MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium acetobutylicum EA 2018 chromosome

Total Repeats: 2039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017295	GTAATA	2	12	828	839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456719
2	NC_017295	TTGCTG	2	12	861	872	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384456719
3	NC_017295	ATAAGG	2	12	3610	3621	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384456722
4	NC_017295	ATAAAT	2	12	3729	3740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
5	NC_017295	GAAGTA	2	12	5240	5251	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384456724
6	NC_017295	TATGAT	2	12	5390	5401	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456724
7	NC_017295	CCGATG	2	12	6336	6347	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384456724
8	NC_017295	TGATAT	2	12	8252	8263	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456725
9	NC_017295	GCTTAT	2	12	9056	9067	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384456725
10	NC_017295	TCTAGC	2	12	9173	9184	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384456725
11	NC_017295	TAATTC	2	12	15473	15484	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384456727
12	NC_017295	CAAGTG	2	12	16942	16953	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384456728
13	NC_017295	TAGTAA	2	12	17421	17432	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456728
14	NC_017295	AAAGAT	2	12	17983	17994	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456728
15	NC_017295	TGGAGT	2	12	22936	22947	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384456733
16	NC_017295	TTAGAT	2	12	24979	24990	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456735
17	NC_017295	AATTTG	2	12	25367	25378	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456735
18	NC_017295	GAAGGT	2	12	25645	25656	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384456735
19	NC_017295	TGAATA	2	12	26358	26369	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456736
20	NC_017295	ATCCAA	2	12	26388	26399	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384456736
21	NC_017295	TTGGAA	2	12	28796	28807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456738
22	NC_017295	AGATAA	2	12	34095	34106	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456741
23	NC_017295	AGTAAA	2	12	36177	36188	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017295	GCTTTT	2	12	39494	39505	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384456746
25	NC_017295	TCTACC	2	12	39692	39703	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384456746
26	NC_017295	TTATAA	2	12	42811	42822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017295	TATAGC	2	12	48011	48022	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384456754
28	NC_017295	CTATAG	2	12	48973	48984	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384456755
29	NC_017295	ATTGAA	2	12	55161	55172	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017295	TAATAG	2	12	57505	57516	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456762
31	NC_017295	TAAAAA	2	12	57566	57577	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384456762
32	NC_017295	TAGAAA	2	12	57926	57937	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017295	GAAAAG	2	12	58652	58663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456763
34	NC_017295	TAAATA	2	12	59374	59385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456764
35	NC_017295	AGGAAA	2	12	60206	60217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456766
36	NC_017295	TAAAAA	2	12	61867	61878	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017295	TAAAAA	2	12	68317	68328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384456778
38	NC_017295	GTAAAT	2	12	75406	75417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456780
39	NC_017295	TAAAAA	2	12	78119	78130	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384456785
40	NC_017295	AGTTTT	2	12	80370	80381	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384456787
41	NC_017295	TATTAG	2	12	83700	83711	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456792
42	NC_017295	ATTGTA	2	12	85204	85215	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456794
43	NC_017295	ATATAA	2	12	86464	86475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456795
44	NC_017295	TAAGGT	2	12	86689	86700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017295	TTAAAT	2	12	87523	87534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017295	GATATA	2	12	91142	91153	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456801
47	NC_017295	AAAAAT	2	12	92119	92130	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017295	TAAAGA	2	12	96251	96262	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456807
49	NC_017295	GCTGGA	2	12	97200	97211	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384456808
50	NC_017295	TTATGA	2	12	98526	98537	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456809
51	NC_017295	AAACAA	2	12	99652	99663	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384456810
52	NC_017295	GAAACT	2	12	99958	99969	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384456810
53	NC_017295	TAGAAA	2	12	107406	107417	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456817
54	NC_017295	TAATAT	2	12	110532	110543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017295	TCAGGT	2	12	113855	113866	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384456822
56	NC_017295	ATAACA	2	12	114050	114061	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384456822
57	NC_017295	AATGGT	2	12	115218	115229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456823
58	NC_017295	ATAGAA	2	12	115359	115370	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456823
59	NC_017295	GGACCA	2	12	116630	116641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456825
60	NC_017295	ATAAAT	2	12	119335	119346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456828
61	NC_017295	ATAGAT	2	12	121943	121954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456830
62	NC_017295	TTCAGG	2	12	123345	123356	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384456831
63	NC_017295	CAAAAG	2	12	128325	128336	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384456836
64	NC_017295	TAACCT	2	12	131776	131787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456839
65	NC_017295	AAAAGG	2	12	132544	132555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456839
66	NC_017295	AGTTAT	2	12	134089	134100	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017295	AGAGTT	2	12	137928	137939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456844
68	NC_017295	TAAAAT	2	12	138479	138490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456845
69	NC_017295	ATATCT	2	12	141484	141495	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017295	CTTTAT	2	12	144511	144522	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017295	AAAAAG	2	12	144792	144803	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384456856
72	NC_017295	AAAAAG	2	12	145545	145556	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384456857
73	NC_017295	TGGGCA	2	12	146629	146640	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384456857
74	NC_017295	AGATCA	2	12	148334	148345	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384456859
75	NC_017295	TAAGTA	2	12	148810	148821	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456859
76	NC_017295	TTTTGC	2	12	152106	152117	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384456865
77	NC_017295	TCTTTT	2	12	152203	152214	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384456865
78	NC_017295	ACTATT	2	12	153026	153037	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017295	ATAAGA	2	12	153424	153435	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456866
80	NC_017295	TTTTGT	2	12	155335	155346	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384456869
81	NC_017295	GATTTT	2	12	156036	156047	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384456870
82	NC_017295	ATTAAA	2	12	156542	156553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456870
83	NC_017295	TAAAAA	2	12	163266	163277	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017295	TAAAAA	2	12	168404	168415	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017295	AAGCAA	2	12	177621	177632	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384456874
86	NC_017295	AAAATT	2	12	179578	179589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456876
87	NC_017295	ATTGGA	2	12	180354	180365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456877
88	NC_017295	CAATTA	2	12	181890	181901	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384456877
89	NC_017295	ATATTG	2	12	183066	183077	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456879
90	NC_017295	TTTTAA	2	12	187076	187087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017295	TATAAA	2	12	187235	187246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017295	GATAAG	2	12	187453	187464	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384456884
93	NC_017295	ATCAGG	2	12	187530	187541	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384456884
94	NC_017295	AAAATT	2	12	188837	188848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456885
95	NC_017295	ACATCA	2	12	193728	193739	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384456890
96	NC_017295	GATATT	2	12	196558	196569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456893
97	NC_017295	GTAAAA	2	12	196927	196938	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456893
98	NC_017295	AGAAAA	2	12	198905	198916	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384456895
99	NC_017295	ACTCAA	2	12	200598	200609	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384456896
100	NC_017295	GGATAA	2	12	200647	200658	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384456896
101	NC_017295	AAAGAA	2	12	202961	202972	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384456899
102	NC_017295	GTATTT	2	12	211487	211498	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384456907
103	NC_017295	TTCTAC	2	12	211993	212004	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384456907
104	NC_017295	GATGAA	2	12	213564	213575	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384456909
105	NC_017295	ATATTT	2	12	214343	214354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456910
106	NC_017295	GAAGAG	2	12	215020	215031	50 %	0 %	50 %	0 %	384456910
107	NC_017295	ATAGCT	2	12	216311	216322	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384456912
108	NC_017295	TAAAAG	2	12	221873	221884	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017295	TAAAGA	2	12	221935	221946	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456917
110	NC_017295	ACTTTT	2	12	223736	223747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384456919
111	NC_017295	TTTTAT	2	12	225644	225655	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384456921
112	NC_017295	TTACAC	2	12	230122	230133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456926
113	NC_017295	GAATAA	2	12	231620	231631	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456927
114	NC_017295	GCAATA	2	12	231643	231654	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384456927
115	NC_017295	AATAGA	2	12	231930	231941	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456927
116	NC_017295	ATTTAT	2	12	232008	232019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456927
117	NC_017295	GCAGTT	2	12	233032	233043	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384456928
118	NC_017295	TTTAAA	2	12	234460	234471	50 %	50 %	0 %	0 %	384456929
119	NC_017295	AAGGAA	2	12	239050	239061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456935
120	NC_017295	AGTTGA	2	12	239520	239531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456935
121	NC_017295	AAAAAT	2	12	241594	241605	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384456937
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123	NC_017295	TTTTTA	2	12	243956	243967	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384456940
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231	NC_017295	ATTATA	2	12	475241	475252	50 %	50 %	0 %	0 %	384457132
232	NC_017295	GTTAAG	2	12	475657	475668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384457132
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234	NC_017295	GATAAG	2	12	478188	478199	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384457136
235	NC_017295	ACACTT	2	12	480016	480027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384457138
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237	NC_017295	ATTGAT	2	12	481145	481156	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384457139
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239	NC_017295	AGACTT	2	12	488729	488740	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384457148
240	NC_017295	TGCTAT	2	12	490237	490248	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384457148
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280	NC_017295	TTTGTA	2	12	569311	569322	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384457222
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346	NC_017295	GGTAAA	2	12	730292	730303	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384457354
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352	NC_017295	CACCAA	2	12	738703	738714	50 %	0 %	0 %	50 %	384457360
353	NC_017295	CTTATG	2	12	740839	740850	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384457363
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