MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum EA 2018 EA2018plasmid

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017296	AATGT	2	10	8401	8410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017296	TTCAT	2	10	9822	9831	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017296	TACAG	2	10	17284	17293	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017296	TAAAA	2	10	17616	17625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017296	TAAAG	2	10	23333	23342	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017296	ATATT	2	10	24097	24106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017296	AAATA	2	10	32739	32748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017296	ATTTT	2	10	36501	36510	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017296	ATAAC	2	10	38187	38196	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017296	AAATT	2	10	41060	41069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017296	TAAAA	2	10	57956	57965	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017296	TGTGC	2	10	65110	65119	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017296	TAAAA	2	10	65225	65234	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017296	ATTTT	2	10	66218	66227	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017296	ATTTA	2	10	66258	66267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017296	GGTAA	2	10	69085	69094	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017296	TTTAA	2	10	72333	72342	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017296	GACAA	2	10	73956	73965	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017296	AATAA	2	10	76323	76332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017296	TTTAA	2	10	83931	83940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017296	AAAAG	2	10	85289	85298	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017296	TGAAC	2	10	89539	89548	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017296	GATGT	2	10	89964	89973	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017296	TAAAT	2	10	100559	100568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017296	ATATT	2	10	100735	100744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017296	ATTCA	2	10	102870	102879	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017296	TAAAA	2	10	104864	104873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017296	TTAAT	2	10	137363	137372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017296	TAAAT	2	10	144136	144145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017296	AATAA	2	10	150306	150315	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017296	ATATA	2	10	157717	157726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017296	TTTAC	2	10	160399	160408	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017296	CATAA	2	10	165599	165608	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017296	TGTAA	2	10	167023	167032	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017296	TTAAA	2	10	168876	168885	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017296	TTGCA	2	10	173947	173956	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017296	TTGTT	2	10	175685	175694	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017296	AGTAT	2	10	185037	185046	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017296	TAAAT	2	10	187556	187565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017296	TCTTT	2	10	187876	187885	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017296	GTTAA	2	10	190507	190516	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017296	ACCTA	2	10	191392	191401	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.