MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum EA 2018 chromosome

Total Repeats: 249

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017295	AGTAAA	2	12	36177	36188	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017295	TTATAA	2	12	42811	42822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017295	ATTGAA	2	12	55161	55172	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017295	TAGAAA	2	12	57926	57937	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017295	TAAAAA	2	12	61867	61878	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017295	TAAGGT	2	12	86689	86700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017295	TTAAAT	2	12	87523	87534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017295	AAAAAT	2	12	92119	92130	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017295	TAATAT	2	12	110532	110543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017295	AGTTAT	2	12	134089	134100	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017295	ATATCT	2	12	141484	141495	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017295	CTTTAT	2	12	144511	144522	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017295	ACTATT	2	12	153026	153037	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017295	TAAAAA	2	12	163266	163277	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017295	TAAAAA	2	12	168404	168415	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017295	TTTTAA	2	12	187076	187087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017295	TATAAA	2	12	187235	187246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017295	TAAAAG	2	12	221873	221884	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017295	TAGTTA	2	12	315801	315812	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017295	TAAAAA	2	12	335961	335972	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017295	TAAAAA	2	12	341099	341110	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017295	TTATAG	2	12	351221	351232	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017295	TTAAAA	2	12	352471	352482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017295	CAAAAT	2	12	368094	368105	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017295	GGTAAA	2	12	385614	385625	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017295	TATAAT	2	12	397583	397594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017295	AAAATA	2	12	402754	402765	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017295	ACGTTA	2	12	419457	419468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017295	GTTAAC	2	12	420759	420770	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017295	TACAAA	2	12	425136	425147	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017295	TACAAA	2	12	439369	439380	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017295	ATTTTT	2	12	443473	443484	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017295	ATGCAA	2	12	444619	444630	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017295	AACATA	2	12	461200	461211	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017295	ATAAAA	2	12	480702	480713	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017295	AAATAT	2	12	531302	531313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017295	TAAGTA	2	12	536040	536051	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017295	ATTTAA	2	12	562674	562685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017295	TAAATT	2	12	567403	567414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017295	TATATT	2	12	574785	574796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017295	TTTTTG	2	12	598508	598519	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017295	AACTTG	2	12	600841	600852	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017295	ATGATT	2	12	611887	611898	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017295	ATATTT	2	12	616658	616669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017295	CAAATG	2	12	638391	638402	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017295	AATTAA	2	12	645517	645528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017295	TGATTT	2	12	645635	645646	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017295	TAAATA	2	12	648462	648473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017295	TGATAA	2	12	675732	675743	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017295	TAAATA	2	12	727709	727720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017295	TAATTA	2	12	746149	746160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017295	ATTTAT	2	12	772045	772056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017295	TATTAA	2	12	772074	772085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017295	TTATAT	2	12	783648	783659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017295	GTTTTT	2	12	785040	785051	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017295	TTTTAA	2	12	788830	788841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017295	AAAATA	2	12	796690	796701	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017295	AAATTA	2	12	815487	815498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017295	TTTTAA	2	12	832530	832541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017295	TTTAGC	2	12	832700	832711	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017295	AAAAAT	2	12	884473	884484	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017295	TAAGAG	2	12	895864	895875	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017295	ATTATA	2	12	927859	927870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017295	ATATTT	2	12	927879	927890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017295	TAAAAA	2	12	933012	933023	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017295	TAAAAA	2	12	938532	938543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017295	TTTAAA	2	12	958575	958586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017295	TAACTT	2	12	972015	972026	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017295	ATATAA	2	12	974642	974653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017295	AAAAAT	2	12	980654	980665	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017295	TTAAAT	2	12	1003998	1004009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017295	TTAAGT	2	12	1007484	1007495	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017295	AATATA	2	12	1010609	1010620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017295	AGATTA	2	12	1070016	1070027	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017295	TAAGAT	2	12	1089545	1089556	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017295	TAAAAA	2	12	1104527	1104538	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017295	TAAAAT	2	12	1113425	1113436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017295	TAAAAA	2	12	1113644	1113655	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017295	ATATTT	2	12	1120826	1120837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017295	AATATT	2	12	1132003	1132014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017295	CATAAA	2	12	1157443	1157454	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017295	TTAATA	2	12	1169612	1169623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017295	ATCATT	2	12	1179086	1179097	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017295	CATATA	2	12	1193040	1193051	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017295	ATTTAA	2	12	1196532	1196543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017295	TTTATT	2	12	1197606	1197617	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017295	ATATTA	2	12	1208384	1208395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017295	ATATTA	2	12	1211266	1211277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017295	ATATAG	2	12	1241072	1241083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017295	CTATAT	2	12	1241092	1241103	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017295	TTGTGC	2	12	1260229	1260240	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017295	TAAAAA	2	12	1297246	1297257	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017295	TTCTTT	2	12	1311040	1311051	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017295	ATAACA	2	12	1313388	1313399	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017295	ATATTT	2	12	1314078	1314089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017295	CAAGGA	2	12	1329630	1329641	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017295	ACAATT	2	12	1329875	1329886	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017295	TTTTAT	2	12	1336748	1336759	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017295	AGAAAT	2	12	1350238	1350249	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017295	TAGTAA	2	12	1352399	1352410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017295	TATAAA	2	12	1357498	1357509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017295	TAAAAA	2	12	1374632	1374643	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017295	TATGAA	2	12	1375143	1375154	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017295	ATATGG	2	12	1376298	1376309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017295	TTTAAG	2	12	1376461	1376472	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017295	CTTTTT	2	12	1394958	1394969	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017295	CTTTTA	2	12	1396363	1396374	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017295	ATATAA	2	12	1410973	1410984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017295	TTTTTA	2	12	1444198	1444209	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017295	ATATAA	2	12	1460174	1460185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017295	TATTAA	2	12	1466859	1466870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017295	AGAAAA	2	12	1479591	1479602	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017295	TTTTAT	2	12	1479611	1479622	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017295	TTTTTA	2	12	1549684	1549695	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017295	TATAAA	2	12	1569597	1569608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017295	GTTATG	2	12	1572789	1572800	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017295	ATTTTT	2	12	1576556	1576567	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017295	TATTAA	2	12	1590941	1590952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017295	AAATAT	2	12	1593301	1593312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017295	TAATTA	2	12	1597647	1597658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017295	CTGAAG	2	12	1626930	1626941	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017295	ATTAGA	2	12	1642874	1642885	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017295	AATAAA	2	12	1702811	1702822	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017295	CAAAGT	2	12	1708401	1708412	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017295	ATAATC	2	12	1746200	1746211	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017295	AGTTTC	2	12	1752398	1752409	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017295	CTTAAA	2	12	1813320	1813331	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017295	TAAAAG	2	12	1824604	1824615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017295	TCAATT	3	18	1889470	1889487	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017295	TATTTT	2	12	1903452	1903463	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017295	ATAATT	2	12	1907970	1907981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.