MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium acetobutylicum EA 2018 EA2018plasmid

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017296	AATATA	2	12	50	61	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456542
2	NC_017296	GATAAA	2	12	5958	5969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456544
3	NC_017296	TAAAAA	2	12	6317	6328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384456544
4	NC_017296	AAATTG	2	12	6981	6992	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017296	ATATTA	2	12	8413	8424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017296	AGGGTT	2	12	8445	8456	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017296	TAACCC	2	12	8469	8480	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017296	TATTAA	2	12	9607	9618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017296	GAAAAA	2	12	13018	13029	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384456552
10	NC_017296	TTATAT	2	12	17593	17604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017296	TAAAAC	2	12	18885	18896	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384456558
12	NC_017296	AATTTT	2	12	21814	21825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456560
13	NC_017296	CAAATA	2	12	23320	23331	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017296	TTCTTT	2	12	24752	24763	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384456564
15	NC_017296	AAAAGA	2	12	26078	26089	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384456565
16	NC_017296	TAGTGC	2	12	27891	27902	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384456567
17	NC_017296	TTATAG	2	12	27956	27967	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456567
18	NC_017296	TAGAAA	2	12	31340	31351	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456570
19	NC_017296	GATTTA	2	12	31657	31668	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456570
20	NC_017296	ATATCT	2	12	35619	35630	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384456575
21	NC_017296	TTCATT	2	12	42517	42528	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384456583
22	NC_017296	AAAATT	2	12	43547	43558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456583
23	NC_017296	AAGTGA	2	12	47364	47375	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384456587
24	NC_017296	ATATGT	2	12	47782	47793	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017296	CTTAAA	2	12	47860	47871	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017296	TGAATT	2	12	50015	50026	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456589
27	NC_017296	CAAAGG	2	12	51348	51359	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384456590
28	NC_017296	TAAAAA	2	12	55598	55609	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017296	TAGCAA	2	12	55769	55780	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384456595
30	NC_017296	GTTAAC	2	12	56776	56787	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017296	TAATTT	2	12	57795	57806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456596
32	NC_017296	TATGAT	2	12	67651	67662	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456605
33	NC_017296	GCTAAT	2	12	67822	67833	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384456605
34	NC_017296	AGTTAA	2	12	69915	69926	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456606
35	NC_017296	TTCCAT	2	12	70630	70641	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384456607
36	NC_017296	GCTATT	2	12	70843	70854	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384456607
37	NC_017296	TTTAGC	2	12	71250	71261	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384456607
38	NC_017296	AATTAA	2	12	71388	71399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456608
39	NC_017296	GCTTTA	2	12	73278	73289	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384456610
40	NC_017296	GTAAAA	2	12	79007	79018	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456614
41	NC_017296	ATGTAT	2	12	79148	79159	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017296	TTTCCA	2	12	81106	81117	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384456617
43	NC_017296	TTACTA	2	12	83197	83208	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384456618
44	NC_017296	TAAAAA	2	12	87332	87343	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384456623
45	NC_017296	ATTATA	2	12	87631	87642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017296	CATTTT	2	12	89059	89070	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384456626
47	NC_017296	TAAAAA	2	12	93058	93069	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017296	ACTTAA	2	12	93744	93755	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384456629
49	NC_017296	ATTTTA	2	12	98572	98583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017296	ACTTTA	2	12	99463	99474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384456636
51	NC_017296	CTACTT	2	12	100705	100716	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017296	ATAATT	2	12	103259	103270	50 %	50 %	0 %	0 %	384456639
53	NC_017296	TATTTA	2	12	105196	105207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017296	ATCAGC	2	12	107470	107481	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384456642
55	NC_017296	GTTGCA	2	12	111178	111189	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384456644
56	NC_017296	TATGAA	2	12	112821	112832	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456646
57	NC_017296	ATCATT	2	12	113023	113034	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384456646
58	NC_017296	CAGAAG	2	12	117313	117324	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384456651
59	NC_017296	CCACTG	2	12	120075	120086	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384456654
60	NC_017296	CTTTTA	2	12	121481	121492	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384456655
61	NC_017296	CCTTCT	2	12	125002	125013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017296	CCTGAA	2	12	125419	125430	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384456658
63	NC_017296	CCTGAA	2	12	127202	127213	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384456659
64	NC_017296	AACATA	2	12	131334	131345	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384456661
65	NC_017296	ATTTAT	2	12	134138	134149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456663
66	NC_017296	ACCTCC	2	12	134534	134545	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384456664
67	NC_017296	TTTAAT	2	12	136803	136814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456666
68	NC_017296	GTACTA	2	12	138441	138452	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384456668
69	NC_017296	TACATT	2	12	140832	140843	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017296	TTGGCT	2	12	142699	142710	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384456671
71	NC_017296	TAATTG	2	12	144884	144895	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456674
72	NC_017296	GCATTA	2	12	145526	145537	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384456675
73	NC_017296	GTCTAA	2	12	150469	150480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017296	CAATTT	2	12	152825	152836	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384456681
75	NC_017296	ACAAAA	2	12	153669	153680	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384456682
76	NC_017296	CTTACT	2	12	157869	157880	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384456688
77	NC_017296	GTTAAC	2	12	158755	158766	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017296	TTTGGT	2	12	161739	161750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456690
79	NC_017296	CTTTTG	2	12	163372	163383	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384456691
80	NC_017296	AAAGGA	2	12	166084	166095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456694
81	NC_017296	AAATGC	2	12	167933	167944	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384456695
82	NC_017296	CTTTAA	2	12	171036	171047	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384456699
83	NC_017296	TATTGT	2	12	172756	172767	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384456699
84	NC_017296	ATGGCA	2	12	178990	179001	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384456702
85	NC_017296	ATACCT	2	12	183300	183311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456707
86	NC_017296	AAATTA	2	12	183884	183895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017296	AAACTA	2	12	184822	184833	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384456709
88	NC_017296	AGTATT	2	12	184882	184893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017296	TAACCC	2	12	184894	184905	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017296	TAAAAA	2	12	185900	185911	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384456712
91	NC_017296	ATTAGT	2	12	187314	187325	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456713
92	NC_017296	TTAATT	2	12	187402	187413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456713
93	NC_017296	AACCCC	2	12	187977	187988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017296	AACTAT	2	12	189820	189831	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017296	ATATTA	2	12	190575	190586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017296	AAGATT	2	12	190824	190835	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456716
97	NC_017296	AAAATC	2	12	190998	191009	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384456716
98	NC_017296	ATATTA	2	12	191560	191571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.