MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 786

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017291	GAAAA	2	10	3356	3365	80 %	0 %	20 %	0 %	384453060
2	NC_017291	AGGAG	2	10	4413	4422	40 %	0 %	60 %	0 %	384453060
3	NC_017291	TGTTT	2	10	6761	6770	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017291	AACAT	2	10	7325	7334	60 %	20 %	0 %	20 %	384453062
5	NC_017291	ATAAA	2	10	13046	13055	80 %	20 %	0 %	0 %	384453064
6	NC_017291	AACTC	2	10	13490	13499	40 %	20 %	0 %	40 %	384453064
7	NC_017291	GTTTT	2	10	13560	13569	0 %	80 %	20 %	0 %	384453064
8	NC_017291	GAAAC	2	10	14328	14337	60 %	0 %	20 %	20 %	384453065
9	NC_017291	AACAA	2	10	15357	15366	80 %	0 %	0 %	20 %	384453065
10	NC_017291	AATAG	2	10	17069	17078	60 %	20 %	20 %	0 %	384453067
11	NC_017291	GCCTA	2	10	19904	19913	20 %	20 %	20 %	40 %	384453069
12	NC_017291	AGTGT	2	10	21118	21127	20 %	40 %	40 %	0 %	384453070
13	NC_017291	GCCAC	2	10	29447	29456	20 %	0 %	20 %	60 %	384453074
14	NC_017291	ATAAA	2	10	34287	34296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017291	AAGGA	2	10	38579	38588	60 %	0 %	40 %	0 %	384453084
16	NC_017291	CCATA	2	10	38786	38795	40 %	20 %	0 %	40 %	384453084
17	NC_017291	CTTTA	2	10	38952	38961	20 %	60 %	0 %	20 %	384453084
18	NC_017291	CTTTC	2	10	43215	43224	0 %	60 %	0 %	40 %	384453090
19	NC_017291	ACAAA	2	10	43877	43886	80 %	0 %	0 %	20 %	384453091
20	NC_017291	TATGG	2	10	44287	44296	20 %	40 %	40 %	0 %	384453092
21	NC_017291	TCTTT	2	10	46095	46104	0 %	80 %	0 %	20 %	384453094
22	NC_017291	AGCCC	2	10	47092	47101	20 %	0 %	20 %	60 %	384453095
23	NC_017291	TCAAA	2	10	47447	47456	60 %	20 %	0 %	20 %	384453095
24	NC_017291	TCTAT	2	10	49566	49575	20 %	60 %	0 %	20 %	384453097
25	NC_017291	TTTGG	2	10	51480	51489	0 %	60 %	40 %	0 %	384453097
26	NC_017291	TTTTG	2	10	52489	52498	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017291	TTTTC	2	10	55349	55358	0 %	80 %	0 %	20 %	384453100
28	NC_017291	GTAAG	2	10	57397	57406	40 %	20 %	40 %	0 %	384453103
29	NC_017291	TTAAT	2	10	57969	57978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017291	TCTTT	2	10	59413	59422	0 %	80 %	0 %	20 %	384453105
31	NC_017291	AAAAT	2	10	60219	60228	80 %	20 %	0 %	0 %	384453106
32	NC_017291	TAGTT	2	10	62821	62830	20 %	60 %	20 %	0 %	384453106
33	NC_017291	GAATG	2	10	62837	62846	40 %	20 %	40 %	0 %	384453106
34	NC_017291	TTGTT	2	10	63823	63832	0 %	80 %	20 %	0 %	384453107
35	NC_017291	TCCTA	2	10	64887	64896	20 %	40 %	0 %	40 %	384453108
36	NC_017291	AGAAA	2	10	70143	70152	80 %	0 %	20 %	0 %	384453112
37	NC_017291	GGATA	2	10	70951	70960	40 %	20 %	40 %	0 %	384453113
38	NC_017291	CACTT	2	10	71134	71143	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017291	ATAGC	2	10	74390	74399	40 %	20 %	20 %	20 %	384453117
40	NC_017291	GCACA	2	10	77223	77232	40 %	0 %	20 %	40 %	384453119
41	NC_017291	AATTT	2	10	77747	77756	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017291	AAAGA	2	10	78176	78185	80 %	0 %	20 %	0 %	384453120
43	NC_017291	AGTTC	2	10	79181	79190	20 %	40 %	20 %	20 %	384453120
44	NC_017291	CGTAT	2	10	81550	81559	20 %	40 %	20 %	20 %	384453122
45	NC_017291	GAAAA	2	10	82760	82769	80 %	0 %	20 %	0 %	384453123
46	NC_017291	AGGAA	2	10	84759	84768	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017291	CTTTT	2	10	85648	85657	0 %	80 %	0 %	20 %	384453126
48	NC_017291	CAAAG	2	10	87119	87128	60 %	0 %	20 %	20 %	384453128
49	NC_017291	AACAA	2	10	87286	87295	80 %	0 %	0 %	20 %	384453128
50	NC_017291	AGAAA	2	10	87356	87365	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017291	AAAGA	2	10	89192	89201	80 %	0 %	20 %	0 %	384453130
52	NC_017291	TTTTC	2	10	90207	90216	0 %	80 %	0 %	20 %	384453130
53	NC_017291	AGGAT	2	10	90730	90739	40 %	20 %	40 %	0 %	384453130
54	NC_017291	ATAAC	2	10	90816	90825	60 %	20 %	0 %	20 %	384453130
55	NC_017291	TGGCA	2	10	93301	93310	20 %	20 %	40 %	20 %	384453131
56	NC_017291	AATTA	2	10	93965	93974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017291	TGTTT	2	10	95026	95035	0 %	80 %	20 %	0 %	384453133
58	NC_017291	TCACC	2	10	96600	96609	20 %	20 %	0 %	60 %	384453134
59	NC_017291	AAAAT	2	10	96735	96744	80 %	20 %	0 %	0 %	384453134
60	NC_017291	TTAAT	2	10	97779	97788	40 %	60 %	0 %	0 %	384453135
61	NC_017291	ATTTG	2	10	98962	98971	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017291	AAAAT	2	10	99683	99692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017291	ATTAC	2	10	102911	102920	40 %	40 %	0 %	20 %	384453143
64	NC_017291	CTACA	2	10	103285	103294	40 %	20 %	0 %	40 %	384453143
65	NC_017291	AATTA	2	10	104832	104841	60 %	40 %	0 %	0 %	384453145
66	NC_017291	CTATA	2	10	105822	105831	40 %	40 %	0 %	20 %	384453146
67	NC_017291	CTTTT	2	10	108365	108374	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017291	AGCTT	2	10	108476	108485	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017291	GTTTG	2	10	108783	108792	0 %	60 %	40 %	0 %	384453149
70	NC_017291	AGTTA	2	10	115588	115597	40 %	40 %	20 %	0 %	384453164
71	NC_017291	AGTTT	2	10	116078	116087	20 %	60 %	20 %	0 %	384453165
72	NC_017291	TTTGC	2	10	116993	117002	0 %	60 %	20 %	20 %	384453167
73	NC_017291	TTTAC	2	10	119190	119199	20 %	60 %	0 %	20 %	384453170
74	NC_017291	AATTA	2	10	122083	122092	60 %	40 %	0 %	0 %	384453173
75	NC_017291	CTTTT	2	10	122881	122890	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017291	GAGAT	2	10	123437	123446	40 %	20 %	40 %	0 %	384453174
77	NC_017291	GTCAA	2	10	124756	124765	40 %	20 %	20 %	20 %	384453176
78	NC_017291	TAGGG	2	10	127228	127237	20 %	20 %	60 %	0 %	384453179
79	NC_017291	AACTT	2	10	128160	128169	40 %	40 %	0 %	20 %	384453179
80	NC_017291	TTCTT	2	10	131364	131373	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017291	TGTCA	2	10	132045	132054	20 %	40 %	20 %	20 %	384453182
82	NC_017291	AAAAG	2	10	135451	135460	80 %	0 %	20 %	0 %	384453184
83	NC_017291	TAAAA	2	10	135732	135741	80 %	20 %	0 %	0 %	384453184
84	NC_017291	GATTT	2	10	137991	138000	20 %	60 %	20 %	0 %	384453186
85	NC_017291	TTGTT	2	10	138333	138342	0 %	80 %	20 %	0 %	384453186
86	NC_017291	AAGAA	2	10	138814	138823	80 %	0 %	20 %	0 %	384453186
87	NC_017291	TTCTT	2	10	139407	139416	0 %	80 %	0 %	20 %	384453187
88	NC_017291	CTTTG	2	10	141311	141320	0 %	60 %	20 %	20 %	384453189
89	NC_017291	AGAAA	2	10	143348	143357	80 %	0 %	20 %	0 %	384453192
90	NC_017291	AAAGA	2	10	146013	146022	80 %	0 %	20 %	0 %	384453194
91	NC_017291	TTTTA	2	10	148192	148201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017291	TACTC	2	10	149644	149653	20 %	40 %	0 %	40 %	384453200
93	NC_017291	CGTTT	2	10	149691	149700	0 %	60 %	20 %	20 %	384453200
94	NC_017291	ATTTT	2	10	149831	149840	20 %	80 %	0 %	0 %	384453200
95	NC_017291	ACCAT	2	10	151862	151871	40 %	20 %	0 %	40 %	384453201
96	NC_017291	CAGAA	2	10	152827	152836	60 %	0 %	20 %	20 %	384453202
97	NC_017291	TTCAT	2	10	153397	153406	20 %	60 %	0 %	20 %	384453202
98	NC_017291	AAAGG	2	10	154227	154236	60 %	0 %	40 %	0 %	384453203
99	NC_017291	ATAGG	2	10	155919	155928	40 %	20 %	40 %	0 %	384453205
100	NC_017291	TTTGA	2	10	156005	156014	20 %	60 %	20 %	0 %	384453205
101	NC_017291	AAGGT	2	10	160946	160955	40 %	20 %	40 %	0 %	384453208
102	NC_017291	TTTTG	2	10	161885	161894	0 %	80 %	20 %	0 %	384453210
103	NC_017291	GGGGC	2	10	162032	162041	0 %	0 %	80 %	20 %	384453210
104	NC_017291	AGCAT	2	10	163324	163333	40 %	20 %	20 %	20 %	384453212
105	NC_017291	TAAAT	2	10	164511	164520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017291	AAATG	2	10	166439	166448	60 %	20 %	20 %	0 %	384453213
107	NC_017291	GGGGA	2	10	168214	168223	20 %	0 %	80 %	0 %	384453214
108	NC_017291	TTTTC	2	10	169263	169272	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017291	CTGTT	2	10	169742	169751	0 %	60 %	20 %	20 %	384453216
110	NC_017291	AATGA	2	10	169777	169786	60 %	20 %	20 %	0 %	384453216
111	NC_017291	ATTTT	2	10	173236	173245	20 %	80 %	0 %	0 %	384453221
112	NC_017291	GAGAG	2	10	173253	173262	40 %	0 %	60 %	0 %	384453221
113	NC_017291	CAAAA	2	10	173583	173592	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017291	CGCAT	2	10	173953	173962	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017291	CTAAG	2	10	181194	181203	40 %	20 %	20 %	20 %	384453228
116	NC_017291	TTTTC	2	10	181794	181803	0 %	80 %	0 %	20 %	384453228
117	NC_017291	GGTAC	2	10	183789	183798	20 %	20 %	40 %	20 %	384453230
118	NC_017291	AGGGA	2	10	186976	186985	40 %	0 %	60 %	0 %	384453234
119	NC_017291	AATGT	2	10	187385	187394	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017291	AGGAA	2	10	187999	188008	60 %	0 %	40 %	0 %	384453235
121	NC_017291	TTCTT	2	10	188378	188387	0 %	80 %	0 %	20 %	384453235
122	NC_017291	GATAA	2	10	191021	191030	60 %	20 %	20 %	0 %	384453235
123	NC_017291	CCCTT	2	10	193225	193234	0 %	40 %	0 %	60 %	384453236
124	NC_017291	TTTTA	2	10	193926	193935	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017291	AGTTA	2	10	194216	194225	40 %	40 %	20 %	0 %	384453237
126	NC_017291	TTATT	2	10	194236	194245	20 %	80 %	0 %	0 %	384453237
127	NC_017291	CCCTA	2	10	195289	195298	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_017291	AGGGT	2	10	197160	197169	20 %	20 %	60 %	0 %	384453239
129	NC_017291	TGGAT	2	10	197601	197610	20 %	40 %	40 %	0 %	384453239
130	NC_017291	CTAAA	2	10	197658	197667	60 %	20 %	0 %	20 %	384453239
131	NC_017291	CTTTA	2	10	197961	197970	20 %	60 %	0 %	20 %	384453239
132	NC_017291	AAAAT	2	10	198138	198147	80 %	20 %	0 %	0 %	384453239
133	NC_017291	GTTTT	2	10	198641	198650	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017291	ATTAA	2	10	201065	201074	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017291	TTGGT	2	10	201441	201450	0 %	60 %	40 %	0 %	384453242
136	NC_017291	AGCAA	2	10	203918	203927	60 %	0 %	20 %	20 %	384453244
137	NC_017291	TAATG	2	10	205033	205042	40 %	40 %	20 %	0 %	384453245
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