MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci 02DC15 chromosome

Total Repeats: 15772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017292	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017292	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017292	CGA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454036
4	NC_017292	AGA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454036
5	NC_017292	CTT	2	6	225	230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454036
6	NC_017292	TCT	2	6	331	336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454036
7	NC_017292	TAT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454036
8	NC_017292	ATG	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454036
9	NC_017292	TGT	2	6	640	645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454036
10	NC_017292	ATG	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454036
11	NC_017292	ACA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454036
12	NC_017292	AGC	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454036
13	NC_017292	GTG	2	6	981	986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454036
14	NC_017292	AGC	3	9	1000	1008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454036
15	NC_017292	CTA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454036
16	NC_017292	GGT	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454036
17	NC_017292	CTT	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454036
18	NC_017292	TTC	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017292	GAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017292	CTT	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454037
21	NC_017292	ACA	2	6	1365	1370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454037
22	NC_017292	ATG	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454037
23	NC_017292	TTA	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454037
24	NC_017292	TAG	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454037
25	NC_017292	TAG	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454037
26	NC_017292	CTA	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454037
27	NC_017292	TTC	2	6	1789	1794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454037
28	NC_017292	ATA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454037
29	NC_017292	CTT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454037
30	NC_017292	GAA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454037
31	NC_017292	TGA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454037
32	NC_017292	GAT	2	6	2146	2151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454037
33	NC_017292	GTT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454037
34	NC_017292	CTT	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454037
35	NC_017292	TAA	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454037
36	NC_017292	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454037
37	NC_017292	AGT	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454038
38	NC_017292	TTA	2	6	2656	2661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454038
39	NC_017292	TCC	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454038
40	NC_017292	TTC	2	6	2778	2783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454038
41	NC_017292	TTA	2	6	2803	2808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454038
42	NC_017292	AGA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454038
43	NC_017292	TAT	2	6	2972	2977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454038
44	NC_017292	TAT	2	6	3006	3011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454038
45	NC_017292	TAT	2	6	3058	3063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017292	ATT	3	9	3073	3081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017292	TGT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017292	GAA	2	6	3217	3222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454039
49	NC_017292	ATG	2	6	3422	3427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454039
50	NC_017292	AGT	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454039
51	NC_017292	CTT	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454039
52	NC_017292	CAA	2	6	3628	3633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454039
53	NC_017292	ATG	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454039
54	NC_017292	ATC	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454039
55	NC_017292	TGG	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454039
56	NC_017292	AGA	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454039
57	NC_017292	TAA	2	6	4209	4214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454039
58	NC_017292	GAA	2	6	4246	4251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454039
59	NC_017292	AGC	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454039
60	NC_017292	TAA	2	6	4313	4318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454039
61	NC_017292	AGA	2	6	4433	4438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454039
62	NC_017292	CTT	2	6	4450	4455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454039
63	NC_017292	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454039
64	NC_017292	GAT	2	6	4525	4530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454039
65	NC_017292	GCT	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454039
66	NC_017292	GAA	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454039
67	NC_017292	AAG	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454039
68	NC_017292	TGG	2	6	4910	4915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454039
69	NC_017292	AAG	2	6	5009	5014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454039
70	NC_017292	AGA	2	6	5112	5117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454039
71	NC_017292	TTA	2	6	5132	5137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454039
72	NC_017292	CAA	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454039
73	NC_017292	CAA	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017292	TTG	2	6	5349	5354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017292	AGA	2	6	5520	5525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454040
76	NC_017292	TGG	2	6	5586	5591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454040
77	NC_017292	TAT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454040
78	NC_017292	GTT	2	6	5667	5672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454040
79	NC_017292	CAA	2	6	5683	5688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454040
80	NC_017292	GAT	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454040
81	NC_017292	TGT	2	6	5730	5735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454040
82	NC_017292	GGA	2	6	5752	5757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454040
83	NC_017292	CAA	2	6	5863	5868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454040
84	NC_017292	TGA	2	6	5925	5930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454040
85	NC_017292	GAT	2	6	5931	5936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454040
86	NC_017292	TGT	3	9	5983	5991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454040
87	NC_017292	TGA	2	6	6047	6052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454040
88	NC_017292	GCT	2	6	6063	6068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454040
89	NC_017292	TGC	2	6	6222	6227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454040
90	NC_017292	TGA	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454040
91	NC_017292	GAA	2	6	6274	6279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454040
92	NC_017292	GAG	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454040
93	NC_017292	TTC	2	6	6297	6302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454040
94	NC_017292	CCT	2	6	6304	6309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454040
95	NC_017292	CTT	2	6	6350	6355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454040
96	NC_017292	GTT	2	6	6392	6397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454040
97	NC_017292	ACA	2	6	6550	6555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454040
98	NC_017292	ATA	2	6	6590	6595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454040
99	NC_017292	CAA	2	6	6634	6639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454040
100	NC_017292	GAA	2	6	6881	6886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017292	GAA	2	6	6910	6915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454041
102	NC_017292	CAT	2	6	6916	6921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454041
103	NC_017292	ACA	2	6	6934	6939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454041
104	NC_017292	GTG	2	6	6988	6993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454041
105	NC_017292	TGT	2	6	7013	7018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454041
106	NC_017292	TTC	2	6	7104	7109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454041
107	NC_017292	GTT	2	6	7115	7120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454041
108	NC_017292	CAT	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454041
109	NC_017292	AGA	2	6	7170	7175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454041
110	NC_017292	TAA	2	6	7253	7258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454041
111	NC_017292	TTG	2	6	7302	7307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454041
112	NC_017292	CTC	2	6	7344	7349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454041
113	NC_017292	GGA	2	6	7462	7467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454041
114	NC_017292	TGA	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454041
115	NC_017292	ATT	2	6	7779	7784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454041
116	NC_017292	TGC	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454041
117	NC_017292	TTC	2	6	7892	7897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454041
118	NC_017292	TTG	2	6	8054	8059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454042
119	NC_017292	TGC	2	6	8072	8077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454042
120	NC_017292	AAG	2	6	8169	8174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454042
121	NC_017292	TTA	2	6	8253	8258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454042
122	NC_017292	CTT	2	6	8272	8277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454042
123	NC_017292	GAA	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454042
124	NC_017292	TTC	2	6	8378	8383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454042
125	NC_017292	TTC	2	6	8503	8508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454042
126	NC_017292	AGG	2	6	8710	8715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454042
127	NC_017292	CCT	2	6	8767	8772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454042
128	NC_017292	AAG	2	6	8815	8820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454042
129	NC_017292	GTT	2	6	8839	8844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454042
130	NC_017292	GAA	2	6	8889	8894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454042
131	NC_017292	CAT	2	6	8938	8943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454042
132	NC_017292	TTC	2	6	9023	9028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454042
133	NC_017292	GAA	2	6	9084	9089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454042
134	NC_017292	GAG	2	6	9145	9150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454042
135	NC_017292	AGT	2	6	9250	9255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454042
136	NC_017292	TTA	2	6	9442	9447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454042
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138	NC_017292	GTT	2	6	9737	9742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454042
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140	NC_017292	GCA	2	6	9997	10002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454042
141	NC_017292	CCA	2	6	10040	10045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384454042
142	NC_017292	ATG	2	6	10138	10143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454042
143	NC_017292	TCT	2	6	10146	10151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454042
144	NC_017292	AAG	2	6	10347	10352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454042
145	NC_017292	TGG	2	6	10417	10422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454042
146	NC_017292	ATG	2	6	10592	10597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454042
147	NC_017292	GCT	2	6	10750	10755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454042
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199	NC_017292	GCA	3	9	15205	15213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454044
200	NC_017292	CCA	2	6	15247	15252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384454044
201	NC_017292	TGT	2	6	15635	15640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454044
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224	NC_017292	TTC	2	6	16579	16584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454045
225	NC_017292	GTA	2	6	16645	16650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454045
226	NC_017292	ATA	3	9	16789	16797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454045
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228	NC_017292	AAT	2	6	16851	16856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
229	NC_017292	TTA	2	6	16931	16936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_017292	AAT	2	6	17009	17014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
231	NC_017292	GAA	2	6	17106	17111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454046
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239	NC_017292	TTC	2	6	18107	18112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454047
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253	NC_017292	AAG	2	6	19559	19564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454048
254	NC_017292	ATA	2	6	19565	19570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454048
255	NC_017292	GAA	2	6	19573	19578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454048
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257	NC_017292	CTT	2	6	19651	19656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454048
258	NC_017292	CAA	2	6	19700	19705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454048
259	NC_017292	CGT	2	6	19801	19806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454048
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261	NC_017292	GTT	2	6	19877	19882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454048
262	NC_017292	GTT	2	6	20026	20031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454048
263	NC_017292	TAC	2	6	20085	20090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454048
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269	NC_017292	TTA	2	6	20339	20344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_017292	TCT	2	6	20387	20392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_017292	TAA	2	6	21787	21792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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