MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci 02DC15 chromosome

Total Repeats: 790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017292	GAAAA	2	10	3356	3365	80 %	0 %	20 %	0 %	384454039
2	NC_017292	AGGAG	2	10	4413	4422	40 %	0 %	60 %	0 %	384454039
3	NC_017292	TGTTT	2	10	6761	6770	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017292	AACAT	2	10	7325	7334	60 %	20 %	0 %	20 %	384454041
5	NC_017292	ATAAA	2	10	13046	13055	80 %	20 %	0 %	0 %	384454043
6	NC_017292	AACTC	2	10	13490	13499	40 %	20 %	0 %	40 %	384454043
7	NC_017292	GTTTT	2	10	13560	13569	0 %	80 %	20 %	0 %	384454043
8	NC_017292	GAAAC	2	10	14328	14337	60 %	0 %	20 %	20 %	384454044
9	NC_017292	AACAA	2	10	15357	15366	80 %	0 %	0 %	20 %	384454044
10	NC_017292	AATAG	2	10	17069	17078	60 %	20 %	20 %	0 %	384454046
11	NC_017292	GCCTA	2	10	19904	19913	20 %	20 %	20 %	40 %	384454048
12	NC_017292	AGTGT	2	10	21118	21127	20 %	40 %	40 %	0 %	384454049
13	NC_017292	GCCAC	2	10	29447	29456	20 %	0 %	20 %	60 %	384454053
14	NC_017292	ATAAA	2	10	34287	34296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017292	AAGGA	2	10	38579	38588	60 %	0 %	40 %	0 %	384454063
16	NC_017292	CCATA	2	10	38786	38795	40 %	20 %	0 %	40 %	384454063
17	NC_017292	CTTTA	2	10	38952	38961	20 %	60 %	0 %	20 %	384454063
18	NC_017292	CTTTC	2	10	43215	43224	0 %	60 %	0 %	40 %	384454069
19	NC_017292	ACAAA	2	10	43877	43886	80 %	0 %	0 %	20 %	384454070
20	NC_017292	TATGG	2	10	44287	44296	20 %	40 %	40 %	0 %	384454071
21	NC_017292	TCTTT	2	10	46095	46104	0 %	80 %	0 %	20 %	384454073
22	NC_017292	AGCCC	2	10	47092	47101	20 %	0 %	20 %	60 %	384454074
23	NC_017292	TCAAA	2	10	47447	47456	60 %	20 %	0 %	20 %	384454074
24	NC_017292	TCTAT	2	10	49566	49575	20 %	60 %	0 %	20 %	384454076
25	NC_017292	TTTGG	2	10	51480	51489	0 %	60 %	40 %	0 %	384454076
26	NC_017292	TTTTG	2	10	52489	52498	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017292	TTTTC	2	10	55349	55358	0 %	80 %	0 %	20 %	384454079
28	NC_017292	GTAAG	2	10	57397	57406	40 %	20 %	40 %	0 %	384454082
29	NC_017292	TTAAT	2	10	57969	57978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017292	TCTTT	2	10	59413	59422	0 %	80 %	0 %	20 %	384454084
31	NC_017292	AAAAT	2	10	60219	60228	80 %	20 %	0 %	0 %	384454085
32	NC_017292	TAGTT	2	10	62821	62830	20 %	60 %	20 %	0 %	384454085
33	NC_017292	GAATG	2	10	62837	62846	40 %	20 %	40 %	0 %	384454085
34	NC_017292	TTGTT	2	10	63823	63832	0 %	80 %	20 %	0 %	384454086
35	NC_017292	TCCTA	2	10	64887	64896	20 %	40 %	0 %	40 %	384454087
36	NC_017292	AGAAA	2	10	70143	70152	80 %	0 %	20 %	0 %	384454091
37	NC_017292	GGATA	2	10	70951	70960	40 %	20 %	40 %	0 %	384454092
38	NC_017292	CACTT	2	10	71134	71143	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017292	ATAGC	2	10	74390	74399	40 %	20 %	20 %	20 %	384454096
40	NC_017292	GCACA	2	10	77223	77232	40 %	0 %	20 %	40 %	384454098
41	NC_017292	AATTT	2	10	77747	77756	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017292	AAAGA	2	10	78176	78185	80 %	0 %	20 %	0 %	384454099
43	NC_017292	AGTTC	2	10	79181	79190	20 %	40 %	20 %	20 %	384454099
44	NC_017292	CGTAT	2	10	81550	81559	20 %	40 %	20 %	20 %	384454101
45	NC_017292	GAAAA	2	10	82760	82769	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017292	AGGAA	2	10	84759	84768	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017292	CTTTT	2	10	85648	85657	0 %	80 %	0 %	20 %	384454104
48	NC_017292	CAAAG	2	10	87119	87128	60 %	0 %	20 %	20 %	384454106
49	NC_017292	AACAA	2	10	87286	87295	80 %	0 %	0 %	20 %	384454106
50	NC_017292	AGAAA	2	10	87356	87365	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017292	AAAGA	2	10	89192	89201	80 %	0 %	20 %	0 %	384454108
52	NC_017292	TTTTC	2	10	90207	90216	0 %	80 %	0 %	20 %	384454108
53	NC_017292	AGGAT	2	10	90730	90739	40 %	20 %	40 %	0 %	384454108
54	NC_017292	ATAAC	2	10	90816	90825	60 %	20 %	0 %	20 %	384454108
55	NC_017292	TGGCA	2	10	93301	93310	20 %	20 %	40 %	20 %	384454109
56	NC_017292	AATTA	2	10	93965	93974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017292	TGTTT	2	10	95026	95035	0 %	80 %	20 %	0 %	384454111
58	NC_017292	TCACC	2	10	96600	96609	20 %	20 %	0 %	60 %	384454112
59	NC_017292	AAAAT	2	10	96735	96744	80 %	20 %	0 %	0 %	384454112
60	NC_017292	TTAAT	2	10	97779	97788	40 %	60 %	0 %	0 %	384454113
61	NC_017292	ATTTG	2	10	98962	98971	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017292	AAAAT	2	10	99683	99692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017292	ATTAC	2	10	102911	102920	40 %	40 %	0 %	20 %	384454121
64	NC_017292	CTACA	2	10	103285	103294	40 %	20 %	0 %	40 %	384454121
65	NC_017292	AATTA	2	10	104832	104841	60 %	40 %	0 %	0 %	384454123
66	NC_017292	CTATA	2	10	105822	105831	40 %	40 %	0 %	20 %	384454124
67	NC_017292	CTTTT	2	10	108365	108374	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017292	AGCTT	2	10	108476	108485	20 %	40 %	20 %	20 %	384454127
69	NC_017292	GTTTG	2	10	108783	108792	0 %	60 %	40 %	0 %	384454127
70	NC_017292	AGTTA	2	10	115588	115597	40 %	40 %	20 %	0 %	384454142
71	NC_017292	AGTTT	2	10	116078	116087	20 %	60 %	20 %	0 %	384454143
72	NC_017292	TTTGC	2	10	116993	117002	0 %	60 %	20 %	20 %	384454145
73	NC_017292	TTTAC	2	10	119190	119199	20 %	60 %	0 %	20 %	384454148
74	NC_017292	AATTA	2	10	122083	122092	60 %	40 %	0 %	0 %	384454151
75	NC_017292	CTTTT	2	10	122881	122890	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017292	GAGAT	2	10	123437	123446	40 %	20 %	40 %	0 %	384454152
77	NC_017292	GTCAA	2	10	124756	124765	40 %	20 %	20 %	20 %	384454154
78	NC_017292	TAGGG	2	10	127228	127237	20 %	20 %	60 %	0 %	384454157
79	NC_017292	AACTT	2	10	128160	128169	40 %	40 %	0 %	20 %	384454157
80	NC_017292	TTCTT	2	10	131364	131373	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017292	TGTCA	2	10	132045	132054	20 %	40 %	20 %	20 %	384454160
82	NC_017292	AAAAG	2	10	135451	135460	80 %	0 %	20 %	0 %	384454162
83	NC_017292	TAAAA	2	10	135732	135741	80 %	20 %	0 %	0 %	384454162
84	NC_017292	GATTT	2	10	137991	138000	20 %	60 %	20 %	0 %	384454164
85	NC_017292	TTGTT	2	10	138333	138342	0 %	80 %	20 %	0 %	384454164
86	NC_017292	AAGAA	2	10	138814	138823	80 %	0 %	20 %	0 %	384454164
87	NC_017292	TTCTT	2	10	139407	139416	0 %	80 %	0 %	20 %	384454165
88	NC_017292	CTTTG	2	10	141311	141320	0 %	60 %	20 %	20 %	384454167
89	NC_017292	AGAAA	2	10	143348	143357	80 %	0 %	20 %	0 %	384454170
90	NC_017292	AAAGA	2	10	146013	146022	80 %	0 %	20 %	0 %	384454172
91	NC_017292	TTTTA	2	10	148192	148201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017292	TACTC	2	10	149644	149653	20 %	40 %	0 %	40 %	384454178
93	NC_017292	CGTTT	2	10	149691	149700	0 %	60 %	20 %	20 %	384454178
94	NC_017292	ATTTT	2	10	149831	149840	20 %	80 %	0 %	0 %	384454178
95	NC_017292	ACCAT	2	10	151862	151871	40 %	20 %	0 %	40 %	384454179
96	NC_017292	CAGAA	2	10	152827	152836	60 %	0 %	20 %	20 %	384454180
97	NC_017292	TTCAT	2	10	153397	153406	20 %	60 %	0 %	20 %	384454180
98	NC_017292	AAAGG	2	10	154227	154236	60 %	0 %	40 %	0 %	384454181
99	NC_017292	ATAGG	2	10	155919	155928	40 %	20 %	40 %	0 %	384454183
100	NC_017292	TTTGA	2	10	156005	156014	20 %	60 %	20 %	0 %	384454183
101	NC_017292	AAGGT	2	10	160946	160955	40 %	20 %	40 %	0 %	384454186
102	NC_017292	TTTTG	2	10	161885	161894	0 %	80 %	20 %	0 %	384454188
103	NC_017292	GGGGC	2	10	162032	162041	0 %	0 %	80 %	20 %	384454188
104	NC_017292	AGCAT	2	10	163324	163333	40 %	20 %	20 %	20 %	384454190
105	NC_017292	TAAAT	2	10	164511	164520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017292	AAATG	2	10	166439	166448	60 %	20 %	20 %	0 %	384454191
107	NC_017292	GGGGA	2	10	168214	168223	20 %	0 %	80 %	0 %	384454192
108	NC_017292	TTTTC	2	10	169263	169272	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017292	CTGTT	2	10	169742	169751	0 %	60 %	20 %	20 %	384454194
110	NC_017292	AATGA	2	10	169777	169786	60 %	20 %	20 %	0 %	384454194
111	NC_017292	ATTTT	2	10	173236	173245	20 %	80 %	0 %	0 %	384454199
112	NC_017292	GAGAG	2	10	173253	173262	40 %	0 %	60 %	0 %	384454199
113	NC_017292	CAAAA	2	10	173583	173592	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017292	CGCAT	2	10	173953	173962	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017292	CTAAG	2	10	181194	181203	40 %	20 %	20 %	20 %	384454206
116	NC_017292	TTTTC	2	10	181794	181803	0 %	80 %	0 %	20 %	384454206
117	NC_017292	GGTAC	2	10	183789	183798	20 %	20 %	40 %	20 %	384454208
118	NC_017292	AGGGA	2	10	186976	186985	40 %	0 %	60 %	0 %	384454212
119	NC_017292	AATGT	2	10	187385	187394	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017292	AGGAA	2	10	187999	188008	60 %	0 %	40 %	0 %	384454213
121	NC_017292	TTCTT	2	10	188378	188387	0 %	80 %	0 %	20 %	384454213
122	NC_017292	GATAA	2	10	191021	191030	60 %	20 %	20 %	0 %	384454213
123	NC_017292	CCCTT	2	10	193225	193234	0 %	40 %	0 %	60 %	384454214
124	NC_017292	TTTTA	2	10	193926	193935	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017292	AGTTA	2	10	194216	194225	40 %	40 %	20 %	0 %	384454215
126	NC_017292	TTATT	2	10	194236	194245	20 %	80 %	0 %	0 %	384454215
127	NC_017292	CCCTA	2	10	195289	195298	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_017292	AGGGT	2	10	197160	197169	20 %	20 %	60 %	0 %	384454217
129	NC_017292	TGGAT	2	10	197601	197610	20 %	40 %	40 %	0 %	384454217
130	NC_017292	CTAAA	2	10	197658	197667	60 %	20 %	0 %	20 %	384454217
131	NC_017292	CTTTA	2	10	197961	197970	20 %	60 %	0 %	20 %	384454217
132	NC_017292	AAAAT	2	10	198138	198147	80 %	20 %	0 %	0 %	384454217
133	NC_017292	GTTTT	2	10	198641	198650	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017292	ATTAA	2	10	201065	201074	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017292	TTGGT	2	10	201441	201450	0 %	60 %	40 %	0 %	384454220
136	NC_017292	AGCAA	2	10	203918	203927	60 %	0 %	20 %	20 %	384454222
137	NC_017292	TAATG	2	10	205033	205042	40 %	40 %	20 %	0 %	384454223
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