MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCVAL chromosome

Total Repeats: 344

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017293	CT	3	6	469	474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017293	AC	3	6	870	875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017293	CT	3	6	1053	1058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017293	TA	3	6	1343	1348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017293	CG	3	6	1581	1586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017293	GC	3	6	1790	1795	0 %	0 %	50 %	50 %	409191059
7	NC_017293	AT	3	6	1885	1890	50 %	50 %	0 %	0 %	409191059
8	NC_017293	GC	3	6	2868	2873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017293	GC	3	6	4846	4851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017293	GC	3	6	5042	5047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017293	GC	3	6	5114	5119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017293	CG	4	8	5244	5251	0 %	0 %	50 %	50 %	409191061
13	NC_017293	CG	3	6	6232	6237	0 %	0 %	50 %	50 %	409191063
14	NC_017293	CT	3	6	7257	7262	0 %	50 %	0 %	50 %	409191064
15	NC_017293	CT	3	6	7921	7926	0 %	50 %	0 %	50 %	409191064
16	NC_017293	GC	3	6	8241	8246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017293	GC	3	6	8309	8314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017293	GA	3	6	8839	8844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017293	GC	3	6	9251	9256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017293	GC	3	6	9720	9725	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
21	NC_017293	GC	3	6	9728	9733	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
22	NC_017293	CA	4	8	9878	9885	50 %	0 %	0 %	50 %	409191065
23	NC_017293	GC	3	6	10353	10358	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
24	NC_017293	CG	3	6	10387	10392	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
25	NC_017293	GC	3	6	10486	10491	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
26	NC_017293	GC	3	6	10537	10542	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
27	NC_017293	TG	3	6	11223	11228	0 %	50 %	50 %	0 %	409191066
28	NC_017293	CA	4	8	11975	11982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017293	CG	3	6	12116	12121	0 %	0 %	50 %	50 %	409191067
30	NC_017293	CA	3	6	13663	13668	50 %	0 %	0 %	50 %	409191068
31	NC_017293	TG	3	6	14000	14005	0 %	50 %	50 %	0 %	409191069
32	NC_017293	CG	3	6	14173	14178	0 %	0 %	50 %	50 %	409191070
33	NC_017293	TA	3	6	14534	14539	50 %	50 %	0 %	0 %	409191070
34	NC_017293	GA	3	6	14820	14825	50 %	0 %	50 %	0 %	409191070
35	NC_017293	AG	3	6	15139	15144	50 %	0 %	50 %	0 %	409191071
36	NC_017293	GC	3	6	15296	15301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017293	CG	3	6	15437	15442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017293	CA	3	6	15574	15579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017293	GC	4	8	15719	15726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017293	GC	3	6	16325	16330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017293	GC	3	6	16400	16405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017293	GC	3	6	16823	16828	0 %	0 %	50 %	50 %	409191072
43	NC_017293	GC	3	6	16878	16883	0 %	0 %	50 %	50 %	409191072
44	NC_017293	TC	3	6	17966	17971	0 %	50 %	0 %	50 %	409191072
45	NC_017293	TG	3	6	18091	18096	0 %	50 %	50 %	0 %	409191072
46	NC_017293	CG	3	6	18624	18629	0 %	0 %	50 %	50 %	409191074
47	NC_017293	GC	3	6	18649	18654	0 %	0 %	50 %	50 %	409191074
48	NC_017293	AG	3	6	19242	19247	50 %	0 %	50 %	0 %	409191074
49	NC_017293	GC	3	6	20261	20266	0 %	0 %	50 %	50 %	409191074
50	NC_017293	GC	3	6	20914	20919	0 %	0 %	50 %	50 %	409191074
51	NC_017293	CG	4	8	21444	21451	0 %	0 %	50 %	50 %	409191074
52	NC_017293	AT	3	6	21754	21759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017293	GC	3	6	22033	22038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017293	CG	4	8	22285	22292	0 %	0 %	50 %	50 %	409191075
55	NC_017293	TG	3	6	22658	22663	0 %	50 %	50 %	0 %	409191075
56	NC_017293	TA	3	6	22707	22712	50 %	50 %	0 %	0 %	409191075
57	NC_017293	GC	3	6	22762	22767	0 %	0 %	50 %	50 %	409191075
58	NC_017293	CA	3	6	23041	23046	50 %	0 %	0 %	50 %	409191075
59	NC_017293	CT	3	6	23094	23099	0 %	50 %	0 %	50 %	409191075
60	NC_017293	GC	3	6	23107	23112	0 %	0 %	50 %	50 %	409191075
61	NC_017293	GC	3	6	23216	23221	0 %	0 %	50 %	50 %	409191075
62	NC_017293	TG	3	6	24388	24393	0 %	50 %	50 %	0 %	409191076
63	NC_017293	GA	3	6	25490	25495	50 %	0 %	50 %	0 %	409191077
64	NC_017293	TC	3	6	26183	26188	0 %	50 %	0 %	50 %	409191078
65	NC_017293	GA	3	6	28011	28016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017293	AC	3	6	28139	28144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017293	GC	3	6	28373	28378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017293	AT	3	6	28513	28518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017293	GC	3	6	28871	28876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017293	TC	3	6	29167	29172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017293	AC	3	6	29301	29306	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017293	GT	3	6	31165	31170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017293	GC	3	6	31299	31304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017293	CG	3	6	32181	32186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017293	GA	3	6	34033	34038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017293	TG	3	6	34508	34513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017293	CA	4	8	34526	34533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017293	CA	3	6	35936	35941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017293	GT	3	6	36257	36262	0 %	50 %	50 %	0 %	409191081
80	NC_017293	AC	3	6	36293	36298	50 %	0 %	0 %	50 %	409191081
81	NC_017293	GC	3	6	36518	36523	0 %	0 %	50 %	50 %	409191081
82	NC_017293	GT	3	6	36648	36653	0 %	50 %	50 %	0 %	409191081
83	NC_017293	GA	3	6	37555	37560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017293	GA	3	6	37595	37600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017293	GT	3	6	37890	37895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017293	GC	3	6	37913	37918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017293	CG	3	6	38314	38319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017293	CG	4	8	38529	38536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017293	CG	3	6	39024	39029	0 %	0 %	50 %	50 %	409191083
90	NC_017293	AT	3	6	39328	39333	50 %	50 %	0 %	0 %	409191083
91	NC_017293	GT	3	6	39343	39348	0 %	50 %	50 %	0 %	409191083
92	NC_017293	CG	4	8	40078	40085	0 %	0 %	50 %	50 %	409191083
93	NC_017293	CG	3	6	40511	40516	0 %	0 %	50 %	50 %	409191084
94	NC_017293	GC	3	6	40976	40981	0 %	0 %	50 %	50 %	409191084
95	NC_017293	TG	3	6	41328	41333	0 %	50 %	50 %	0 %	409191084
96	NC_017293	TG	3	6	41609	41614	0 %	50 %	50 %	0 %	409191085
97	NC_017293	TA	3	6	41635	41640	50 %	50 %	0 %	0 %	409191085
98	NC_017293	CG	3	6	41773	41778	0 %	0 %	50 %	50 %	409191085
99	NC_017293	CA	3	6	42435	42440	50 %	0 %	0 %	50 %	409191085
100	NC_017293	GC	3	6	42704	42709	0 %	0 %	50 %	50 %	409191085
101	NC_017293	CA	3	6	42805	42810	50 %	0 %	0 %	50 %	409191085
102	NC_017293	CG	3	6	42933	42938	0 %	0 %	50 %	50 %	409191086
103	NC_017293	GC	3	6	43650	43655	0 %	0 %	50 %	50 %	409191088
104	NC_017293	GC	3	6	44580	44585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017293	GA	3	6	45366	45371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017293	TA	3	6	45726	45731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017293	CA	3	6	45872	45877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017293	GC	3	6	45885	45890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017293	GT	3	6	46521	46526	0 %	50 %	50 %	0 %	409191089
110	NC_017293	TG	3	6	47626	47631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017293	CT	3	6	48212	48217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017293	CG	3	6	49340	49345	0 %	0 %	50 %	50 %	409191090
113	NC_017293	CA	3	6	49613	49618	50 %	0 %	0 %	50 %	409191091
114	NC_017293	GC	3	6	49621	49626	0 %	0 %	50 %	50 %	409191091
115	NC_017293	AC	3	6	50014	50019	50 %	0 %	0 %	50 %	409191092
116	NC_017293	GC	3	6	50216	50221	0 %	0 %	50 %	50 %	409191092
117	NC_017293	CG	4	8	51319	51326	0 %	0 %	50 %	50 %	409191093
118	NC_017293	GC	3	6	51578	51583	0 %	0 %	50 %	50 %	409191093
119	NC_017293	CT	3	6	52014	52019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017293	AC	3	6	52686	52691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017293	GC	3	6	52714	52719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017293	CG	3	6	52987	52992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017293	CG	3	6	53799	53804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017293	GA	3	6	53953	53958	50 %	0 %	50 %	0 %	409191095
125	NC_017293	CT	3	6	55185	55190	0 %	50 %	0 %	50 %	409191096
126	NC_017293	CG	3	6	55431	55436	0 %	0 %	50 %	50 %	409191096
127	NC_017293	GC	3	6	55518	55523	0 %	0 %	50 %	50 %	409191096
128	NC_017293	CG	3	6	55776	55781	0 %	0 %	50 %	50 %	409191096
129	NC_017293	AC	3	6	55808	55813	50 %	0 %	0 %	50 %	409191096
130	NC_017293	CG	3	6	56956	56961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017293	TG	3	6	57169	57174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017293	GC	3	6	57495	57500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017293	CG	3	6	57697	57702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017293	GC	3	6	57808	57813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017293	GA	3	6	57900	57905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017293	GC	3	6	58418	58423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017293	GC	3	6	58640	58645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017293	GC	3	6	58885	58890	0 %	0 %	50 %	50 %	409191097
139	NC_017293	GC	3	6	58914	58919	0 %	0 %	50 %	50 %	409191097
140	NC_017293	AT	3	6	58957	58962	50 %	50 %	0 %	0 %	409191097
141	NC_017293	CA	3	6	58983	58988	50 %	0 %	0 %	50 %	409191097
142	NC_017293	GC	3	6	59276	59281	0 %	0 %	50 %	50 %	409191097
143	NC_017293	GC	4	8	60175	60182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017293	CA	3	6	60515	60520	50 %	0 %	0 %	50 %	409191098
145	NC_017293	CA	3	6	60524	60529	50 %	0 %	0 %	50 %	409191098
146	NC_017293	GC	3	6	61796	61801	0 %	0 %	50 %	50 %	409191101
147	NC_017293	GC	3	6	62428	62433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017293	GC	3	6	62491	62496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017293	GC	3	6	63164	63169	0 %	0 %	50 %	50 %	409191102
150	NC_017293	AC	3	6	63232	63237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.