MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 02DC15 chromosome

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017292	ATTTAA	2	12	33598	33609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017292	TTTTAA	2	12	42721	42732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017292	ATTATA	2	12	77761	77772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017292	TTTCTT	2	12	123039	123050	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017292	TTCCGT	2	12	148028	148039	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017292	AGAAAA	2	12	163063	163074	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017292	TAAAGA	2	12	226841	226852	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017292	ATTATA	2	12	239710	239721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017292	TTGAAT	2	12	244023	244034	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017292	ATATAA	2	12	261775	261786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017292	GGGAAA	2	12	267742	267753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017292	TAAGAA	2	12	277659	277670	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017292	TAAAAT	2	12	291667	291678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017292	TGAAAA	2	12	337044	337055	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017292	ATTTTT	2	12	371432	371443	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017292	AAAAAT	2	12	470420	470431	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017292	TATAAT	2	12	489874	489885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017292	TTAATT	2	12	507570	507581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017292	CTTTTG	2	12	656278	656289	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017292	AAATAC	2	12	661836	661847	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017292	CAATCT	2	12	662422	662433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017292	TCATTC	2	12	664671	664682	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017292	AAGGGA	2	12	703522	703533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017292	ATTAAT	2	12	706212	706223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017292	TAAAAG	2	12	739752	739763	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017292	ATTTTA	2	12	752444	752455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017292	TAACCT	2	12	793827	793838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017292	CTATGT	2	12	814110	814121	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017292	ATTTTA	2	12	951278	951289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017292	ATCTAT	2	12	966570	966581	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017292	ATAAAA	2	12	983015	983026	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017292	TGAGAA	2	12	995865	995876	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017292	TTTTCT	2	12	1013971	1013982	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017292	AAATAA	2	12	1019193	1019204	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017292	TCGCTT	2	12	1022053	1022064	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017292	TTATCC	2	12	1022957	1022968	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017292	AAATTT	2	12	1025098	1025109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017292	CTTTGT	2	12	1036541	1036552	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017292	AAAAAT	2	12	1056816	1056827	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017292	TAATTT	2	12	1103450	1103461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017292	AAAATA	2	12	1141975	1141986	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017292	TACAGA	2	12	1154653	1154664	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017292	GTTAAA	2	12	1167580	1167591	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017292	CCTTCG	2	12	1170368	1170379	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.