MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Yit

Total Repeats: 934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017294	TATAAA	2	12	2068	2079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455127
2	NC_017294	ATGATA	2	12	2987	2998	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384455128
3	NC_017294	AAATAT	2	12	3411	3422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455128
4	NC_017294	TAATGG	2	12	4472	4483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384455130
5	NC_017294	AATAAA	2	12	4760	4771	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384455130
6	NC_017294	AAATAT	2	12	10969	10980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455134
7	NC_017294	GATTTT	2	12	11105	11116	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384455134
8	NC_017294	AAATTT	2	12	12806	12817	50 %	50 %	0 %	0 %	384455135
9	NC_017294	CCTTAT	2	12	13670	13681	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384455135
10	NC_017294	TGAATT	2	12	15460	15471	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455135
11	NC_017294	TAAGAA	2	12	15760	15771	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384455135
12	NC_017294	AATGGA	2	12	15875	15886	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384455135
13	NC_017294	ATGAGG	2	12	16631	16642	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384455136
14	NC_017294	TATGAT	2	12	19132	19143	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455136
15	NC_017294	TATCTG	2	12	19169	19180	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384455136
16	NC_017294	ATATAA	2	12	21034	21045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455138
17	NC_017294	ATTTTA	2	12	26284	26295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017294	TGATAT	2	12	29983	29994	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455145
19	NC_017294	ATAACT	2	12	31311	31322	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384455148
20	NC_017294	TATAAA	2	12	31706	31717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455149
21	NC_017294	TTAAGT	2	12	32458	32469	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455149
22	NC_017294	AAAAAT	2	12	32756	32767	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017294	TATAAA	2	12	33194	33205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455150
24	NC_017294	AGAGGA	2	12	33846	33857	50 %	0 %	50 %	0 %	384455150
25	NC_017294	AGATTT	2	12	36007	36018	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455153
26	NC_017294	AAAATT	2	12	38220	38231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017294	AAGGAT	2	12	39042	39053	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384455155
28	NC_017294	TTAGGT	2	12	42339	42350	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017294	TAGTGA	2	12	44401	44412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017294	TAGTGA	2	12	52630	52641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017294	TTTATT	2	12	56626	56637	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384455164
32	NC_017294	TTTAAT	2	12	56650	56661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455164
33	NC_017294	TTAATT	2	12	56709	56720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455164
34	NC_017294	ATTTAA	2	12	57067	57078	50 %	50 %	0 %	0 %	384455164
35	NC_017294	GTCTCC	2	12	60315	60326	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384455168
36	NC_017294	AATTTA	2	12	61179	61190	50 %	50 %	0 %	0 %	384455169
37	NC_017294	AATAAG	2	12	61433	61444	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384455169
38	NC_017294	ATTATA	2	12	64455	64466	50 %	50 %	0 %	0 %	384455171
39	NC_017294	GTTCAT	2	12	67697	67708	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384455174
40	NC_017294	AAAATT	2	12	68007	68018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017294	TATAAA	2	12	78297	78308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455186
42	NC_017294	CATATA	2	12	78682	78693	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384455187
43	NC_017294	TATAAA	2	12	81302	81313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455191
44	NC_017294	TAGAGA	2	12	81513	81524	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384455191
45	NC_017294	TTACCT	2	12	81818	81829	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384455191
46	NC_017294	ATAATT	2	12	81876	81887	50 %	50 %	0 %	0 %	384455191
47	NC_017294	TAATGA	2	12	85517	85528	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384455194
48	NC_017294	TTAATA	2	12	89297	89308	50 %	50 %	0 %	0 %	384455196
49	NC_017294	TCTGGA	2	12	91371	91382	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384455197
50	NC_017294	ATGAAA	2	12	93446	93457	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384455198
51	NC_017294	GATTTG	2	12	94522	94533	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384455199
52	NC_017294	AGATAA	2	12	96055	96066	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384455200
53	NC_017294	GATAGT	2	12	103054	103065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384455206
54	NC_017294	TAAATT	2	12	103227	103238	50 %	50 %	0 %	0 %	384455206
55	NC_017294	ATGTTA	2	12	107070	107081	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455207
56	NC_017294	CTTTTT	2	12	112381	112392	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384455210
57	NC_017294	TAGAAA	2	12	112757	112768	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384455211
58	NC_017294	TAGATA	2	12	113581	113592	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384455211
59	NC_017294	AAAGAA	2	12	114291	114302	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384455212
60	NC_017294	AAACTA	2	12	120022	120033	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017294	AGTACA	2	12	123200	123211	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384455222
62	NC_017294	AGGATA	2	12	127195	127206	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384455224
63	NC_017294	TGAAAT	2	12	129173	129184	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384455227
64	NC_017294	TTTGGA	2	12	134543	134554	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384455234
65	NC_017294	GCTAAA	2	12	136682	136693	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384455236
66	NC_017294	TGAGTT	2	12	137162	137173	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384455237
67	NC_017294	TAAATT	2	12	138066	138077	50 %	50 %	0 %	0 %	384455238
68	NC_017294	GTACAA	2	12	138733	138744	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384455239
69	NC_017294	TTTAAT	2	12	140107	140118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017294	AGGTAC	2	12	140256	140267	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384455242
71	NC_017294	TTAGTG	2	12	143615	143626	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017294	GATAAG	2	12	147123	147134	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384455248
73	NC_017294	AAAGCT	2	12	147633	147644	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384455248
74	NC_017294	ATTAAT	2	12	148188	148199	50 %	50 %	0 %	0 %	384455250
75	NC_017294	TAAAAA	2	12	154249	154260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384455256
76	NC_017294	TTTTAA	2	12	155837	155848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455260
77	NC_017294	ATTGAA	2	12	157143	157154	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384455261
78	NC_017294	AATTTA	2	12	157176	157187	50 %	50 %	0 %	0 %	384455261
79	NC_017294	AATTTA	2	12	160004	160015	50 %	50 %	0 %	0 %	384455263
80	NC_017294	ATAAAA	2	12	161125	161136	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384455263
81	NC_017294	TTTATT	2	12	161824	161835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384455264
82	NC_017294	ATTTAT	2	12	167875	167886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455269
83	NC_017294	TTAATG	2	12	171986	171997	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017294	ATTTTG	2	12	172388	172399	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384455274
85	NC_017294	TTTAAT	2	12	176374	176385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455278
86	NC_017294	TTGATT	2	12	180000	180011	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384455281
87	NC_017294	AAATAT	2	12	180667	180678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455282
88	NC_017294	ATATTT	2	12	183741	183752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455285
89	NC_017294	ATTTTT	2	12	184161	184172	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384455286
90	NC_017294	TAGTGA	2	12	185731	185742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017294	GTATTT	2	12	189703	189714	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384455287
92	NC_017294	TAATTA	2	12	190169	190180	50 %	50 %	0 %	0 %	384455287
93	NC_017294	TAAAAA	2	12	190218	190229	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384455287
94	NC_017294	TTTTAA	2	12	193402	193413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455290
95	NC_017294	TACTTT	2	12	195323	195334	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384455293
96	NC_017294	GGTATA	2	12	203326	203337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017294	GGATTA	2	12	203511	203522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017294	TATGAG	2	12	203750	203761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017294	TTAAAT	2	12	205030	205041	50 %	50 %	0 %	0 %	384455297
100	NC_017294	TCCAAC	2	12	208335	208346	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384455299
101	NC_017294	GGAATT	2	12	209241	209252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384455300
102	NC_017294	ATTTTT	2	12	213558	213569	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017294	ACAAAG	2	12	214111	214122	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384455304
104	NC_017294	ATTGAT	2	12	214284	214295	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455304
105	NC_017294	ATTTCT	2	12	214719	214730	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384455305
106	NC_017294	TAAAGA	2	12	216266	216277	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384455308
107	NC_017294	GACCAG	2	12	221364	221375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384455310
108	NC_017294	GAATTT	2	12	221905	221916	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455310
109	NC_017294	ATTAAC	2	12	222970	222981	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384455310
110	NC_017294	AGAAGG	2	12	226575	226586	50 %	0 %	50 %	0 %	384455311
111	NC_017294	TTTATA	2	12	227552	227563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455313
112	NC_017294	AATGGT	2	12	228500	228511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384455314
113	NC_017294	CCAGGA	2	12	229464	229475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384455315
114	NC_017294	TGATAG	2	12	230183	230194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384455315
115	NC_017294	TATGAA	2	12	231725	231736	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384455316
116	NC_017294	AATAAG	2	12	232209	232220	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384455316
117	NC_017294	TATATT	2	12	235438	235449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455319
118	NC_017294	ATTTAG	2	12	243177	243188	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455327
119	NC_017294	GAGGAT	2	12	245083	245094	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384455329
120	NC_017294	CAGGTA	2	12	245552	245563	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384455329
121	NC_017294	AATTTA	2	12	246369	246380	50 %	50 %	0 %	0 %	384455330
122	NC_017294	TGAGAT	2	12	246530	246541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384455330
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240	NC_017294	TATAAA	2	12	450329	450340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455515
241	NC_017294	ATAGGT	2	12	450495	450506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384455515
242	NC_017294	TGTAAG	2	12	451590	451601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384455516
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