MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum EA 2018 EA2018plasmid

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017296	AAATTG	2	12	6981	6992	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017296	ATATTA	2	12	8413	8424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017296	AGGGTT	2	12	8445	8456	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017296	TAACCC	2	12	8469	8480	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017296	TATTAA	2	12	9607	9618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017296	TTATAT	2	12	17593	17604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017296	CAAATA	2	12	23320	23331	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017296	ATATGT	2	12	47782	47793	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017296	CTTAAA	2	12	47860	47871	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017296	TAAAAA	2	12	55598	55609	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017296	GTTAAC	2	12	56776	56787	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017296	ATGTAT	2	12	79148	79159	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017296	ATTATA	2	12	87631	87642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017296	TAAAAA	2	12	93058	93069	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017296	ATTTTA	2	12	98572	98583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017296	CTACTT	2	12	100705	100716	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017296	TATTTA	2	12	105196	105207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017296	CCTTCT	2	12	125002	125013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017296	TACATT	2	12	140832	140843	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017296	GTCTAA	2	12	150469	150480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017296	GTTAAC	2	12	158755	158766	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017296	AAATTA	2	12	183884	183895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017296	AGTATT	2	12	184882	184893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017296	TAACCC	2	12	184894	184905	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017296	AACCCC	2	12	187977	187988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017296	AACTAT	2	12	189820	189831	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017296	ATATTA	2	12	190575	190586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017296	ATATTA	2	12	191560	191571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.