MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum EA 2018 chromosome

Total Repeats: 1790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017295	GTAATA	2	12	828	839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456719
2	NC_017295	TTGCTG	2	12	861	872	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384456719
3	NC_017295	ATAAGG	2	12	3610	3621	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384456722
4	NC_017295	ATAAAT	2	12	3729	3740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
5	NC_017295	GAAGTA	2	12	5240	5251	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384456724
6	NC_017295	TATGAT	2	12	5390	5401	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456724
7	NC_017295	CCGATG	2	12	6336	6347	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384456724
8	NC_017295	TGATAT	2	12	8252	8263	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456725
9	NC_017295	GCTTAT	2	12	9056	9067	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384456725
10	NC_017295	TCTAGC	2	12	9173	9184	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384456725
11	NC_017295	TAATTC	2	12	15473	15484	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384456727
12	NC_017295	CAAGTG	2	12	16942	16953	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384456728
13	NC_017295	TAGTAA	2	12	17421	17432	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456728
14	NC_017295	AAAGAT	2	12	17983	17994	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456728
15	NC_017295	TGGAGT	2	12	22936	22947	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384456733
16	NC_017295	TTAGAT	2	12	24979	24990	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456735
17	NC_017295	AATTTG	2	12	25367	25378	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456735
18	NC_017295	GAAGGT	2	12	25645	25656	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384456735
19	NC_017295	TGAATA	2	12	26358	26369	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456736
20	NC_017295	ATCCAA	2	12	26388	26399	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384456736
21	NC_017295	TTGGAA	2	12	28796	28807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456738
22	NC_017295	AGATAA	2	12	34095	34106	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456741
23	NC_017295	GCTTTT	2	12	39494	39505	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384456746
24	NC_017295	TCTACC	2	12	39692	39703	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384456746
25	NC_017295	TATAGC	2	12	48011	48022	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384456754
26	NC_017295	CTATAG	2	12	48973	48984	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384456755
27	NC_017295	TAATAG	2	12	57505	57516	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456762
28	NC_017295	TAAAAA	2	12	57566	57577	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384456762
29	NC_017295	GAAAAG	2	12	58652	58663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456763
30	NC_017295	TAAATA	2	12	59374	59385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456764
31	NC_017295	AGGAAA	2	12	60206	60217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456766
32	NC_017295	TAAAAA	2	12	68317	68328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384456778
33	NC_017295	GTAAAT	2	12	75406	75417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456780
34	NC_017295	TAAAAA	2	12	78119	78130	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384456785
35	NC_017295	AGTTTT	2	12	80370	80381	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384456787
36	NC_017295	TATTAG	2	12	83700	83711	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456792
37	NC_017295	ATTGTA	2	12	85204	85215	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456794
38	NC_017295	ATATAA	2	12	86464	86475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456795
39	NC_017295	GATATA	2	12	91142	91153	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456801
40	NC_017295	TAAAGA	2	12	96251	96262	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456807
41	NC_017295	GCTGGA	2	12	97200	97211	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384456808
42	NC_017295	TTATGA	2	12	98526	98537	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456809
43	NC_017295	AAACAA	2	12	99652	99663	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384456810
44	NC_017295	GAAACT	2	12	99958	99969	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384456810
45	NC_017295	TAGAAA	2	12	107406	107417	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456817
46	NC_017295	TCAGGT	2	12	113855	113866	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384456822
47	NC_017295	ATAACA	2	12	114050	114061	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384456822
48	NC_017295	AATGGT	2	12	115218	115229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456823
49	NC_017295	ATAGAA	2	12	115359	115370	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456823
50	NC_017295	GGACCA	2	12	116630	116641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456825
51	NC_017295	ATAAAT	2	12	119335	119346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456828
52	NC_017295	ATAGAT	2	12	121943	121954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456830
53	NC_017295	TTCAGG	2	12	123345	123356	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384456831
54	NC_017295	CAAAAG	2	12	128325	128336	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384456836
55	NC_017295	TAACCT	2	12	131776	131787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456839
56	NC_017295	AAAAGG	2	12	132544	132555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456839
57	NC_017295	AGAGTT	2	12	137928	137939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456844
58	NC_017295	TAAAAT	2	12	138479	138490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456845
59	NC_017295	AAAAAG	2	12	144792	144803	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384456856
60	NC_017295	AAAAAG	2	12	145545	145556	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384456857
61	NC_017295	TGGGCA	2	12	146629	146640	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384456857
62	NC_017295	AGATCA	2	12	148334	148345	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384456859
63	NC_017295	TAAGTA	2	12	148810	148821	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456859
64	NC_017295	TTTTGC	2	12	152106	152117	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384456865
65	NC_017295	TCTTTT	2	12	152203	152214	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384456865
66	NC_017295	ATAAGA	2	12	153424	153435	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456866
67	NC_017295	TTTTGT	2	12	155335	155346	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384456869
68	NC_017295	GATTTT	2	12	156036	156047	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384456870
69	NC_017295	ATTAAA	2	12	156542	156553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456870
70	NC_017295	AAGCAA	2	12	177621	177632	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384456874
71	NC_017295	AAAATT	2	12	179578	179589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456876
72	NC_017295	ATTGGA	2	12	180354	180365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456877
73	NC_017295	CAATTA	2	12	181890	181901	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384456877
74	NC_017295	ATATTG	2	12	183066	183077	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456879
75	NC_017295	GATAAG	2	12	187453	187464	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384456884
76	NC_017295	ATCAGG	2	12	187530	187541	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384456884
77	NC_017295	AAAATT	2	12	188837	188848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456885
78	NC_017295	ACATCA	2	12	193728	193739	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384456890
79	NC_017295	GATATT	2	12	196558	196569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456893
80	NC_017295	GTAAAA	2	12	196927	196938	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456893
81	NC_017295	AGAAAA	2	12	198905	198916	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384456895
82	NC_017295	ACTCAA	2	12	200598	200609	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384456896
83	NC_017295	GGATAA	2	12	200647	200658	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384456896
84	NC_017295	AAAGAA	2	12	202961	202972	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384456899
85	NC_017295	GTATTT	2	12	211487	211498	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384456907
86	NC_017295	TTCTAC	2	12	211993	212004	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384456907
87	NC_017295	GATGAA	2	12	213564	213575	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384456909
88	NC_017295	ATATTT	2	12	214343	214354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456910
89	NC_017295	GAAGAG	2	12	215020	215031	50 %	0 %	50 %	0 %	384456910
90	NC_017295	ATAGCT	2	12	216311	216322	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384456912
91	NC_017295	TAAAGA	2	12	221935	221946	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456917
92	NC_017295	ACTTTT	2	12	223736	223747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384456919
93	NC_017295	TTTTAT	2	12	225644	225655	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384456921
94	NC_017295	TTACAC	2	12	230122	230133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456926
95	NC_017295	GAATAA	2	12	231620	231631	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456927
96	NC_017295	GCAATA	2	12	231643	231654	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384456927
97	NC_017295	AATAGA	2	12	231930	231941	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384456927
98	NC_017295	ATTTAT	2	12	232008	232019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456927
99	NC_017295	GCAGTT	2	12	233032	233043	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384456928
100	NC_017295	TTTAAA	2	12	234460	234471	50 %	50 %	0 %	0 %	384456929
101	NC_017295	AAGGAA	2	12	239050	239061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456935
102	NC_017295	AGTTGA	2	12	239520	239531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456935
103	NC_017295	AAAAAT	2	12	241594	241605	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384456937
104	NC_017295	ATTTTA	2	12	243653	243664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456940
105	NC_017295	TTTTTA	2	12	243956	243967	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384456940
106	NC_017295	TACAAA	2	12	244536	244547	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384456941
107	NC_017295	TAAAAA	2	12	244821	244832	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384456941
108	NC_017295	AGGAAC	2	12	244904	244915	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384456941
109	NC_017295	GATATA	2	12	245870	245881	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456942
110	NC_017295	TACAGT	2	12	246208	246219	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384456942
111	NC_017295	CTATAG	2	12	248435	248446	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384456944
112	NC_017295	GTAAAG	2	12	249093	249104	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384456945
113	NC_017295	TAAATA	2	12	249553	249564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456945
114	NC_017295	GGTATA	2	12	250427	250438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456946
115	NC_017295	GATAGA	2	12	251450	251461	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384456947
116	NC_017295	TATAGC	2	12	251621	251632	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384456948
117	NC_017295	TCTTTT	2	12	253836	253847	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384456949
118	NC_017295	TAAAAT	2	12	261367	261378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456951
119	NC_017295	ATTGCA	2	12	269353	269364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384456960
120	NC_017295	TTTTGG	2	12	269774	269785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456960
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127	NC_017295	GTTGAA	2	12	294327	294338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456983
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223	NC_017295	ATGAAC	2	12	531877	531888	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384457185
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231	NC_017295	AAAACA	2	12	548250	548261	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384457200
232	NC_017295	GATTTT	2	12	550584	550595	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384457202
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