MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Yit

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017294	ATTTTA	2	12	26284	26295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017294	AAAAAT	2	12	32756	32767	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017294	AAAATT	2	12	38220	38231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017294	TTAGGT	2	12	42339	42350	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017294	TAGTGA	2	12	44401	44412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017294	TAGTGA	2	12	52630	52641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017294	AAAATT	2	12	68007	68018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017294	AAACTA	2	12	120022	120033	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017294	TTTAAT	2	12	140107	140118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017294	TTAGTG	2	12	143615	143626	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017294	TTAATG	2	12	171986	171997	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017294	TAGTGA	2	12	185731	185742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017294	GGTATA	2	12	203326	203337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017294	GGATTA	2	12	203511	203522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017294	TATGAG	2	12	203750	203761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017294	ATTTTT	2	12	213558	213569	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017294	TATTTT	2	12	252763	252774	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017294	TTTTTA	2	12	258426	258437	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017294	TAGTGA	2	12	301548	301559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017294	TAGTGA	2	12	306556	306567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017294	TAATAT	2	12	316661	316672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017294	ATAAAA	2	12	325242	325253	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017294	TAAATG	2	12	341498	341509	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017294	TATCTT	2	12	346372	346383	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017294	TATTTT	2	12	350608	350619	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017294	CTAATA	2	12	368002	368013	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017294	GAGTGT	2	12	375372	375383	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017294	GATTTA	2	12	433053	433064	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017294	ATTTTT	2	12	435708	435719	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017294	TTTAAA	2	12	440704	440715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017294	ATATTA	2	12	448671	448682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017294	ATTTAT	2	12	477480	477491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017294	ATTAAT	2	12	487665	487676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017294	GATAAT	2	12	503086	503097	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017294	TTAAAA	2	12	544222	544233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017294	TTGTAT	2	12	588492	588503	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017294	TGTCAT	2	12	610431	610442	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017294	GATAAA	2	12	611510	611521	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017294	AAATGT	2	12	613884	613895	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017294	GAAAAA	2	12	631763	631774	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017294	TAATTG	2	12	651442	651453	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017294	AATAGT	2	12	651458	651469	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017294	AATTAA	2	12	674975	674986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017294	TAGATT	2	12	681357	681368	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017294	ATAAAA	2	12	704988	704999	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017294	ATAAAA	2	12	705900	705911	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017294	AATTTA	2	12	718450	718461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017294	ATGAAA	2	12	723057	723068	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017294	TAAATT	2	12	739153	739164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017294	TATAGA	2	12	760633	760644	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017294	TATTTT	2	12	786663	786674	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017294	ATTTTT	2	12	788270	788281	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017294	TATAAA	2	12	797051	797062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017294	TATTAG	2	12	835022	835033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017294	TTCAAA	2	12	847002	847013	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017294	TTCAAA	2	12	852032	852043	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017294	TCCATT	2	12	852224	852235	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017294	TAAATG	2	12	852461	852472	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017294	AAAAAT	2	12	872260	872271	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017294	AAATTT	2	12	873518	873529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017294	AAAAAT	2	12	890795	890806	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017294	ATAATT	2	12	922235	922246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017294	AATGAA	2	12	925559	925570	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017294	TAAAAA	2	12	926151	926162	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017294	AACTAA	2	12	935704	935715	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017294	AATGAA	2	12	956223	956234	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017294	AAAATA	2	12	956398	956409	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017294	TAAAAT	2	12	960368	960379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017294	TAAAAA	2	12	960494	960505	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017294	TTAAAA	2	12	960736	960747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017294	AATAAA	2	12	966298	966309	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017294	AAATTT	2	12	967518	967529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017294	TTAACT	2	12	1046374	1046385	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017294	TTAAAA	2	12	1047841	1047852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017294	AAAGTA	2	12	1048454	1048465	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017294	AAATAT	2	12	1057018	1057029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017294	TATTAA	2	12	1097230	1097241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017294	TTAAAA	2	12	1104237	1104248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017294	AAATTC	2	12	1107960	1107971	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017294	TCAGGA	2	12	1108249	1108260	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017294	ATTTTA	2	12	1112035	1112046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017294	TCAAAA	2	12	1129142	1129153	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017294	ATCCAT	2	12	1129714	1129725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017294	TATCTT	2	12	1130277	1130288	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017294	AAATTA	2	12	1130909	1130920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017294	CTTTAA	2	12	1155040	1155051	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017294	TAAAAA	2	12	1167503	1167514	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017294	ATTTAT	2	12	1168083	1168094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017294	TATAAA	2	12	1185086	1185097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017294	TAAAAT	2	12	1193183	1193194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017294	CAAATA	2	12	1194797	1194808	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017294	TAATTA	2	12	1230663	1230674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017294	TATTTA	2	12	1254983	1254994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017294	TCAAAT	2	12	1274190	1274201	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017294	AAATCT	2	12	1278867	1278878	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017294	ATTTAA	2	12	1288338	1288349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017294	TACAAA	2	12	1293996	1294007	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017294	AAATTT	2	12	1305333	1305344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017294	TAAATT	2	12	1308657	1308668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017294	ATTTTT	2	12	1308694	1308705	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017294	TTTTAT	2	12	1315687	1315698	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017294	TTATAA	2	12	1320771	1320782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017294	TAAAAA	2	12	1327433	1327444	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017294	ATTGTT	2	12	1328180	1328191	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017294	ATTAAA	2	12	1336667	1336678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017294	CAATTA	2	12	1365633	1365644	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017294	TAAAAA	2	12	1371930	1371941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017294	ATTTTT	2	12	1421270	1421281	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017294	TTCATT	2	12	1449131	1449142	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017294	ACACTT	2	12	1481810	1481821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017294	TAAATT	2	12	1495602	1495613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017294	TTAAAG	2	12	1501467	1501478	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017294	TTAACT	2	12	1532205	1532216	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017294	AATATT	2	12	1571612	1571623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017294	TTTAAT	2	12	1586143	1586154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.