	NC_017297	AGATGA	2	12	35416	35427	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384460485
19	NC_017297	CTATAG	2	12	35597	35608	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384460486
20	NC_017297	AGAAAA	2	12	37420	37431	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384460489
21	NC_017297	ATGTTT	2	12	42474	42485	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384460495
22	NC_017297	AATATG	2	12	64304	64315	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460502
23	NC_017297	ATTATA	2	12	83183	83194	50 %	50 %	0 %	0 %	384460511
24	NC_017297	AATATG	2	12	83203	83214	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460511
25	NC_017297	AATTAT	2	12	85225	85236	50 %	50 %	0 %	0 %	384460514
26	NC_017297	GAAAAA	2	12	85766	85777	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384460515
27	NC_017297	TGTAGA	2	12	86601	86612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460516
28	NC_017297	ATTTAA	2	12	99591	99602	50 %	50 %	0 %	0 %	384460528
29	NC_017297	ATAAAT	2	12	103670	103681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460530
30	NC_017297	AGTTAA	2	12	105534	105545	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460532
31	NC_017297	AGAACA	2	12	108406	108417	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384460534
32	NC_017297	AATATA	2	12	110764	110775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460536
33	NC_017297	AGGACA	2	12	111512	111523	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384460537
34	NC_017297	GTAGAT	2	12	111780	111791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460537
35	NC_017297	AATAAA	2	12	117615	117626	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384460543
36	NC_017297	GATATA	2	12	117703	117714	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460543
37	NC_017297	TAAAGA	2	12	118951	118962	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384460544
38	NC_017297	TTAAAT	2	12	122720	122731	50 %	50 %	0 %	0 %	384460548
39	NC_017297	TCAAAA	2	12	125235	125246	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384460549
40	NC_017297	TTTGCT	2	12	126261	126272	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384460549
41	NC_017297	TGGATA	2	12	132518	132529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460551
42	NC_017297	ATAAGA	2	12	139410	139421	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384460555
43	NC_017297	ATATAA	2	12	142093	142104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460558
44	NC_017297	ATTTTT	2	12	145012	145023	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384460560
45	NC_017297	GTAAGT	2	12	145246	145257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460560
46	NC_017297	TTGAAA	2	12	145444	145455	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460561
47	NC_017297	AGCAAG	2	12	146629	146640	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384460562
48	NC_017297	AAAGAA	2	12	150037	150048	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384460566
49	NC_017297	AATATA	2	12	151116	151127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460567
50	NC_017297	ATTAGT	2	12	153981	153992	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384460568
51	NC_017297	AAATTT	2	12	157920	157931	50 %	50 %	0 %	0 %	384460572
52	NC_017297	TTAAAG	2	12	159011	159022	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460573
53	NC_017297	TACCTA	2	12	160098	160109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384460574
54	NC_017297	GTAGAA	2	12	163085	163096	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384460576
55	NC_017297	AAAAGA	2	12	163644	163655	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384460577
56	NC_017297	ATAAAT	2	12	163885	163896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460577
57	NC_017297	ATAGAA	2	12	164304	164315	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384460578
58	NC_017297	AGATTT	2	12	164896	164907	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384460579
59	NC_017297	AAAGAA	2	12	165083	165094	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384460579
60	NC_017297	ATGAAT	2	12	166884	166895	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460580
61	NC_017297	GTGGTA	2	12	171114	171125	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384460585
62	NC_017297	ATATAA	2	12	172320	172331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460586
63	NC_017297	AGGTAT	2	12	175973	175984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460591
64	NC_017297	TTGAAA	2	12	176397	176408	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460592
65	NC_017297	AGTTAT	2	12	178219	178230	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384460594
66	NC_017297	TACAAC	2	12	179312	179323	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384460595
67	NC_017297	ATGGTA	2	12	184861	184872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460601
68	NC_017297	AACATA	2	12	184929	184940	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384460601
69	NC_017297	AATTAA	2	12	187311	187322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460603
70	NC_017297	TAATTT	2	12	188028	188039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460604
71	NC_017297	AATAAA	2	12	189006	189017	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384460605
72	NC_017297	ATAAAA	2	12	189079	189090	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384460605
73	NC_017297	ATTAAT	2	12	190857	190868	50 %	50 %	0 %	0 %	384460606
74	NC_017297	TAAAGT	2	12	192029	192040	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460607
75	NC_017297	AATGGT	2	12	196231	196242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460613
76	NC_017297	TGTAAT	2	12	203728	203739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384460617
77	NC_017297	AAAGAA	2	12	204659	204670	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384460617
78	NC_017297	GTAGAA	2	12	204896	204907	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384460617
79	NC_017297	GAAATA	2	12	206003	206014	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384460618
80	NC_017297	AATTAA	2	12	206977	206988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460619
81	NC_017297	GAAAAA	2	12	208813	208824	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384460620
82	NC_017297	GGGTAA	2	12	212928	212939	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384460622
83	NC_017297	ATATAG	2	12	213418	213429	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460623
84	NC_017297	TAAGAT	2	12	213950	213961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460624
85	NC_017297	CTATAT	2	12	217578	217589	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384460626
86	NC_017297	TATAAA	2	12	218587	218598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460627
87	NC_017297	TTTATA	2	12	224928	224939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460634
88	NC_017297	ATAGAT	2	12	226017	226028	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460635
89	NC_017297	TCATAA	2	12	227509	227520	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384460636
90	NC_017297	TTTATA	2	12	229494	229505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460639
91	NC_017297	AAATGA	2	12	229601	229612	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384460639
92	NC_017297	CTTATT	2	12	234450	234461	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384460645
93	NC_017297	ATTTAG	2	12	241777	241788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384460650
94	NC_017297	TATGTT	2	12	247994	248005	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384460656
95	NC_017297	TCAATA	2	12	250464	250475	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384460657
96	NC_017297	TAAGGT	2	12	251210	251221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460657
97	NC_017297	ATTTTT	2	12	252832	252843	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384460659
98	NC_017297	CTGTAG	2	12	253018	253029	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384460659
99	NC_017297	GAAAAA	2	12	254224	254235	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384460661
100	NC_017297	AGGAAT	2	12	255744	255755	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384460662
101	NC_017297	ATATTA	2	12	255988	255999	50 %	50 %	0 %	0 %	384460662
102	NC_017297	TTAGCA	2	12	258987	258998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384460664
103	NC_017297	TATGAA	2	12	260238	260249	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460666
104	NC_017297	TGGATT	2	12	266448	266459	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384460671
105	NC_017297	AGTAGA	3	18	268066	268083	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384460672
106	NC_017297	TAGAAC	2	12	269651	269662	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384460673
107	NC_017297	AGATGA	2	12	271084	271095	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384460674
108	NC_017297	TTTAAA	2	12	273031	273042	50 %	50 %	0 %	0 %	384460675
109	NC_017297	TTTTTA	2	12	277958	277969	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384460679
110	NC_017297	CAGGGA	2	12	280575	280586	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384460680
111	NC_017297	TATATT	2	12	281712	281723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460681
112	NC_017297	TCAGGG	2	12	290691	290702	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384460687
113	NC_017297	TAAAAA	2	12	292086	292097	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384460688
114	NC_017297	GAAATA	2	12	292582	292593	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384460688
115	NC_017297	ATTAGG	2	12	298151	298162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460692
116	NC_017297	TGGTAT	2	12	299583	299594	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384460693
117	NC_017297	AGATAT	3	18	302377	302394	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460695
118	NC_017297	CATTGG	2	12	305598	305609	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384460696
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120	NC_017297	AAAGAT	2	12	307219	307230	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384460698
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469	NC_017297	TAAGAG	2	12	1086446	1086457	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384461388
470	NC_017297	ATCTAA	2	12	1093679	1093690	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384461395
471	NC_017297	TAATTT	2	12	1096961	1096972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384461398
472	NC_017297	ACTTTT	2	12	1098426	1098437	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384461400
473	NC_017297	ATCACC	2	12	1100181	1100192	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384461401
474	NC_017297	TAAATT	2	12	1103867	1103878	50 %	50 %	0 %	0 %	384461403
475	NC_017297	ATTGAT	2	12	1104358	1104369	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384461404
476	NC_017297	CTATAG	2	12	1114199	1114210	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384461412
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487	NC_017297	TATAAT	2	12	1137405	1137416	50 %	50 %	0 %	0 %	384461430
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499	NC_017297	GAGATA	2	12	1168435	1168446	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384461463
500	NC_017297	AAACAT	2	12	1171719	1171730	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384461466

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