MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum EA 2018 chromosome

Total Repeats: 3221

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017295	GTTCA	2	10	1106	1115	20 %	40 %	20 %	20 %	384456719
2	NC_017295	TTTAA	2	10	1559	1568	40 %	60 %	0 %	0 %	384456719
3	NC_017295	AAATT	2	10	2556	2565	60 %	40 %	0 %	0 %	384456720
4	NC_017295	ATGAT	2	10	3964	3973	40 %	40 %	20 %	0 %	384456722
5	NC_017295	TGAAA	2	10	6824	6833	60 %	20 %	20 %	0 %	384456725
6	NC_017295	ATATT	2	10	6921	6930	40 %	60 %	0 %	0 %	384456725
7	NC_017295	CTTAA	2	10	14972	14981	40 %	40 %	0 %	20 %	384456726
8	NC_017295	GACAA	2	10	15380	15389	60 %	0 %	20 %	20 %	384456727
9	NC_017295	GGTAA	2	10	15889	15898	40 %	20 %	40 %	0 %	384456728
10	NC_017295	ATTTA	2	10	16506	16515	40 %	60 %	0 %	0 %	384456728
11	NC_017295	TGAAT	2	10	18531	18540	40 %	40 %	20 %	0 %	384456728
12	NC_017295	AAAAG	2	10	18985	18994	80 %	0 %	20 %	0 %	384456729
13	NC_017295	GTATG	2	10	19300	19309	20 %	40 %	40 %	0 %	384456729
14	NC_017295	TAATT	2	10	20208	20217	40 %	60 %	0 %	0 %	384456730
15	NC_017295	TACAG	2	10	23889	23898	40 %	20 %	20 %	20 %	384456734
16	NC_017295	GAAAA	2	10	25322	25331	80 %	0 %	20 %	0 %	384456735
17	NC_017295	TGATT	2	10	25413	25422	20 %	60 %	20 %	0 %	384456735
18	NC_017295	AGAGG	2	10	26534	26543	40 %	0 %	60 %	0 %	384456736
19	NC_017295	AAAGA	2	10	28933	28942	80 %	0 %	20 %	0 %	384456738
20	NC_017295	AAGAA	2	10	29109	29118	80 %	0 %	20 %	0 %	384456738
21	NC_017295	AGAGG	2	10	32389	32398	40 %	0 %	60 %	0 %	384456740
22	NC_017295	TATAA	2	10	33844	33853	60 %	40 %	0 %	0 %	384456741
23	NC_017295	CATTT	2	10	35480	35489	20 %	60 %	0 %	20 %	384456742
24	NC_017295	GTTTA	2	10	38452	38461	20 %	60 %	20 %	0 %	384456746
25	NC_017295	AATTT	2	10	38669	38678	40 %	60 %	0 %	0 %	384456746
26	NC_017295	ATTGA	2	10	39351	39360	40 %	40 %	20 %	0 %	384456746
27	NC_017295	ATGGA	2	10	40684	40693	40 %	20 %	40 %	0 %	384456747
28	NC_017295	ATATA	2	10	41211	41220	60 %	40 %	0 %	0 %	384456748
29	NC_017295	CTTTA	2	10	42181	42190	20 %	60 %	0 %	20 %	384456749
30	NC_017295	AGGAG	2	10	42685	42694	40 %	0 %	60 %	0 %	384456749
31	NC_017295	AGGAA	2	10	43141	43150	60 %	0 %	40 %	0 %	384456750
32	NC_017295	ATTTT	2	10	44301	44310	20 %	80 %	0 %	0 %	384456751
33	NC_017295	TTTTG	2	10	46847	46856	0 %	80 %	20 %	0 %	384456753
34	NC_017295	ACAAA	2	10	49445	49454	80 %	0 %	0 %	20 %	384456755
35	NC_017295	TAAAT	2	10	49893	49902	60 %	40 %	0 %	0 %	384456756
36	NC_017295	AATAA	2	10	50107	50116	80 %	20 %	0 %	0 %	384456757
37	NC_017295	TGGTT	2	10	52044	52053	0 %	60 %	40 %	0 %	384456757
38	NC_017295	TTAGT	2	10	53480	53489	20 %	60 %	20 %	0 %	384456757
39	NC_017295	AGATA	2	10	55011	55020	60 %	20 %	20 %	0 %	384456758
40	NC_017295	CATTT	2	10	57553	57562	20 %	60 %	0 %	20 %	384456762
41	NC_017295	GAAAA	2	10	59205	59214	80 %	0 %	20 %	0 %	384456763
42	NC_017295	AGTGC	2	10	59479	59488	20 %	20 %	40 %	20 %	384456764
43	NC_017295	AGAAT	2	10	60599	60608	60 %	20 %	20 %	0 %	384456767
44	NC_017295	AATCA	2	10	60983	60992	60 %	20 %	0 %	20 %	384456767
45	NC_017295	TAAAT	2	10	62510	62519	60 %	40 %	0 %	0 %	384456770
46	NC_017295	AGAAA	2	10	67393	67402	80 %	0 %	20 %	0 %	384456777
47	NC_017295	GTTGT	2	10	75334	75343	0 %	60 %	40 %	0 %	384456780
48	NC_017295	AAGGC	2	10	77541	77550	40 %	0 %	40 %	20 %	384456784
49	NC_017295	AAGTT	2	10	80333	80342	40 %	40 %	20 %	0 %	384456787
50	NC_017295	TTAAA	2	10	80393	80402	60 %	40 %	0 %	0 %	384456787
51	NC_017295	AATTA	2	10	80424	80433	60 %	40 %	0 %	0 %	384456787
52	NC_017295	ATAGT	2	10	81877	81886	40 %	40 %	20 %	0 %	384456789
53	NC_017295	TTAAA	2	10	86221	86230	60 %	40 %	0 %	0 %	384456795
54	NC_017295	TAAAA	2	10	86357	86366	80 %	20 %	0 %	0 %	384456795
55	NC_017295	ATTTT	2	10	86872	86881	20 %	80 %	0 %	0 %	384456796
56	NC_017295	ATGTT	2	10	88870	88879	20 %	60 %	20 %	0 %	384456799
57	NC_017295	AAATA	2	10	89958	89967	80 %	20 %	0 %	0 %	384456801
58	NC_017295	AAAAT	2	10	93485	93494	80 %	20 %	0 %	0 %	384456803
59	NC_017295	GTGAT	2	10	97036	97045	20 %	40 %	40 %	0 %	384456808
60	NC_017295	GATGG	2	10	104077	104086	20 %	20 %	60 %	0 %	384456814
61	NC_017295	TCTTA	2	10	104173	104182	20 %	60 %	0 %	20 %	384456814
62	NC_017295	TCCTT	2	10	104517	104526	0 %	60 %	0 %	40 %	384456814
63	NC_017295	AAGAA	2	10	105613	105622	80 %	0 %	20 %	0 %	384456815
64	NC_017295	CAGCT	2	10	106066	106075	20 %	20 %	20 %	40 %	384456816
65	NC_017295	AAATG	2	10	106768	106777	60 %	20 %	20 %	0 %	384456817
66	NC_017295	ATGGA	2	10	107112	107121	40 %	20 %	40 %	0 %	384456817
67	NC_017295	AAAGA	2	10	107593	107602	80 %	0 %	20 %	0 %	384456817
68	NC_017295	AGATA	2	10	108410	108419	60 %	20 %	20 %	0 %	384456818
69	NC_017295	TAAAG	2	10	111041	111050	60 %	20 %	20 %	0 %	384456820
70	NC_017295	TAAAA	2	10	113785	113794	80 %	20 %	0 %	0 %	384456822
71	NC_017295	GTAAA	2	10	115978	115987	60 %	20 %	20 %	0 %	384456823
72	NC_017295	GAAGT	2	10	116352	116361	40 %	20 %	40 %	0 %	384456825
73	NC_017295	TAAAA	2	10	116548	116557	80 %	20 %	0 %	0 %	384456825
74	NC_017295	AAGAA	2	10	117046	117055	80 %	0 %	20 %	0 %	384456825
75	NC_017295	AAAAG	2	10	117466	117475	80 %	0 %	20 %	0 %	384456826
76	NC_017295	CCTTC	2	10	118303	118312	0 %	40 %	0 %	60 %	384456827
77	NC_017295	GAAAA	2	10	118959	118968	80 %	0 %	20 %	0 %	384456827
78	NC_017295	AAAGA	2	10	120039	120048	80 %	0 %	20 %	0 %	384456829
79	NC_017295	CAATC	2	10	122036	122045	40 %	20 %	0 %	40 %	384456830
80	NC_017295	GATAC	2	10	124106	124115	40 %	20 %	20 %	20 %	384456832
81	NC_017295	AATAA	2	10	124285	124294	80 %	20 %	0 %	0 %	384456832
82	NC_017295	ATTTT	2	10	124728	124737	20 %	80 %	0 %	0 %	384456832
83	NC_017295	GTATT	2	10	128917	128926	20 %	60 %	20 %	0 %	384456837
84	NC_017295	CAATA	2	10	129047	129056	60 %	20 %	0 %	20 %	384456837
85	NC_017295	AGATG	2	10	131001	131010	40 %	20 %	40 %	0 %	384456838
86	NC_017295	CAAGC	2	10	132498	132507	40 %	0 %	20 %	40 %	384456839
87	NC_017295	ATGGA	2	10	132579	132588	40 %	20 %	40 %	0 %	384456839
88	NC_017295	GAACT	2	10	133962	133971	40 %	20 %	20 %	20 %	384456841
89	NC_017295	AAGCT	2	10	134238	134247	40 %	20 %	20 %	20 %	384456842
90	NC_017295	AATAG	2	10	136518	136527	60 %	20 %	20 %	0 %	384456844
91	NC_017295	GATTT	2	10	136930	136939	20 %	60 %	20 %	0 %	384456844
92	NC_017295	GCGGT	2	10	138279	138288	0 %	20 %	60 %	20 %	384456845
93	NC_017295	CTGTT	2	10	138744	138753	0 %	60 %	20 %	20 %	384456846
94	NC_017295	AAAAG	2	10	140287	140296	80 %	0 %	20 %	0 %	384456849
95	NC_017295	TATTT	2	10	141885	141894	20 %	80 %	0 %	0 %	384456851
96	NC_017295	TAAAA	2	10	142377	142386	80 %	20 %	0 %	0 %	384456852
97	NC_017295	TACCT	2	10	142960	142969	20 %	40 %	0 %	40 %	384456853
98	NC_017295	TTCTT	2	10	145982	145991	0 %	80 %	0 %	20 %	384456857
99	NC_017295	ATAAG	2	10	148899	148908	60 %	20 %	20 %	0 %	384456860
100	NC_017295	ATAGT	2	10	150847	150856	40 %	40 %	20 %	0 %	384456864
101	NC_017295	CTTAA	2	10	151944	151953	40 %	40 %	0 %	20 %	384456864
102	NC_017295	ATAAA	2	10	154822	154831	80 %	20 %	0 %	0 %	384456868
103	NC_017295	ACTTT	2	10	156088	156097	20 %	60 %	0 %	20 %	384456870
104	NC_017295	ATATT	2	10	157437	157446	40 %	60 %	0 %	0 %	384456871
105	NC_017295	ATAGA	2	10	157748	157757	60 %	20 %	20 %	0 %	384456871
106	NC_017295	AAATG	2	10	174090	174099	60 %	20 %	20 %	0 %	384456872
107	NC_017295	AAAAT	2	10	174860	174869	80 %	20 %	0 %	0 %	384456873
108	NC_017295	ATTAA	2	10	175645	175654	60 %	40 %	0 %	0 %	384456873
109	NC_017295	TAAAG	2	10	176685	176694	60 %	20 %	20 %	0 %	384456874
110	NC_017295	AGTTA	2	10	176783	176792	40 %	40 %	20 %	0 %	384456874
111	NC_017295	ATATA	2	10	177093	177102	60 %	40 %	0 %	0 %	384456874
112	NC_017295	TAAAA	2	10	177435	177444	80 %	20 %	0 %	0 %	384456874
113	NC_017295	CAAAA	2	10	181413	181422	80 %	0 %	0 %	20 %	384456877
114	NC_017295	GAATT	2	10	183410	183419	40 %	40 %	20 %	0 %	384456879
115	NC_017295	TGCCA	2	10	184236	184245	20 %	20 %	20 %	40 %	384456880
116	NC_017295	CGCTC	2	10	184451	184460	0 %	20 %	20 %	60 %	384456880
117	NC_017295	AAATA	2	10	186737	186746	80 %	20 %	0 %	0 %	384456883
118	NC_017295	TATTT	2	10	188662	188671	20 %	80 %	0 %	0 %	384456885
119	NC_017295	TTTTA	2	10	190295	190304	20 %	80 %	0 %	0 %	384456887
120	NC_017295	GGAAA	2	10	190952	190961	60 %	0 %	40 %	0 %	384456887
121	NC_017295	GAATA	2	10	193712	193721	60 %	20 %	20 %	0 %	384456890
122	NC_017295	TGGTA	2	10	193769	193778	20 %	40 %	40 %	0 %	384456890
123	NC_017295	AAATT	2	10	196966	196975	60 %	40 %	0 %	0 %	384456893
124	NC_017295	ATTGA	2	10	197313	197322	40 %	40 %	20 %	0 %	384456894
125	NC_017295	ATCTT	2	10	200230	200239	20 %	60 %	0 %	20 %	384456896
126	NC_017295	TCGTA	2	10	202475	202484	20 %	40 %	20 %	20 %	384456898
127	NC_017295	CTAAA	2	10	202837	202846	60 %	20 %	0 %	20 %	384456898
128	NC_017295	AAATA	2	10	203137	203146	80 %	20 %	0 %	0 %	384456899
129	NC_017295	ATTTA	2	10	205318	205327	40 %	60 %	0 %	0 %	384456902
130	NC_017295	CATTT	2	10	207075	207084	20 %	60 %	0 %	20 %	384456903
131	NC_017295	ATAGT	2	10	207374	207383	40 %	40 %	20 %	0 %	384456903
132	NC_017295	TAATG	2	10	209065	209074	40 %	40 %	20 %	0 %	384456905
133	NC_017295	AGACA	2	10	209320	209329	60 %	0 %	20 %	20 %	384456905
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135	NC_017295	GGAAT	2	10	217836	217845	40 %	20 %	40 %	0 %	384456913
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