MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium acetobutylicum EA 2018 EA2018plasmid

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017296	GGATA	2	10	86	95	40 %	20 %	40 %	0 %	384456542
2	NC_017296	GCTTA	2	10	366	375	20 %	40 %	20 %	20 %	384456542
3	NC_017296	AATTA	2	10	705	714	60 %	40 %	0 %	0 %	384456542
4	NC_017296	AGTAT	2	10	1986	1995	40 %	40 %	20 %	0 %	384456543
5	NC_017296	TAGTT	2	10	2576	2585	20 %	60 %	20 %	0 %	384456543
6	NC_017296	TTAGA	2	10	3076	3085	40 %	40 %	20 %	0 %	384456543
7	NC_017296	AAAGT	2	10	3463	3472	60 %	20 %	20 %	0 %	384456543
8	NC_017296	AATGT	2	10	8401	8410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017296	TTCAT	2	10	9822	9831	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017296	ATATT	2	10	10166	10175	40 %	60 %	0 %	0 %	384456550
11	NC_017296	AAAGG	2	10	10495	10504	60 %	0 %	40 %	0 %	384456550
12	NC_017296	ACTTC	2	10	11263	11272	20 %	40 %	0 %	40 %	384456551
13	NC_017296	ATTTT	2	10	15238	15247	20 %	80 %	0 %	0 %	384456554
14	NC_017296	TACAG	2	10	17284	17293	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017296	TAAAA	2	10	17616	17625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017296	AAAAT	2	10	18490	18499	80 %	20 %	0 %	0 %	384456557
17	NC_017296	TACGT	2	10	20673	20682	20 %	40 %	20 %	20 %	384456560
18	NC_017296	ATCTA	2	10	21141	21150	40 %	40 %	0 %	20 %	384456560
19	NC_017296	TAAAC	2	10	21196	21205	60 %	20 %	0 %	20 %	384456560
20	NC_017296	TGGTT	2	10	21590	21599	0 %	60 %	40 %	0 %	384456560
21	NC_017296	TTTTC	2	10	21605	21614	0 %	80 %	0 %	20 %	384456560
22	NC_017296	CTTTT	2	10	22296	22305	0 %	80 %	0 %	20 %	384456562
23	NC_017296	TAAAG	2	10	23333	23342	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017296	CTTTT	2	10	23704	23713	0 %	80 %	0 %	20 %	384456563
25	NC_017296	ATATT	2	10	24097	24106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017296	TGAAT	2	10	25106	25115	40 %	40 %	20 %	0 %	384456565
27	NC_017296	TATCT	2	10	27755	27764	20 %	60 %	0 %	20 %	384456567
28	NC_017296	ATAAA	2	10	29436	29445	80 %	20 %	0 %	0 %	384456568
29	NC_017296	ACAGC	2	10	30455	30464	40 %	0 %	20 %	40 %	384456569
30	NC_017296	TAAAG	2	10	32279	32288	60 %	20 %	20 %	0 %	384456571
31	NC_017296	TTAAT	2	10	32473	32482	40 %	60 %	0 %	0 %	384456572
32	NC_017296	AAATA	2	10	32739	32748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017296	TTATT	2	10	34807	34816	20 %	80 %	0 %	0 %	384456575
34	NC_017296	TTTTA	2	10	35456	35465	20 %	80 %	0 %	0 %	384456575
35	NC_017296	ATTTT	2	10	36501	36510	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017296	TTTAT	2	10	37513	37522	20 %	80 %	0 %	0 %	384456577
37	NC_017296	AAATT	2	10	38127	38136	60 %	40 %	0 %	0 %	384456577
38	NC_017296	ATAAC	2	10	38187	38196	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017296	TTTAT	2	10	38414	38423	20 %	80 %	0 %	0 %	384456578
40	NC_017296	AAATT	2	10	41060	41069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017296	ATTAT	2	10	44285	44294	40 %	60 %	0 %	0 %	384456584
42	NC_017296	TAGAA	2	10	46241	46250	60 %	20 %	20 %	0 %	384456586
43	NC_017296	AAAGA	2	10	48093	48102	80 %	0 %	20 %	0 %	384456588
44	NC_017296	TATAA	2	10	49037	49046	60 %	40 %	0 %	0 %	384456588
45	NC_017296	TTTTC	2	10	52380	52389	0 %	80 %	0 %	20 %	384456591
46	NC_017296	TAGGT	2	10	52758	52767	20 %	40 %	40 %	0 %	384456591
47	NC_017296	TTCTT	2	10	52920	52929	0 %	80 %	0 %	20 %	384456591
48	NC_017296	TATTC	2	10	53039	53048	20 %	60 %	0 %	20 %	384456592
49	NC_017296	TTATT	2	10	53469	53478	20 %	80 %	0 %	0 %	384456592
50	NC_017296	TGAGT	2	10	53804	53813	20 %	40 %	40 %	0 %	384456593
51	NC_017296	CAATC	2	10	54084	54093	40 %	20 %	0 %	40 %	384456593
52	NC_017296	TAAAA	2	10	57956	57965	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017296	AGTAT	2	10	58456	58465	40 %	40 %	20 %	0 %	384456597
54	NC_017296	CATTT	2	10	61111	61120	20 %	60 %	0 %	20 %	384456599
55	NC_017296	GATAT	2	10	61733	61742	40 %	40 %	20 %	0 %	384456600
56	NC_017296	TCATA	2	10	63069	63078	40 %	40 %	0 %	20 %	384456602
57	NC_017296	TAAGT	2	10	63636	63645	40 %	40 %	20 %	0 %	384456603
58	NC_017296	GCCAG	2	10	64198	64207	20 %	0 %	40 %	40 %	384456603
59	NC_017296	TGTGC	2	10	65110	65119	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017296	TAAAA	2	10	65225	65234	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017296	TTGAA	2	10	65992	66001	40 %	40 %	20 %	0 %	384456604
62	NC_017296	TCTCA	2	10	66026	66035	20 %	40 %	0 %	40 %	384456604
63	NC_017296	ATTTT	2	10	66218	66227	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017296	ATTTA	2	10	66258	66267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017296	AGAAA	2	10	66978	66987	80 %	0 %	20 %	0 %	384456605
66	NC_017296	ATATT	2	10	68485	68494	40 %	60 %	0 %	0 %	384456605
67	NC_017296	GGTAA	2	10	69085	69094	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017296	GTTAA	2	10	72011	72020	40 %	40 %	20 %	0 %	384456608
69	NC_017296	TTTAA	2	10	72333	72342	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017296	GACAA	2	10	73956	73965	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017296	AATAA	2	10	76323	76332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017296	TTGTT	2	10	77296	77305	0 %	80 %	20 %	0 %	384456613
73	NC_017296	TTATT	2	10	77662	77671	20 %	80 %	0 %	0 %	384456613
74	NC_017296	TTATG	2	10	78427	78436	20 %	60 %	20 %	0 %	384456613
75	NC_017296	AATGG	2	10	79019	79028	40 %	20 %	40 %	0 %	384456614
76	NC_017296	TTATT	2	10	81015	81024	20 %	80 %	0 %	0 %	384456617
77	NC_017296	ATTAA	2	10	81920	81929	60 %	40 %	0 %	0 %	384456617
78	NC_017296	CTCTT	2	10	82697	82706	0 %	60 %	0 %	40 %	384456618
79	NC_017296	TTTAA	2	10	83931	83940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017296	GATAT	2	10	84799	84808	40 %	40 %	20 %	0 %	384456620
81	NC_017296	AAAAG	2	10	85289	85298	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017296	GTCTT	2	10	86409	86418	0 %	60 %	20 %	20 %	384456622
83	NC_017296	ATCAA	2	10	86903	86912	60 %	20 %	0 %	20 %	384456623
84	NC_017296	AAAAT	2	10	88131	88140	80 %	20 %	0 %	0 %	384456625
85	NC_017296	TGAAC	2	10	89539	89548	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017296	GATGT	2	10	89964	89973	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017296	GAAAT	2	10	91087	91096	60 %	20 %	20 %	0 %	384456627
88	NC_017296	TATTC	2	10	91990	91999	20 %	60 %	0 %	20 %	384456628
89	NC_017296	CTTCT	2	10	92487	92496	0 %	60 %	0 %	40 %	384456628
90	NC_017296	CAAGC	2	10	93441	93450	40 %	0 %	20 %	40 %	384456629
91	NC_017296	CAATA	2	10	95758	95767	60 %	20 %	0 %	20 %	384456633
92	NC_017296	GTTCT	2	10	95887	95896	0 %	60 %	20 %	20 %	384456633
93	NC_017296	AGAAT	2	10	97290	97299	60 %	20 %	20 %	0 %	384456634
94	NC_017296	TAAAT	2	10	100559	100568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017296	ATATT	2	10	100735	100744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017296	GCTTG	2	10	101539	101548	0 %	40 %	40 %	20 %	384456638
97	NC_017296	TTTTG	2	10	101597	101606	0 %	80 %	20 %	0 %	384456638
98	NC_017296	ATTCA	2	10	102870	102879	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017296	TTTAG	2	10	103920	103929	20 %	60 %	20 %	0 %	384456639
100	NC_017296	CATAT	2	10	103971	103980	40 %	40 %	0 %	20 %	384456639
101	NC_017296	TAAAA	2	10	104864	104873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017296	TTATT	2	10	106611	106620	20 %	80 %	0 %	0 %	384456642
103	NC_017296	GTATT	2	10	107205	107214	20 %	60 %	20 %	0 %	384456642
104	NC_017296	AATTT	2	10	107229	107238	40 %	60 %	0 %	0 %	384456642
105	NC_017296	TAGAT	2	10	107830	107839	40 %	40 %	20 %	0 %	384456642
106	NC_017296	ATAAA	2	10	109023	109032	80 %	20 %	0 %	0 %	384456642
107	NC_017296	TTTCA	2	10	113482	113491	20 %	60 %	0 %	20 %	384456646
108	NC_017296	AATTA	2	10	114369	114378	60 %	40 %	0 %	0 %	384456648
109	NC_017296	AGAGA	2	10	114569	114578	60 %	0 %	40 %	0 %	384456648
110	NC_017296	TTTAT	2	10	114912	114921	20 %	80 %	0 %	0 %	384456649
111	NC_017296	GATAC	2	10	117984	117993	40 %	20 %	20 %	20 %	384456652
112	NC_017296	TTACA	2	10	120557	120566	40 %	40 %	0 %	20 %	384456654
113	NC_017296	AAAGA	2	10	120603	120612	80 %	0 %	20 %	0 %	384456654
114	NC_017296	TTACA	2	10	121310	121319	40 %	40 %	0 %	20 %	384456655
115	NC_017296	ACCAT	2	10	124050	124059	40 %	20 %	0 %	40 %	384456657
116	NC_017296	TTTAA	2	10	128612	128621	40 %	60 %	0 %	0 %	384456659
117	NC_017296	TTCAG	2	10	132109	132118	20 %	40 %	20 %	20 %	384456661
118	NC_017296	CTACA	2	10	132594	132603	40 %	20 %	0 %	40 %	384456661
119	NC_017296	ATTAC	2	10	132776	132785	40 %	40 %	0 %	20 %	384456662
120	NC_017296	CTTGC	2	10	135357	135366	0 %	40 %	20 %	40 %	384456664
121	NC_017296	ATCTT	2	10	136723	136732	20 %	60 %	0 %	20 %	384456666
122	NC_017296	TTAAT	2	10	137363	137372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017296	AAAGA	2	10	138751	138760	80 %	0 %	20 %	0 %	384456668
124	NC_017296	ATAAA	2	10	139335	139344	80 %	20 %	0 %	0 %	384456668
125	NC_017296	TTGGA	2	10	140570	140579	20 %	40 %	40 %	0 %	384456669
126	NC_017296	TTATT	2	10	141910	141919	20 %	80 %	0 %	0 %	384456671
127	NC_017296	TATTT	2	10	143319	143328	20 %	80 %	0 %	0 %	384456673
128	NC_017296	TAAAT	2	10	144136	144145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017296	CTCTT	2	10	148207	148216	0 %	60 %	0 %	40 %	384456677
130	NC_017296	CTATC	2	10	148239	148248	20 %	40 %	0 %	40 %	384456677
131	NC_017296	ATGTT	2	10	148832	148841	20 %	60 %	20 %	0 %	384456678
132	NC_017296	TTTCT	2	10	149131	149140	0 %	80 %	0 %	20 %	384456678
133	NC_017296	TTTCC	2	10	149243	149252	0 %	60 %	0 %	40 %	384456678
134	NC_017296	AATAA	2	10	150306	150315	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017296	GGCTT	2	10	150800	150809	0 %	40 %	40 %	20 %	384456680
136	NC_017296	TTACT	2	10	151384	151393	20 %	60 %	0 %	20 %	384456680
137	NC_017296	TCTTA	2	10	151860	151869	20 %	60 %	0 %	20 %	384456680
138	NC_017296	AATAT	2	10	152329	152338	60 %	40 %	0 %	0 %	384456681
139	NC_017296	ATTTT	2	10	152616	152625	20 %	80 %	0 %	0 %	384456681
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.