MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum EA 2018 EA2018plasmid

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017296	GGATA	2	10	86	95	40 %	20 %	40 %	0 %	384456542
2	NC_017296	GCTTA	2	10	366	375	20 %	40 %	20 %	20 %	384456542
3	NC_017296	AATTA	2	10	705	714	60 %	40 %	0 %	0 %	384456542
4	NC_017296	AGTAT	2	10	1986	1995	40 %	40 %	20 %	0 %	384456543
5	NC_017296	TAGTT	2	10	2576	2585	20 %	60 %	20 %	0 %	384456543
6	NC_017296	TTAGA	2	10	3076	3085	40 %	40 %	20 %	0 %	384456543
7	NC_017296	AAAGT	2	10	3463	3472	60 %	20 %	20 %	0 %	384456543
8	NC_017296	ATATT	2	10	10166	10175	40 %	60 %	0 %	0 %	384456550
9	NC_017296	AAAGG	2	10	10495	10504	60 %	0 %	40 %	0 %	384456550
10	NC_017296	ACTTC	2	10	11263	11272	20 %	40 %	0 %	40 %	384456551
11	NC_017296	ATTTT	2	10	15238	15247	20 %	80 %	0 %	0 %	384456554
12	NC_017296	AAAAT	2	10	18490	18499	80 %	20 %	0 %	0 %	384456557
13	NC_017296	TACGT	2	10	20673	20682	20 %	40 %	20 %	20 %	384456560
14	NC_017296	ATCTA	2	10	21141	21150	40 %	40 %	0 %	20 %	384456560
15	NC_017296	TAAAC	2	10	21196	21205	60 %	20 %	0 %	20 %	384456560
16	NC_017296	TGGTT	2	10	21590	21599	0 %	60 %	40 %	0 %	384456560
17	NC_017296	TTTTC	2	10	21605	21614	0 %	80 %	0 %	20 %	384456560
18	NC_017296	CTTTT	2	10	22296	22305	0 %	80 %	0 %	20 %	384456562
19	NC_017296	CTTTT	2	10	23704	23713	0 %	80 %	0 %	20 %	384456563
20	NC_017296	TGAAT	2	10	25106	25115	40 %	40 %	20 %	0 %	384456565
21	NC_017296	TATCT	2	10	27755	27764	20 %	60 %	0 %	20 %	384456567
22	NC_017296	ATAAA	2	10	29436	29445	80 %	20 %	0 %	0 %	384456568
23	NC_017296	ACAGC	2	10	30455	30464	40 %	0 %	20 %	40 %	384456569
24	NC_017296	TAAAG	2	10	32279	32288	60 %	20 %	20 %	0 %	384456571
25	NC_017296	TTAAT	2	10	32473	32482	40 %	60 %	0 %	0 %	384456572
26	NC_017296	TTATT	2	10	34807	34816	20 %	80 %	0 %	0 %	384456575
27	NC_017296	TTTTA	2	10	35456	35465	20 %	80 %	0 %	0 %	384456575
28	NC_017296	TTTAT	2	10	37513	37522	20 %	80 %	0 %	0 %	384456577
29	NC_017296	AAATT	2	10	38127	38136	60 %	40 %	0 %	0 %	384456577
30	NC_017296	TTTAT	2	10	38414	38423	20 %	80 %	0 %	0 %	384456578
31	NC_017296	ATTAT	2	10	44285	44294	40 %	60 %	0 %	0 %	384456584
32	NC_017296	TAGAA	2	10	46241	46250	60 %	20 %	20 %	0 %	384456586
33	NC_017296	AAAGA	2	10	48093	48102	80 %	0 %	20 %	0 %	384456588
34	NC_017296	TATAA	2	10	49037	49046	60 %	40 %	0 %	0 %	384456588
35	NC_017296	TTTTC	2	10	52380	52389	0 %	80 %	0 %	20 %	384456591
36	NC_017296	TAGGT	2	10	52758	52767	20 %	40 %	40 %	0 %	384456591
37	NC_017296	TTCTT	2	10	52920	52929	0 %	80 %	0 %	20 %	384456591
38	NC_017296	TATTC	2	10	53039	53048	20 %	60 %	0 %	20 %	384456592
39	NC_017296	TTATT	2	10	53469	53478	20 %	80 %	0 %	0 %	384456592
40	NC_017296	TGAGT	2	10	53804	53813	20 %	40 %	40 %	0 %	384456593
41	NC_017296	CAATC	2	10	54084	54093	40 %	20 %	0 %	40 %	384456593
42	NC_017296	AGTAT	2	10	58456	58465	40 %	40 %	20 %	0 %	384456597
43	NC_017296	CATTT	2	10	61111	61120	20 %	60 %	0 %	20 %	384456599
44	NC_017296	GATAT	2	10	61733	61742	40 %	40 %	20 %	0 %	384456600
45	NC_017296	TCATA	2	10	63069	63078	40 %	40 %	0 %	20 %	384456602
46	NC_017296	TAAGT	2	10	63636	63645	40 %	40 %	20 %	0 %	384456603
47	NC_017296	GCCAG	2	10	64198	64207	20 %	0 %	40 %	40 %	384456603
48	NC_017296	TTGAA	2	10	65992	66001	40 %	40 %	20 %	0 %	384456604
49	NC_017296	TCTCA	2	10	66026	66035	20 %	40 %	0 %	40 %	384456604
50	NC_017296	AGAAA	2	10	66978	66987	80 %	0 %	20 %	0 %	384456605
51	NC_017296	ATATT	2	10	68485	68494	40 %	60 %	0 %	0 %	384456605
52	NC_017296	GTTAA	2	10	72011	72020	40 %	40 %	20 %	0 %	384456608
53	NC_017296	TTGTT	2	10	77296	77305	0 %	80 %	20 %	0 %	384456613
54	NC_017296	TTATT	2	10	77662	77671	20 %	80 %	0 %	0 %	384456613
55	NC_017296	TTATG	2	10	78427	78436	20 %	60 %	20 %	0 %	384456613
56	NC_017296	AATGG	2	10	79019	79028	40 %	20 %	40 %	0 %	384456614
57	NC_017296	TTATT	2	10	81015	81024	20 %	80 %	0 %	0 %	384456617
58	NC_017296	ATTAA	2	10	81920	81929	60 %	40 %	0 %	0 %	384456617
59	NC_017296	CTCTT	2	10	82697	82706	0 %	60 %	0 %	40 %	384456618
60	NC_017296	GATAT	2	10	84799	84808	40 %	40 %	20 %	0 %	384456620
61	NC_017296	GTCTT	2	10	86409	86418	0 %	60 %	20 %	20 %	384456622
62	NC_017296	ATCAA	2	10	86903	86912	60 %	20 %	0 %	20 %	384456623
63	NC_017296	AAAAT	2	10	88131	88140	80 %	20 %	0 %	0 %	384456625
64	NC_017296	GAAAT	2	10	91087	91096	60 %	20 %	20 %	0 %	384456627
65	NC_017296	TATTC	2	10	91990	91999	20 %	60 %	0 %	20 %	384456628
66	NC_017296	CTTCT	2	10	92487	92496	0 %	60 %	0 %	40 %	384456628
67	NC_017296	CAAGC	2	10	93441	93450	40 %	0 %	20 %	40 %	384456629
68	NC_017296	CAATA	2	10	95758	95767	60 %	20 %	0 %	20 %	384456633
69	NC_017296	GTTCT	2	10	95887	95896	0 %	60 %	20 %	20 %	384456633
70	NC_017296	AGAAT	2	10	97290	97299	60 %	20 %	20 %	0 %	384456634
71	NC_017296	GCTTG	2	10	101539	101548	0 %	40 %	40 %	20 %	384456638
72	NC_017296	TTTTG	2	10	101597	101606	0 %	80 %	20 %	0 %	384456638
73	NC_017296	TTTAG	2	10	103920	103929	20 %	60 %	20 %	0 %	384456639
74	NC_017296	CATAT	2	10	103971	103980	40 %	40 %	0 %	20 %	384456639
75	NC_017296	TTATT	2	10	106611	106620	20 %	80 %	0 %	0 %	384456642
76	NC_017296	GTATT	2	10	107205	107214	20 %	60 %	20 %	0 %	384456642
77	NC_017296	AATTT	2	10	107229	107238	40 %	60 %	0 %	0 %	384456642
78	NC_017296	TAGAT	2	10	107830	107839	40 %	40 %	20 %	0 %	384456642
79	NC_017296	ATAAA	2	10	109023	109032	80 %	20 %	0 %	0 %	384456642
80	NC_017296	TTTCA	2	10	113482	113491	20 %	60 %	0 %	20 %	384456646
81	NC_017296	AATTA	2	10	114369	114378	60 %	40 %	0 %	0 %	384456648
82	NC_017296	AGAGA	2	10	114569	114578	60 %	0 %	40 %	0 %	384456648
83	NC_017296	TTTAT	2	10	114912	114921	20 %	80 %	0 %	0 %	384456649
84	NC_017296	GATAC	2	10	117984	117993	40 %	20 %	20 %	20 %	384456652
85	NC_017296	TTACA	2	10	120557	120566	40 %	40 %	0 %	20 %	384456654
86	NC_017296	AAAGA	2	10	120603	120612	80 %	0 %	20 %	0 %	384456654
87	NC_017296	TTACA	2	10	121310	121319	40 %	40 %	0 %	20 %	384456655
88	NC_017296	ACCAT	2	10	124050	124059	40 %	20 %	0 %	40 %	384456657
89	NC_017296	TTTAA	2	10	128612	128621	40 %	60 %	0 %	0 %	384456659
90	NC_017296	TTCAG	2	10	132109	132118	20 %	40 %	20 %	20 %	384456661
91	NC_017296	CTACA	2	10	132594	132603	40 %	20 %	0 %	40 %	384456661
92	NC_017296	ATTAC	2	10	132776	132785	40 %	40 %	0 %	20 %	384456662
93	NC_017296	CTTGC	2	10	135357	135366	0 %	40 %	20 %	40 %	384456664
94	NC_017296	ATCTT	2	10	136723	136732	20 %	60 %	0 %	20 %	384456666
95	NC_017296	AAAGA	2	10	138751	138760	80 %	0 %	20 %	0 %	384456668
96	NC_017296	ATAAA	2	10	139335	139344	80 %	20 %	0 %	0 %	384456668
97	NC_017296	TTGGA	2	10	140570	140579	20 %	40 %	40 %	0 %	384456669
98	NC_017296	TTATT	2	10	141910	141919	20 %	80 %	0 %	0 %	384456671
99	NC_017296	TATTT	2	10	143319	143328	20 %	80 %	0 %	0 %	384456673
100	NC_017296	CTCTT	2	10	148207	148216	0 %	60 %	0 %	40 %	384456677
101	NC_017296	CTATC	2	10	148239	148248	20 %	40 %	0 %	40 %	384456677
102	NC_017296	ATGTT	2	10	148832	148841	20 %	60 %	20 %	0 %	384456678
103	NC_017296	TTTCT	2	10	149131	149140	0 %	80 %	0 %	20 %	384456678
104	NC_017296	TTTCC	2	10	149243	149252	0 %	60 %	0 %	40 %	384456678
105	NC_017296	GGCTT	2	10	150800	150809	0 %	40 %	40 %	20 %	384456680
106	NC_017296	TTACT	2	10	151384	151393	20 %	60 %	0 %	20 %	384456680
107	NC_017296	TCTTA	2	10	151860	151869	20 %	60 %	0 %	20 %	384456680
108	NC_017296	AATAT	2	10	152329	152338	60 %	40 %	0 %	0 %	384456681
109	NC_017296	ATTTT	2	10	152616	152625	20 %	80 %	0 %	0 %	384456681
110	NC_017296	AATGG	2	10	152767	152776	40 %	20 %	40 %	0 %	384456681
111	NC_017296	AACAT	2	10	154556	154565	60 %	20 %	0 %	20 %	384456683
112	NC_017296	TATCA	2	10	156672	156681	40 %	40 %	0 %	20 %	384456686
113	NC_017296	TTCAA	2	10	156816	156825	40 %	40 %	0 %	20 %	384456686
114	NC_017296	TGTAA	2	10	157225	157234	40 %	40 %	20 %	0 %	384456687
115	NC_017296	GATAT	2	10	162103	162112	40 %	40 %	20 %	0 %	384456690
116	NC_017296	TCAAT	2	10	165255	165264	40 %	40 %	0 %	20 %	384456692
117	NC_017296	ATAAG	2	10	168011	168020	60 %	20 %	20 %	0 %	384456695
118	NC_017296	CTTAT	2	10	168030	168039	20 %	60 %	0 %	20 %	384456696
119	NC_017296	AACAA	2	10	169429	169438	80 %	0 %	0 %	20 %	384456697
120	NC_017296	AACAA	2	10	169558	169567	80 %	0 %	0 %	20 %	384456697
121	NC_017296	CAAAT	2	10	169689	169698	60 %	20 %	0 %	20 %	384456697
122	NC_017296	ATTTT	2	10	170573	170582	20 %	80 %	0 %	0 %	384456698
123	NC_017296	TTAAA	2	10	173808	173817	60 %	40 %	0 %	0 %	384456699
124	NC_017296	TCAAA	2	10	174273	174282	60 %	20 %	0 %	20 %	384456700
125	NC_017296	ATTAA	2	10	174463	174472	60 %	40 %	0 %	0 %	384456700
126	NC_017296	TTTTC	2	10	176210	176219	0 %	80 %	0 %	20 %	384456701
127	NC_017296	ATTAT	2	10	176503	176512	40 %	60 %	0 %	0 %	384456701
128	NC_017296	TAGAA	2	10	180889	180898	60 %	20 %	20 %	0 %	384456705
129	NC_017296	TTAAA	2	10	181538	181547	60 %	40 %	0 %	0 %	384456706
130	NC_017296	AATGT	2	10	181771	181780	40 %	40 %	20 %	0 %	384456707
131	NC_017296	TTAAA	2	10	182608	182617	60 %	40 %	0 %	0 %	384456707
132	NC_017296	GATTT	2	10	183100	183109	20 %	60 %	20 %	0 %	384456707
133	NC_017296	GAAAT	2	10	184538	184547	60 %	20 %	20 %	0 %	384456708
134	NC_017296	TAAAA	2	10	184649	184658	80 %	20 %	0 %	0 %	384456709
135	NC_017296	TCACA	2	10	184771	184780	40 %	20 %	0 %	40 %	384456709
136	NC_017296	TAAAA	2	10	185346	185355	80 %	20 %	0 %	0 %	384456710
137	NC_017296	GGATG	2	10	187267	187276	20 %	20 %	60 %	0 %	384456713
138	NC_017296	ATTTT	2	10	187336	187345	20 %	80 %	0 %	0 %	384456713
139	NC_017296	CAATT	2	10	189267	189276	40 %	40 %	0 %	20 %	384456714
140	NC_017296	TAAAA	2	10	189499	189508	80 %	20 %	0 %	0 %	384456714

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.